MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 20900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013721	ATT	2	6	46	51	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782521
2	NC_013721	AAT	2	6	196	201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782521
3	NC_013721	ACG	2	6	245	250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782521
4	NC_013721	TCT	2	6	325	330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782521
5	NC_013721	AAG	2	6	414	419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782521
6	NC_013721	TCT	2	6	535	540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782521
7	NC_013721	ACT	2	6	634	639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782521
8	NC_013721	TCT	2	6	655	660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782521
9	NC_013721	TAA	2	6	715	720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782521
10	NC_013721	GCC	2	6	850	855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782521
11	NC_013721	ATT	2	6	955	960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
12	NC_013721	GCA	2	6	1002	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
13	NC_013721	CAG	2	6	1066	1071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
14	NC_013721	TAA	2	6	1111	1116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782522
15	NC_013721	ATT	2	6	1127	1132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
16	NC_013721	ATT	2	6	1142	1147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
17	NC_013721	CAA	2	6	1204	1209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782522
18	NC_013721	TCA	2	6	1224	1229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782522
19	NC_013721	TAC	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782522
20	NC_013721	TAC	2	6	1291	1296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782522
21	NC_013721	GCA	2	6	1302	1307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
22	NC_013721	TAA	2	6	1312	1317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782522
23	NC_013721	ACC	2	6	1389	1394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283782522
24	NC_013721	AGC	2	6	1427	1432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
25	NC_013721	CCG	2	6	1449	1454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782522
26	NC_013721	CAA	2	6	1456	1461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782522
27	NC_013721	ACA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782522
28	NC_013721	TCT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782522
29	NC_013721	AAT	2	6	1580	1585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782522
30	NC_013721	CTG	2	6	1726	1731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782522
31	NC_013721	GAT	2	6	1807	1812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782522
32	NC_013721	GCA	2	6	1860	1865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
33	NC_013721	AGC	2	6	1868	1873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782522
34	NC_013721	CCG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782522
35	NC_013721	GAA	2	6	1947	1952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782522
36	NC_013721	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
37	NC_013721	GGA	2	6	2045	2050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782522
38	NC_013721	CTG	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782522
39	NC_013721	CTT	2	6	2107	2112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782522
40	NC_013721	TAA	2	6	2158	2163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782522
41	NC_013721	TCA	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782522
42	NC_013721	ATT	3	9	2450	2458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782522
43	NC_013721	CTT	2	6	2497	2502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782522
44	NC_013721	ATG	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782522
45	NC_013721	CAA	2	6	2618	2623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782522
46	NC_013721	TTC	2	6	2798	2803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782523
47	NC_013721	TGC	2	6	2858	2863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782523
48	NC_013721	AGC	2	6	2877	2882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782523
49	NC_013721	TCG	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782523
50	NC_013721	AGA	3	9	3208	3216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782523
51	NC_013721	CAA	2	6	3256	3261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782523
52	NC_013721	GAA	2	6	3295	3300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782523
53	NC_013721	CAA	2	6	3758	3763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782524
54	NC_013721	CTG	2	6	3794	3799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782524
55	NC_013721	AAG	2	6	3874	3879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782524
56	NC_013721	TTA	2	6	3963	3968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782524
57	NC_013721	ATG	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782524
58	NC_013721	GAT	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782524
59	NC_013721	GGA	2	6	4234	4239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782524
60	NC_013721	GAT	3	9	4342	4350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782524
61	NC_013721	GGA	2	6	4465	4470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782524
62	NC_013721	AAC	2	6	4825	4830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782524
63	NC_013721	CAA	2	6	5291	5296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
64	NC_013721	AGA	2	6	5307	5312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782525
65	NC_013721	GAA	2	6	5460	5465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782525
66	NC_013721	TTA	2	6	5531	5536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782525
67	NC_013721	AAG	2	6	5657	5662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782525
68	NC_013721	ACT	2	6	5669	5674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782525
69	NC_013721	ATT	2	6	5689	5694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782525
70	NC_013721	TTA	2	6	5825	5830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782525
71	NC_013721	ATG	2	6	5891	5896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782525
72	NC_013721	GCT	2	6	5929	5934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782525
73	NC_013721	TGA	2	6	5952	5957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782525
74	NC_013721	AGT	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782525
75	NC_013721	AAG	2	6	6164	6169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782525
76	NC_013721	TTA	2	6	6392	6397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782525
77	NC_013721	CAA	2	6	6473	6478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
78	NC_013721	TCT	2	6	6486	6491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782525
79	NC_013721	TAC	2	6	6587	6592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782525
80	NC_013721	TAT	2	6	6621	6626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782525
81	NC_013721	CTG	2	6	6683	6688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782525
82	NC_013721	AAC	2	6	6797	6802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
83	NC_013721	ACA	2	6	6808	6813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
84	NC_013721	ACA	2	6	6826	6831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
85	NC_013721	CAA	2	6	7102	7107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
86	NC_013721	CCA	2	6	7198	7203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283782525
87	NC_013721	ACA	2	6	7223	7228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782525
88	NC_013721	TAA	2	6	7287	7292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782525
89	NC_013721	AAT	2	6	7516	7521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782525
90	NC_013721	CTT	2	6	7648	7653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782525
91	NC_013721	AGA	2	6	7731	7736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782525
92	NC_013721	AAT	2	6	7849	7854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782525
93	NC_013721	AAT	2	6	7878	7883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782525
94	NC_013721	GCA	2	6	8238	8243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782526
95	NC_013721	TTA	2	6	8316	8321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782526
96	NC_013721	ATC	2	6	8337	8342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782526
97	NC_013721	AAG	2	6	8344	8349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782526
98	NC_013721	CAG	2	6	8365	8370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782526
99	NC_013721	TTA	2	6	8409	8414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782526
100	NC_013721	GCA	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782526
101	NC_013721	ACT	2	6	8453	8458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782526
102	NC_013721	AAT	2	6	8492	8497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782526
103	NC_013721	ATA	2	6	8505	8510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782526
104	NC_013721	ACG	2	6	8579	8584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782526
105	NC_013721	GAA	2	6	8655	8660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782526
106	NC_013721	ACA	2	6	8753	8758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782526
107	NC_013721	CTT	3	9	8890	8898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782526
108	NC_013721	AAT	2	6	8924	8929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782526
109	NC_013721	AAT	2	6	8981	8986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782526
110	NC_013721	ACA	3	9	9051	9059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782526
111	NC_013721	ATT	2	6	9217	9222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782527
112	NC_013721	AAT	2	6	9366	9371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782527
113	NC_013721	ATT	2	6	9446	9451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782527
114	NC_013721	TCG	2	6	9603	9608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782527
115	NC_013721	ATA	2	6	9795	9800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782527
116	NC_013721	CTC	2	6	9884	9889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283782527
117	NC_013721	ATC	2	6	9953	9958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782527
118	NC_013721	TAA	2	6	9964	9969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782527
119	NC_013721	ACG	2	6	10040	10045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782527
120	NC_013721	AAT	2	6	10126	10131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782527
121	NC_013721	CCA	2	6	10179	10184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283782527
122	NC_013721	CTC	2	6	10300	10305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283782527
123	NC_013721	CAT	2	6	10348	10353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782527
124	NC_013721	TCT	2	6	10368	10373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782527
125	NC_013721	TTC	2	6	10562	10567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782527
126	NC_013721	AAG	2	6	10590	10595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782527
127	NC_013721	ATT	2	6	10695	10700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782527
128	NC_013721	ATA	2	6	11023	11028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782528
129	NC_013721	CAA	2	6	11030	11035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782528
130	NC_013721	CTT	2	6	11045	11050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782528
131	NC_013721	CAT	2	6	11052	11057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782528
132	NC_013721	CTG	2	6	11069	11074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782528
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136	NC_013721	CAT	2	6	11319	11324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782528
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139	NC_013721	CTG	2	6	11609	11614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782528
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252	NC_013721	AGC	2	6	20353	20358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782535
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255	NC_013721	GGA	2	6	21005	21010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782535
256	NC_013721	CTT	2	6	21022	21027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782535
257	NC_013721	AGC	2	6	21032	21037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782535
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259	NC_013721	TTC	2	6	21115	21120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782535
260	NC_013721	CTT	2	6	21133	21138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782535
261	NC_013721	GAA	2	6	21159	21164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782535
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