MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gluconobacter oxydans 621H plasmid pGOX4

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006675	GGAA	2	8	130	137	50 %	0 %	50 %	0 %	58038468
2	NC_006675	CACG	2	8	175	182	25 %	0 %	25 %	50 %	58038468
3	NC_006675	AGC	2	6	190	195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038468
4	NC_006675	TCGC	2	8	215	222	0 %	25 %	25 %	50 %	58038468
5	NC_006675	GAG	2	6	233	238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038468
6	NC_006675	AGA	2	6	297	302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038468
7	NC_006675	GACG	2	8	340	347	25 %	0 %	50 %	25 %	58038468
8	NC_006675	GAT	2	6	352	357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038468
9	NC_006675	TGC	2	6	381	386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038468
10	NC_006675	CA	3	6	631	636	50 %	0 %	0 %	50 %	58038468
11	NC_006675	CAT	2	6	694	699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038468
12	NC_006675	ATC	2	6	846	851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038468
13	NC_006675	AC	3	6	944	949	50 %	0 %	0 %	50 %	58038468
14	NC_006675	TCA	3	9	1059	1067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038468
15	NC_006675	ATCCA	2	10	1068	1077	40 %	20 %	0 %	40 %	58038468
16	NC_006675	CGC	2	6	1915	1920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038469
17	NC_006675	GGC	2	6	2019	2024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038469
18	NC_006675	GGC	3	9	2083	2091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038469
19	NC_006675	TGC	2	6	2095	2100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038469
20	NC_006675	AAG	2	6	2112	2117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038469
21	NC_006675	TTCT	2	8	2142	2149	0 %	75 %	0 %	25 %	58038469
22	NC_006675	AATG	2	8	2216	2223	50 %	25 %	25 %	0 %	58038469
23	NC_006675	CTT	2	6	2238	2243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038469
24	NC_006675	GCC	2	6	2796	2801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038470
25	NC_006675	CAGC	2	8	2840	2847	25 %	0 %	25 %	50 %	58038470
26	NC_006675	CGC	2	6	3242	3247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038470
27	NC_006675	GGC	2	6	3282	3287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038470
28	NC_006675	TGC	2	6	3305	3310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038470
29	NC_006675	GGA	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038471
30	NC_006675	AAG	2	6	3605	3610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038471
31	NC_006675	GA	5	10	3629	3638	50 %	0 %	50 %	0 %	58038471
32	NC_006675	CGG	2	6	4100	4105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038472
33	NC_006675	AGG	2	6	4120	4125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038472
34	NC_006675	GCG	2	6	4131	4136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038472
35	NC_006675	TGG	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58038472
36	NC_006675	CCCT	2	8	4435	4442	0 %	25 %	0 %	75 %	58038472
37	NC_006675	CG	3	6	4447	4452	0 %	0 %	50 %	50 %	58038472
38	NC_006675	GGC	3	9	4461	4469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038472
39	NC_006675	GTC	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038472
40	NC_006675	TCC	2	6	4576	4581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038472
41	NC_006675	TCGCT	2	10	4584	4593	0 %	40 %	20 %	40 %	58038472
42	NC_006675	GC	3	6	4614	4619	0 %	0 %	50 %	50 %	58038472
43	NC_006675	GCT	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038472
44	NC_006675	ACC	2	6	4812	4817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58038472
45	NC_006675	GA	3	6	4915	4920	50 %	0 %	50 %	0 %	58038472
46	NC_006675	TCCG	2	8	4939	4946	0 %	25 %	25 %	50 %	58038472
47	NC_006675	TTG	2	6	4960	4965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58038472
48	NC_006675	CGCC	2	8	5017	5024	0 %	0 %	25 %	75 %	58038472
49	NC_006675	A	6	6	5154	5159	100 %	0 %	0 %	0 %	58038472
50	NC_006675	TCC	2	6	5335	5340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038473
51	NC_006675	GTC	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038473
52	NC_006675	GCA	2	6	5426	5431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038473
53	NC_006675	CGC	2	6	5485	5490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038473
54	NC_006675	GCCC	2	8	5492	5499	0 %	0 %	25 %	75 %	58038473
55	NC_006675	CCG	2	6	5546	5551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038473
56	NC_006675	CCA	2	6	5561	5566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58038473
57	NC_006675	TGC	2	6	5602	5607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038473
58	NC_006675	ATTT	2	8	5749	5756	25 %	75 %	0 %	0 %	58038474
59	NC_006675	CTA	2	6	5758	5763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038474
60	NC_006675	CTT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038474
61	NC_006675	AT	3	6	5804	5809	50 %	50 %	0 %	0 %	58038474
62	NC_006675	TAA	2	6	5815	5820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58038474
63	NC_006675	CGA	2	6	5847	5852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038474
64	NC_006675	AAG	2	6	5876	5881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038474
65	NC_006675	GATG	2	8	6240	6247	25 %	25 %	50 %	0 %	58038475
66	NC_006675	ACGG	2	8	6252	6259	25 %	0 %	50 %	25 %	58038475
67	NC_006675	AGC	2	6	6479	6484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038475
68	NC_006675	AAAGC	2	10	6604	6613	60 %	0 %	20 %	20 %	58038475
69	NC_006675	AGG	2	6	6617	6622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038475
70	NC_006675	AAC	2	6	6720	6725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58038475
71	NC_006675	GCC	3	9	6730	6738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038475
72	NC_006675	GA	3	6	6756	6761	50 %	0 %	50 %	0 %	58038475
73	NC_006675	GCTG	2	8	7422	7429	0 %	25 %	50 %	25 %	58038476
74	NC_006675	CTG	2	6	7465	7470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038476
75	NC_006675	GGC	2	6	7535	7540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038476
76	NC_006675	TCAT	2	8	7630	7637	25 %	50 %	0 %	25 %	58038476
77	NC_006675	CGC	3	9	7653	7661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038476
78	NC_006675	AAG	2	6	7705	7710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038477
79	NC_006675	TCA	2	6	7750	7755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038477
80	NC_006675	TCA	2	6	7825	7830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038477
81	NC_006675	ACA	2	6	7925	7930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58038477
82	NC_006675	GAA	2	6	8233	8238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038478
83	NC_006675	TCT	2	6	8271	8276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038478
84	NC_006675	GAA	2	6	8308	8313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038478
85	NC_006675	TC	3	6	8545	8550	0 %	50 %	0 %	50 %	58038478
86	NC_006675	TCTGCT	2	12	8553	8564	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	58038478
87	NC_006675	TTC	2	6	8660	8665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038478
88	NC_006675	CCT	2	6	8679	8684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038478
89	NC_006675	ATC	2	6	8719	8724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038478
90	NC_006675	AGG	3	9	8750	8758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038478
91	NC_006675	GATC	2	8	8945	8952	25 %	25 %	25 %	25 %	58038479
92	NC_006675	GAC	2	6	8978	8983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038479
93	NC_006675	TG	3	6	9084	9089	0 %	50 %	50 %	0 %	58038479
94	NC_006675	CGCC	2	8	9412	9419	0 %	0 %	25 %	75 %	58038480
95	NC_006675	CGC	2	6	9456	9461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038480
96	NC_006675	AGC	2	6	9479	9484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038480
97	NC_006675	CCGT	2	8	9540	9547	0 %	25 %	25 %	50 %	58038480
98	NC_006675	GGGC	2	8	9582	9589	0 %	0 %	75 %	25 %	58038480
99	NC_006675	CCT	2	6	10183	10188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038481
100	NC_006675	CGG	2	6	10285	10290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038481
101	NC_006675	CTC	2	6	10346	10351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038481
102	NC_006675	GTC	2	6	10421	10426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038481
103	NC_006675	GCG	2	6	10469	10474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038481
104	NC_006675	CAGG	2	8	10857	10864	25 %	0 %	50 %	25 %	58038482
105	NC_006675	ATC	2	6	11038	11043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038482
106	NC_006675	GCG	2	6	11144	11149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038482
107	NC_006675	TGG	2	6	11316	11321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58038482
108	NC_006675	GCTAA	2	10	11410	11419	40 %	20 %	20 %	20 %	58038482
109	NC_006675	TC	3	6	11440	11445	0 %	50 %	0 %	50 %	58038482
110	NC_006675	GCATC	2	10	11454	11463	20 %	20 %	20 %	40 %	58038482
111	NC_006675	GC	3	6	11683	11688	0 %	0 %	50 %	50 %	58038483
112	NC_006675	CCG	2	6	11703	11708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038483
113	NC_006675	TGT	2	6	11723	11728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58038483
114	NC_006675	CATG	2	8	11760	11767	25 %	25 %	25 %	25 %	58038483
115	NC_006675	CTG	2	6	11839	11844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038483
116	NC_006675	TGG	2	6	11852	11857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58038483
117	NC_006675	TGA	2	6	11871	11876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038483
118	NC_006675	GCA	2	6	11880	11885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038483
119	NC_006675	G	6	6	11938	11943	0 %	0 %	100 %	0 %	58038483
120	NC_006675	CGG	2	6	11972	11977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038483
121	NC_006675	CGG	2	6	12041	12046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038483
122	NC_006675	GCTG	2	8	12113	12120	0 %	25 %	50 %	25 %	58038484
123	NC_006675	CTG	2	6	12156	12161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038484
124	NC_006675	TGAT	2	8	12237	12244	25 %	50 %	25 %	0 %	58038484
125	NC_006675	ATC	2	6	12273	12278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038485
126	NC_006675	TTG	2	6	12301	12306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58038485
127	NC_006675	GGC	3	9	12325	12333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038485
128	NC_006675	GAC	2	6	12383	12388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038485
129	NC_006675	CAGC	2	8	12445	12452	25 %	0 %	25 %	50 %	58038485
130	NC_006675	CAC	2	6	12454	12459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58038485
131	NC_006675	GCG	2	6	12541	12546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038485
132	NC_006675	CGG	2	6	12568	12573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038485
133	NC_006675	GCC	2	6	12585	12590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038485
134	NC_006675	GTCG	2	8	12608	12615	0 %	25 %	50 %	25 %	58038485
135	NC_006675	TCT	2	6	12640	12645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038485
136	NC_006675	GCC	2	6	12668	12673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038485
137	NC_006675	GGCGT	2	10	12720	12729	0 %	20 %	60 %	20 %	58038485
138	NC_006675	GCC	2	6	12856	12861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038485
139	NC_006675	GTG	2	6	12873	12878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58038485
140	NC_006675	GCG	2	6	12958	12963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038485
141	NC_006675	GTC	2	6	13010	13015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038485

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.