MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Gluconobacter oxydans H24 plasmid unnamed

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019397	CGAGCA	2	12	3661	3672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414344525
2	NC_019397	TATGGC	2	12	7209	7220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414344530
3	NC_019397	ATGTTG	2	12	10820	10831	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	414344536
4	NC_019397	ACAGGA	2	12	13557	13568	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_019397	CTGGAA	2	12	16967	16978	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414344543
6	NC_019397	GCGCGG	2	12	21659	21670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414344548
7	NC_019397	CTGTTC	2	12	34102	34113	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	414344567
8	NC_019397	TGGCCG	2	12	35186	35197	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	414344569
9	NC_019397	ATCGAT	2	12	35722	35733	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414344569
10	NC_019397	GACAGC	2	12	38367	38378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414344572
11	NC_019397	TCAACA	2	12	40291	40302	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019397	TTCAGG	2	12	42101	42112	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	414344578
13	NC_019397	GATCGG	2	12	42141	42152	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414344578
14	NC_019397	CCGGGG	2	12	43137	43148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414344578
15	NC_019397	GTAGCG	2	12	44708	44719	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414344580
16	NC_019397	ATGGCA	2	12	51639	51650	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414344593
17	NC_019397	GGACGC	2	12	52629	52640	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	414344594
18	NC_019397	GCCCCG	2	12	55443	55454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414344597
19	NC_019397	GGTGAA	2	12	56726	56737	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	414344597
20	NC_019397	CTACGC	2	12	59543	59554	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414344597
21	NC_019397	CGTGAC	2	12	59829	59840	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414344597
22	NC_019397	GGCCGT	2	12	60425	60436	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	414344597
23	NC_019397	CGGAGC	2	12	62135	62146	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	414344601
24	NC_019397	CAGCGG	2	12	63183	63194	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	414344601
25	NC_019397	GCGCAG	2	12	63409	63420	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	414344601
26	NC_019397	GCCCGA	2	12	63615	63626	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	414344601
27	NC_019397	AAAGGA	2	12	63863	63874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019397	GGACGA	2	12	64970	64981	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	414344603
29	NC_019397	GCCGGG	2	12	80896	80907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414344627
30	NC_019397	TCCCGG	2	12	84805	84816	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	414344632
31	NC_019397	CAGACC	2	12	87699	87710	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	414344637
32	NC_019397	GACCCT	2	12	88564	88575	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414344638
33	NC_019397	GGGCGC	2	12	98981	98992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414344647
34	NC_019397	GCACCG	2	12	106453	106464	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	414344657
35	NC_019397	CATCCG	2	12	106604	106615	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414344657
36	NC_019397	GCGACA	2	12	112453	112464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414344664
37	NC_019397	GCCTGA	2	12	116964	116975	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414344670
38	NC_019397	GGTCTT	2	12	116990	117001	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414344670
39	NC_019397	ACGTCC	2	12	117916	117927	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	414344671
40	NC_019397	TGTCGC	2	12	117971	117982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414344671
41	NC_019397	GCAGGC	2	12	118203	118214	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	414344671
42	NC_019397	CCCTCG	2	12	118380	118391	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	414344672
43	NC_019397	CCATGA	2	12	124511	124522	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414344678
44	NC_019397	GCGGGC	2	12	135231	135242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414344691
45	NC_019397	ACCGCA	2	12	141615	141626	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	414344697
46	NC_019397	TTCCTC	2	12	142874	142885	0 %	50 %	0 %	50 %	414344699
47	NC_019397	CAGTTT	2	12	143151	143162	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414344700
48	NC_019397	CTTCCT	2	12	149093	149104	0 %	50 %	0 %	50 %	414344706
49	NC_019397	TCCGGT	2	12	151269	151280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414344709
50	NC_019397	GCTTCT	2	12	156237	156248	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	414344718
51	NC_019397	TGAAAC	2	12	159256	159267	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	414344724
52	NC_019397	TTCGCC	2	12	160779	160790	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	414344725
53	NC_019397	ATTTTC	2	12	163260	163271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019397	ATCCTG	2	12	172098	172109	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414344740
55	NC_019397	GTGTCG	2	12	174093	174104	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	414344744
56	NC_019397	TCGCTG	2	12	174609	174620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019397	GAGGAA	2	12	177720	177731	50 %	0 %	50 %	0 %	414344749
58	NC_019397	TGACAG	2	12	184718	184729	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414344757
59	NC_019397	TGAATC	2	12	188089	188100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414344760
60	NC_019397	CTTCCT	2	12	192170	192181	0 %	50 %	0 %	50 %	414344763
61	NC_019397	CGGTCT	2	12	195576	195587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414344768
62	NC_019397	CTGCCG	2	12	199204	199215	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	414344771
63	NC_019397	CATTCG	2	12	201558	201569	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414344774
64	NC_019397	CCAGCG	2	12	208230	208241	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	414344780

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.