MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Gloeocapsa sp. PCC 7428 plasmid pGLO7428.01

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019746	TG	3	6	2114	2119	0 %	50 %	50 %	0 %	434395722
2	NC_019746	CG	3	6	2951	2956	0 %	0 %	50 %	50 %	434395722
3	NC_019746	GT	3	6	3587	3592	0 %	50 %	50 %	0 %	434395722
4	NC_019746	CA	3	6	5015	5020	50 %	0 %	0 %	50 %	434395723
5	NC_019746	GC	3	6	5281	5286	0 %	0 %	50 %	50 %	434395723
6	NC_019746	AT	3	6	6622	6627	50 %	50 %	0 %	0 %	434395723
7	NC_019746	GA	3	6	7171	7176	50 %	0 %	50 %	0 %	434395723
8	NC_019746	AT	3	6	7423	7428	50 %	50 %	0 %	0 %	434395723
9	NC_019746	AT	3	6	10979	10984	50 %	50 %	0 %	0 %	434395723
10	NC_019746	GC	3	6	11625	11630	0 %	0 %	50 %	50 %	434395723
11	NC_019746	GC	3	6	12133	12138	0 %	0 %	50 %	50 %	434395724
12	NC_019746	AT	3	6	12245	12250	50 %	50 %	0 %	0 %	434395724
13	NC_019746	AC	3	6	12564	12569	50 %	0 %	0 %	50 %	434395724
14	NC_019746	GC	4	8	13247	13254	0 %	0 %	50 %	50 %	434395724
15	NC_019746	CG	3	6	13401	13406	0 %	0 %	50 %	50 %	434395724
16	NC_019746	GC	3	6	13964	13969	0 %	0 %	50 %	50 %	434395724
17	NC_019746	TA	3	6	14166	14171	50 %	50 %	0 %	0 %	434395724
18	NC_019746	CA	3	6	16137	16142	50 %	0 %	0 %	50 %	434395724
19	NC_019746	AT	3	6	17446	17451	50 %	50 %	0 %	0 %	434395724
20	NC_019746	TA	3	6	17604	17609	50 %	50 %	0 %	0 %	434395724
21	NC_019746	CG	3	6	20872	20877	0 %	0 %	50 %	50 %	434395724
22	NC_019746	TA	3	6	21983	21988	50 %	50 %	0 %	0 %	434395724
23	NC_019746	CG	4	8	22169	22176	0 %	0 %	50 %	50 %	434395724
24	NC_019746	CG	3	6	23687	23692	0 %	0 %	50 %	50 %	434395725
25	NC_019746	CA	3	6	24324	24329	50 %	0 %	0 %	50 %	434395725
26	NC_019746	AT	3	6	25868	25873	50 %	50 %	0 %	0 %	434395725
27	NC_019746	TC	3	6	26599	26604	0 %	50 %	0 %	50 %	434395726
28	NC_019746	TA	3	6	26689	26694	50 %	50 %	0 %	0 %	434395726
29	NC_019746	TG	3	6	27440	27445	0 %	50 %	50 %	0 %	434395726
30	NC_019746	TA	3	6	27488	27493	50 %	50 %	0 %	0 %	434395726
31	NC_019746	AT	3	6	28417	28422	50 %	50 %	0 %	0 %	434395726
32	NC_019746	CA	3	6	28444	28449	50 %	0 %	0 %	50 %	434395726
33	NC_019746	AT	3	6	28705	28710	50 %	50 %	0 %	0 %	434395726
34	NC_019746	TG	3	6	33809	33814	0 %	50 %	50 %	0 %	434395732
35	NC_019746	AC	3	6	35601	35606	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_019746	CT	3	6	35620	35625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019746	CT	3	6	36035	36040	0 %	50 %	0 %	50 %	434395736
38	NC_019746	GA	3	6	36130	36135	50 %	0 %	50 %	0 %	434395736
39	NC_019746	GT	3	6	36516	36521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019746	CG	3	6	38375	38380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019746	TC	3	6	38662	38667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019746	CT	3	6	39363	39368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_019746	GA	3	6	42371	42376	50 %	0 %	50 %	0 %	434395740
44	NC_019746	AC	3	6	42955	42960	50 %	0 %	0 %	50 %	434395741
45	NC_019746	TG	3	6	43140	43145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019746	TC	3	6	44850	44855	0 %	50 %	0 %	50 %	434395743
47	NC_019746	GA	3	6	45372	45377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019746	TA	3	6	46068	46073	50 %	50 %	0 %	0 %	434395744
49	NC_019746	GC	3	6	46196	46201	0 %	0 %	50 %	50 %	434395744
50	NC_019746	CG	3	6	46304	46309	0 %	0 %	50 %	50 %	434395744
51	NC_019746	TG	3	6	47251	47256	0 %	50 %	50 %	0 %	434395746
52	NC_019746	GT	3	6	47309	47314	0 %	50 %	50 %	0 %	434395746
53	NC_019746	CG	3	6	47931	47936	0 %	0 %	50 %	50 %	434395747
54	NC_019746	CG	3	6	48328	48333	0 %	0 %	50 %	50 %	434395747
55	NC_019746	TA	3	6	48485	48490	50 %	50 %	0 %	0 %	434395747
56	NC_019746	TA	3	6	48974	48979	50 %	50 %	0 %	0 %	434395748
57	NC_019746	GA	3	6	51480	51485	50 %	0 %	50 %	0 %	434395748
58	NC_019746	GA	3	6	53740	53745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019746	AG	4	8	53936	53943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019746	GA	3	6	53993	53998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019746	CT	3	6	54251	54256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_019746	CT	3	6	54892	54897	0 %	50 %	0 %	50 %	434395750
63	NC_019746	TA	3	6	55522	55527	50 %	50 %	0 %	0 %	434395750
64	NC_019746	GA	3	6	59359	59364	50 %	0 %	50 %	0 %	434395755
65	NC_019746	TC	3	6	59836	59841	0 %	50 %	0 %	50 %	434395755
66	NC_019746	CA	3	6	61760	61765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_019746	CA	3	6	62154	62159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_019746	AG	3	6	62487	62492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019746	AT	3	6	62834	62839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019746	GT	3	6	63644	63649	0 %	50 %	50 %	0 %	434395757
71	NC_019746	TA	3	6	66010	66015	50 %	50 %	0 %	0 %	434395758
72	NC_019746	CA	3	6	67355	67360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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74	NC_019746	TA	3	6	68601	68606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019746	TG	3	6	69462	69467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019746	TC	3	6	69556	69561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_019746	AT	3	6	70526	70531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019746	TG	3	6	70790	70795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019746	CT	3	6	71355	71360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_019746	GA	3	6	71375	71380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019746	CG	3	6	71845	71850	0 %	0 %	50 %	50 %	434395762
82	NC_019746	TC	3	6	72841	72846	0 %	50 %	0 %	50 %	434395762
83	NC_019746	AC	3	6	75525	75530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019746	GA	3	6	75847	75852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019746	TG	3	6	76833	76838	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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87	NC_019746	TC	3	6	78626	78631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_019746	GA	3	6	79626	79631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019746	AG	3	6	79872	79877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019746	AG	3	6	81606	81611	50 %	0 %	50 %	0 %	434395768
91	NC_019746	CG	3	6	81842	81847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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93	NC_019746	TA	3	6	82902	82907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019746	GC	3	6	83577	83582	0 %	0 %	50 %	50 %	434395771
95	NC_019746	CG	3	6	83938	83943	0 %	0 %	50 %	50 %	434395771
96	NC_019746	CG	3	6	85358	85363	0 %	0 %	50 %	50 %	434395772
97	NC_019746	CT	3	6	85591	85596	0 %	50 %	0 %	50 %	434395772
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103	NC_019746	GA	3	6	92639	92644	50 %	0 %	50 %	0 %	434395777
104	NC_019746	CG	3	6	92867	92872	0 %	0 %	50 %	50 %	434395777
105	NC_019746	TG	3	6	92948	92953	0 %	50 %	50 %	0 %	434395777
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109	NC_019746	AT	3	6	94977	94982	50 %	50 %	0 %	0 %	434395779
110	NC_019746	AG	3	6	96255	96260	50 %	0 %	50 %	0 %	434395780
111	NC_019746	GA	3	6	96593	96598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019746	AT	3	6	97742	97747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019746	TA	3	6	98689	98694	50 %	50 %	0 %	0 %	434395781
114	NC_019746	AT	3	6	100471	100476	50 %	50 %	0 %	0 %	434395782
115	NC_019746	CG	3	6	100757	100762	0 %	0 %	50 %	50 %	434395783
116	NC_019746	AT	3	6	102931	102936	50 %	50 %	0 %	0 %	434395785
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129	NC_019746	AG	3	6	118099	118104	50 %	0 %	50 %	0 %	434395798
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139	NC_019746	TG	3	6	122418	122423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_019746	GT	3	6	124852	124857	0 %	50 %	50 %	0 %	434395804
145	NC_019746	TC	3	6	125189	125194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.