MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.03

Total Repeats: 425

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019759	AGG	2	6	120	125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434408187
2	NC_019759	GGA	2	6	157	162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434408187
3	NC_019759	CAA	2	6	172	177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408187
4	NC_019759	CTG	2	6	284	289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408187
5	NC_019759	CTG	2	6	373	378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408187
6	NC_019759	CCA	2	6	460	465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434408187
7	NC_019759	GCT	2	6	496	501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408187
8	NC_019759	GCT	2	6	510	515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408187
9	NC_019759	AAG	2	6	586	591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408187
10	NC_019759	TGA	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408187
11	NC_019759	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408187
12	NC_019759	ACT	2	6	907	912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434408188
13	NC_019759	TAA	2	6	998	1003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408188
14	NC_019759	CAA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408188
15	NC_019759	CAA	2	6	1038	1043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408188
16	NC_019759	AGC	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408188
17	NC_019759	AAG	2	6	1156	1161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408188
18	NC_019759	GAA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408188
19	NC_019759	CTT	2	6	1188	1193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408188
20	NC_019759	GTA	2	6	1224	1229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408188
21	NC_019759	AGC	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019759	GAA	2	6	1469	1474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019759	CCA	2	6	1499	1504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019759	TCT	2	6	1508	1513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019759	ATT	2	6	1544	1549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019759	GAA	2	6	1589	1594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
27	NC_019759	TGT	2	6	1675	1680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434408189
28	NC_019759	GCG	2	6	1704	1709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434408189
29	NC_019759	GCT	2	6	1858	1863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408189
30	NC_019759	TAG	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408189
31	NC_019759	CCA	2	6	1897	1902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434408189
32	NC_019759	CCG	2	6	1908	1913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434408189
33	NC_019759	CTA	2	6	1952	1957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434408189
34	NC_019759	GAC	2	6	2213	2218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408189
35	NC_019759	GTT	2	6	2255	2260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434408189
36	NC_019759	AGA	3	9	2398	2406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
37	NC_019759	GCG	2	6	2497	2502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434408189
38	NC_019759	AGA	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
39	NC_019759	TGA	2	6	2530	2535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408189
40	NC_019759	GAA	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
41	NC_019759	CTT	2	6	2721	2726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408189
42	NC_019759	CGC	3	9	2756	2764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434408189
43	NC_019759	GAA	3	9	2789	2797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
44	NC_019759	TTG	2	6	2798	2803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434408189
45	NC_019759	GGA	2	6	2872	2877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434408189
46	NC_019759	GAA	2	6	2888	2893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
47	NC_019759	AGA	2	6	2905	2910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
48	NC_019759	GAA	2	6	3035	3040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
49	NC_019759	CTG	2	6	3050	3055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408189
50	NC_019759	CCA	2	6	3098	3103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434408189
51	NC_019759	ACG	2	6	3111	3116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408189
52	NC_019759	CTA	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434408189
53	NC_019759	CGG	2	6	3244	3249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434408189
54	NC_019759	GAA	2	6	3260	3265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
55	NC_019759	CGC	2	6	3266	3271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434408189
56	NC_019759	GAA	2	6	3514	3519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
57	NC_019759	CGG	2	6	3585	3590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434408189
58	NC_019759	CTG	2	6	3602	3607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408189
59	NC_019759	CAA	2	6	3683	3688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408189
60	NC_019759	AGA	2	6	3706	3711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
61	NC_019759	GCA	2	6	3751	3756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408189
62	NC_019759	GCA	2	6	3779	3784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408189
63	NC_019759	GCG	2	6	3787	3792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434408189
64	NC_019759	CTT	2	6	3813	3818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408189
65	NC_019759	CCG	2	6	3897	3902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434408189
66	NC_019759	CTG	2	6	3944	3949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408189
67	NC_019759	TTA	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408189
68	NC_019759	CGG	2	6	4208	4213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434408189
69	NC_019759	GAA	2	6	4298	4303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
70	NC_019759	CGA	2	6	4365	4370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408189
71	NC_019759	GAA	2	6	4427	4432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
72	NC_019759	AGA	2	6	4504	4509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
73	NC_019759	TGC	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408189
74	NC_019759	AGG	2	6	4663	4668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434408189
75	NC_019759	GTA	2	6	4676	4681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408189
76	NC_019759	TGC	2	6	4692	4697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408189
77	NC_019759	ACA	2	6	4711	4716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408189
78	NC_019759	GGC	2	6	4771	4776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434408189
79	NC_019759	GCA	2	6	4784	4789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408189
80	NC_019759	GCA	2	6	4910	4915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408189
81	NC_019759	GAA	2	6	4930	4935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
82	NC_019759	AGA	3	9	5014	5022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408189
83	NC_019759	AGA	2	6	5187	5192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019759	ACG	3	9	5282	5290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408190
85	NC_019759	TTG	2	6	5300	5305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434408190
86	NC_019759	AGA	2	6	5523	5528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408190
87	NC_019759	GTT	2	6	5776	5781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019759	ATT	2	6	5989	5994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408191
89	NC_019759	TGG	2	6	6162	6167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434408192
90	NC_019759	AAC	2	6	6193	6198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408192
91	NC_019759	ACA	2	6	6212	6217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408192
92	NC_019759	TTG	2	6	6254	6259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434408192
93	NC_019759	TAG	2	6	6274	6279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408192
94	NC_019759	AAT	2	6	6282	6287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408192
95	NC_019759	ATT	2	6	6462	6467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019759	TAG	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019759	AGA	2	6	6536	6541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019759	ATA	2	6	6622	6627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408193
99	NC_019759	ATT	2	6	6678	6683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408193
100	NC_019759	AAC	2	6	6753	6758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408193
101	NC_019759	CAA	2	6	6780	6785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408193
102	NC_019759	ACA	2	6	6901	6906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408193
103	NC_019759	TGC	2	6	6926	6931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408193
104	NC_019759	GAA	2	6	6960	6965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408193
105	NC_019759	TAA	2	6	7042	7047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408193
106	NC_019759	CCG	2	6	7076	7081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434408193
107	NC_019759	CTT	2	6	7132	7137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408193
108	NC_019759	TTA	2	6	7151	7156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408193
109	NC_019759	CAA	2	6	7170	7175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408193
110	NC_019759	CAA	2	6	7219	7224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408193
111	NC_019759	TAA	2	6	7229	7234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408193
112	NC_019759	GAA	2	6	7239	7244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408193
113	NC_019759	TGA	2	6	7388	7393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408193
114	NC_019759	ACA	2	6	7520	7525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434408193
115	NC_019759	GAA	2	6	7592	7597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408193
116	NC_019759	TTC	2	6	7685	7690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408193
117	NC_019759	ATT	2	6	7758	7763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408193
118	NC_019759	ATT	2	6	7818	7823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408193
119	NC_019759	TTG	2	6	7846	7851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434408193
120	NC_019759	AGA	2	6	7913	7918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434408193
121	NC_019759	CTG	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408194
122	NC_019759	ATG	2	6	8048	8053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408194
123	NC_019759	AAT	2	6	8085	8090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408194
124	NC_019759	TTA	2	6	8121	8126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408194
125	NC_019759	CAC	2	6	8180	8185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434408194
126	NC_019759	TAT	2	6	8287	8292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434408194
127	NC_019759	TAA	2	6	8358	8363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408194
128	NC_019759	TAG	2	6	8411	8416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434408194
129	NC_019759	TTG	2	6	8451	8456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434408194
130	NC_019759	AAT	2	6	8466	8471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408194
131	NC_019759	TAA	2	6	8517	8522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434408194
132	NC_019759	GAC	2	6	8551	8556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434408194
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258	NC_019759	TCT	2	6	18236	18241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408198
259	NC_019759	GGC	2	6	18308	18313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434408198
260	NC_019759	GGT	2	6	18317	18322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434408198
261	NC_019759	TCT	2	6	18344	18349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434408198
262	NC_019759	TTG	2	6	18416	18421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434408198
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269	NC_019759	CAT	2	6	18847	18852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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271	NC_019759	AGT	2	6	18970	18975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_019759	GTC	2	6	18990	18995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_019759	GCT	3	9	19190	19198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434408199
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367	NC_019759	AAT	2	6	27055	27060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_019759	CAC	2	6	27951	27956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
380	NC_019759	TAT	2	6	28043	28048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_019759	GCA	2	6	28160	28165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_019759	GAA	2	6	28208	28213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_019759	CTA	2	6	30751	30756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.