MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Gluconobacter oxydans 621H plasmid pGOX1

Total Repeats: 382

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006672	CCTT	2	8	613	620	0 %	50 %	0 %	50 %	58038255
2	NC_006672	GCCC	2	8	1007	1014	0 %	0 %	25 %	75 %	58038255
3	NC_006672	AAGG	2	8	1190	1197	50 %	0 %	50 %	0 %	58038255
4	NC_006672	CTGC	2	8	1736	1743	0 %	25 %	25 %	50 %	58038256
5	NC_006672	ACCT	2	8	1797	1804	25 %	25 %	0 %	50 %	58038256
6	NC_006672	GCGG	2	8	3069	3076	0 %	0 %	75 %	25 %	58038257
7	NC_006672	CCGG	2	8	3139	3146	0 %	0 %	50 %	50 %	58038257
8	NC_006672	GCGG	2	8	3358	3365	0 %	0 %	75 %	25 %	58038258
9	NC_006672	GCAG	2	8	3755	3762	25 %	0 %	50 %	25 %	58038258
10	NC_006672	GGAT	2	8	3863	3870	25 %	25 %	50 %	0 %	58038259
11	NC_006672	ATCC	2	8	4110	4117	25 %	25 %	0 %	50 %	58038259
12	NC_006672	CCAG	2	8	4148	4155	25 %	0 %	25 %	50 %	58038259
13	NC_006672	ACGC	2	8	5271	5278	25 %	0 %	25 %	50 %	58038261
14	NC_006672	CCCG	2	8	5552	5559	0 %	0 %	25 %	75 %	58038262
15	NC_006672	GGAC	2	8	5871	5878	25 %	0 %	50 %	25 %	58038262
16	NC_006672	AGCC	2	8	6249	6256	25 %	0 %	25 %	50 %	58038263
17	NC_006672	GATC	2	8	7123	7130	25 %	25 %	25 %	25 %	58038264
18	NC_006672	GATC	2	8	8066	8073	25 %	25 %	25 %	25 %	58038264
19	NC_006672	GAAA	2	8	8285	8292	75 %	0 %	25 %	0 %	58038264
20	NC_006672	CGGT	2	8	8893	8900	0 %	25 %	50 %	25 %	58038264
21	NC_006672	CGCT	2	8	8902	8909	0 %	25 %	25 %	50 %	58038264
22	NC_006672	GACA	2	8	9212	9219	50 %	0 %	25 %	25 %	58038264
23	NC_006672	GTCG	2	8	9531	9538	0 %	25 %	50 %	25 %	58038265
24	NC_006672	TTCC	2	8	9681	9688	0 %	50 %	0 %	50 %	58038265
25	NC_006672	CGAC	2	8	10481	10488	25 %	0 %	25 %	50 %	58038266
26	NC_006672	GACA	2	8	10551	10558	50 %	0 %	25 %	25 %	58038266
27	NC_006672	ATTT	2	8	10560	10567	25 %	75 %	0 %	0 %	58038266
28	NC_006672	TGAT	2	8	11239	11246	25 %	50 %	25 %	0 %	58038267
29	NC_006672	CAGC	2	8	11447	11454	25 %	0 %	25 %	50 %	58038267
30	NC_006672	GTCG	2	8	11610	11617	0 %	25 %	50 %	25 %	58038267
31	NC_006672	TCGC	2	8	12407	12414	0 %	25 %	25 %	50 %	58038268
32	NC_006672	TGAT	2	8	12738	12745	25 %	50 %	25 %	0 %	58038269
33	NC_006672	ACGG	2	8	13571	13578	25 %	0 %	50 %	25 %	58038270
34	NC_006672	AGGA	2	8	13646	13653	50 %	0 %	50 %	0 %	58038270
35	NC_006672	TCGA	2	8	13681	13688	25 %	25 %	25 %	25 %	58038270
36	NC_006672	CGGT	2	8	14567	14574	0 %	25 %	50 %	25 %	58038270
37	NC_006672	CGGG	2	8	14605	14612	0 %	0 %	75 %	25 %	58038270
38	NC_006672	ATGA	2	8	14622	14629	50 %	25 %	25 %	0 %	58038270
39	NC_006672	AGGC	2	8	15521	15528	25 %	0 %	50 %	25 %	58038271
40	NC_006672	CACG	2	8	15652	15659	25 %	0 %	25 %	50 %	58038271
41	NC_006672	CCGA	2	8	16000	16007	25 %	0 %	25 %	50 %	58038271
42	NC_006672	CGGA	2	8	16042	16049	25 %	0 %	50 %	25 %	58038271
43	NC_006672	CGTG	2	8	16568	16575	0 %	25 %	50 %	25 %	58038271
44	NC_006672	GCAG	2	8	16720	16727	25 %	0 %	50 %	25 %	58038271
45	NC_006672	GCGG	2	8	16765	16772	0 %	0 %	75 %	25 %	58038271
46	NC_006672	GTGC	2	8	16891	16898	0 %	25 %	50 %	25 %	58038272
47	NC_006672	GCGA	2	8	17073	17080	25 %	0 %	50 %	25 %	58038272
48	NC_006672	TTGG	2	8	17117	17124	0 %	50 %	50 %	0 %	58038272
49	NC_006672	ATGG	2	8	17423	17430	25 %	25 %	50 %	0 %	58038272
50	NC_006672	CATG	2	8	19344	19351	25 %	25 %	25 %	25 %	58038274
51	NC_006672	GCTG	2	8	19697	19704	0 %	25 %	50 %	25 %	58038275
52	NC_006672	TCAT	2	8	19905	19912	25 %	50 %	0 %	25 %	58038275
53	NC_006672	ATGG	2	8	20456	20463	25 %	25 %	50 %	0 %	58038276
54	NC_006672	CGAC	2	8	20478	20485	25 %	0 %	25 %	50 %	58038276
55	NC_006672	CGGG	2	8	20847	20854	0 %	0 %	75 %	25 %	58038276
56	NC_006672	GGTC	2	8	21868	21875	0 %	25 %	50 %	25 %	58038276
57	NC_006672	CCCA	2	8	21909	21916	25 %	0 %	0 %	75 %	58038276
58	NC_006672	AACA	2	8	22584	22591	75 %	0 %	0 %	25 %	58038277
59	NC_006672	GCGG	2	8	22858	22865	0 %	0 %	75 %	25 %	58038278
60	NC_006672	CAGC	2	8	23043	23050	25 %	0 %	25 %	50 %	58038278
61	NC_006672	TCAC	2	8	23168	23175	25 %	25 %	0 %	50 %	58038278
62	NC_006672	GACA	2	8	23240	23247	50 %	0 %	25 %	25 %	58038278
63	NC_006672	TACC	2	8	23523	23530	25 %	25 %	0 %	50 %	58038278
64	NC_006672	GGTT	2	8	24695	24702	0 %	50 %	50 %	0 %	58038280
65	NC_006672	TTCA	2	8	24905	24912	25 %	50 %	0 %	25 %	58038280
66	NC_006672	GCGA	2	8	24939	24946	25 %	0 %	50 %	25 %	58038280
67	NC_006672	CAGA	2	8	26298	26305	50 %	0 %	25 %	25 %	58038282
68	NC_006672	GGTC	2	8	26558	26565	0 %	25 %	50 %	25 %	58038282
69	NC_006672	CGGC	2	8	26872	26879	0 %	0 %	50 %	50 %	58038283
70	NC_006672	CAGC	2	8	27394	27401	25 %	0 %	25 %	50 %	58038284
71	NC_006672	GGCA	2	8	28187	28194	25 %	0 %	50 %	25 %	58038285
72	NC_006672	ACCC	2	8	28431	28438	25 %	0 %	0 %	75 %	58038286
73	NC_006672	CTCC	2	8	28510	28517	0 %	25 %	0 %	75 %	58038286
74	NC_006672	CTCG	2	8	28929	28936	0 %	25 %	25 %	50 %	58038286
75	NC_006672	CGAC	2	8	29420	29427	25 %	0 %	25 %	50 %	58038287
76	NC_006672	GGCG	2	8	29576	29583	0 %	0 %	75 %	25 %	58038287
77	NC_006672	AAAG	2	8	29597	29604	75 %	0 %	25 %	0 %	58038287
78	NC_006672	ACAG	2	8	30474	30481	50 %	0 %	25 %	25 %	58038288
79	NC_006672	ACAG	2	8	32172	32179	50 %	0 %	25 %	25 %	58038290
80	NC_006672	GGCC	2	8	32403	32410	0 %	0 %	50 %	50 %	58038290
81	NC_006672	CGTC	2	8	32718	32725	0 %	25 %	25 %	50 %	58038290
82	NC_006672	CCGG	2	8	32984	32991	0 %	0 %	50 %	50 %	58038290
83	NC_006672	CTCC	2	8	32997	33004	0 %	25 %	0 %	75 %	58038290
84	NC_006672	AGGC	2	8	33165	33172	25 %	0 %	50 %	25 %	58038290
85	NC_006672	CGCA	2	8	34439	34446	25 %	0 %	25 %	50 %	58038292
86	NC_006672	CCGG	2	8	34543	34550	0 %	0 %	50 %	50 %	58038293
87	NC_006672	CTGC	2	8	35223	35230	0 %	25 %	25 %	50 %	58038294
88	NC_006672	GACG	2	8	38508	38515	25 %	0 %	50 %	25 %	58038295
89	NC_006672	GCTG	2	8	38828	38835	0 %	25 %	50 %	25 %	58038295
90	NC_006672	GCAG	2	8	38942	38949	25 %	0 %	50 %	25 %	58038295
91	NC_006672	CCAG	2	8	39074	39081	25 %	0 %	25 %	50 %	58038295
92	NC_006672	CCTT	2	8	39433	39440	0 %	50 %	0 %	50 %	58038295
93	NC_006672	TCCC	2	8	39696	39703	0 %	25 %	0 %	75 %	58038295
94	NC_006672	CCAG	2	8	39734	39741	25 %	0 %	25 %	50 %	58038295
95	NC_006672	TTTC	2	8	40655	40662	0 %	75 %	0 %	25 %	58038295
96	NC_006672	ACGG	2	8	41274	41281	25 %	0 %	50 %	25 %	58038296
97	NC_006672	ACCC	2	8	41282	41289	25 %	0 %	0 %	75 %	58038296
98	NC_006672	TGAC	2	8	41503	41510	25 %	25 %	25 %	25 %	58038296
99	NC_006672	CCTC	2	8	41942	41949	0 %	25 %	0 %	75 %	58038297
100	NC_006672	CCGG	2	8	42033	42040	0 %	0 %	50 %	50 %	58038298
101	NC_006672	CAGG	2	8	42086	42093	25 %	0 %	50 %	25 %	58038298
102	NC_006672	CATC	2	8	42229	42236	25 %	25 %	0 %	50 %	58038298
103	NC_006672	CCGC	2	8	45379	45386	0 %	0 %	25 %	75 %	58038300
104	NC_006672	CAAG	2	8	45854	45861	50 %	0 %	25 %	25 %	58038300
105	NC_006672	CGAC	2	8	45933	45940	25 %	0 %	25 %	50 %	58038300
106	NC_006672	CGAT	2	8	45951	45958	25 %	25 %	25 %	25 %	58038300
107	NC_006672	CTCG	2	8	46140	46147	0 %	25 %	25 %	50 %	58038301
108	NC_006672	CTGC	2	8	46958	46965	0 %	25 %	25 %	50 %	58038301
109	NC_006672	GTCA	2	8	46984	46991	25 %	25 %	25 %	25 %	58038301
110	NC_006672	GCGG	2	8	48432	48439	0 %	0 %	75 %	25 %	58038302
111	NC_006672	GTCA	2	8	48597	48604	25 %	25 %	25 %	25 %	58038302
112	NC_006672	ACGC	2	8	50352	50359	25 %	0 %	25 %	50 %	58038305
113	NC_006672	ACGG	2	8	50588	50595	25 %	0 %	50 %	25 %	58038305
114	NC_006672	CTGG	2	8	51093	51100	0 %	25 %	50 %	25 %	58038306
115	NC_006672	CTGC	2	8	51144	51151	0 %	25 %	25 %	50 %	58038306
116	NC_006672	ACCG	2	8	51284	51291	25 %	0 %	25 %	50 %	58038306
117	NC_006672	GCGG	2	8	51495	51502	0 %	0 %	75 %	25 %	58038307
118	NC_006672	CTGG	2	8	51648	51655	0 %	25 %	50 %	25 %	58038307
119	NC_006672	CGCC	2	8	51711	51718	0 %	0 %	25 %	75 %	58038307
120	NC_006672	CATA	2	8	52297	52304	50 %	25 %	0 %	25 %	58038308
121	NC_006672	GCCC	2	8	52372	52379	0 %	0 %	25 %	75 %	58038308
122	NC_006672	GCCA	2	8	52407	52414	25 %	0 %	25 %	50 %	58038308
123	NC_006672	ATCC	2	8	52689	52696	25 %	25 %	0 %	50 %	58038308
124	NC_006672	GGCA	2	8	52987	52994	25 %	0 %	50 %	25 %	58038308
125	NC_006672	AAAC	2	8	53902	53909	75 %	0 %	0 %	25 %	58038309
126	NC_006672	TCTG	2	8	54459	54466	0 %	50 %	25 %	25 %	58038310
127	NC_006672	CGTG	2	8	55350	55357	0 %	25 %	50 %	25 %	58038312
128	NC_006672	ATGG	2	8	55632	55639	25 %	25 %	50 %	0 %	58038312
129	NC_006672	ATTG	2	8	55824	55831	25 %	50 %	25 %	0 %	58038312
130	NC_006672	ATGA	2	8	56148	56155	50 %	25 %	25 %	0 %	58038312
131	NC_006672	CCTT	2	8	56164	56171	0 %	50 %	0 %	50 %	58038312
132	NC_006672	GCAT	2	8	56538	56545	25 %	25 %	25 %	25 %	58038312
133	NC_006672	AAAG	2	8	56786	56793	75 %	0 %	25 %	0 %	58038312
134	NC_006672	GCGG	2	8	56918	56925	0 %	0 %	75 %	25 %	58038312
135	NC_006672	CAGT	2	8	57367	57374	25 %	25 %	25 %	25 %	58038312
136	NC_006672	CATT	2	8	57503	57510	25 %	50 %	0 %	25 %	58038312
137	NC_006672	GAAT	2	8	57719	57726	50 %	25 %	25 %	0 %	58038312
138	NC_006672	GTCG	2	8	58013	58020	0 %	25 %	50 %	25 %	58038313
139	NC_006672	GGTC	2	8	59081	59088	0 %	25 %	50 %	25 %	58038314
140	NC_006672	CTGA	2	8	59097	59104	25 %	25 %	25 %	25 %	58038314
141	NC_006672	ACGG	2	8	59608	59615	25 %	0 %	50 %	25 %	58038314
142	NC_006672	GACA	2	8	59638	59645	50 %	0 %	25 %	25 %	58038314
143	NC_006672	TCCG	2	8	59663	59670	0 %	25 %	25 %	50 %	58038314
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.