MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Gordonia bronchialis DSM 43247 chromosome

Total Repeats: 93022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013441	GTC	2	6	375	380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200047
2	NC_013441	ACG	3	9	391	399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200047
3	NC_013441	CAA	2	6	432	437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262200047
4	NC_013441	GCT	2	6	488	493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200047
5	NC_013441	CGC	2	6	505	510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200047
6	NC_013441	CGC	2	6	610	615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200047
7	NC_013441	GAA	2	6	621	626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262200047
8	NC_013441	CGA	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200047
9	NC_013441	CAC	2	6	809	814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262200047
10	NC_013441	GTT	2	6	947	952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262200047
11	NC_013441	TCA	2	6	1075	1080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262200047
12	NC_013441	CGA	2	6	1091	1096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200047
13	NC_013441	CGT	2	6	1098	1103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200047
14	NC_013441	TCG	2	6	1144	1149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200047
15	NC_013441	TTC	2	6	1194	1199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262200047
16	NC_013441	TCC	2	6	1245	1250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262200047
17	NC_013441	GCC	2	6	1331	1336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200047
18	NC_013441	AAG	2	6	1368	1373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262200047
19	NC_013441	ACA	2	6	1384	1389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262200047
20	NC_013441	CGA	2	6	1400	1405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200047
21	NC_013441	CAA	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262200047
22	NC_013441	GCT	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200047
23	NC_013441	GCG	2	6	1575	1580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200047
24	NC_013441	GGA	2	6	1622	1627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262200047
25	NC_013441	GCG	2	6	1796	1801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200047
26	NC_013441	CCG	2	6	2521	2526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200048
27	NC_013441	CGA	2	6	2559	2564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200048
28	NC_013441	CGC	2	6	2616	2621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200048
29	NC_013441	GCT	2	6	2661	2666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200048
30	NC_013441	CAA	2	6	2691	2696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262200048
31	NC_013441	CGA	2	6	2765	2770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200048
32	NC_013441	GGA	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262200048
33	NC_013441	CGC	2	6	2868	2873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200048
34	NC_013441	GCA	2	6	2927	2932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200048
35	NC_013441	GTG	2	6	2935	2940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262200048
36	NC_013441	CGC	2	6	2943	2948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200048
37	NC_013441	ACG	2	6	3122	3127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200048
38	NC_013441	CAC	3	9	3159	3167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262200048
39	NC_013441	GCT	2	6	3171	3176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200048
40	NC_013441	CCA	2	6	3233	3238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262200048
41	NC_013441	CCG	2	6	3341	3346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200048
42	NC_013441	GCG	2	6	3347	3352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200048
43	NC_013441	GAA	2	6	3373	3378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262200048
44	NC_013441	CAC	2	6	3483	3488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262200048
45	NC_013441	GTG	2	6	3521	3526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262200048
46	NC_013441	AGC	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200048
47	NC_013441	CTG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200049
48	NC_013441	CGC	2	6	3705	3710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200049
49	NC_013441	CAA	2	6	3918	3923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262200049
50	NC_013441	CCG	2	6	3943	3948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200049
51	NC_013441	GTT	2	6	3987	3992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262200049
52	NC_013441	GGA	2	6	3999	4004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262200049
53	NC_013441	CGA	2	6	4050	4055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200049
54	NC_013441	TCG	2	6	4058	4063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200049
55	NC_013441	CGG	2	6	4164	4169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200049
56	NC_013441	CGG	2	6	4346	4351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200049
57	NC_013441	GCC	2	6	4368	4373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200049
58	NC_013441	GCT	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200049
59	NC_013441	CGA	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200049
60	NC_013441	CAT	2	6	4497	4502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262200049
61	NC_013441	CGA	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200049
62	NC_013441	CGA	2	6	4626	4631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200049
63	NC_013441	CGT	2	6	4660	4665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200049
64	NC_013441	AGC	2	6	4694	4699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200049
65	NC_013441	CGA	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200049
66	NC_013441	CGG	2	6	4743	4748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200049
67	NC_013441	CGG	2	6	4750	4755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200049
68	NC_013441	CGA	2	6	4773	4778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200049
69	NC_013441	GTC	2	6	4787	4792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200049
70	NC_013441	GCT	2	6	4810	4815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200049
71	NC_013441	CGG	2	6	4900	4905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200050
72	NC_013441	GCC	2	6	4943	4948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200050
73	NC_013441	CGT	2	6	4997	5002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200050
74	NC_013441	AAG	2	6	5018	5023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262200050
75	NC_013441	CGC	2	6	5176	5181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200050
76	NC_013441	ATC	2	6	5276	5281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262200050
77	NC_013441	CGC	2	6	5290	5295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200050
78	NC_013441	CGT	2	6	5319	5324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200050
79	NC_013441	AAG	2	6	5797	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262200051
80	NC_013441	GTC	2	6	5923	5928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200051
81	NC_013441	CGA	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200051
82	NC_013441	GCT	2	6	5982	5987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200051
83	NC_013441	GGT	2	6	5995	6000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262200051
84	NC_013441	CGA	2	6	6012	6017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200051
85	NC_013441	GGT	2	6	6069	6074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262200051
86	NC_013441	GGC	2	6	6094	6099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200051
87	NC_013441	CGG	2	6	6129	6134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200051
88	NC_013441	CCA	2	6	6173	6178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262200051
89	NC_013441	CGG	2	6	6201	6206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200051
90	NC_013441	ACC	2	6	6322	6327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262200051
91	NC_013441	CAA	2	6	6378	6383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262200051
92	NC_013441	AGC	2	6	6587	6592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200051
93	NC_013441	CAA	2	6	6768	6773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262200051
94	NC_013441	AAG	2	6	6787	6792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262200051
95	NC_013441	CTG	2	6	6793	6798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200051
96	NC_013441	CGA	2	6	6825	6830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200051
97	NC_013441	AGA	2	6	6938	6943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262200051
98	NC_013441	ATC	3	9	6997	7005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262200051
99	NC_013441	AAG	2	6	7006	7011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262200051
100	NC_013441	CGC	2	6	7038	7043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200051
101	NC_013441	GCG	2	6	7065	7070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200051
102	NC_013441	CGG	2	6	7089	7094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200051
103	NC_013441	GCA	2	6	7121	7126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200051
104	NC_013441	CCG	2	6	7169	7174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200051
105	NC_013441	TTC	2	6	7217	7222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262200051
106	NC_013441	ATC	2	6	7237	7242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262200051
107	NC_013441	GAA	2	6	7275	7280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262200051
108	NC_013441	CAT	2	6	7296	7301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262200051
109	NC_013441	ACG	2	6	7325	7330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200051
110	NC_013441	ACA	2	6	7395	7400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262200051
111	NC_013441	TGC	2	6	7412	7417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200051
112	NC_013441	GCT	2	6	7422	7427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200051
113	NC_013441	GCC	2	6	7479	7484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200051
114	NC_013441	CGA	2	6	7593	7598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200051
115	NC_013441	ACC	2	6	7654	7659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262200051
116	NC_013441	TGC	2	6	7679	7684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200051
117	NC_013441	CGA	2	6	7698	7703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200051
118	NC_013441	CGC	2	6	7704	7709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200051
119	NC_013441	CGA	2	6	7716	7721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200051
120	NC_013441	GCC	2	6	7753	7758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200051
121	NC_013441	CGC	2	6	7759	7764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200051
122	NC_013441	CCG	2	6	8019	8024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200052
123	NC_013441	ACG	2	6	8042	8047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200052
124	NC_013441	ACG	2	6	8141	8146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200052
125	NC_013441	ACG	2	6	8225	8230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200052
126	NC_013441	GCC	3	9	8233	8241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200052
127	NC_013441	TGC	2	6	8285	8290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200052
128	NC_013441	CGA	2	6	8298	8303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200052
129	NC_013441	ACG	2	6	8330	8335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200052
130	NC_013441	CTG	2	6	8380	8385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200052
131	NC_013441	CGG	2	6	8397	8402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200052
132	NC_013441	CCA	2	6	8420	8425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262200052
133	NC_013441	CGC	2	6	8432	8437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200052
134	NC_013441	CGA	3	9	8493	8501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200052
135	NC_013441	GCA	2	6	8609	8614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200052
136	NC_013441	GGT	2	6	8628	8633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262200052
137	NC_013441	GAG	2	6	8641	8646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262200052
138	NC_013441	CAC	2	6	8655	8660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262200052
139	NC_013441	TCG	2	6	8666	8671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200052
140	NC_013441	TCG	2	6	8801	8806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200052
141	NC_013441	GGT	2	6	8835	8840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262200052
142	NC_013441	AAC	2	6	8845	8850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262200052
143	NC_013441	TCG	2	6	8903	8908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200052
144	NC_013441	GAT	2	6	8940	8945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262200052
145	NC_013441	TAC	2	6	8950	8955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262200052
146	NC_013441	GCC	2	6	9106	9111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200052
147	NC_013441	CGA	2	6	9141	9146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200052
148	NC_013441	GCG	2	6	9180	9185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200052
149	NC_013441	AGA	2	6	9206	9211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262200052
150	NC_013441	TCG	2	6	9212	9217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200052
151	NC_013441	GGT	2	6	9312	9317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262200052
152	NC_013441	TCG	2	6	9339	9344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200052
153	NC_013441	ATC	2	6	9352	9357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262200052
154	NC_013441	GCC	2	6	9358	9363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200052
155	NC_013441	CGA	2	6	9378	9383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200052
156	NC_013441	GTC	2	6	9409	9414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200052
157	NC_013441	GCG	2	6	9476	9481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200052
158	NC_013441	GAC	2	6	9514	9519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200052
159	NC_013441	CTT	2	6	9531	9536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262200052
160	NC_013441	TTC	2	6	9565	9570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262200052
161	NC_013441	ACC	2	6	9571	9576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262200052
162	NC_013441	GCA	2	6	9639	9644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200052
163	NC_013441	CTG	2	6	9655	9660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200052
164	NC_013441	GGA	2	6	9672	9677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262200052
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166	NC_013441	CGG	2	6	9795	9800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200052
167	NC_013441	CGC	2	6	9804	9809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200052
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171	NC_013441	CGA	3	9	9915	9923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200052
172	NC_013441	CGA	2	6	9981	9986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200052
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199	NC_013441	TCA	2	6	11197	11202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262200053
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203	NC_013441	CGA	2	6	11318	11323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200053
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212	NC_013441	CGA	2	6	12104	12109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200054
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221	NC_013441	CGC	2	6	12410	12415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200054
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223	NC_013441	GCA	2	6	12453	12458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200054
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233	NC_013441	CAT	2	6	13027	13032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262200055
234	NC_013441	CGA	2	6	13095	13100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200055
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245	NC_013441	GGC	2	6	13844	13849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200055
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249	NC_013441	GTC	2	6	14056	14061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200055
250	NC_013441	TCG	2	6	14114	14119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200055
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252	NC_013441	ACG	2	6	14234	14239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200055
253	NC_013441	CAC	2	6	14247	14252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262200055
254	NC_013441	CCG	2	6	14254	14259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200055
255	NC_013441	ACC	2	6	14271	14276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262200055
256	NC_013441	GGA	2	6	14323	14328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262200055
257	NC_013441	GCC	2	6	14339	14344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200055
258	NC_013441	CTT	2	6	14614	14619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262200056
259	NC_013441	CTG	2	6	14678	14683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200056
260	NC_013441	TTC	2	6	14706	14711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262200056
261	NC_013441	CGG	2	6	14811	14816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200056
262	NC_013441	TCG	2	6	14820	14825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200056
263	NC_013441	GAC	2	6	14846	14851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200056
264	NC_013441	CGG	2	6	14926	14931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200056
265	NC_013441	CTC	2	6	14957	14962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262200056
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271	NC_013441	CGA	2	6	15387	15392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200056
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283	NC_013441	CGA	2	6	17305	17310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200057
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289	NC_013441	GTC	2	6	17628	17633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200057
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292	NC_013441	GTC	2	6	17781	17786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200057
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303	NC_013441	GCA	2	6	18263	18268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262200058
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364	NC_013441	GTC	2	6	21989	21994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200064
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372	NC_013441	CGG	2	6	22245	22250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262200065
373	NC_013441	TCA	2	6	22290	22295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262200065
374	NC_013441	CGC	2	6	22351	22356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	262200065
375	NC_013441	CTG	2	6	22415	22420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262200065
376	NC_013441	TCC	2	6	22431	22436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262200065
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