MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 96961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019703	GCA	2	6	186979	186984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223620
4002	NC_019703	CTG	2	6	187029	187034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223620
4003	NC_019703	T	6	6	187044	187049	0 %	100 %	0 %	0 %	428223620
4004	NC_019703	GCTT	2	8	187086	187093	0 %	50 %	25 %	25 %	428223620
4005	NC_019703	GGTT	2	8	187183	187190	0 %	50 %	50 %	0 %	428223620
4006	NC_019703	TAAT	2	8	187218	187225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_019703	TAA	2	6	187227	187232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_019703	AAT	2	6	187286	187291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_019703	ATTA	2	8	187311	187318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_019703	ATTACT	2	12	187326	187337	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4011	NC_019703	AGA	2	6	187378	187383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_019703	ACT	2	6	187444	187449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_019703	TGA	2	6	187461	187466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_019703	CAG	2	6	187525	187530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_019703	GAAG	2	8	187583	187590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_019703	GGT	2	6	187667	187672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223621
4017	NC_019703	GGT	2	6	187705	187710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223621
4018	NC_019703	GAG	2	6	187756	187761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223621
4019	NC_019703	GGT	2	6	187845	187850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223621
4020	NC_019703	CGA	3	9	187857	187865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223621
4021	NC_019703	GCG	2	6	188042	188047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223621
4022	NC_019703	CGG	2	6	188049	188054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223621
4023	NC_019703	GGC	2	6	188116	188121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223621
4024	NC_019703	GCT	2	6	188226	188231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223621
4025	NC_019703	TGC	2	6	188240	188245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223621
4026	NC_019703	CCG	2	6	188256	188261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223621
4027	NC_019703	TCAGC	2	10	188304	188313	20 %	20 %	20 %	40 %	428223621
4028	NC_019703	TCA	2	6	188340	188345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223621
4029	NC_019703	GGT	2	6	188365	188370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223621
4030	NC_019703	GCAG	2	8	188388	188395	25 %	0 %	50 %	25 %	428223621
4031	NC_019703	GAA	3	9	188427	188435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_019703	CAA	2	6	188470	188475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_019703	GATTGT	2	12	188582	188593	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_019703	GAA	2	6	188602	188607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_019703	GAT	2	6	188676	188681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_019703	GGT	2	6	188716	188721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_019703	TTG	2	6	188777	188782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223622
4038	NC_019703	GCG	2	6	188851	188856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223622
4039	NC_019703	AT	3	6	188874	188879	50 %	50 %	0 %	0 %	428223622
4040	NC_019703	GCT	2	6	188904	188909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223622
4041	NC_019703	CCA	2	6	189008	189013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223622
4042	NC_019703	CCA	2	6	189080	189085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223622
4043	NC_019703	GGA	2	6	189087	189092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223622
4044	NC_019703	GCC	2	6	189097	189102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223622
4045	NC_019703	CCAGCG	2	12	189105	189116	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	428223622
4046	NC_019703	TCA	2	6	189212	189217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223622
4047	NC_019703	GC	3	6	189254	189259	0 %	0 %	50 %	50 %	428223622
4048	NC_019703	AGC	2	6	189287	189292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223622
4049	NC_019703	GGC	2	6	189295	189300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223622
4050	NC_019703	CCT	2	6	189451	189456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223623
4051	NC_019703	TGC	2	6	189564	189569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223623
4052	NC_019703	CCA	2	6	189706	189711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223623
4053	NC_019703	CGG	2	6	189737	189742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223623
4054	NC_019703	G	6	6	189762	189767	0 %	0 %	100 %	0 %	428223623
4055	NC_019703	CAG	2	6	189889	189894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223623
4056	NC_019703	GCT	2	6	189900	189905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223623
4057	NC_019703	CAG	2	6	189968	189973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223623
4058	NC_019703	TTC	2	6	190042	190047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_019703	CAG	2	6	190134	190139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_019703	CAA	2	6	190161	190166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_019703	GAT	2	6	190326	190331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_019703	A	7	7	190464	190470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_019703	AGG	2	6	190474	190479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_019703	TCTA	2	8	190527	190534	25 %	50 %	0 %	25 %	428223624
4065	NC_019703	TCC	2	6	190539	190544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223624
4066	NC_019703	G	6	6	190694	190699	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_019703	GA	3	6	190950	190955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_019703	GTA	2	6	190958	190963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_019703	TCC	2	6	191026	191031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223625
4070	NC_019703	CT	3	6	191054	191059	0 %	50 %	0 %	50 %	428223625
4071	NC_019703	ACG	2	6	191301	191306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223625
4072	NC_019703	CGCAAG	2	12	191312	191323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223625
4073	NC_019703	CCT	2	6	191359	191364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223625
4074	NC_019703	TGA	2	6	191413	191418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223625
4075	NC_019703	T	6	6	191654	191659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_019703	CTC	2	6	191671	191676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_019703	CTT	2	6	191776	191781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_019703	CAT	2	6	191823	191828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223626
4079	NC_019703	TGC	2	6	191840	191845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223626
4080	NC_019703	CGG	2	6	191962	191967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223626
4081	NC_019703	GCC	2	6	191971	191976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223626
4082	NC_019703	TGGC	2	8	191988	191995	0 %	25 %	50 %	25 %	428223626
4083	NC_019703	CTG	2	6	192030	192035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223626
4084	NC_019703	GAC	2	6	192053	192058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223626
4085	NC_019703	TCG	2	6	192125	192130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223626
4086	NC_019703	CGC	2	6	192214	192219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223626
4087	NC_019703	TGC	2	6	192220	192225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223626
4088	NC_019703	GC	3	6	192234	192239	0 %	0 %	50 %	50 %	428223626
4089	NC_019703	TGA	2	6	192271	192276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223626
4090	NC_019703	CAG	2	6	192333	192338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223626
4091	NC_019703	GCG	2	6	192452	192457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223627
4092	NC_019703	GCG	2	6	192460	192465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223627
4093	NC_019703	GCG	2	6	192672	192677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223627
4094	NC_019703	CAC	2	6	192693	192698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223627
4095	NC_019703	CTG	2	6	192782	192787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223627
4096	NC_019703	GCG	2	6	192810	192815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223627
4097	NC_019703	GCA	2	6	192860	192865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223627
4098	NC_019703	AG	3	6	192888	192893	50 %	0 %	50 %	0 %	428223627
4099	NC_019703	CAG	2	6	193005	193010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_019703	CTC	2	6	193031	193036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_019703	ATCA	2	8	193174	193181	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4102	NC_019703	GCAC	2	8	193195	193202	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4103	NC_019703	T	6	6	193233	193238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_019703	TGCT	2	8	193262	193269	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4105	NC_019703	TTC	2	6	193291	193296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_019703	GACA	2	8	193355	193362	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4107	NC_019703	A	6	6	193401	193406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_019703	AGA	2	6	193417	193422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_019703	TTTAAC	2	12	193424	193435	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4110	NC_019703	CGC	2	6	193560	193565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223628
4111	NC_019703	TAC	2	6	193588	193593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223628
4112	NC_019703	GCC	2	6	193603	193608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223628
4113	NC_019703	CCT	2	6	193613	193618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223628
4114	NC_019703	TGCCCA	2	12	193697	193708	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428223628
4115	NC_019703	TTG	2	6	193715	193720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223628
4116	NC_019703	CGA	2	6	193772	193777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223628
4117	NC_019703	CTC	2	6	193795	193800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223628
4118	NC_019703	CTCAG	2	10	193807	193816	20 %	20 %	20 %	40 %	428223628
4119	NC_019703	GGCG	2	8	193899	193906	0 %	0 %	75 %	25 %	428223628
4120	NC_019703	GCC	2	6	193964	193969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223628
4121	NC_019703	AAT	2	6	193984	193989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223628
4122	NC_019703	ATT	2	6	194011	194016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223628
4123	NC_019703	CTG	2	6	194030	194035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223628
4124	NC_019703	GCT	2	6	194193	194198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223628
4125	NC_019703	A	6	6	194218	194223	100 %	0 %	0 %	0 %	428223628
4126	NC_019703	GAG	2	6	194260	194265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223628
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4134	NC_019703	CAG	2	6	194775	194780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223629
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4138	NC_019703	CGG	2	6	194908	194913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223629
4139	NC_019703	TTC	2	6	195024	195029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223629
4140	NC_019703	AGC	2	6	195049	195054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223629
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4152	NC_019703	GGT	2	6	195755	195760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223629
4153	NC_019703	GCG	2	6	195775	195780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223629
4154	NC_019703	CGGTGC	2	12	195781	195792	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	428223629
4155	NC_019703	ACTG	2	8	195870	195877	25 %	25 %	25 %	25 %	428223629
4156	NC_019703	TCG	2	6	195951	195956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223629
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4191	NC_019703	TTGA	2	8	198038	198045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4239	NC_019703	ACC	2	6	200977	200982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223633
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4241	NC_019703	GAT	2	6	201120	201125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223633
4242	NC_019703	CGCT	2	8	201134	201141	0 %	25 %	25 %	50 %	428223633
4243	NC_019703	CTT	2	6	201213	201218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223633
4244	NC_019703	GAT	2	6	201225	201230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223633
4245	NC_019703	AAC	2	6	201238	201243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223633
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4247	NC_019703	A	6	6	201394	201399	100 %	0 %	0 %	0 %	428223633
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4360	NC_019703	TGAG	2	8	206906	206913	25 %	25 %	50 %	0 %	428223646
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4492	NC_019703	GCCTA	2	10	212772	212781	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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4494	NC_019703	GCT	2	6	212935	212940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223651
4495	NC_019703	GCG	2	6	212945	212950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223651
4496	NC_019703	C	6	6	212978	212983	0 %	0 %	0 %	100 %	428223651
4497	NC_019703	CGA	2	6	213000	213005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223651
4498	NC_019703	GCT	2	6	213070	213075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223651
4499	NC_019703	CGC	2	6	213078	213083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223651
4500	NC_019703	GGT	2	6	213115	213120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223651

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