MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Gluconobacter oxydans 621H plasmid pGOX2

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006673	CAT	2	6	743	748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038419
2	NC_006673	CTG	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038419
3	NC_006673	CAC	2	6	837	842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58038419
4	NC_006673	CCA	2	6	883	888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58038419
5	NC_006673	TGC	2	6	970	975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038419
6	NC_006673	TCA	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038419
7	NC_006673	CAG	2	6	1030	1035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038419
8	NC_006673	GAA	2	6	1203	1208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038419
9	NC_006673	CGG	2	6	1272	1277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038419
10	NC_006673	AGC	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038419
11	NC_006673	GTC	2	6	1538	1543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038419
12	NC_006673	GGA	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038419
13	NC_006673	CCG	2	6	1709	1714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038420
14	NC_006673	CTT	2	6	1727	1732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038420
15	NC_006673	TCT	2	6	1746	1751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038420
16	NC_006673	CCA	2	6	1834	1839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58038420
17	NC_006673	TCA	2	6	1878	1883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038420
18	NC_006673	TGT	2	6	1891	1896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58038420
19	NC_006673	GCA	2	6	1918	1923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038420
20	NC_006673	TCC	2	6	1941	1946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038420
21	NC_006673	GAT	2	6	1952	1957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038420
22	NC_006673	CCG	2	6	2029	2034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038420
23	NC_006673	GGC	2	6	2111	2116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038420
24	NC_006673	GCG	2	6	2642	2647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038421
25	NC_006673	TGG	2	6	2671	2676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58038421
26	NC_006673	GTC	2	6	2736	2741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038421
27	NC_006673	AGC	2	6	3154	3159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038422
28	NC_006673	AGA	2	6	3261	3266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038422
29	NC_006673	TGC	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038422
30	NC_006673	CAT	2	6	3658	3663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038422
31	NC_006673	ATC	2	6	3810	3815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038422
32	NC_006673	TCA	3	9	4023	4031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038422
33	NC_006673	AGA	2	6	4090	4095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038423
34	NC_006673	TGC	2	6	4103	4108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038423
35	NC_006673	CGC	2	6	4164	4169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038423
36	NC_006673	TTC	2	6	4257	4262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038423
37	NC_006673	TTA	2	6	4311	4316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58038423
38	NC_006673	GCC	2	6	4475	4480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038424
39	NC_006673	ATC	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038424
40	NC_006673	GGC	2	6	4632	4637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038424
41	NC_006673	GGC	2	6	4944	4949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038425
42	NC_006673	GGA	2	6	4953	4958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038425
43	NC_006673	GGA	2	6	5022	5027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038425
44	NC_006673	AGC	2	6	5059	5064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038425
45	NC_006673	TGA	2	6	5093	5098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038425
46	NC_006673	CGG	2	6	5189	5194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038425
47	NC_006673	CGA	2	6	5200	5205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038425
48	NC_006673	GCC	2	6	5231	5236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038425
49	NC_006673	TCG	2	6	5265	5270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038425
50	NC_006673	CGA	2	6	5301	5306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038425
51	NC_006673	GCG	2	6	5322	5327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038425
52	NC_006673	CGG	2	6	5875	5880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038426
53	NC_006673	CTG	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038426
54	NC_006673	GCT	2	6	5984	5989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038426
55	NC_006673	ATC	2	6	6015	6020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038426
56	NC_006673	ACG	2	6	6027	6032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038426
57	NC_006673	CAA	2	6	6034	6039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58038426
58	NC_006673	TGC	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038426
59	NC_006673	GGA	2	6	6151	6156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038426
60	NC_006673	CGA	2	6	6292	6297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038427
61	NC_006673	TCT	2	6	6336	6341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038427
62	NC_006673	CGG	2	6	6363	6368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038427
63	NC_006673	GGC	2	6	6502	6507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038427
64	NC_006673	GCC	2	6	6535	6540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038427
65	NC_006673	ATG	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038427
66	NC_006673	TGA	2	6	7239	7244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038428
67	NC_006673	AAG	2	6	7248	7253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038428
68	NC_006673	CAG	2	6	7282	7287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038428
69	NC_006673	GCC	2	6	7408	7413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038428
70	NC_006673	GGC	2	6	7416	7421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038428
71	NC_006673	CAT	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038428
72	NC_006673	CTG	2	6	7626	7631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038428
73	NC_006673	CAG	2	6	7690	7695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038428
74	NC_006673	TCC	2	6	7838	7843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038428
75	NC_006673	AAT	2	6	7858	7863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58038428
76	NC_006673	ACC	2	6	7918	7923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58038428
77	NC_006673	CTG	2	6	7978	7983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038428
78	NC_006673	CAG	2	6	8009	8014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038428
79	NC_006673	CAC	2	6	8154	8159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58038428
80	NC_006673	TGA	3	9	8229	8237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038428
81	NC_006673	TGA	3	9	8514	8522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038429
82	NC_006673	GAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038429
83	NC_006673	ATG	2	6	8882	8887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038429
84	NC_006673	CGA	2	6	8979	8984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038429
85	NC_006673	CAG	2	6	9003	9008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038429
86	NC_006673	GTC	2	6	9066	9071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038429
87	NC_006673	GCA	2	6	9195	9200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038429
88	NC_006673	ATC	2	6	9224	9229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038429
89	NC_006673	TCT	2	6	9279	9284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038429
90	NC_006673	CTC	2	6	9343	9348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038429
91	NC_006673	TGC	2	6	9385	9390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038429
92	NC_006673	GGC	2	6	9681	9686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038430
93	NC_006673	GGC	3	9	10012	10020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038430
94	NC_006673	GTT	2	6	10025	10030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58038430
95	NC_006673	TCC	2	6	10127	10132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038430
96	NC_006673	GCT	2	6	10266	10271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038430
97	NC_006673	CTG	2	6	11029	11034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038431
98	NC_006673	GGC	2	6	11099	11104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038431
99	NC_006673	CGC	3	9	11217	11225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038431
100	NC_006673	ATG	2	6	11799	11804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038432
101	NC_006673	ACG	2	6	12243	12248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038432
102	NC_006673	GCT	2	6	12273	12278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038432
103	NC_006673	GTC	2	6	12303	12308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038432
104	NC_006673	GGC	2	6	12639	12644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038433
105	NC_006673	CGA	2	6	12758	12763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038433
106	NC_006673	ACG	2	6	12776	12781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038433
107	NC_006673	GAA	2	6	12875	12880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038434
108	NC_006673	GAA	2	6	12890	12895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038434
109	NC_006673	CCG	2	6	12927	12932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038434
110	NC_006673	ATG	2	6	13578	13583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038435
111	NC_006673	TTC	2	6	13584	13589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58038435
112	NC_006673	ATG	2	6	13636	13641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038435
113	NC_006673	CAA	2	6	13643	13648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58038435
114	NC_006673	TAA	2	6	13703	13708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58038435
115	NC_006673	TGA	2	6	13849	13854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038435
116	NC_006673	GCG	2	6	13908	13913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038435
117	NC_006673	TCA	2	6	13993	13998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038435
118	NC_006673	CAT	2	6	14517	14522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038436
119	NC_006673	ATC	2	6	14560	14565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038436
120	NC_006673	CCG	2	6	14660	14665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038436
121	NC_006673	AGG	2	6	14837	14842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58038436
122	NC_006673	TGC	2	6	14874	14879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038436
123	NC_006673	GCC	2	6	14923	14928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038436
124	NC_006673	CGA	2	6	14943	14948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038436
125	NC_006673	ATC	2	6	14969	14974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038436
126	NC_006673	CGA	2	6	14979	14984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038436
127	NC_006673	GCT	2	6	15150	15155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038436
128	NC_006673	GAA	2	6	15298	15303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58038436
129	NC_006673	CGT	2	6	15382	15387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038436
130	NC_006673	CTG	2	6	15832	15837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038437
131	NC_006673	ACG	2	6	15865	15870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038437
132	NC_006673	CCA	2	6	16069	16074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58038437
133	NC_006673	GCC	2	6	16208	16213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038437
134	NC_006673	CGC	2	6	16279	16284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58038437
135	NC_006673	TGT	2	6	16343	16348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58038437
136	NC_006673	AGC	2	6	16364	16369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038437
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138	NC_006673	TCC	2	6	16798	16803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038438
139	NC_006673	CGT	2	6	16815	16820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038438
140	NC_006673	GAT	2	6	16826	16831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038438
141	NC_006673	ACG	2	6	16885	16890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038438
142	NC_006673	CAA	2	6	16955	16960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58038438
143	NC_006673	GAC	2	6	17093	17098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038438
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147	NC_006673	CCA	2	6	17196	17201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58038438
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154	NC_006673	CAT	2	6	18283	18288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038439
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159	NC_006673	GCT	2	6	18874	18879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038439
160	NC_006673	GTC	2	6	18995	19000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58038440
161	NC_006673	CAG	2	6	19007	19012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58038440
162	NC_006673	CCT	2	6	19135	19140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58038440
163	NC_006673	TAC	2	6	19160	19165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58038440
164	NC_006673	TGA	2	6	19286	19291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58038440
165	NC_006673	TGG	2	6	19305	19310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58038440
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169	NC_006673	CGG	2	6	19516	19521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58038440
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.