MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 96961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019703	GGA	2	6	236997	237002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_019703	AC	3	6	237047	237052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_019703	TAC	2	6	237054	237059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_019703	GCA	2	6	237077	237082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_019703	GC	3	6	237084	237089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_019703	AC	3	6	237216	237221	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_019703	GGA	3	9	237278	237286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_019703	CCT	2	6	237359	237364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_019703	GA	3	6	237411	237416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_019703	GGT	2	6	237501	237506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_019703	GA	3	6	237795	237800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_019703	CTG	2	6	237811	237816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_019703	TCAG	2	8	237862	237869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5014	NC_019703	GTA	2	6	237870	237875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_019703	GAA	2	6	237920	237925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_019703	TGG	2	6	237968	237973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_019703	CA	3	6	237983	237988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_019703	AAGC	2	8	238036	238043	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_019703	TA	3	6	238076	238081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_019703	GGT	2	6	238101	238106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_019703	TAG	2	6	238136	238141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_019703	GGA	2	6	238144	238149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_019703	AGAA	2	8	238152	238159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_019703	TAG	2	6	238173	238178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_019703	GCGA	2	8	238181	238188	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5026	NC_019703	TGCA	2	8	238212	238219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_019703	AGC	2	6	238265	238270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_019703	ACC	2	6	238378	238383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_019703	TG	3	6	238403	238408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_019703	GGGAG	2	10	238454	238463	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_019703	GAA	2	6	238535	238540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_019703	AAAGCG	2	12	238592	238603	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5033	NC_019703	AGCT	2	8	238766	238773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_019703	G	6	6	238820	238825	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_019703	ACC	2	6	238953	238958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_019703	AGG	2	6	238992	238997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_019703	AGG	2	6	239017	239022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_019703	AGC	2	6	239033	239038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_019703	AT	3	6	239127	239132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_019703	AGT	2	6	239164	239169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_019703	TCC	2	6	239273	239278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_019703	GAT	2	6	239409	239414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_019703	GAG	2	6	239443	239448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_019703	CTGAG	2	10	239462	239471	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5045	NC_019703	CT	4	8	239612	239619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_019703	GGT	2	6	239673	239678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_019703	CGG	2	6	239833	239838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_019703	GA	3	6	239929	239934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_019703	GAG	2	6	240085	240090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_019703	CCG	2	6	240091	240096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5051	NC_019703	CCT	2	6	240191	240196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_019703	GC	3	6	240211	240216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_019703	GTA	2	6	240460	240465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_019703	CGT	2	6	240522	240527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_019703	TTC	2	6	240576	240581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_019703	GAA	2	6	240601	240606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_019703	GCGGA	2	10	240661	240670	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5058	NC_019703	GAA	2	6	240748	240753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_019703	GA	3	6	240864	240869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_019703	GAA	2	6	240874	240879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_019703	AGC	2	6	240910	240915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_019703	ATCC	2	8	240959	240966	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_019703	GCG	2	6	240991	240996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_019703	CCT	2	6	241015	241020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_019703	TTA	2	6	241043	241048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_019703	A	7	7	241051	241057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_019703	CTTT	2	8	241089	241096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_019703	T	7	7	241094	241100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_019703	TGT	2	6	241143	241148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_019703	GTC	2	6	241149	241154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_019703	AAATT	2	10	241160	241169	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_019703	CTA	2	6	241260	241265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_019703	GTG	2	6	241296	241301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_019703	T	6	6	241457	241462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_019703	TTGA	2	8	241498	241505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_019703	AGCTG	2	10	241530	241539	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5077	NC_019703	TGT	2	6	241616	241621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_019703	TGC	2	6	241636	241641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_019703	GT	3	6	241662	241667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_019703	GGC	2	6	241673	241678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_019703	TGC	2	6	241691	241696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_019703	TGG	2	6	241706	241711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_019703	GCTG	2	8	241714	241721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_019703	TAG	2	6	241754	241759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223673
5085	NC_019703	CTTG	2	8	241761	241768	0 %	50 %	25 %	25 %	428223673
5086	NC_019703	AGT	2	6	241874	241879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223673
5087	NC_019703	GGC	2	6	241964	241969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223673
5088	NC_019703	TCA	2	6	242001	242006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223673
5089	NC_019703	ATG	2	6	242011	242016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223673
5090	NC_019703	AATC	2	8	242115	242122	50 %	25 %	0 %	25 %	428223673
5091	NC_019703	A	6	6	242147	242152	100 %	0 %	0 %	0 %	428223673
5092	NC_019703	AGG	2	6	242158	242163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223673
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5095	NC_019703	ATG	2	6	242463	242468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223673
5096	NC_019703	GCA	2	6	242492	242497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223673
5097	NC_019703	TAC	2	6	242586	242591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223673
5098	NC_019703	GCT	2	6	242630	242635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223673
5099	NC_019703	T	7	7	242691	242697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_019703	T	6	6	242784	242789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_019703	CAA	2	6	242808	242813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_019703	CAAA	2	8	242821	242828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5103	NC_019703	ATT	2	6	242896	242901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_019703	TTGT	2	8	242942	242949	0 %	75 %	25 %	0 %	428223674
5105	NC_019703	GACTG	2	10	242956	242965	20 %	20 %	40 %	20 %	428223674
5106	NC_019703	CTG	2	6	243060	243065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223674
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5108	NC_019703	GT	3	6	243157	243162	0 %	50 %	50 %	0 %	428223674
5109	NC_019703	AAC	2	6	243233	243238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223674
5110	NC_019703	ACG	2	6	243258	243263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223674
5111	NC_019703	GGT	2	6	243294	243299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223674
5112	NC_019703	AGC	2	6	243336	243341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223674
5113	NC_019703	TTG	2	6	243420	243425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428223674
5114	NC_019703	CAG	2	6	243575	243580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223674
5115	NC_019703	GAA	2	6	243620	243625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223674
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5117	NC_019703	T	6	6	243759	243764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_019703	CAG	2	6	243770	243775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_019703	GGT	2	6	243837	243842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223675
5120	NC_019703	GC	3	6	243954	243959	0 %	0 %	50 %	50 %	428223675
5121	NC_019703	CTT	2	6	243981	243986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428223675
5122	NC_019703	GCTG	2	8	244026	244033	0 %	25 %	50 %	25 %	428223675
5123	NC_019703	AAC	2	6	244036	244041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428223675
5124	NC_019703	GC	3	6	244063	244068	0 %	0 %	50 %	50 %	428223675
5125	NC_019703	CAG	2	6	244087	244092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223675
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5128	NC_019703	CAACG	2	10	244201	244210	40 %	0 %	20 %	40 %	428223675
5129	NC_019703	GCC	2	6	244220	244225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223675
5130	NC_019703	AAT	2	6	244240	244245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428223675
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5132	NC_019703	CG	3	6	244512	244517	0 %	0 %	50 %	50 %	428223675
5133	NC_019703	GCA	2	6	244605	244610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223675
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5265	NC_019703	ATC	2	6	250639	250644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5353	NC_019703	GA	3	6	255501	255506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5357	NC_019703	GGC	2	6	255710	255715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5359	NC_019703	AGG	2	6	255794	255799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5360	NC_019703	T	6	6	255855	255860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5377	NC_019703	GAA	2	6	256593	256598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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