MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gordonia sp. KTR9 chromosome

Total Repeats: 144697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018581	CGC	2	6	205179	205184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212816
5502	NC_018581	CG	4	8	205244	205251	0 %	0 %	50 %	50 %	404212816
5503	NC_018581	CAG	2	6	205281	205286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212816
5504	NC_018581	CGGT	2	8	205294	205301	0 %	25 %	50 %	25 %	404212816
5505	NC_018581	CGG	2	6	205321	205326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212816
5506	NC_018581	CGA	2	6	205359	205364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212816
5507	NC_018581	CGG	2	6	205427	205432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212816
5508	NC_018581	CG	3	6	205446	205451	0 %	0 %	50 %	50 %	404212816
5509	NC_018581	GCC	2	6	205452	205457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212816
5510	NC_018581	CCGC	2	8	205492	205499	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5511	NC_018581	CCG	2	6	205655	205660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212817
5512	NC_018581	GTC	2	6	205697	205702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212817
5513	NC_018581	GAA	2	6	205760	205765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212817
5514	NC_018581	GGT	2	6	205802	205807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212817
5515	NC_018581	CCCTCT	2	12	205911	205922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212817
5516	NC_018581	GAC	2	6	205958	205963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212817
5517	NC_018581	GCCGC	2	10	205983	205992	0 %	0 %	40 %	60 %	404212817
5518	NC_018581	TCA	2	6	206002	206007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212817
5519	NC_018581	CAGAT	2	10	206037	206046	40 %	20 %	20 %	20 %	404212817
5520	NC_018581	GC	3	6	206083	206088	0 %	0 %	50 %	50 %	404212817
5521	NC_018581	CGGC	2	8	206107	206114	0 %	0 %	50 %	50 %	404212817
5522	NC_018581	GC	3	6	206178	206183	0 %	0 %	50 %	50 %	404212817
5523	NC_018581	CGG	2	6	206203	206208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212817
5524	NC_018581	CAT	2	6	206273	206278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212817
5525	NC_018581	CGT	2	6	206299	206304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212817
5526	NC_018581	ACCCG	2	10	206378	206387	20 %	0 %	20 %	60 %	404212817
5527	NC_018581	AGA	2	6	206401	206406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212817
5528	NC_018581	TCG	2	6	206412	206417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212817
5529	NC_018581	ACC	2	6	206445	206450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212817
5530	NC_018581	CG	4	8	206481	206488	0 %	0 %	50 %	50 %	404212817
5531	NC_018581	GCA	2	6	206584	206589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212817
5532	NC_018581	CGT	2	6	206647	206652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212817
5533	NC_018581	CGG	2	6	206716	206721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212817
5534	NC_018581	GC	4	8	206722	206729	0 %	0 %	50 %	50 %	404212817
5535	NC_018581	GAT	2	6	206735	206740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212817
5536	NC_018581	TCGT	2	8	206763	206770	0 %	50 %	25 %	25 %	404212817
5537	NC_018581	GGT	2	6	206792	206797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212817
5538	NC_018581	CGA	2	6	206800	206805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212817
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5540	NC_018581	TTG	2	6	206883	206888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404212817
5541	NC_018581	TCG	2	6	206910	206915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212817
5542	NC_018581	AGG	2	6	207007	207012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212817
5543	NC_018581	GATC	2	8	207047	207054	25 %	25 %	25 %	25 %	404212817
5544	NC_018581	CGG	2	6	207055	207060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212817
5545	NC_018581	CGGG	2	8	207179	207186	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5546	NC_018581	GAC	2	6	207222	207227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_018581	TCG	2	6	207325	207330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_018581	GAC	2	6	207401	207406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212818
5549	NC_018581	GAT	2	6	207449	207454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212818
5550	NC_018581	TCG	2	6	207508	207513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212818
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5552	NC_018581	CAG	2	6	207555	207560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212818
5553	NC_018581	CGG	2	6	207578	207583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212818
5554	NC_018581	GAC	2	6	207792	207797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212818
5555	NC_018581	GCG	2	6	207831	207836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212818
5556	NC_018581	TCCC	2	8	207851	207858	0 %	25 %	0 %	75 %	404212818
5557	NC_018581	CGG	2	6	207869	207874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212818
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5560	NC_018581	CGT	2	6	207932	207937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212818
5561	NC_018581	GCT	2	6	207953	207958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212818
5562	NC_018581	TCG	2	6	208009	208014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212818
5563	NC_018581	TAC	2	6	208059	208064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212818
5564	NC_018581	CGA	2	6	208088	208093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212818
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5566	NC_018581	C	6	6	208149	208154	0 %	0 %	0 %	100 %	404212818
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5569	NC_018581	TGG	2	6	208282	208287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212818
5570	NC_018581	AG	3	6	208306	208311	50 %	0 %	50 %	0 %	404212818
5571	NC_018581	GCG	2	6	208337	208342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212818
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5581	NC_018581	CGA	2	6	208646	208651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212819
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5583	NC_018581	CCG	2	6	208735	208740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212819
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5586	NC_018581	AC	3	6	208781	208786	50 %	0 %	0 %	50 %	404212819
5587	NC_018581	CTG	2	6	208794	208799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212819
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5589	NC_018581	CGC	2	6	208883	208888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212819
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5591	NC_018581	CTG	3	9	208905	208913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212819
5592	NC_018581	GAGGTG	2	12	208944	208955	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	404212819
5593	NC_018581	CGG	2	6	209056	209061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212819
5594	NC_018581	TCG	2	6	209083	209088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212819
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5599	NC_018581	GAT	3	9	209417	209425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212819
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5601	NC_018581	CCT	2	6	209499	209504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5602	NC_018581	CAC	2	6	209514	209519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_018581	CT	3	6	209555	209560	0 %	50 %	0 %	50 %	404212820
5604	NC_018581	CCG	2	6	209592	209597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212820
5605	NC_018581	GCT	2	6	209602	209607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212820
5606	NC_018581	TGGC	2	8	209609	209616	0 %	25 %	50 %	25 %	404212820
5607	NC_018581	GCCG	2	8	209656	209663	0 %	0 %	50 %	50 %	404212820
5608	NC_018581	CGT	2	6	209674	209679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212820
5609	NC_018581	ATCA	2	8	209684	209691	50 %	25 %	0 %	25 %	404212820
5610	NC_018581	GAA	2	6	209767	209772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212820
5611	NC_018581	ACA	2	6	209784	209789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212820
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5613	NC_018581	TCG	2	6	209895	209900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212820
5614	NC_018581	CGA	2	6	209916	209921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212820
5615	NC_018581	GC	3	6	209985	209990	0 %	0 %	50 %	50 %	404212820
5616	NC_018581	CCG	2	6	210129	210134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212820
5617	NC_018581	TGA	2	6	210147	210152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212820
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5619	NC_018581	CGG	2	6	210226	210231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212820
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5621	NC_018581	GTC	2	6	210346	210351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_018581	CCGG	2	8	210362	210369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5623	NC_018581	GCG	2	6	210552	210557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212821
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5653	NC_018581	ACG	2	6	211604	211609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212822
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5744	NC_018581	CGGT	2	8	214807	214814	0 %	25 %	50 %	25 %	404212824
5745	NC_018581	TCG	2	6	214826	214831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212824
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5748	NC_018581	CGA	2	6	214953	214958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212824
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5756	NC_018581	CAGC	2	8	215197	215204	25 %	0 %	25 %	50 %	404212824
5757	NC_018581	CGG	2	6	215229	215234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212824
5758	NC_018581	CGG	2	6	215258	215263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212824
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5763	NC_018581	CGG	2	6	215436	215441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212824
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5781	NC_018581	CACC	2	8	216417	216424	25 %	0 %	0 %	75 %	404212825
5782	NC_018581	AACGC	2	10	216516	216525	40 %	0 %	20 %	40 %	404212825
5783	NC_018581	GTC	2	6	216535	216540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212825
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5785	NC_018581	GC	3	6	216579	216584	0 %	0 %	50 %	50 %	404212825
5786	NC_018581	CCT	2	6	216611	216616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5787	NC_018581	CAT	2	6	216623	216628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5789	NC_018581	AC	3	6	216671	216676	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5790	NC_018581	CG	3	6	216708	216713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5796	NC_018581	GTC	2	6	216947	216952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212826
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5809	NC_018581	AGC	2	6	217460	217465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212827
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5813	NC_018581	CGT	3	9	217572	217580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212827
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5836	NC_018581	CATG	2	8	218531	218538	25 %	25 %	25 %	25 %	404212828
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5848	NC_018581	CG	3	6	218927	218932	0 %	0 %	50 %	50 %	404212828
5849	NC_018581	CGG	2	6	218936	218941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212828
5850	NC_018581	CA	3	6	218944	218949	50 %	0 %	0 %	50 %	404212828
5851	NC_018581	CCG	2	6	218977	218982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212828
5852	NC_018581	GGCGTC	2	12	219000	219011	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	404212828
5853	NC_018581	GTC	2	6	219045	219050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212828
5854	NC_018581	CGGGG	2	10	219101	219110	0 %	0 %	80 %	20 %	404212828
5855	NC_018581	GACG	2	8	219117	219124	25 %	0 %	50 %	25 %	404212828
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5862	NC_018581	TCG	2	6	219357	219362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212829
5863	NC_018581	CGT	2	6	219421	219426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212829
5864	NC_018581	CCG	2	6	219454	219459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212829
5865	NC_018581	CGG	2	6	219520	219525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212829
5866	NC_018581	CGA	2	6	219535	219540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212829
5867	NC_018581	GGT	2	6	219572	219577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212829
5868	NC_018581	GGT	2	6	219587	219592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212829
5869	NC_018581	CCG	3	9	219616	219624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212829
5870	NC_018581	CGA	2	6	219636	219641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212829
5871	NC_018581	GCC	2	6	219642	219647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212829
5872	NC_018581	CGA	2	6	219664	219669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212829
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5874	NC_018581	AGC	2	6	219693	219698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212829
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5880	NC_018581	CAC	2	6	219824	219829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212829
5881	NC_018581	GAC	2	6	219830	219835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212829
5882	NC_018581	G	6	6	219878	219883	0 %	0 %	100 %	0 %	404212829
5883	NC_018581	GCG	2	6	219894	219899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212829
5884	NC_018581	CGT	2	6	219907	219912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212829
5885	NC_018581	CGAA	2	8	219921	219928	50 %	0 %	25 %	25 %	404212829
5886	NC_018581	GCG	2	6	219931	219936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212829
5887	NC_018581	GAT	2	6	219993	219998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5888	NC_018581	TCG	3	9	220104	220112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212830
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5892	NC_018581	CGA	2	6	220230	220235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212830
5893	NC_018581	TTC	2	6	220406	220411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212830
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5895	NC_018581	GC	3	6	220484	220489	0 %	0 %	50 %	50 %	404212830
5896	NC_018581	GAG	2	6	220496	220501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212830
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5903	NC_018581	ACG	3	9	221040	221048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212830
5904	NC_018581	TAC	2	6	221054	221059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212830
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5907	NC_018581	CGG	2	6	221146	221151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212830
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5909	NC_018581	ACA	2	6	221217	221222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212830
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5917	NC_018581	GGATCG	2	12	221631	221642	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	404212831
5918	NC_018581	TCG	2	6	221652	221657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212831
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5933	NC_018581	CG	3	6	222052	222057	0 %	0 %	50 %	50 %	404212831
5934	NC_018581	CAT	2	6	222058	222063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212831
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5954	NC_018581	CTG	2	6	222755	222760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212831
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5969	NC_018581	GCCC	2	8	223335	223342	0 %	0 %	25 %	75 %	404212832
5970	NC_018581	CGTC	2	8	223346	223353	0 %	25 %	25 %	50 %	404212832
5971	NC_018581	CGG	2	6	223354	223359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212832
5972	NC_018581	CG	3	6	223360	223365	0 %	0 %	50 %	50 %	404212832
5973	NC_018581	GCTGG	2	10	223391	223400	0 %	20 %	60 %	20 %	404212832
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5976	NC_018581	GC	3	6	223495	223500	0 %	0 %	50 %	50 %	404212832
5977	NC_018581	CGC	2	6	223502	223507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212832
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5980	NC_018581	CGA	2	6	223618	223623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212832
5981	NC_018581	CGG	2	6	223627	223632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212832
5982	NC_018581	GCC	2	6	223650	223655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212832
5983	NC_018581	TGC	2	6	223672	223677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212832
5984	NC_018581	CCG	2	6	223678	223683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212832
5985	NC_018581	GCC	2	6	223691	223696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212832
5986	NC_018581	GCG	2	6	223779	223784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212832
5987	NC_018581	TGC	2	6	223804	223809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212832
5988	NC_018581	ACCC	2	8	223814	223821	25 %	0 %	0 %	75 %	404212832
5989	NC_018581	CGC	2	6	223848	223853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212832
5990	NC_018581	GCG	2	6	223854	223859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212832
5991	NC_018581	CGG	2	6	223898	223903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212832
5992	NC_018581	CG	3	6	223934	223939	0 %	0 %	50 %	50 %	404212832
5993	NC_018581	GACAC	2	10	223943	223952	40 %	0 %	20 %	40 %	404212832
5994	NC_018581	GAG	2	6	223970	223975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212833
5995	NC_018581	CCG	2	6	224003	224008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212833
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5997	NC_018581	CGC	2	6	224089	224094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212833
5998	NC_018581	CCG	2	6	224127	224132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212833
5999	NC_018581	TCG	2	6	224142	224147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212833
6000	NC_018581	ACG	2	6	224184	224189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212833

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