MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Geitlerinema sp. PCC 7407 chromosome

Total Repeats: 96961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019703	GCA	2	6	213121	213126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223651
4502	NC_019703	CGC	2	6	213150	213155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223651
4503	NC_019703	GCT	2	6	213187	213192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223651
4504	NC_019703	GC	3	6	213225	213230	0 %	0 %	50 %	50 %	428223651
4505	NC_019703	GCT	2	6	213244	213249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223651
4506	NC_019703	TGGGC	2	10	213277	213286	0 %	20 %	60 %	20 %	428223651
4507	NC_019703	AGG	2	6	213369	213374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428223651
4508	NC_019703	GC	3	6	213435	213440	0 %	0 %	50 %	50 %	428223651
4509	NC_019703	GCG	2	6	213454	213459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223651
4510	NC_019703	CTGGC	2	10	213464	213473	0 %	20 %	40 %	40 %	428223651
4511	NC_019703	GGT	2	6	213475	213480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223651
4512	NC_019703	ACT	2	6	213522	213527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223651
4513	NC_019703	TG	3	6	213530	213535	0 %	50 %	50 %	0 %	428223651
4514	NC_019703	GGC	2	6	213544	213549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223651
4515	NC_019703	TGG	2	6	213572	213577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223651
4516	NC_019703	CTGGC	2	10	213677	213686	0 %	20 %	40 %	40 %	428223651
4517	NC_019703	GGC	2	6	213784	213789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223651
4518	NC_019703	TGG	2	6	213801	213806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223651
4519	NC_019703	GGT	2	6	213838	213843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223651
4520	NC_019703	TCGGG	2	10	213846	213855	0 %	20 %	60 %	20 %	428223651
4521	NC_019703	GCT	2	6	213856	213861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223651
4522	NC_019703	TGC	2	6	213864	213869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223651
4523	NC_019703	T	6	6	213872	213877	0 %	100 %	0 %	0 %	428223651
4524	NC_019703	TGG	2	6	213908	213913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223651
4525	NC_019703	GCT	2	6	213937	213942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223651
4526	NC_019703	CTG	2	6	214073	214078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223651
4527	NC_019703	GGC	2	6	214081	214086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223651
4528	NC_019703	CGG	2	6	214104	214109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223651
4529	NC_019703	GCCC	2	8	214153	214160	0 %	0 %	25 %	75 %	428223651
4530	NC_019703	CCA	2	6	214314	214319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223651
4531	NC_019703	ATG	2	6	214349	214354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223651
4532	NC_019703	CGC	2	6	214376	214381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223651
4533	NC_019703	GAC	3	9	214421	214429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223651
4534	NC_019703	TCGC	2	8	214464	214471	0 %	25 %	25 %	50 %	428223651
4535	NC_019703	CTGG	2	8	214492	214499	0 %	25 %	50 %	25 %	428223651
4536	NC_019703	GCT	2	6	214536	214541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223651
4537	NC_019703	GCC	2	6	214557	214562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223651
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4539	NC_019703	ACT	2	6	214742	214747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223652
4540	NC_019703	GCC	2	6	214757	214762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223652
4541	NC_019703	CGC	2	6	214774	214779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223652
4542	NC_019703	TCG	2	6	214787	214792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223652
4543	NC_019703	CCG	2	6	214798	214803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223652
4544	NC_019703	GCC	2	6	214946	214951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223652
4545	NC_019703	GCC	3	9	214964	214972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223652
4546	NC_019703	CAGC	2	8	215014	215021	25 %	0 %	25 %	50 %	428223652
4547	NC_019703	AGC	3	9	215033	215041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223652
4548	NC_019703	GGC	2	6	215064	215069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223652
4549	NC_019703	CGG	2	6	215096	215101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223652
4550	NC_019703	GCT	2	6	215128	215133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223652
4551	NC_019703	TGGG	2	8	215147	215154	0 %	25 %	75 %	0 %	428223652
4552	NC_019703	CAG	2	6	215203	215208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223652
4553	NC_019703	GCG	2	6	215209	215214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223652
4554	NC_019703	TTCGGG	2	12	215218	215229	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428223652
4555	NC_019703	TGG	2	6	215238	215243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223652
4556	NC_019703	TGC	2	6	215261	215266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_019703	AGG	2	6	215296	215301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_019703	TGA	2	6	215321	215326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_019703	GCC	2	6	215350	215355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_019703	TCG	2	6	215417	215422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223653
4561	NC_019703	CG	3	6	215496	215501	0 %	0 %	50 %	50 %	428223653
4562	NC_019703	CAG	2	6	215536	215541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223653
4563	NC_019703	TTTG	2	8	215553	215560	0 %	75 %	25 %	0 %	428223653
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4569	NC_019703	CGC	3	9	215723	215731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223653
4570	NC_019703	GCA	2	6	215766	215771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223653
4571	NC_019703	GCTGG	2	10	215812	215821	0 %	20 %	60 %	20 %	428223653
4572	NC_019703	AGC	2	6	215861	215866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223653
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4574	NC_019703	CGC	2	6	216003	216008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428223653
4575	NC_019703	CAG	3	9	216136	216144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223653
4576	NC_019703	CGG	2	6	216145	216150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223653
4577	NC_019703	GCCATT	2	12	216201	216212	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428223653
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4579	NC_019703	CGA	2	6	216300	216305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_019703	GA	3	6	216304	216309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_019703	GCC	2	6	216394	216399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_019703	A	6	6	216431	216436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_019703	GAG	2	6	216448	216453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_019703	ATC	2	6	216535	216540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223654
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4586	NC_019703	ATG	2	6	216565	216570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223654
4587	NC_019703	C	6	6	216619	216624	0 %	0 %	0 %	100 %	428223654
4588	NC_019703	A	6	6	216625	216630	100 %	0 %	0 %	0 %	428223654
4589	NC_019703	TGC	2	6	216661	216666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223654
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4591	NC_019703	TGG	2	6	216739	216744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428223654
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4594	NC_019703	ATG	2	6	216942	216947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223654
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4602	NC_019703	AGC	2	6	217191	217196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223654
4603	NC_019703	CTC	2	6	217203	217208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428223654
4604	NC_019703	GCT	2	6	217255	217260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223654
4605	NC_019703	GAA	2	6	217318	217323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428223655
4606	NC_019703	GC	3	6	217464	217469	0 %	0 %	50 %	50 %	428223655
4607	NC_019703	CCA	2	6	217503	217508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223655
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4610	NC_019703	GGC	2	6	217577	217582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223655
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4612	NC_019703	AGC	2	6	217619	217624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428223655
4613	NC_019703	AGGT	2	8	217691	217698	25 %	25 %	50 %	0 %	428223655
4614	NC_019703	TGC	2	6	217764	217769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223655
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4616	NC_019703	CGT	2	6	217875	217880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223655
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4619	NC_019703	T	6	6	217986	217991	0 %	100 %	0 %	0 %	428223655
4620	NC_019703	GAA	2	6	218062	218067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_019703	GCA	2	6	218116	218121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_019703	CCT	2	6	218188	218193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_019703	ACT	2	6	218207	218212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_019703	ATT	2	6	218215	218220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_019703	CCA	2	6	218331	218336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428223656
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4631	NC_019703	GA	3	6	218594	218599	50 %	0 %	50 %	0 %	428223657
4632	NC_019703	CTG	2	6	218619	218624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223657
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4745	NC_019703	CGCGAT	2	12	223964	223975	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428223661
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4753	NC_019703	CAGC	2	8	224281	224288	25 %	0 %	25 %	50 %	428223662
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4763	NC_019703	TCG	2	6	224899	224904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4869	NC_019703	GGC	2	6	230532	230537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223668
4870	NC_019703	ATC	2	6	230715	230720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428223668
4871	NC_019703	GCG	2	6	230740	230745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223668
4872	NC_019703	TGC	2	6	230789	230794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223668
4873	NC_019703	GC	3	6	230832	230837	0 %	0 %	50 %	50 %	428223668
4874	NC_019703	ATT	2	6	230865	230870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428223668
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4877	NC_019703	TCCG	2	8	231109	231116	0 %	25 %	25 %	50 %	428223668
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4882	NC_019703	AGT	2	6	231292	231297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428223668
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4884	NC_019703	GC	3	6	231368	231373	0 %	0 %	50 %	50 %	428223669
4885	NC_019703	GAAC	2	8	231388	231395	50 %	0 %	25 %	25 %	428223669
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4888	NC_019703	GATC	2	8	231772	231779	25 %	25 %	25 %	25 %	428223669
4889	NC_019703	GGC	2	6	231811	231816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428223669
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4892	NC_019703	CTC	2	6	231862	231867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4893	NC_019703	CT	3	6	231964	231969	0 %	50 %	0 %	50 %	428223670
4894	NC_019703	CG	3	6	231975	231980	0 %	0 %	50 %	50 %	428223670
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4906	NC_019703	GACAG	2	10	232953	232962	40 %	0 %	40 %	20 %	428223671
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4940	NC_019703	GCT	2	6	234437	234442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428223671
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4971	NC_019703	GA	3	6	235707	235712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4972	NC_019703	TAAGGC	2	12	235774	235785	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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4974	NC_019703	GAAA	2	8	235824	235831	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4975	NC_019703	GGC	2	6	235916	235921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4976	NC_019703	CGAA	2	8	235941	235948	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4977	NC_019703	AGG	2	6	236000	236005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4979	NC_019703	CGA	2	6	236123	236128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4983	NC_019703	GAGG	2	8	236252	236259	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4984	NC_019703	GAA	2	6	236293	236298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4985	NC_019703	CAG	2	6	236342	236347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4986	NC_019703	GGA	2	6	236360	236365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4987	NC_019703	ATT	2	6	236383	236388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4988	NC_019703	GGC	2	6	236407	236412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4989	NC_019703	CTG	2	6	236422	236427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4990	NC_019703	CTG	2	6	236466	236471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4991	NC_019703	GAA	2	6	236534	236539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4992	NC_019703	CTG	2	6	236559	236564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4993	NC_019703	AGT	2	6	236622	236627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4994	NC_019703	ACGC	2	8	236716	236723	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4995	NC_019703	GAA	2	6	236797	236802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4996	NC_019703	CTG	2	6	236832	236837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4997	NC_019703	GGT	2	6	236871	236876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_019703	GTC	2	6	236885	236890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4999	NC_019703	TCGTG	2	10	236894	236903	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5000	NC_019703	CAT	2	6	236953	236958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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