MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 28756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013721	CAA	2	6	215143	215148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782702
4002	NC_013721	CTT	2	6	215363	215368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782702
4003	NC_013721	CGA	2	6	215492	215497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782702
4004	NC_013721	CTG	2	6	215527	215532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782702
4005	NC_013721	ATT	2	6	215670	215675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782702
4006	NC_013721	GCT	2	6	215722	215727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782702
4007	NC_013721	TGC	2	6	215741	215746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782702
4008	NC_013721	AAG	2	6	215778	215783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782702
4009	NC_013721	CTTGG	2	10	215877	215886	0 %	40 %	40 %	20 %	283782702
4010	NC_013721	ACG	2	6	215896	215901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782702
4011	NC_013721	GAT	2	6	215982	215987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782702
4012	NC_013721	TTC	2	6	216150	216155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782702
4013	NC_013721	GCT	2	6	216240	216245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782702
4014	NC_013721	GCTT	2	8	216295	216302	0 %	50 %	25 %	25 %	283782702
4015	NC_013721	GAA	2	6	216327	216332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782702
4016	NC_013721	CTG	2	6	216406	216411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782702
4017	NC_013721	GAG	2	6	216558	216563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782702
4018	NC_013721	TTC	2	6	216644	216649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782702
4019	NC_013721	TCTGAA	2	12	216654	216665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	283782702
4020	NC_013721	A	6	6	216746	216751	100 %	0 %	0 %	0 %	283782702
4021	NC_013721	AGT	2	6	216754	216759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782702
4022	NC_013721	TTA	2	6	216858	216863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782703
4023	NC_013721	CTG	2	6	216870	216875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782703
4024	NC_013721	CAA	2	6	216892	216897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782703
4025	NC_013721	ATT	2	6	216911	216916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782703
4026	NC_013721	ATT	2	6	216930	216935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782703
4027	NC_013721	TGCCT	2	10	216986	216995	0 %	40 %	20 %	40 %	283782703
4028	NC_013721	CAC	2	6	217128	217133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283782704
4029	NC_013721	GTC	2	6	217134	217139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782704
4030	NC_013721	TCA	2	6	217213	217218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782704
4031	NC_013721	TTG	2	6	217328	217333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782704
4032	NC_013721	AT	3	6	217371	217376	50 %	50 %	0 %	0 %	283782704
4033	NC_013721	AAT	2	6	217391	217396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782704
4034	NC_013721	CG	3	6	217427	217432	0 %	0 %	50 %	50 %	283782704
4035	NC_013721	AATT	2	8	217475	217482	50 %	50 %	0 %	0 %	283782705
4036	NC_013721	A	6	6	217484	217489	100 %	0 %	0 %	0 %	283782705
4037	NC_013721	TAG	2	6	217502	217507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782705
4038	NC_013721	AGA	2	6	217533	217538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782705
4039	NC_013721	CTG	2	6	217547	217552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782705
4040	NC_013721	A	6	6	217630	217635	100 %	0 %	0 %	0 %	283782705
4041	NC_013721	AAG	2	6	217685	217690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782705
4042	NC_013721	GC	3	6	217702	217707	0 %	0 %	50 %	50 %	283782705
4043	NC_013721	TTA	2	6	217730	217735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782705
4044	NC_013721	TTCTGC	2	12	217749	217760	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	283782705
4045	NC_013721	GGC	2	6	217761	217766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782705
4046	NC_013721	TGG	2	6	217881	217886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782705
4047	NC_013721	TAC	2	6	217960	217965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782705
4048	NC_013721	TGC	2	6	218013	218018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782705
4049	NC_013721	GAA	2	6	218029	218034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782705
4050	NC_013721	AAG	2	6	218093	218098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782705
4051	NC_013721	AGGA	2	8	218156	218163	50 %	0 %	50 %	0 %	283782705
4052	NC_013721	AGC	2	6	218189	218194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782705
4053	NC_013721	GC	3	6	218211	218216	0 %	0 %	50 %	50 %	283782705
4054	NC_013721	ATG	2	6	218224	218229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782705
4055	NC_013721	GC	3	6	218322	218327	0 %	0 %	50 %	50 %	283782705
4056	NC_013721	CGA	2	6	218403	218408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782705
4057	NC_013721	ATT	2	6	218422	218427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782705
4058	NC_013721	TGC	2	6	218454	218459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782705
4059	NC_013721	CAA	2	6	218478	218483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782705
4060	NC_013721	ATC	2	6	218537	218542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782705
4061	NC_013721	AT	3	6	218547	218552	50 %	50 %	0 %	0 %	283782705
4062	NC_013721	ATG	2	6	218560	218565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782705
4063	NC_013721	TTA	2	6	218684	218689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782705
4064	NC_013721	ACA	2	6	218756	218761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782705
4065	NC_013721	GATTTG	2	12	218776	218787	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	283782705
4066	NC_013721	TAC	2	6	218818	218823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782705
4067	NC_013721	ACGCTC	2	12	218831	218842	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	283782705
4068	NC_013721	GCTT	2	8	218906	218913	0 %	50 %	25 %	25 %	283782705
4069	NC_013721	GCT	2	6	218941	218946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782705
4070	NC_013721	CTG	2	6	218960	218965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782705
4071	NC_013721	GC	3	6	218988	218993	0 %	0 %	50 %	50 %	283782705
4072	NC_013721	GCA	2	6	219028	219033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782705
4073	NC_013721	TGC	2	6	219156	219161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782705
4074	NC_013721	GCT	2	6	219181	219186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782705
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4081	NC_013721	CAA	2	6	219859	219864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782706
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4085	NC_013721	GCG	2	6	220075	220080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782706
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4087	NC_013721	TACAA	2	10	220149	220158	60 %	20 %	0 %	20 %	283782706
4088	NC_013721	TAGC	2	8	220168	220175	25 %	25 %	25 %	25 %	283782706
4089	NC_013721	GTT	2	6	220194	220199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782706
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4092	NC_013721	CTG	2	6	220345	220350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782706
4093	NC_013721	TGC	2	6	220418	220423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782706
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4097	NC_013721	TGCAT	2	10	220763	220772	20 %	40 %	20 %	20 %	283782706
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4102	NC_013721	GCT	2	6	220923	220928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782706
4103	NC_013721	CGA	2	6	220958	220963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782706
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4105	NC_013721	TTC	2	6	220970	220975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782706
4106	NC_013721	CTG	2	6	220999	221004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782706
4107	NC_013721	GCC	2	6	221186	221191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283782707
4108	NC_013721	CAGT	2	8	221202	221209	25 %	25 %	25 %	25 %	283782707
4109	NC_013721	AAAT	2	8	221373	221380	75 %	25 %	0 %	0 %	283782707
4110	NC_013721	AGC	2	6	221456	221461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782707
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4113	NC_013721	TTA	2	6	221664	221669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782708
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4116	NC_013721	TTTC	2	8	221733	221740	0 %	75 %	0 %	25 %	283782708
4117	NC_013721	TGGA	2	8	221813	221820	25 %	25 %	50 %	0 %	283782708
4118	NC_013721	ATT	2	6	221873	221878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782708
4119	NC_013721	TGT	3	9	221965	221973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782708
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4121	NC_013721	GCT	2	6	222004	222009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782708
4122	NC_013721	GAT	2	6	222011	222016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782708
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4125	NC_013721	AT	3	6	222278	222283	50 %	50 %	0 %	0 %	283782709
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4244	NC_013721	GAA	2	6	229527	229532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782715
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4366	NC_013721	TCG	2	6	235799	235804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782719
4367	NC_013721	TTG	2	6	235809	235814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782719
4368	NC_013721	TGGT	2	8	235819	235826	0 %	50 %	50 %	0 %	283782719
4369	NC_013721	TCG	3	9	235829	235837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782719
4370	NC_013721	TCT	2	6	235838	235843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782719
4371	NC_013721	TTGA	2	8	235884	235891	25 %	50 %	25 %	0 %	283782719
4372	NC_013721	TACGC	2	10	236321	236330	20 %	20 %	20 %	40 %	283782720
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4378	NC_013721	TGC	2	6	236486	236491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782720
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4385	NC_013721	GTT	2	6	236619	236624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782720
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4465	NC_013721	A	7	7	241463	241469	100 %	0 %	0 %	0 %	283782723
4466	NC_013721	GCA	2	6	241524	241529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782723
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4471	NC_013721	TGC	2	6	241653	241658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782723
4472	NC_013721	AAG	2	6	241670	241675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782723
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4477	NC_013721	AGC	2	6	241879	241884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782723
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4479	NC_013721	AGC	2	6	241925	241930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782723
4480	NC_013721	AAAC	2	8	241970	241977	75 %	0 %	0 %	25 %	283782723
4481	NC_013721	GAT	2	6	242046	242051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782723
4482	NC_013721	TGC	4	12	242088	242099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782723
4483	NC_013721	GAT	2	6	242119	242124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782723
4484	NC_013721	ACGC	2	8	242136	242143	25 %	0 %	25 %	50 %	283782723
4485	NC_013721	TGC	2	6	242193	242198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782723
4486	NC_013721	AGG	2	6	242204	242209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782723
4487	NC_013721	AAAG	2	8	242217	242224	75 %	0 %	25 %	0 %	283782723
4488	NC_013721	GAAAGA	2	12	242247	242258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782723
4489	NC_013721	AGC	2	6	242262	242267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782723
4490	NC_013721	GAA	2	6	242272	242277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782723
4491	NC_013721	TCA	2	6	242310	242315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782723
4492	NC_013721	GCT	2	6	242365	242370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782723
4493	NC_013721	AGG	2	6	242393	242398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283782723
4494	NC_013721	GCAGC	2	10	242428	242437	20 %	0 %	40 %	40 %	283782723
4495	NC_013721	GAC	2	6	242454	242459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782723
4496	NC_013721	GCA	2	6	242475	242480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782723
4497	NC_013721	GATTT	2	10	242546	242555	20 %	60 %	20 %	0 %	283782723
4498	NC_013721	CAA	2	6	242566	242571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782723
4499	NC_013721	CAA	2	6	242575	242580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782723
4500	NC_013721	TCG	2	6	242611	242616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782723

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