MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gordonia sp. KTR9 chromosome

Total Repeats: 144697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018581	GC	3	6	17893	17898	0 %	0 %	50 %	50 %	404212646
502	NC_018581	CCG	2	6	17933	17938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212646
503	NC_018581	ACGT	2	8	17950	17957	25 %	25 %	25 %	25 %	404212646
504	NC_018581	GAA	2	6	17964	17969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212646
505	NC_018581	CCG	2	6	17970	17975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212646
506	NC_018581	AGG	2	6	18041	18046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212646
507	NC_018581	AAG	2	6	18060	18065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212647
508	NC_018581	AGC	2	6	18085	18090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212647
509	NC_018581	GTC	2	6	18099	18104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212647
510	NC_018581	GC	3	6	18137	18142	0 %	0 %	50 %	50 %	404212647
511	NC_018581	GAG	2	6	18168	18173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212647
512	NC_018581	GCC	2	6	18256	18261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212647
513	NC_018581	CAA	2	6	18393	18398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212648
514	NC_018581	CGA	3	9	18414	18422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212648
515	NC_018581	CAAACG	2	12	18429	18440	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	404212648
516	NC_018581	TCG	2	6	18449	18454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212648
517	NC_018581	GCT	2	6	18507	18512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212648
518	NC_018581	CGG	2	6	18550	18555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212648
519	NC_018581	AGC	2	6	18578	18583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212648
520	NC_018581	CG	4	8	18609	18616	0 %	0 %	50 %	50 %	404212648
521	NC_018581	CTG	2	6	18625	18630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212648
522	NC_018581	GAG	2	6	18704	18709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018581	CGA	2	6	18716	18721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_018581	GCTC	2	8	18772	18779	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
525	NC_018581	CAG	2	6	18802	18807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_018581	GC	3	6	18859	18864	0 %	0 %	50 %	50 %	404212649
527	NC_018581	CGA	2	6	18874	18879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212649
528	NC_018581	CAG	2	6	18898	18903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212649
529	NC_018581	CCTG	2	8	18959	18966	0 %	25 %	25 %	50 %	404212649
530	NC_018581	TCC	2	6	19019	19024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212649
531	NC_018581	TGG	2	6	19083	19088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212649
532	NC_018581	TCG	2	6	19142	19147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212649
533	NC_018581	AGG	2	6	19157	19162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212649
534	NC_018581	TCC	2	6	19190	19195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212649
535	NC_018581	CGT	2	6	19227	19232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212649
536	NC_018581	CTT	2	6	19267	19272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212649
537	NC_018581	ACG	2	6	19292	19297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212649
538	NC_018581	TCG	2	6	19355	19360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212649
539	NC_018581	CGG	2	6	19363	19368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212649
540	NC_018581	GCG	2	6	19428	19433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212649
541	NC_018581	CGT	2	6	19476	19481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212649
542	NC_018581	ATG	2	6	19508	19513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212649
543	NC_018581	CCT	2	6	19539	19544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_018581	GTC	3	9	19565	19573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_018581	ACG	2	6	19606	19611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_018581	CAGGT	2	10	19612	19621	20 %	20 %	40 %	20 %	404212650
547	NC_018581	CGG	2	6	19641	19646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212650
548	NC_018581	GGC	2	6	19780	19785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212650
549	NC_018581	CGA	2	6	19842	19847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212650
550	NC_018581	GCG	2	6	19895	19900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212650
551	NC_018581	TCA	2	6	19956	19961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212650
552	NC_018581	GTC	2	6	20017	20022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212650
553	NC_018581	GGA	2	6	20103	20108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212650
554	NC_018581	AGG	2	6	20117	20122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212650
555	NC_018581	GGT	2	6	20133	20138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212650
556	NC_018581	CGA	2	6	20179	20184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212650
557	NC_018581	CCCG	2	8	20194	20201	0 %	0 %	25 %	75 %	404212650
558	NC_018581	GTT	2	6	20203	20208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404212650
559	NC_018581	CGG	2	6	20232	20237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212650
560	NC_018581	CCG	2	6	20313	20318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212650
561	NC_018581	CTT	2	6	20332	20337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212650
562	NC_018581	CGA	2	6	20349	20354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212650
563	NC_018581	CGC	2	6	20389	20394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212650
564	NC_018581	CCG	2	6	20487	20492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212651
565	NC_018581	GC	3	6	20530	20535	0 %	0 %	50 %	50 %	404212651
566	NC_018581	CGT	2	6	20536	20541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212651
567	NC_018581	TCGG	2	8	20564	20571	0 %	25 %	50 %	25 %	404212651
568	NC_018581	CGG	2	6	20593	20598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212651
569	NC_018581	TCG	2	6	20628	20633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212651
570	NC_018581	TCG	2	6	20637	20642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212651
571	NC_018581	GATCGG	2	12	20647	20658	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404212651
572	NC_018581	TTCG	2	8	20672	20679	0 %	50 %	25 %	25 %	404212651
573	NC_018581	TC	3	6	20710	20715	0 %	50 %	0 %	50 %	404212651
574	NC_018581	TCG	3	9	20781	20789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_018581	TCG	2	6	20832	20837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_018581	GGT	2	6	20869	20874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212652
577	NC_018581	ACC	2	6	20897	20902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212652
578	NC_018581	ACC	2	6	20939	20944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212652
579	NC_018581	TCG	2	6	20961	20966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212652
580	NC_018581	CGG	2	6	21004	21009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212652
581	NC_018581	CGG	2	6	21011	21016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212652
582	NC_018581	GCG	2	6	21026	21031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212652
583	NC_018581	CGG	3	9	21118	21126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212652
584	NC_018581	TGC	2	6	21129	21134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212652
585	NC_018581	GAT	2	6	21190	21195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212652
586	NC_018581	TCG	2	6	21258	21263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212652
587	NC_018581	CGG	2	6	21318	21323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212652
588	NC_018581	TGGCG	2	10	21327	21336	0 %	20 %	60 %	20 %	404212652
589	NC_018581	TTC	2	6	21338	21343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212652
590	NC_018581	CGC	2	6	21359	21364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212652
591	NC_018581	GCT	2	6	21457	21462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212652
592	NC_018581	TGT	2	6	21501	21506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404212652
593	NC_018581	CTG	2	6	21563	21568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212652
594	NC_018581	GC	3	6	21575	21580	0 %	0 %	50 %	50 %	404212652
595	NC_018581	GTG	3	9	21593	21601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212652
596	NC_018581	TCT	2	6	21606	21611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212652
597	NC_018581	CGGTC	2	10	21663	21672	0 %	20 %	40 %	40 %	404212652
598	NC_018581	CCA	2	6	21681	21686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212652
599	NC_018581	CCG	2	6	21687	21692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212652
600	NC_018581	GCT	2	6	21715	21720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212652
601	NC_018581	CGG	2	6	21807	21812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212652
602	NC_018581	CGA	2	6	21838	21843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212652
603	NC_018581	TCG	2	6	21864	21869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212652
604	NC_018581	CGA	2	6	21903	21908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212652
605	NC_018581	TGC	2	6	21909	21914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212652
606	NC_018581	CCG	2	6	21924	21929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212652
607	NC_018581	GAC	2	6	21979	21984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212652
608	NC_018581	GCG	2	6	22037	22042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212652
609	NC_018581	TGA	2	6	22044	22049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212652
610	NC_018581	GTC	2	6	22064	22069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212652
611	NC_018581	TAC	2	6	22160	22165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212652
612	NC_018581	CCG	2	6	22170	22175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212652
613	NC_018581	CTC	2	6	22178	22183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212652
614	NC_018581	CTC	2	6	22193	22198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212652
615	NC_018581	GCG	2	6	22199	22204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212652
616	NC_018581	CG	3	6	22219	22224	0 %	0 %	50 %	50 %	404212652
617	NC_018581	GAG	2	6	22276	22281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_018581	GAG	2	6	22289	22294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018581	CGAAGA	2	12	22489	22500	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	404212653
620	NC_018581	TGCG	2	8	22575	22582	0 %	25 %	50 %	25 %	404212653
621	NC_018581	TCC	2	6	22701	22706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212653
622	NC_018581	TGG	2	6	22714	22719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212653
623	NC_018581	CTG	2	6	22726	22731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212653
624	NC_018581	CGC	2	6	22805	22810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212653
625	NC_018581	ACG	2	6	22824	22829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212653
626	NC_018581	ATC	2	6	22847	22852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212653
627	NC_018581	CGA	2	6	22861	22866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212653
628	NC_018581	ACC	2	6	22881	22886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212653
629	NC_018581	TCCGAA	2	12	22908	22919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	404212653
630	NC_018581	CGGCG	2	10	22943	22952	0 %	0 %	60 %	40 %	404212653
631	NC_018581	GGA	2	6	22974	22979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212653
632	NC_018581	G	6	6	22992	22997	0 %	0 %	100 %	0 %	404212653
633	NC_018581	GGA	2	6	23079	23084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212653
634	NC_018581	CGG	2	6	23099	23104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212653
635	NC_018581	GGT	2	6	23120	23125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212653
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640	NC_018581	GGGC	2	8	23222	23229	0 %	0 %	75 %	25 %	404212653
641	NC_018581	CCG	2	6	23245	23250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212653
642	NC_018581	CGC	2	6	23266	23271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212653
643	NC_018581	AGG	2	6	23294	23299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212653
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645	NC_018581	CG	3	6	23350	23355	0 %	0 %	50 %	50 %	404212653
646	NC_018581	GCCG	2	8	23362	23369	0 %	0 %	50 %	50 %	404212653
647	NC_018581	CTG	2	6	23392	23397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212653
648	NC_018581	GC	3	6	23407	23412	0 %	0 %	50 %	50 %	404212653
649	NC_018581	TCG	2	6	23455	23460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212653
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652	NC_018581	CGG	3	9	23522	23530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212653
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654	NC_018581	CGG	2	6	23610	23615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212654
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660	NC_018581	CGG	2	6	23739	23744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212654
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663	NC_018581	CGC	2	6	23822	23827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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665	NC_018581	TGGA	2	8	23897	23904	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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681	NC_018581	GTCG	2	8	24548	24555	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
682	NC_018581	CGA	2	6	24581	24586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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752	NC_018581	GATCGA	2	12	27084	27095	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404212659
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754	NC_018581	CGC	2	6	27152	27157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1000	NC_018581	GCT	2	6	36213	36218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212666

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