MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gardnerella vaginalis 409-05 chromosome

Total Repeats: 28756

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013721	TCA	2	6	77899	77904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782579
1502	NC_013721	AAT	2	6	77934	77939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782579
1503	NC_013721	ATT	2	6	77986	77991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782579
1504	NC_013721	TTG	2	6	78029	78034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782579
1505	NC_013721	TA	3	6	78057	78062	50 %	50 %	0 %	0 %	283782579
1506	NC_013721	TAA	2	6	78078	78083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782579
1507	NC_013721	T	6	6	78149	78154	0 %	100 %	0 %	0 %	283782579
1508	NC_013721	TTG	2	6	78188	78193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782579
1509	NC_013721	GTT	2	6	78199	78204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782579
1510	NC_013721	TGC	2	6	78207	78212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782579
1511	NC_013721	AAAAAT	2	12	78278	78289	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	283782579
1512	NC_013721	ATA	2	6	78440	78445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782580
1513	NC_013721	CGT	2	6	78523	78528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782580
1514	NC_013721	AGCA	2	8	78530	78537	50 %	0 %	25 %	25 %	283782580
1515	NC_013721	GTA	2	6	78553	78558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782580
1516	NC_013721	ATT	2	6	78559	78564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782580
1517	NC_013721	GCT	2	6	78580	78585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782580
1518	NC_013721	A	7	7	78628	78634	100 %	0 %	0 %	0 %	283782580
1519	NC_013721	ATA	2	6	78668	78673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782580
1520	NC_013721	GCAA	2	8	78743	78750	50 %	0 %	25 %	25 %	283782580
1521	NC_013721	GCT	2	6	78751	78756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782580
1522	NC_013721	TGA	2	6	78825	78830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782580
1523	NC_013721	TTAA	2	8	78835	78842	50 %	50 %	0 %	0 %	283782580
1524	NC_013721	TGGA	2	8	78893	78900	25 %	25 %	50 %	0 %	283782580
1525	NC_013721	ACTCG	2	10	78917	78926	20 %	20 %	20 %	40 %	283782580
1526	NC_013721	GAA	2	6	79024	79029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782580
1527	NC_013721	GCT	2	6	79143	79148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782580
1528	NC_013721	TAA	2	6	79152	79157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782580
1529	NC_013721	A	7	7	79273	79279	100 %	0 %	0 %	0 %	283782580
1530	NC_013721	A	6	6	79321	79326	100 %	0 %	0 %	0 %	283782580
1531	NC_013721	TTTA	2	8	79480	79487	25 %	75 %	0 %	0 %	283782581
1532	NC_013721	T	6	6	79548	79553	0 %	100 %	0 %	0 %	283782581
1533	NC_013721	CTA	2	6	79622	79627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782581
1534	NC_013721	TTA	2	6	79669	79674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782581
1535	NC_013721	TCT	2	6	79702	79707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782581
1536	NC_013721	TAA	2	6	79721	79726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782581
1537	NC_013721	CTT	2	6	79727	79732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782581
1538	NC_013721	CTT	2	6	79844	79849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782581
1539	NC_013721	TGA	2	6	79880	79885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782581
1540	NC_013721	TTAA	2	8	80032	80039	50 %	50 %	0 %	0 %	283782581
1541	NC_013721	TCA	2	6	80044	80049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782581
1542	NC_013721	CAG	2	6	80117	80122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782581
1543	NC_013721	CTTG	2	8	80123	80130	0 %	50 %	25 %	25 %	283782581
1544	NC_013721	AAG	2	6	80148	80153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782581
1545	NC_013721	TGG	2	6	80178	80183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782581
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1547	NC_013721	T	6	6	80202	80207	0 %	100 %	0 %	0 %	283782581
1548	NC_013721	CTG	2	6	80231	80236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782581
1549	NC_013721	GTT	2	6	80266	80271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782581
1550	NC_013721	ATTG	2	8	80298	80305	25 %	50 %	25 %	0 %	283782581
1551	NC_013721	TAA	2	6	80311	80316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782581
1552	NC_013721	AAT	2	6	80349	80354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283782581
1553	NC_013721	ATT	2	6	80415	80420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782581
1554	NC_013721	TGT	2	6	80421	80426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782581
1555	NC_013721	TTG	3	9	80430	80438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782581
1556	NC_013721	TA	3	6	80717	80722	50 %	50 %	0 %	0 %	283782582
1557	NC_013721	TGA	2	6	80747	80752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782582
1558	NC_013721	ACT	2	6	80820	80825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782582
1559	NC_013721	GGT	2	6	80877	80882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782582
1560	NC_013721	TAC	2	6	80891	80896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782582
1561	NC_013721	GCTTT	2	10	80980	80989	0 %	60 %	20 %	20 %	283782582
1562	NC_013721	GAA	2	6	81012	81017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782582
1563	NC_013721	TGG	2	6	81095	81100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283782582
1564	NC_013721	TCAGCG	2	12	81101	81112	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283782582
1565	NC_013721	TGC	2	6	81218	81223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283782582
1566	NC_013721	TAC	2	6	81245	81250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782582
1567	NC_013721	GCA	2	6	81326	81331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283782582
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1569	NC_013721	CTT	2	6	81465	81470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782582
1570	NC_013721	AGA	2	6	81500	81505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782582
1571	NC_013721	ATT	2	6	81516	81521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782582
1572	NC_013721	AGA	2	6	81536	81541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283782582
1573	NC_013721	GAT	2	6	81561	81566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782582
1574	NC_013721	ATC	2	6	81636	81641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782582
1575	NC_013721	CTA	2	6	81667	81672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782582
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1577	NC_013721	CTC	2	6	82078	82083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283782583
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1582	NC_013721	GTTA	2	8	82457	82464	25 %	50 %	25 %	0 %	283782583
1583	NC_013721	ATT	2	6	82499	82504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283782583
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1588	NC_013721	TGA	2	6	82937	82942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782583
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1591	NC_013721	TGGAT	2	10	83039	83048	20 %	40 %	40 %	0 %	283782583
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1603	NC_013721	TTC	2	6	83899	83904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782584
1604	NC_013721	TGCGGC	2	12	84260	84271	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283782585
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1608	NC_013721	TGT	2	6	84437	84442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782585
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1619	NC_013721	TAG	2	6	84742	84747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283782585
1620	NC_013721	CAT	2	6	84792	84797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283782585
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1998	NC_013721	CTT	2	6	106676	106681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283782602
1999	NC_013721	CG	3	6	106730	106735	0 %	0 %	50 %	50 %	283782602
2000	NC_013721	GTT	2	6	106784	106789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283782602

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