MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 96961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019703	GCTT	2	8	46409	46416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_019703	GGT	2	6	46451	46456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223509
1003	NC_019703	TGT	3	9	46457	46465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223509
1004	NC_019703	GC	3	6	46473	46478	0 %	0 %	50 %	50 %	428223509
1005	NC_019703	CAG	2	6	46488	46493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223509
1006	NC_019703	GTA	2	6	46512	46517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223509
1007	NC_019703	AAT	2	6	46536	46541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223509
1008	NC_019703	TCCA	2	8	46615	46622	25 %	25 %	0 %	50 %	428223509
1009	NC_019703	CAC	2	6	46665	46670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223509
1010	NC_019703	GGC	2	6	46694	46699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223509
1011	NC_019703	CCA	2	6	46838	46843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223509
1012	NC_019703	AGGC	2	8	46895	46902	25 %	0 %	50 %	25 %	428223509
1013	NC_019703	TTCA	2	8	46914	46921	25 %	50 %	0 %	25 %	428223509
1014	NC_019703	GCA	2	6	46985	46990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223509
1015	NC_019703	CCG	2	6	46995	47000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223509
1016	NC_019703	TCC	2	6	47017	47022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223509
1017	NC_019703	AGC	2	6	47023	47028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223509
1018	NC_019703	GCC	2	6	47091	47096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223509
1019	NC_019703	TCC	2	6	47125	47130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223509
1020	NC_019703	GCC	2	6	47146	47151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223509
1021	NC_019703	CCGTC	2	10	47156	47165	0 %	20 %	20 %	60 %	428223509
1022	NC_019703	C	6	6	47167	47172	0 %	0 %	0 %	100 %	428223509
1023	NC_019703	CAC	2	6	47175	47180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223509
1024	NC_019703	AGC	2	6	47254	47259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223509
1025	NC_019703	CGG	2	6	47308	47313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223509
1026	NC_019703	A	6	6	47376	47381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019703	CGC	2	6	47409	47414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_019703	CAG	2	6	47453	47458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223510
1029	NC_019703	AAT	2	6	47507	47512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223510
1030	NC_019703	GACC	2	8	47518	47525	25 %	0 %	25 %	50 %	428223510
1031	NC_019703	GCC	2	6	47535	47540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223510
1032	NC_019703	AGGTTG	2	12	47616	47627	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428223510
1033	NC_019703	A	6	6	47707	47712	100 %	0 %	0 %	0 %	428223510
1034	NC_019703	CAG	2	6	47723	47728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223510
1035	NC_019703	CG	3	6	47786	47791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_019703	CGG	2	6	47847	47852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223511
1037	NC_019703	TCG	2	6	47864	47869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223511
1038	NC_019703	CGT	2	6	47910	47915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223511
1039	NC_019703	CTC	2	6	47925	47930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223511
1040	NC_019703	ATG	2	6	47959	47964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223511
1041	NC_019703	CACC	2	8	47966	47973	25 %	0 %	0 %	75 %	428223511
1042	NC_019703	CCA	2	6	47978	47983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223511
1043	NC_019703	GCA	3	9	47984	47992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223511
1044	NC_019703	GCA	2	6	48011	48016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223511
1045	NC_019703	AAG	2	6	48028	48033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223511
1046	NC_019703	CAC	2	6	48045	48050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223511
1047	NC_019703	CGC	2	6	48054	48059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223511
1048	NC_019703	AGC	2	6	48118	48123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223511
1049	NC_019703	CGG	2	6	48160	48165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223511
1050	NC_019703	ATG	2	6	48214	48219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223511
1051	NC_019703	AGC	2	6	48364	48369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223511
1052	NC_019703	GC	3	6	48380	48385	0 %	0 %	50 %	50 %	428223511
1053	NC_019703	ATC	3	9	48391	48399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223511
1054	NC_019703	AGC	2	6	48406	48411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223511
1055	NC_019703	CAA	2	6	48419	48424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223511
1056	NC_019703	CAG	2	6	48449	48454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223511
1057	NC_019703	TGT	2	6	48455	48460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019703	GAAT	2	8	48478	48485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019703	CGG	2	6	48486	48491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_019703	ACT	2	6	48493	48498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223512
1061	NC_019703	GCT	2	6	48511	48516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223512
1062	NC_019703	CCGCTT	2	12	48526	48537	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428223512
1063	NC_019703	GCAG	2	8	48582	48589	25 %	0 %	50 %	25 %	428223512
1064	NC_019703	GCC	2	6	48723	48728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223512
1065	NC_019703	CTC	2	6	48737	48742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223512
1066	NC_019703	TGG	2	6	48760	48765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223512
1067	NC_019703	AGA	2	6	48790	48795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223512
1068	NC_019703	CTT	4	12	48830	48841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223512
1069	NC_019703	TTG	2	6	48849	48854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223512
1070	NC_019703	CCA	2	6	48865	48870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223512
1071	NC_019703	CGC	2	6	49002	49007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223512
1072	NC_019703	TTC	2	6	49111	49116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_019703	TC	3	6	49115	49120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_019703	AGGG	2	8	49149	49156	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019703	CCG	2	6	49231	49236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223513
1076	NC_019703	GCA	2	6	49264	49269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223513
1077	NC_019703	CAG	2	6	49289	49294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223513
1078	NC_019703	CAG	2	6	49364	49369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223513
1079	NC_019703	CAC	2	6	49397	49402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223513
1080	NC_019703	CTC	2	6	49421	49426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223513
1081	NC_019703	CAGC	3	12	49433	49444	25 %	0 %	25 %	50 %	428223513
1082	NC_019703	GCC	2	6	49475	49480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223513
1083	NC_019703	CAG	2	6	49499	49504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223513
1084	NC_019703	GCC	2	6	49559	49564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223513
1085	NC_019703	AAG	2	6	49662	49667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223513
1086	NC_019703	CTG	2	6	49715	49720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223513
1087	NC_019703	CAT	2	6	49754	49759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223513
1088	NC_019703	AGC	2	6	49811	49816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223513
1089	NC_019703	GC	3	6	49818	49823	0 %	0 %	50 %	50 %	428223513
1090	NC_019703	TCC	2	6	49826	49831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223513
1091	NC_019703	CAG	2	6	49832	49837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223513
1092	NC_019703	TTG	3	9	49845	49853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223513
1093	NC_019703	ACA	2	6	49887	49892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223513
1094	NC_019703	TGA	2	6	49936	49941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223513
1095	NC_019703	AGG	2	6	50019	50024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223513
1096	NC_019703	TCT	2	6	50049	50054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223513
1097	NC_019703	GCT	2	6	50128	50133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223513
1098	NC_019703	GCG	3	9	50136	50144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223513
1099	NC_019703	ACG	2	6	50169	50174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223513
1100	NC_019703	GAT	2	6	50195	50200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223513
1101	NC_019703	AGC	2	6	50205	50210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223513
1102	NC_019703	TAA	2	6	50275	50280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223513
1103	NC_019703	TGA	2	6	50361	50366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_019703	GCA	2	6	50377	50382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_019703	AGC	2	6	50390	50395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_019703	TTGCC	2	10	50418	50427	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1107	NC_019703	TGGC	2	8	50449	50456	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_019703	A	8	8	50530	50537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_019703	G	6	6	50642	50647	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_019703	GCT	2	6	50700	50705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223514
1111	NC_019703	TGGG	2	8	50764	50771	0 %	25 %	75 %	0 %	428223514
1112	NC_019703	GCT	2	6	50795	50800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223514
1113	NC_019703	AGCC	2	8	50815	50822	25 %	0 %	25 %	50 %	428223514
1114	NC_019703	CGA	2	6	50945	50950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223514
1115	NC_019703	GTA	2	6	50976	50981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223514
1116	NC_019703	GCT	2	6	51008	51013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223514
1117	NC_019703	GAA	2	6	51026	51031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223514
1118	NC_019703	CCT	2	6	51164	51169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223514
1119	NC_019703	GCC	2	6	51177	51182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223514
1120	NC_019703	GCG	2	6	51328	51333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223514
1121	NC_019703	GCTCGC	2	12	51344	51355	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	428223514
1122	NC_019703	AGT	2	6	51380	51385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223514
1123	NC_019703	TCG	2	6	51391	51396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223514
1124	NC_019703	GCC	2	6	51439	51444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223514
1125	NC_019703	TGG	2	6	51449	51454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223514
1126	NC_019703	CAG	2	6	51465	51470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223514
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1141	NC_019703	TTG	2	6	51926	51931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1249	NC_019703	TCAG	2	8	57661	57668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1250	NC_019703	CCT	2	6	57686	57691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1251	NC_019703	TTAAT	2	10	57734	57743	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1252	NC_019703	CTG	2	6	57747	57752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1254	NC_019703	AGT	2	6	57844	57849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_019703	TAC	2	6	57851	57856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_019703	TCC	2	6	57868	57873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1257	NC_019703	CTG	2	6	58001	58006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1258	NC_019703	GGT	2	6	58143	58148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1259	NC_019703	TGC	2	6	58183	58188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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