MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 28756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013721	TAA	2	6	160115	160120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782648
3002	NC_013721	CAAA	2	8	160243	160250	75 %	0 %	0 %	25 %	283782648
3003	NC_013721	CGG	2	6	160319	160324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782648
3004	NC_013721	A	6	6	160340	160345	100 %	0 %	0 %	0 %	283782648
3005	NC_013721	TTC	2	6	160367	160372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782648
3006	NC_013721	CAA	2	6	160455	160460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782649
3007	NC_013721	TGT	2	6	160482	160487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782649
3008	NC_013721	CTG	2	6	160541	160546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782649
3009	NC_013721	GTA	2	6	160553	160558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782649
3010	NC_013721	ACG	2	6	160637	160642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782649
3011	NC_013721	CGAG	2	8	160700	160707	25 %	0 %	50 %	25 %	283782649
3012	NC_013721	CAAA	2	8	160718	160725	75 %	0 %	0 %	25 %	283782649
3013	NC_013721	ACT	3	9	160825	160833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782649
3014	NC_013721	CAG	2	6	160840	160845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782649
3015	NC_013721	AG	3	6	160874	160879	50 %	0 %	50 %	0 %	283782649
3016	NC_013721	GC	3	6	160909	160914	0 %	0 %	50 %	50 %	283782649
3017	NC_013721	TTC	2	6	160962	160967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782649
3018	NC_013721	TGA	2	6	160997	161002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782649
3019	NC_013721	ATT	2	6	161084	161089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782649
3020	NC_013721	AGTT	2	8	161099	161106	25 %	50 %	25 %	0 %	283782649
3021	NC_013721	CAAA	2	8	161181	161188	75 %	0 %	0 %	25 %	283782649
3022	NC_013721	GTT	2	6	161224	161229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782649
3023	NC_013721	GC	3	6	161230	161235	0 %	0 %	50 %	50 %	283782649
3024	NC_013721	TG	3	6	161244	161249	0 %	50 %	50 %	0 %	283782649
3025	NC_013721	TGA	2	6	161292	161297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782649
3026	NC_013721	ATT	2	6	161307	161312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782649
3027	NC_013721	TAG	2	6	161369	161374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782649
3028	NC_013721	TCC	2	6	161376	161381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283782649
3029	NC_013721	ATT	2	6	161401	161406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782649
3030	NC_013721	AAGC	2	8	161591	161598	50 %	0 %	25 %	25 %	283782650
3031	NC_013721	TTC	2	6	161626	161631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782650
3032	NC_013721	GGC	2	6	161645	161650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782650
3033	NC_013721	TAT	2	6	161750	161755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782650
3034	NC_013721	TGA	2	6	161827	161832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782650
3035	NC_013721	GCA	2	6	161863	161868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782650
3036	NC_013721	CAG	2	6	161945	161950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782650
3037	NC_013721	AAT	2	6	162086	162091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782650
3038	NC_013721	TGC	2	6	162160	162165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782650
3039	NC_013721	ATG	2	6	162201	162206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782650
3040	NC_013721	TTG	2	6	162236	162241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782650
3041	NC_013721	TAATAC	2	12	162250	162261	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	283782650
3042	NC_013721	TGC	2	6	162268	162273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782650
3043	NC_013721	GCT	2	6	162284	162289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782650
3044	NC_013721	ATA	2	6	162294	162299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782650
3045	NC_013721	GAT	2	6	162302	162307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782650
3046	NC_013721	TGA	2	6	162358	162363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782650
3047	NC_013721	GAT	2	6	162464	162469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782650
3048	NC_013721	GC	4	8	162479	162486	0 %	0 %	50 %	50 %	283782650
3049	NC_013721	TCG	2	6	162487	162492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782650
3050	NC_013721	TTC	2	6	162504	162509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782650
3051	NC_013721	ATT	2	6	162517	162522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782650
3052	NC_013721	CAG	2	6	162934	162939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782651
3053	NC_013721	TTG	2	6	162958	162963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782651
3054	NC_013721	A	7	7	162982	162988	100 %	0 %	0 %	0 %	283782651
3055	NC_013721	AAC	2	6	163135	163140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782651
3056	NC_013721	ACG	2	6	163145	163150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782651
3057	NC_013721	TGT	2	6	163155	163160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782651
3058	NC_013721	ACT	2	6	163202	163207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782651
3059	NC_013721	AC	3	6	163243	163248	50 %	0 %	0 %	50 %	283782651
3060	NC_013721	CAA	2	6	163256	163261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782651
3061	NC_013721	A	6	6	163311	163316	100 %	0 %	0 %	0 %	283782651
3062	NC_013721	A	6	6	163330	163335	100 %	0 %	0 %	0 %	283782651
3063	NC_013721	GT	3	6	163343	163348	0 %	50 %	50 %	0 %	283782651
3064	NC_013721	TGA	2	6	163395	163400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782651
3065	NC_013721	ATT	2	6	163668	163673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782651
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3067	NC_013721	CTG	2	6	163772	163777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782651
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3072	NC_013721	ATG	2	6	164402	164407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782652
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3081	NC_013721	TGG	2	6	164748	164753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782652
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3101	NC_013721	ATT	2	6	165813	165818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782654
3102	NC_013721	AAGTA	2	10	165867	165876	60 %	20 %	20 %	0 %	283782654
3103	NC_013721	TTC	2	6	166013	166018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782655
3104	NC_013721	AGCGC	2	10	166052	166061	20 %	0 %	40 %	40 %	283782655
3105	NC_013721	ATG	2	6	166083	166088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782655
3106	NC_013721	TGAT	2	8	166093	166100	25 %	50 %	25 %	0 %	283782655
3107	NC_013721	TGA	2	6	166169	166174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782655
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3109	NC_013721	TAG	2	6	166225	166230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782655
3110	NC_013721	GGT	2	6	166275	166280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782655
3111	NC_013721	ACT	2	6	166329	166334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782655
3112	NC_013721	TTGA	2	8	166368	166375	25 %	50 %	25 %	0 %	283782655
3113	NC_013721	TGG	2	6	166439	166444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782655
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3233	NC_013721	GCAAT	2	10	174116	174125	40 %	20 %	20 %	20 %	283782662
3234	NC_013721	GA	3	6	174142	174147	50 %	0 %	50 %	0 %	283782662
3235	NC_013721	TTGA	2	8	174172	174179	25 %	50 %	25 %	0 %	283782662
3236	NC_013721	A	6	6	174232	174237	100 %	0 %	0 %	0 %	283782662
3237	NC_013721	GC	4	8	174315	174322	0 %	0 %	50 %	50 %	283782663
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3239	NC_013721	AGC	2	6	174346	174351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782663
3240	NC_013721	GGC	2	6	174469	174474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283782663
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3485	NC_013721	CAG	2	6	186813	186818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782674
3486	NC_013721	CAG	2	6	186897	186902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782674
3487	NC_013721	TTC	2	6	186919	186924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782674
3488	NC_013721	TTC	2	6	186931	186936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782674
3489	NC_013721	CAA	2	6	186962	186967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283782674
3490	NC_013721	TCT	2	6	187142	187147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782674
3491	NC_013721	TGCGCG	2	12	187197	187208	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283782674
3492	NC_013721	CTG	3	9	187230	187238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782674
3493	NC_013721	TAT	2	6	187246	187251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782674
3494	NC_013721	GTT	2	6	187289	187294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782674
3495	NC_013721	TGA	2	6	187302	187307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782674
3496	NC_013721	TTC	2	6	187330	187335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782674
3497	NC_013721	GCA	2	6	187342	187347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782674
3498	NC_013721	GAAAT	2	10	187353	187362	60 %	20 %	20 %	0 %	283782674
3499	NC_013721	CTG	2	6	187416	187421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782674
3500	NC_013721	TGCT	2	8	187488	187495	0 %	50 %	25 %	25 %	283782674

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