MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5 plasmid pGDIPal5II

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010123	GTC	2	6	56	61	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986652
2	NC_010123	CTC	2	6	135	140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161986652
3	NC_010123	CCG	2	6	240	245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986652
4	NC_010123	GAT	2	6	274	279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986652
5	NC_010123	CCG	2	6	385	390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986652
6	NC_010123	CGC	2	6	465	470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986652
7	NC_010123	TCA	3	9	585	593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986652
8	NC_010123	GTA	2	6	630	635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986652
9	NC_010123	GAT	2	6	657	662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986652
10	NC_010123	TCT	2	6	676	681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986652
11	NC_010123	TGA	2	6	709	714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986652
12	NC_010123	GAC	2	6	823	828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986652
13	NC_010123	TCC	2	6	1080	1085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161986652
14	NC_010123	ATG	2	6	1259	1264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986652
15	NC_010123	GTC	2	6	1307	1312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986652
16	NC_010123	ACG	2	6	1419	1424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986652
17	NC_010123	TGA	2	6	1432	1437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986652
18	NC_010123	CAG	2	6	1460	1465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986652
19	NC_010123	CCA	2	6	1551	1556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986652
20	NC_010123	CCG	2	6	2302	2307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
21	NC_010123	CCG	2	6	2372	2377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
22	NC_010123	CAG	2	6	2451	2456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986653
23	NC_010123	CGC	2	6	2463	2468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
24	NC_010123	CCG	2	6	2481	2486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
25	NC_010123	CGC	2	6	2574	2579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
26	NC_010123	TCG	2	6	2611	2616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986653
27	NC_010123	TCA	2	6	2624	2629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986653
28	NC_010123	CCG	2	6	2673	2678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
29	NC_010123	CGA	2	6	2696	2701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986653
30	NC_010123	CAC	2	6	2706	2711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986653
31	NC_010123	TTC	2	6	2733	2738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161986653
32	NC_010123	GCA	2	6	2759	2764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986653
33	NC_010123	CGG	2	6	2816	2821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986653
34	NC_010123	TGC	2	6	2921	2926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986653
35	NC_010123	TTG	2	6	3040	3045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161986653
36	NC_010123	CGC	2	6	3060	3065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
37	NC_010123	CCG	2	6	3092	3097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
38	NC_010123	CGT	2	6	3225	3230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986653
39	NC_010123	CCA	2	6	3257	3262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986653
40	NC_010123	CCG	2	6	3269	3274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986653
41	NC_010123	TCG	2	6	3277	3282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986653
42	NC_010123	GAA	2	6	3672	3677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161986654
43	NC_010123	GTC	2	6	3716	3721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986654
44	NC_010123	TGT	2	6	3904	3909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161986654
45	NC_010123	TCG	2	6	3927	3932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986654
46	NC_010123	GAC	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986654
47	NC_010123	GCA	2	6	4042	4047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986654
48	NC_010123	CGG	2	6	4048	4053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986654
49	NC_010123	ACG	2	6	4152	4157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986654
50	NC_010123	AGC	2	6	4176	4181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986654
51	NC_010123	CCG	2	6	4197	4202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986654
52	NC_010123	GAT	2	6	4734	4739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986655
53	NC_010123	AGC	2	6	4835	4840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986655
54	NC_010123	GGC	2	6	4895	4900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986655
55	NC_010123	CAC	2	6	5011	5016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986655
56	NC_010123	GGT	2	6	5047	5052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986655
57	NC_010123	CAT	2	6	5102	5107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986656
58	NC_010123	GCC	2	6	5165	5170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986656
59	NC_010123	GCA	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986656
60	NC_010123	CAC	2	6	5279	5284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986656
61	NC_010123	ACC	2	6	5356	5361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986656
62	NC_010123	CGG	2	6	5409	5414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986656
63	NC_010123	CGA	3	9	5431	5439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986656
64	NC_010123	CAG	2	6	5606	5611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986657
65	NC_010123	CGC	2	6	5651	5656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986657
66	NC_010123	TGG	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986657
67	NC_010123	CGG	2	6	5764	5769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986657
68	NC_010123	GCG	2	6	5855	5860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986658
69	NC_010123	AGG	2	6	5987	5992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161986658
70	NC_010123	GCG	2	6	6028	6033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986659
71	NC_010123	GGC	2	6	6042	6047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986659
72	NC_010123	GGC	2	6	6077	6082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986659
73	NC_010123	GCC	2	6	6136	6141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986659
74	NC_010123	CCA	2	6	6152	6157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986659
75	NC_010123	CAG	2	6	6222	6227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986659
76	NC_010123	GCA	2	6	6263	6268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986659
77	NC_010123	GCC	2	6	6328	6333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986659
78	NC_010123	GCA	2	6	6347	6352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986659
79	NC_010123	GCC	2	6	6355	6360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986659
80	NC_010123	GAC	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986659
81	NC_010123	GTG	2	6	6420	6425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986659
82	NC_010123	CGC	2	6	6541	6546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986659
83	NC_010123	CGT	2	6	6585	6590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986659
84	NC_010123	CGC	2	6	6599	6604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986659
85	NC_010123	CGG	2	6	6661	6666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986660
86	NC_010123	GCG	2	6	6974	6979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986660
87	NC_010123	GCC	2	6	7091	7096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986660
88	NC_010123	GTG	2	6	7290	7295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986660
89	NC_010123	CGC	2	6	7313	7318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986660
90	NC_010123	CCA	2	6	7387	7392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986660
91	NC_010123	CAA	2	6	7429	7434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986660
92	NC_010123	GGC	2	6	7442	7447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986660
93	NC_010123	GAA	2	6	7571	7576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161986660
94	NC_010123	GAG	2	6	7606	7611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161986660
95	NC_010123	GCG	2	6	7675	7680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986660
96	NC_010123	CGA	2	6	7688	7693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986661
97	NC_010123	CGG	2	6	7717	7722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986661
98	NC_010123	GCG	3	9	7742	7750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986661
99	NC_010123	CGG	2	6	7761	7766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986661
100	NC_010123	GCC	2	6	7840	7845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986661
101	NC_010123	CGA	2	6	7911	7916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986661
102	NC_010123	GCG	2	6	7947	7952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986661
103	NC_010123	TTA	2	6	8191	8196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986662
104	NC_010123	GAT	2	6	8260	8265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986662
105	NC_010123	CAA	2	6	8296	8301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986662
106	NC_010123	GGC	2	6	8321	8326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986662
107	NC_010123	GCC	2	6	8365	8370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986662
108	NC_010123	GCC	2	6	8486	8491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986662
109	NC_010123	GCG	2	6	8508	8513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986662
110	NC_010123	CAG	2	6	8548	8553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986662
111	NC_010123	CGA	2	6	8997	9002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986662
112	NC_010123	CAC	2	6	9047	9052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161986662
113	NC_010123	CGC	2	6	9094	9099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986662
114	NC_010123	CAG	2	6	9325	9330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986662
115	NC_010123	GTG	2	6	9385	9390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986662
116	NC_010123	GAG	2	6	9433	9438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161986662
117	NC_010123	TCC	2	6	9603	9608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161986663
118	NC_010123	CCG	2	6	9733	9738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986663
119	NC_010123	CTG	2	6	9775	9780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986663
120	NC_010123	GGC	2	6	9919	9924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986663
121	NC_010123	GGC	2	6	9985	9990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986663
122	NC_010123	CGC	2	6	10023	10028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986663
123	NC_010123	ACA	2	6	10054	10059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161986663
124	NC_010123	CAG	2	6	10542	10547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986664
125	NC_010123	GCC	2	6	10569	10574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986664
126	NC_010123	CCG	2	6	10620	10625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986664
127	NC_010123	CAG	2	6	10637	10642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986664
128	NC_010123	GCG	2	6	10771	10776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986665
129	NC_010123	GAA	2	6	10815	10820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161986665
130	NC_010123	CGC	2	6	10827	10832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986665
131	NC_010123	CGC	2	6	10864	10869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986665
132	NC_010123	CGG	2	6	10880	10885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986665
133	NC_010123	CGC	2	6	11008	11013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986665
134	NC_010123	ATC	2	6	11033	11038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986665
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138	NC_010123	CGA	2	6	11437	11442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986666
139	NC_010123	CGA	2	6	11488	11493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986666
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143	NC_010123	GCC	2	6	12277	12282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986667
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145	NC_010123	CGA	2	6	12442	12447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986667
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147	NC_010123	GAA	2	6	12497	12502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161986667
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153	NC_010123	CGC	2	6	12857	12862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986668
154	NC_010123	CGG	2	6	12870	12875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986668
155	NC_010123	ACG	2	6	13125	13130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986668
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159	NC_010123	GGC	2	6	13742	13747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161986669
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163	NC_010123	CCG	2	6	14285	14290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161986670
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187	NC_010123	CTA	2	6	16427	16432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986672
188	NC_010123	CAG	2	6	16542	16547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986672

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.