MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus kaustophilus HTA426 plasmid pHTA426

Total Repeats: 505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006509	TGC	2	6	325	330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410438
2	NC_006509	AGG	2	6	378	383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410438
3	NC_006509	GTT	2	6	460	465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410438
4	NC_006509	GTT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410438
5	NC_006509	TAA	2	6	603	608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410438
6	NC_006509	ACA	2	6	742	747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410439
7	NC_006509	AGA	2	6	808	813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410439
8	NC_006509	ATC	2	6	825	830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410439
9	NC_006509	ACG	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410439
10	NC_006509	CCT	2	6	1082	1087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56410439
11	NC_006509	GAA	2	6	1121	1126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410439
12	NC_006509	GAT	2	6	1215	1220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410439
13	NC_006509	GAT	2	6	1226	1231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410439
14	NC_006509	AAG	2	6	1296	1301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410439
15	NC_006509	CAT	2	6	1322	1327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410439
16	NC_006509	GAG	2	6	1338	1343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410439
17	NC_006509	GCG	2	6	1365	1370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410439
18	NC_006509	GAT	2	6	1446	1451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410439
19	NC_006509	CGG	2	6	1547	1552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410439
20	NC_006509	CCG	2	6	1724	1729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410439
21	NC_006509	AGC	2	6	1765	1770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410439
22	NC_006509	TGC	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410439
23	NC_006509	TGA	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410439
24	NC_006509	GAG	2	6	1836	1841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410439
25	NC_006509	GCT	2	6	2028	2033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410440
26	NC_006509	TGA	2	6	2062	2067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410440
27	NC_006509	ATA	2	6	2073	2078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410440
28	NC_006509	AAT	2	6	2092	2097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410440
29	NC_006509	CAA	2	6	2135	2140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410440
30	NC_006509	GCC	2	6	2197	2202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410440
31	NC_006509	GCT	2	6	2264	2269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410440
32	NC_006509	CCG	2	6	2334	2339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410440
33	NC_006509	AAT	2	6	2345	2350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410440
34	NC_006509	GGA	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410440
35	NC_006509	GAA	2	6	2980	2985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410441
36	NC_006509	GAA	2	6	3105	3110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410441
37	NC_006509	TCA	2	6	3243	3248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410441
38	NC_006509	GTC	3	9	3440	3448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410441
39	NC_006509	TCC	2	6	3474	3479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56410441
40	NC_006509	GAA	2	6	3529	3534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410441
41	NC_006509	GAA	2	6	3537	3542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410441
42	NC_006509	ATA	2	6	3564	3569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410441
43	NC_006509	GTT	2	6	3681	3686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410441
44	NC_006509	TGA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410441
45	NC_006509	GAT	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410441
46	NC_006509	ATG	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410441
47	NC_006509	GAG	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410441
48	NC_006509	GAA	2	6	3877	3882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410441
49	NC_006509	GGA	2	6	3916	3921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410441
50	NC_006509	ATT	2	6	3941	3946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56410441
51	NC_006509	CGG	2	6	3965	3970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410441
52	NC_006509	GAG	2	6	4034	4039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410441
53	NC_006509	AAC	2	6	4050	4055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410441
54	NC_006509	GGA	2	6	4066	4071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410441
55	NC_006509	ATG	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410441
56	NC_006509	GCG	2	6	4156	4161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410441
57	NC_006509	CAG	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410441
58	NC_006509	TAC	2	6	5273	5278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410442
59	NC_006509	TCA	2	6	5324	5329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410442
60	NC_006509	GGA	2	6	5392	5397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410442
61	NC_006509	GTC	2	6	5416	5421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410442
62	NC_006509	TGA	2	6	5502	5507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410442
63	NC_006509	TGT	2	6	5634	5639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410442
64	NC_006509	TTG	2	6	5669	5674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410442
65	NC_006509	TCA	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410442
66	NC_006509	CAA	2	6	6017	6022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410442
67	NC_006509	AAC	2	6	6030	6035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410442
68	NC_006509	TTA	2	6	6060	6065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56410442
69	NC_006509	GGA	2	6	6128	6133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410443
70	NC_006509	TGA	2	6	6268	6273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410443
71	NC_006509	GAG	2	6	6285	6290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410443
72	NC_006509	CTG	2	6	6533	6538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410444
73	NC_006509	AGA	2	6	6599	6604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410444
74	NC_006509	GAT	2	6	6674	6679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410444
75	NC_006509	CTT	2	6	6800	6805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56410444
76	NC_006509	CCG	2	6	6838	6843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410444
77	NC_006509	AGA	2	6	7960	7965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410445
78	NC_006509	CAA	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410445
79	NC_006509	GTT	2	6	8035	8040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410445
80	NC_006509	ATT	2	6	8129	8134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56410445
81	NC_006509	GAA	2	6	8189	8194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410445
82	NC_006509	TAT	2	6	8237	8242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56410445
83	NC_006509	AGC	2	6	8287	8292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410445
84	NC_006509	TGA	2	6	8398	8403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410445
85	NC_006509	TTG	2	6	8448	8453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410445
86	NC_006509	CCG	2	6	8516	8521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410445
87	NC_006509	GAA	2	6	8579	8584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410445
88	NC_006509	AAG	2	6	8604	8609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410445
89	NC_006509	AAC	2	6	8781	8786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410445
90	NC_006509	TCC	2	6	8839	8844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56410445
91	NC_006509	ACG	3	9	9294	9302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410445
92	NC_006509	CAA	2	6	9332	9337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410445
93	NC_006509	TAC	2	6	9461	9466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410445
94	NC_006509	TCG	2	6	9493	9498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410445
95	NC_006509	TTG	2	6	9507	9512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56410445
96	NC_006509	ATG	2	6	9615	9620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410445
97	NC_006509	ACA	3	9	9798	9806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410445
98	NC_006509	AGT	2	6	10052	10057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410446
99	NC_006509	GAA	2	6	10074	10079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410446
100	NC_006509	TGC	2	6	10087	10092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410446
101	NC_006509	GAT	2	6	10130	10135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410446
102	NC_006509	ATA	2	6	10298	10303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410446
103	NC_006509	AAC	2	6	10372	10377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410446
104	NC_006509	AGA	2	6	10384	10389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410446
105	NC_006509	TGA	2	6	10393	10398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410446
106	NC_006509	CTA	2	6	10443	10448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410446
107	NC_006509	CAT	2	6	10621	10626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410446
108	NC_006509	GAA	2	6	10640	10645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410446
109	NC_006509	ACA	2	6	10745	10750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410446
110	NC_006509	GAT	2	6	10847	10852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410446
111	NC_006509	TGC	2	6	10978	10983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410446
112	NC_006509	GAT	2	6	11132	11137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410446
113	NC_006509	TAG	2	6	11145	11150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410446
114	NC_006509	TAG	2	6	11226	11231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410446
115	NC_006509	AAC	2	6	11241	11246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410446
116	NC_006509	AAT	2	6	11477	11482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410446
117	NC_006509	ACA	3	9	11509	11517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410446
118	NC_006509	CTT	3	9	11694	11702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56410447
119	NC_006509	ATC	2	6	11713	11718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410447
120	NC_006509	ATA	2	6	11900	11905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410447
121	NC_006509	ATC	2	6	11909	11914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410447
122	NC_006509	GAT	2	6	11942	11947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410447
123	NC_006509	TTC	2	6	12031	12036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56410447
124	NC_006509	TAA	2	6	12052	12057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410447
125	NC_006509	AGA	2	6	12197	12202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410447
126	NC_006509	GAA	2	6	12501	12506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410447
127	NC_006509	TAT	2	6	12627	12632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56410447
128	NC_006509	ATA	2	6	12633	12638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410447
129	NC_006509	AGA	2	6	12667	12672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410447
130	NC_006509	ATT	2	6	12772	12777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56410447
131	NC_006509	AAG	2	6	12862	12867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56410447
132	NC_006509	AGG	2	6	13156	13161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56410447
133	NC_006509	AAT	2	6	13184	13189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410447
134	NC_006509	TCT	2	6	13211	13216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56410447
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139	NC_006509	ATA	2	6	13341	13346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410447
140	NC_006509	TCT	2	6	13347	13352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56410447
141	NC_006509	TTA	2	6	13373	13378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56410447
142	NC_006509	ATC	2	6	13384	13389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410447
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144	NC_006509	ATT	2	6	13412	13417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56410447
145	NC_006509	CAT	2	6	13465	13470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410448
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148	NC_006509	CAA	2	6	13718	13723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410448
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150	NC_006509	TAG	2	6	13803	13808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410448
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154	NC_006509	CTT	2	6	14424	14429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56410449
155	NC_006509	TCG	2	6	14537	14542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410449
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162	NC_006509	AAT	2	6	15023	15028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410449
163	NC_006509	CTG	2	6	15151	15156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410449
164	NC_006509	CGT	2	6	15349	15354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56410449
165	NC_006509	TCC	2	6	15373	15378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56410449
166	NC_006509	CGG	2	6	15436	15441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410449
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171	NC_006509	TCC	2	6	16411	16416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56410450
172	NC_006509	ACC	2	6	16567	16572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56410450
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179	NC_006509	TCC	2	6	17472	17477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56410451
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182	NC_006509	CGG	2	6	17669	17674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410451
183	NC_006509	GTG	2	6	17878	17883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56410451
184	NC_006509	GCC	2	6	17938	17943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410451
185	NC_006509	GAC	2	6	17979	17984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410451
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200	NC_006509	GCC	2	6	19005	19010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56410452
201	NC_006509	CAA	2	6	19020	19025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56410452
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223	NC_006509	TAC	2	6	20738	20743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410453
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231	NC_006509	ACG	2	6	21350	21355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410454
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240	NC_006509	ATC	2	6	21886	21891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410454
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242	NC_006509	TCA	2	6	22256	22261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410454
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246	NC_006509	CTT	2	6	22634	22639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56410455
247	NC_006509	TAA	2	6	22812	22817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56410455
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249	NC_006509	TTC	2	6	23059	23064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56410456
250	NC_006509	ATC	2	6	23081	23086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56410456
251	NC_006509	CCT	2	6	23129	23134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56410456
252	NC_006509	GCA	2	6	23192	23197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56410456
253	NC_006509	CGG	2	6	23219	23224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56410456
254	NC_006509	TTC	2	6	23290	23295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56410456
255	NC_006509	TCC	2	6	23333	23338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56410456
256	NC_006509	TAG	2	6	23395	23400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56410456
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258	NC_006509	CCA	2	6	23684	23689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56410456
259	NC_006509	TGG	2	6	23773	23778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56410456
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263	NC_006509	CCA	2	6	23896	23901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56410457
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