MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Gluconobacter oxydans 621H plasmid pGOX1

Total Repeats: 280

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006672	GT	3	6	839	844	0 %	50 %	50 %	0 %	58038255
2	NC_006672	GA	3	6	969	974	50 %	0 %	50 %	0 %	58038255
3	NC_006672	TC	3	6	1017	1022	0 %	50 %	0 %	50 %	58038255
4	NC_006672	GC	3	6	1281	1286	0 %	0 %	50 %	50 %	58038255
5	NC_006672	AC	3	6	2479	2484	50 %	0 %	0 %	50 %	58038256
6	NC_006672	GC	3	6	2840	2845	0 %	0 %	50 %	50 %	58038257
7	NC_006672	CT	3	6	2855	2860	0 %	50 %	0 %	50 %	58038257
8	NC_006672	CA	4	8	2969	2976	50 %	0 %	0 %	50 %	58038257
9	NC_006672	TC	3	6	2985	2990	0 %	50 %	0 %	50 %	58038257
10	NC_006672	GC	3	6	3615	3620	0 %	0 %	50 %	50 %	58038258
11	NC_006672	CG	3	6	3934	3939	0 %	0 %	50 %	50 %	58038259
12	NC_006672	CT	3	6	4965	4970	0 %	50 %	0 %	50 %	58038261
13	NC_006672	CG	3	6	5319	5324	0 %	0 %	50 %	50 %	58038261
14	NC_006672	CG	3	6	5812	5817	0 %	0 %	50 %	50 %	58038262
15	NC_006672	AG	3	6	6186	6191	50 %	0 %	50 %	0 %	58038263
16	NC_006672	GA	3	6	6320	6325	50 %	0 %	50 %	0 %	58038263
17	NC_006672	CA	3	6	7460	7465	50 %	0 %	0 %	50 %	58038264
18	NC_006672	GC	3	6	7816	7821	0 %	0 %	50 %	50 %	58038264
19	NC_006672	TC	3	6	7851	7856	0 %	50 %	0 %	50 %	58038264
20	NC_006672	AT	3	6	8213	8218	50 %	50 %	0 %	0 %	58038264
21	NC_006672	CG	3	6	8250	8255	0 %	0 %	50 %	50 %	58038264
22	NC_006672	CG	3	6	8428	8433	0 %	0 %	50 %	50 %	58038264
23	NC_006672	CG	3	6	8669	8674	0 %	0 %	50 %	50 %	58038264
24	NC_006672	TC	3	6	8682	8687	0 %	50 %	0 %	50 %	58038264
25	NC_006672	GC	4	8	9039	9046	0 %	0 %	50 %	50 %	58038264
26	NC_006672	GA	3	6	9065	9070	50 %	0 %	50 %	0 %	58038264
27	NC_006672	GC	4	8	9643	9650	0 %	0 %	50 %	50 %	58038265
28	NC_006672	CT	3	6	10410	10415	0 %	50 %	0 %	50 %	58038266
29	NC_006672	CG	3	6	10788	10793	0 %	0 %	50 %	50 %	58038266
30	NC_006672	TC	3	6	12357	12362	0 %	50 %	0 %	50 %	58038268
31	NC_006672	TC	3	6	16208	16213	0 %	50 %	0 %	50 %	58038271
32	NC_006672	GC	3	6	16741	16746	0 %	0 %	50 %	50 %	58038271
33	NC_006672	CT	3	6	16876	16881	0 %	50 %	0 %	50 %	58038272
34	NC_006672	AG	3	6	17809	17814	50 %	0 %	50 %	0 %	58038272
35	NC_006672	TA	3	6	18617	18622	50 %	50 %	0 %	0 %	58038273
36	NC_006672	GC	3	6	19267	19272	0 %	0 %	50 %	50 %	58038274
37	NC_006672	AC	3	6	20311	20316	50 %	0 %	0 %	50 %	58038276
38	NC_006672	CT	3	6	20640	20645	0 %	50 %	0 %	50 %	58038276
39	NC_006672	GC	3	6	20994	20999	0 %	0 %	50 %	50 %	58038276
40	NC_006672	GA	3	6	21024	21029	50 %	0 %	50 %	0 %	58038276
41	NC_006672	CG	3	6	21542	21547	0 %	0 %	50 %	50 %	58038276
42	NC_006672	TC	3	6	21745	21750	0 %	50 %	0 %	50 %	58038276
43	NC_006672	CG	3	6	22113	22118	0 %	0 %	50 %	50 %	58038276
44	NC_006672	GA	3	6	22146	22151	50 %	0 %	50 %	0 %	58038276
45	NC_006672	GA	3	6	22606	22611	50 %	0 %	50 %	0 %	58038277
46	NC_006672	GC	3	6	22966	22971	0 %	0 %	50 %	50 %	58038278
47	NC_006672	CG	3	6	23115	23120	0 %	0 %	50 %	50 %	58038278
48	NC_006672	CG	3	6	24353	24358	0 %	0 %	50 %	50 %	58038279
49	NC_006672	CG	3	6	25019	25024	0 %	0 %	50 %	50 %	58038280
50	NC_006672	GC	3	6	25793	25798	0 %	0 %	50 %	50 %	58038281
51	NC_006672	CG	3	6	26454	26459	0 %	0 %	50 %	50 %	58038282
52	NC_006672	GC	3	6	26675	26680	0 %	0 %	50 %	50 %	58038282
53	NC_006672	CG	3	6	27045	27050	0 %	0 %	50 %	50 %	58038283
54	NC_006672	GC	3	6	27408	27413	0 %	0 %	50 %	50 %	58038284
55	NC_006672	GT	3	6	27625	27630	0 %	50 %	50 %	0 %	58038285
56	NC_006672	CG	3	6	27757	27762	0 %	0 %	50 %	50 %	58038285
57	NC_006672	CG	4	8	27907	27914	0 %	0 %	50 %	50 %	58038285
58	NC_006672	GC	3	6	28012	28017	0 %	0 %	50 %	50 %	58038285
59	NC_006672	CT	3	6	28468	28473	0 %	50 %	0 %	50 %	58038286
60	NC_006672	CT	3	6	28490	28495	0 %	50 %	0 %	50 %	58038286
61	NC_006672	CG	3	6	28526	28531	0 %	0 %	50 %	50 %	58038286
62	NC_006672	GC	3	6	28566	28571	0 %	0 %	50 %	50 %	58038286
63	NC_006672	GC	3	6	28711	28716	0 %	0 %	50 %	50 %	58038286
64	NC_006672	GC	3	6	29119	29124	0 %	0 %	50 %	50 %	58038287
65	NC_006672	CG	3	6	29221	29226	0 %	0 %	50 %	50 %	58038287
66	NC_006672	CG	3	6	29374	29379	0 %	0 %	50 %	50 %	58038287
67	NC_006672	GC	3	6	30063	30068	0 %	0 %	50 %	50 %	58038288
68	NC_006672	CT	3	6	30498	30503	0 %	50 %	0 %	50 %	58038288
69	NC_006672	CG	3	6	30540	30545	0 %	0 %	50 %	50 %	58038288
70	NC_006672	GA	3	6	31233	31238	50 %	0 %	50 %	0 %	58038289
71	NC_006672	CG	3	6	31551	31556	0 %	0 %	50 %	50 %	58038289
72	NC_006672	CG	3	6	31930	31935	0 %	0 %	50 %	50 %	58038290
73	NC_006672	GC	3	6	31936	31941	0 %	0 %	50 %	50 %	58038290
74	NC_006672	GC	3	6	32516	32521	0 %	0 %	50 %	50 %	58038290
75	NC_006672	CG	3	6	32553	32558	0 %	0 %	50 %	50 %	58038290
76	NC_006672	CG	3	6	33426	33431	0 %	0 %	50 %	50 %	58038290
77	NC_006672	CG	3	6	34618	34623	0 %	0 %	50 %	50 %	58038293
78	NC_006672	GC	3	6	35172	35177	0 %	0 %	50 %	50 %	58038294
79	NC_006672	CG	3	6	35344	35349	0 %	0 %	50 %	50 %	58038294
80	NC_006672	CA	3	6	36047	36052	50 %	0 %	0 %	50 %	58038295
81	NC_006672	GC	3	6	36117	36122	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
82	NC_006672	CG	3	6	36288	36293	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
83	NC_006672	CG	3	6	36800	36805	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
84	NC_006672	GC	4	8	38195	38202	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
85	NC_006672	GC	3	6	38308	38313	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
86	NC_006672	GC	3	6	38648	38653	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
87	NC_006672	TG	3	6	39028	39033	0 %	50 %	50 %	0 %	58038295
88	NC_006672	GC	3	6	39217	39222	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
89	NC_006672	GC	3	6	39239	39244	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
90	NC_006672	GC	3	6	39268	39273	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
91	NC_006672	CG	3	6	39322	39327	0 %	0 %	50 %	50 %	58038295
92	NC_006672	TG	3	6	41130	41135	0 %	50 %	50 %	0 %	58038296
93	NC_006672	CT	3	6	41334	41339	0 %	50 %	0 %	50 %	58038296
94	NC_006672	GC	3	6	41873	41878	0 %	0 %	50 %	50 %	58038297
95	NC_006672	GC	3	6	42461	42466	0 %	0 %	50 %	50 %	58038298
96	NC_006672	CT	4	8	43763	43770	0 %	50 %	0 %	50 %	58038299
97	NC_006672	TG	3	6	44493	44498	0 %	50 %	50 %	0 %	58038299
98	NC_006672	CT	3	6	45362	45367	0 %	50 %	0 %	50 %	58038300
99	NC_006672	TC	3	6	45541	45546	0 %	50 %	0 %	50 %	58038300
100	NC_006672	GA	3	6	45554	45559	50 %	0 %	50 %	0 %	58038300
101	NC_006672	CG	3	6	46366	46371	0 %	0 %	50 %	50 %	58038301
102	NC_006672	CG	3	6	47949	47954	0 %	0 %	50 %	50 %	58038302
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104	NC_006672	GC	3	6	48550	48555	0 %	0 %	50 %	50 %	58038302
105	NC_006672	GA	3	6	49412	49417	50 %	0 %	50 %	0 %	58038303
106	NC_006672	GC	3	6	49823	49828	0 %	0 %	50 %	50 %	58038304
107	NC_006672	GT	3	6	49930	49935	0 %	50 %	50 %	0 %	58038304
108	NC_006672	CG	3	6	50093	50098	0 %	0 %	50 %	50 %	58038305
109	NC_006672	TG	3	6	50211	50216	0 %	50 %	50 %	0 %	58038305
110	NC_006672	AG	3	6	50375	50380	50 %	0 %	50 %	0 %	58038305
111	NC_006672	GC	3	6	50496	50501	0 %	0 %	50 %	50 %	58038305
112	NC_006672	AT	3	6	50837	50842	50 %	50 %	0 %	0 %	58038306
113	NC_006672	GC	3	6	50967	50972	0 %	0 %	50 %	50 %	58038306
114	NC_006672	GA	3	6	52287	52292	50 %	0 %	50 %	0 %	58038308
115	NC_006672	CT	3	6	52538	52543	0 %	50 %	0 %	50 %	58038308
116	NC_006672	TG	3	6	52666	52671	0 %	50 %	50 %	0 %	58038308
117	NC_006672	CG	3	6	53067	53072	0 %	0 %	50 %	50 %	58038308
118	NC_006672	TG	3	6	55201	55206	0 %	50 %	50 %	0 %	58038312
119	NC_006672	AT	3	6	55461	55466	50 %	50 %	0 %	0 %	58038312
120	NC_006672	CT	3	6	56042	56047	0 %	50 %	0 %	50 %	58038312
121	NC_006672	CT	3	6	56325	56330	0 %	50 %	0 %	50 %	58038312
122	NC_006672	CG	3	6	56555	56560	0 %	0 %	50 %	50 %	58038312
123	NC_006672	AT	3	6	56990	56995	50 %	50 %	0 %	0 %	58038312
124	NC_006672	AC	3	6	57314	57319	50 %	0 %	0 %	50 %	58038312
125	NC_006672	GT	3	6	57956	57961	0 %	50 %	50 %	0 %	58038313
126	NC_006672	GA	3	6	58534	58539	50 %	0 %	50 %	0 %	58038313
127	NC_006672	AG	3	6	59321	59326	50 %	0 %	50 %	0 %	58038314
128	NC_006672	CG	3	6	59461	59466	0 %	0 %	50 %	50 %	58038314
129	NC_006672	GC	3	6	61728	61733	0 %	0 %	50 %	50 %	58038315
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131	NC_006672	TC	3	6	61984	61989	0 %	50 %	0 %	50 %	58038316
132	NC_006672	GT	3	6	64438	64443	0 %	50 %	50 %	0 %	58038318
133	NC_006672	CG	3	6	64531	64536	0 %	0 %	50 %	50 %	58038318
134	NC_006672	TG	3	6	64782	64787	0 %	50 %	50 %	0 %	58038318
135	NC_006672	GA	3	6	67145	67150	50 %	0 %	50 %	0 %	58038319
136	NC_006672	TA	3	6	67282	67287	50 %	50 %	0 %	0 %	58038319
137	NC_006672	GT	3	6	68893	68898	0 %	50 %	50 %	0 %	58038320
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139	NC_006672	AC	3	6	69459	69464	50 %	0 %	0 %	50 %	58038321
140	NC_006672	GA	3	6	69743	69748	50 %	0 %	50 %	0 %	58038321
141	NC_006672	GA	3	6	70585	70590	50 %	0 %	50 %	0 %	58038322
142	NC_006672	CT	3	6	70700	70705	0 %	50 %	0 %	50 %	58038322
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144	NC_006672	GC	3	6	72071	72076	0 %	0 %	50 %	50 %	58038323
145	NC_006672	CT	3	6	76082	76087	0 %	50 %	0 %	50 %	58038328
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.