MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT2

Total Repeats: 4060

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018580	ACG	2	6	179293	179298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212531
4002	NC_018580	TGA	2	6	179313	179318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212531
4003	NC_018580	AGC	2	6	179342	179347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212531
4004	NC_018580	CGA	2	6	179350	179355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212531
4005	NC_018580	CGTG	2	8	179361	179368	0 %	25 %	50 %	25 %	404212531
4006	NC_018580	CCT	2	6	179443	179448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_018580	C	6	6	179494	179499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4008	NC_018580	AC	3	6	179501	179506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_018580	GATC	2	8	179546	179553	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_018580	TTCGAG	2	12	179560	179571	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4011	NC_018580	CCG	2	6	179670	179675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_018580	CGC	2	6	179758	179763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_018580	GC	3	6	179800	179805	0 %	0 %	50 %	50 %	404212532
4014	NC_018580	TCGGA	2	10	179824	179833	20 %	20 %	40 %	20 %	404212532
4015	NC_018580	CGG	3	9	179847	179855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212532
4016	NC_018580	CCA	2	6	179871	179876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212532
4017	NC_018580	GCT	2	6	179936	179941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212532
4018	NC_018580	CTC	2	6	179967	179972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212532
4019	NC_018580	CTG	2	6	180033	180038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212532
4020	NC_018580	CA	3	6	180152	180157	50 %	0 %	0 %	50 %	404212532
4021	NC_018580	ATG	2	6	180201	180206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212532
4022	NC_018580	CGA	2	6	180217	180222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212532
4023	NC_018580	GTC	2	6	180272	180277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212532
4024	NC_018580	GC	4	8	180295	180302	0 %	0 %	50 %	50 %	404212532
4025	NC_018580	TCC	2	6	180317	180322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212532
4026	NC_018580	GCC	2	6	180342	180347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212532
4027	NC_018580	GTCG	2	8	180385	180392	0 %	25 %	50 %	25 %	404212532
4028	NC_018580	GC	3	6	180414	180419	0 %	0 %	50 %	50 %	404212532
4029	NC_018580	CCG	2	6	180428	180433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212532
4030	NC_018580	TTGC	2	8	180448	180455	0 %	50 %	25 %	25 %	404212532
4031	NC_018580	CCGA	2	8	180561	180568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_018580	GCA	2	6	180585	180590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_018580	AAC	2	6	180611	180616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_018580	TCT	2	6	180683	180688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212533
4035	NC_018580	TCG	2	6	180708	180713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212533
4036	NC_018580	ACGC	2	8	180791	180798	25 %	0 %	25 %	50 %	404212533
4037	NC_018580	GCCA	2	8	180822	180829	25 %	0 %	25 %	50 %	404212533
4038	NC_018580	GCG	2	6	180892	180897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212533
4039	NC_018580	CCG	2	6	180916	180921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212533
4040	NC_018580	GCC	2	6	181000	181005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212533
4041	NC_018580	TCT	2	6	181115	181120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212534
4042	NC_018580	GCT	2	6	181275	181280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212534
4043	NC_018580	TCCC	2	8	181336	181343	0 %	25 %	0 %	75 %	404212534
4044	NC_018580	ACG	2	6	181370	181375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212534
4045	NC_018580	GTC	3	9	181438	181446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212534
4046	NC_018580	TGG	2	6	181552	181557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_018580	AATGT	2	10	181569	181578	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_018580	GT	3	6	181619	181624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_018580	GT	3	6	181668	181673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_018580	TGA	2	6	181695	181700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_018580	CGC	2	6	181754	181759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_018580	CCG	2	6	181877	181882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_018580	GAC	3	9	181925	181933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_018580	GT	3	6	181944	181949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_018580	CCG	2	6	182002	182007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_018580	AAT	2	6	182059	182064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_018580	CGGGC	2	10	182122	182131	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4058	NC_018580	CGA	2	6	182134	182139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_018580	AGC	2	6	182248	182253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_018580	TC	3	6	182335	182340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.