MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Geobacter sp. FRC-32 chromosome

Total Repeats: 2353

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011979	ATCAG	2	10	678	687	40 %	20 %	20 %	20 %	222053118
2	NC_011979	AGGAA	2	10	3901	3910	60 %	0 %	40 %	0 %	222053120
3	NC_011979	TGAAG	2	10	5093	5102	40 %	20 %	40 %	0 %	222053121
4	NC_011979	TGAAA	2	10	6533	6542	60 %	20 %	20 %	0 %	222053122
5	NC_011979	AAGGC	2	10	7296	7305	40 %	0 %	40 %	20 %	222053122
6	NC_011979	ATGCA	2	10	9102	9111	40 %	20 %	20 %	20 %	222053123
7	NC_011979	CCCTT	2	10	11001	11010	0 %	40 %	0 %	60 %	222053124
8	NC_011979	CAAAT	2	10	11990	11999	60 %	20 %	0 %	20 %	222053125
9	NC_011979	TCGGT	2	10	14884	14893	0 %	40 %	40 %	20 %	222053126
10	NC_011979	GCCAA	2	10	15059	15068	40 %	0 %	20 %	40 %	222053126
11	NC_011979	CACCG	2	10	22203	22212	20 %	0 %	20 %	60 %	222053130
12	NC_011979	CCGTG	2	10	24151	24160	0 %	20 %	40 %	40 %	222053133
13	NC_011979	TTTCC	2	10	24373	24382	0 %	60 %	0 %	40 %	222053133
14	NC_011979	CCTTG	2	10	24633	24642	0 %	40 %	20 %	40 %	222053134
15	NC_011979	TGGCT	2	10	25279	25288	0 %	40 %	40 %	20 %	222053134
16	NC_011979	TGCGG	2	10	26763	26772	0 %	20 %	60 %	20 %	222053134
17	NC_011979	GATCA	2	10	28609	28618	40 %	20 %	20 %	20 %	222053137
18	NC_011979	CGTTC	2	10	28722	28731	0 %	40 %	20 %	40 %	222053138
19	NC_011979	TGCCA	2	10	29101	29110	20 %	20 %	20 %	40 %	222053138
20	NC_011979	CGAGG	2	10	29634	29643	20 %	0 %	60 %	20 %	222053138
21	NC_011979	AGGAA	2	10	31580	31589	60 %	0 %	40 %	0 %	222053139
22	NC_011979	TCGAT	2	10	31649	31658	20 %	40 %	20 %	20 %	222053139
23	NC_011979	GCAGG	2	10	34806	34815	20 %	0 %	60 %	20 %	222053142
24	NC_011979	CCCGA	2	10	36941	36950	20 %	0 %	20 %	60 %	222053144
25	NC_011979	CCGCA	2	10	42227	42236	20 %	0 %	20 %	60 %	222053150
26	NC_011979	GCAAG	2	10	42911	42920	40 %	0 %	40 %	20 %	222053151
27	NC_011979	TGGAA	2	10	43330	43339	40 %	20 %	40 %	0 %	222053151
28	NC_011979	CCCTT	2	10	47490	47499	0 %	40 %	0 %	60 %	222053154
29	NC_011979	CGCTC	2	10	48279	48288	0 %	20 %	20 %	60 %	222053155
30	NC_011979	GCGAC	2	10	48513	48522	20 %	0 %	40 %	40 %	222053155
31	NC_011979	GGATG	2	10	49122	49131	20 %	20 %	60 %	0 %	222053156
32	NC_011979	AGCTG	2	10	49691	49700	20 %	20 %	40 %	20 %	222053156
33	NC_011979	GCCGA	2	10	52122	52131	20 %	0 %	40 %	40 %	222053159
34	NC_011979	CGGCT	2	10	54863	54872	0 %	20 %	40 %	40 %	222053163
35	NC_011979	CTGGG	2	10	55392	55401	0 %	20 %	60 %	20 %	222053163
36	NC_011979	GAAGT	2	10	57473	57482	40 %	20 %	40 %	0 %	222053164
37	NC_011979	GGGCA	2	10	59143	59152	20 %	0 %	60 %	20 %	222053166
38	NC_011979	GATGG	2	10	60075	60084	20 %	20 %	60 %	0 %	222053166
39	NC_011979	TTTTG	2	10	66314	66323	0 %	80 %	20 %	0 %	222053169
40	NC_011979	CTGGC	2	10	67623	67632	0 %	20 %	40 %	40 %	222053170
41	NC_011979	TTCCG	2	10	67665	67674	0 %	40 %	20 %	40 %	222053170
42	NC_011979	TGCCG	2	10	69490	69499	0 %	20 %	40 %	40 %	222053171
43	NC_011979	TGGCA	2	10	70854	70863	20 %	20 %	40 %	20 %	222053173
44	NC_011979	CTGAA	2	10	71070	71079	40 %	20 %	20 %	20 %	222053173
45	NC_011979	CGGCG	2	10	71143	71152	0 %	0 %	60 %	40 %	222053173
46	NC_011979	TGTCC	2	10	75011	75020	0 %	40 %	20 %	40 %	222053175
47	NC_011979	GTAGC	2	10	76829	76838	20 %	20 %	40 %	20 %	222053177
48	NC_011979	CGTAC	2	10	77192	77201	20 %	20 %	20 %	40 %	222053178
49	NC_011979	TGATC	2	10	82480	82489	20 %	40 %	20 %	20 %	222053182
50	NC_011979	CCGGT	2	10	84780	84789	0 %	20 %	40 %	40 %	222053184
51	NC_011979	TCCTT	2	10	85345	85354	0 %	60 %	0 %	40 %	222053185
52	NC_011979	GGCCA	2	10	86353	86362	20 %	0 %	40 %	40 %	222053185
53	NC_011979	GATCG	2	10	86440	86449	20 %	20 %	40 %	20 %	222053185
54	NC_011979	CAGGC	2	10	89278	89287	20 %	0 %	40 %	40 %	222053186
55	NC_011979	TTCGT	2	10	93675	93684	0 %	60 %	20 %	20 %	222053188
56	NC_011979	TCCGA	2	10	94071	94080	20 %	20 %	20 %	40 %	222053188
57	NC_011979	GGTGA	2	10	94236	94245	20 %	20 %	60 %	0 %	222053188
58	NC_011979	GATGG	2	10	98658	98667	20 %	20 %	60 %	0 %	222053191
59	NC_011979	CGGTC	2	10	99194	99203	0 %	20 %	40 %	40 %	222053191
60	NC_011979	GCTCG	2	10	105077	105086	0 %	20 %	40 %	40 %	222053194
61	NC_011979	GGAAG	2	10	105877	105886	40 %	0 %	60 %	0 %	222053195
62	NC_011979	GGGAT	2	10	112299	112308	20 %	20 %	60 %	0 %	222053200
63	NC_011979	GACGG	2	10	113345	113354	20 %	0 %	60 %	20 %	222053201
64	NC_011979	ACTGG	2	10	114771	114780	20 %	20 %	40 %	20 %	222053202
65	NC_011979	TAAGG	2	10	115287	115296	40 %	20 %	40 %	0 %	222053202
66	NC_011979	CTTAT	2	10	116294	116303	20 %	60 %	0 %	20 %	222053203
67	NC_011979	CAGCC	2	10	116561	116570	20 %	0 %	20 %	60 %	222053203
68	NC_011979	CCTGC	2	10	117831	117840	0 %	20 %	20 %	60 %	222053204
69	NC_011979	GAAGA	2	10	119547	119556	60 %	0 %	40 %	0 %	222053207
70	NC_011979	AGGGA	2	10	120710	120719	40 %	0 %	60 %	0 %	222053209
71	NC_011979	GGCAA	2	10	121922	121931	40 %	0 %	40 %	20 %	222053210
72	NC_011979	GAGCT	2	10	126254	126263	20 %	20 %	40 %	20 %	222053214
73	NC_011979	TTTCC	2	10	126655	126664	0 %	60 %	0 %	40 %	222053214
74	NC_011979	GCGTG	2	10	130099	130108	0 %	20 %	60 %	20 %	222053218
75	NC_011979	TGCCG	2	10	131235	131244	0 %	20 %	40 %	40 %	222053219
76	NC_011979	TGGCG	2	10	132224	132233	0 %	20 %	60 %	20 %	222053219
77	NC_011979	CGGGC	2	10	132382	132391	0 %	0 %	60 %	40 %	222053219
78	NC_011979	CAACT	2	10	136381	136390	40 %	20 %	0 %	40 %	222053226
79	NC_011979	TTGAA	2	10	140829	140838	40 %	40 %	20 %	0 %	222053230
80	NC_011979	TTCCA	2	10	141953	141962	20 %	40 %	0 %	40 %	222053231
81	NC_011979	AACGA	2	10	144248	144257	60 %	0 %	20 %	20 %	222053232
82	NC_011979	CATGG	2	10	147638	147647	20 %	20 %	40 %	20 %	222053238
83	NC_011979	ACTGC	2	10	148330	148339	20 %	20 %	20 %	40 %	222053239
84	NC_011979	GCCGG	2	10	149420	149429	0 %	0 %	60 %	40 %	222053239
85	NC_011979	TTTAT	2	10	153851	153860	20 %	80 %	0 %	0 %	222053242
86	NC_011979	GCAGC	2	10	154295	154304	20 %	0 %	40 %	40 %	222053243
87	NC_011979	CGTCC	2	10	155985	155994	0 %	20 %	20 %	60 %	222053244
88	NC_011979	TTTGA	2	10	156352	156361	20 %	60 %	20 %	0 %	222053244
89	NC_011979	GTGCC	2	10	157936	157945	0 %	20 %	40 %	40 %	222053246
90	NC_011979	TGGTC	2	10	160433	160442	0 %	40 %	40 %	20 %	222053247
91	NC_011979	TGGAC	2	10	165503	165512	20 %	20 %	40 %	20 %	222053253
92	NC_011979	TCAGG	2	10	166524	166533	20 %	20 %	40 %	20 %	222053254
93	NC_011979	GAAGG	2	10	166665	166674	40 %	0 %	60 %	0 %	222053254
94	NC_011979	GCCTT	2	10	167953	167962	0 %	40 %	20 %	40 %	222053255
95	NC_011979	TTCCG	2	10	171417	171426	0 %	40 %	20 %	40 %	222053256
96	NC_011979	GCCGT	2	10	175013	175022	0 %	20 %	40 %	40 %	222053258
97	NC_011979	GAGAG	2	10	176731	176740	40 %	0 %	60 %	0 %	222053259
98	NC_011979	TGTTC	2	10	183646	183655	0 %	60 %	20 %	20 %	222053264
99	NC_011979	CTCAG	2	10	185704	185713	20 %	20 %	20 %	40 %	222053265
100	NC_011979	CCAGG	2	10	189191	189200	20 %	0 %	40 %	40 %	222053267
101	NC_011979	CGTCA	2	10	190495	190504	20 %	20 %	20 %	40 %	222053268
102	NC_011979	GCCAT	2	10	193641	193650	20 %	20 %	20 %	40 %	222053272
103	NC_011979	GATCC	2	10	193916	193925	20 %	20 %	20 %	40 %	222053272
104	NC_011979	TGATC	2	10	194887	194896	20 %	40 %	20 %	20 %	222053273
105	NC_011979	CTTCT	2	10	197544	197553	0 %	60 %	0 %	40 %	222053275
106	NC_011979	TTCCT	2	10	201701	201710	0 %	60 %	0 %	40 %	222053277
107	NC_011979	GAGGT	2	10	202929	202938	20 %	20 %	60 %	0 %	222053278
108	NC_011979	TTCCG	2	10	207454	207463	0 %	40 %	20 %	40 %	222053281
109	NC_011979	TTTTC	2	10	207656	207665	0 %	80 %	0 %	20 %	222053281
110	NC_011979	CGATC	2	10	208160	208169	20 %	20 %	20 %	40 %	222053281
111	NC_011979	CTTCT	2	10	209463	209472	0 %	60 %	0 %	40 %	222053283
112	NC_011979	AGGGA	2	10	215080	215089	40 %	0 %	60 %	0 %	222053287
113	NC_011979	TGACC	2	10	220660	220669	20 %	20 %	20 %	40 %	222053291
114	NC_011979	TTGGT	2	10	222794	222803	0 %	60 %	40 %	0 %	222053293
115	NC_011979	GACCG	2	10	233993	234002	20 %	0 %	40 %	40 %	222053306
116	NC_011979	CCGAG	2	10	234228	234237	20 %	0 %	40 %	40 %	222053306
117	NC_011979	GGTCA	2	10	238511	238520	20 %	20 %	40 %	20 %	222053310
118	NC_011979	GGCCG	2	10	239024	239033	0 %	0 %	60 %	40 %	222053310
119	NC_011979	TGCAG	2	10	244128	244137	20 %	20 %	40 %	20 %	222053313
120	NC_011979	CCGAG	2	10	246019	246028	20 %	0 %	40 %	40 %	222053315
121	NC_011979	CGAAG	2	10	246511	246520	40 %	0 %	40 %	20 %	222053315
122	NC_011979	GGGCA	2	10	248143	248152	20 %	0 %	60 %	20 %	222053316
123	NC_011979	TGCTG	2	10	248360	248369	0 %	40 %	40 %	20 %	222053316
124	NC_011979	CTTGG	2	10	248839	248848	0 %	40 %	40 %	20 %	222053316
125	NC_011979	AGGAA	2	10	249793	249802	60 %	0 %	40 %	0 %	222053318
126	NC_011979	CCATG	2	10	256609	256618	20 %	20 %	20 %	40 %	222053324
127	NC_011979	AAAAG	2	10	257117	257126	80 %	0 %	20 %	0 %	222053325
128	NC_011979	GGATG	2	10	257498	257507	20 %	20 %	60 %	0 %	222053325
129	NC_011979	AGATC	2	10	262250	262259	40 %	20 %	20 %	20 %	222053328
130	NC_011979	CGGTG	2	10	264531	264540	0 %	20 %	60 %	20 %	222053329
131	NC_011979	CTCTG	2	10	265143	265152	0 %	40 %	20 %	40 %	222053330
132	NC_011979	GGTCG	2	10	266136	266145	0 %	20 %	60 %	20 %	222053331
133	NC_011979	CTAAG	2	10	266401	266410	40 %	20 %	20 %	20 %	222053332
134	NC_011979	CCGTC	2	10	268299	268308	0 %	20 %	20 %	60 %	222053333
135	NC_011979	TGCCG	2	10	271691	271700	0 %	20 %	40 %	40 %	222053335
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139	NC_011979	CCCGA	2	10	277335	277344	20 %	0 %	20 %	60 %	222053338
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242	NC_011979	GAAAA	2	10	481250	481259	80 %	0 %	20 %	0 %	222053513
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252	NC_011979	GCTCA	2	10	501390	501399	20 %	20 %	20 %	40 %	222053532
253	NC_011979	GCAGA	2	10	506346	506355	40 %	0 %	40 %	20 %	222053537
254	NC_011979	CTGAT	2	10	511084	511093	20 %	40 %	20 %	20 %	222053543
255	NC_011979	TTCCT	2	10	512765	512774	0 %	60 %	0 %	40 %	222053544
256	NC_011979	TTCTG	2	10	520318	520327	0 %	60 %	20 %	20 %	222053550
257	NC_011979	GCCGT	2	10	521379	521388	0 %	20 %	40 %	40 %	222053551
258	NC_011979	GCAGT	2	10	527025	527034	20 %	20 %	40 %	20 %	222053557
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260	NC_011979	AGGAA	2	10	528254	528263	60 %	0 %	40 %	0 %	222053558
261	NC_011979	GCGCG	2	10	530306	530315	0 %	0 %	60 %	40 %	222053561
262	NC_011979	TGATT	2	10	532327	532336	20 %	60 %	20 %	0 %	222053563
263	NC_011979	TATGG	2	10	533441	533450	20 %	40 %	40 %	0 %	222053564
264	NC_011979	TGTGG	2	10	537101	537110	0 %	40 %	60 %	0 %	222053570
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