MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT2

Total Repeats: 4060

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018580	GCAA	2	8	109397	109404	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2502	NC_018580	GTG	2	6	109407	109412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_018580	TCG	2	6	109436	109441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_018580	CG	3	6	109588	109593	0 %	0 %	50 %	50 %	404212470
2505	NC_018580	TGG	2	6	109637	109642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212470
2506	NC_018580	GC	3	6	109643	109648	0 %	0 %	50 %	50 %	404212470
2507	NC_018580	TTG	2	6	109689	109694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404212470
2508	NC_018580	GC	3	6	109706	109711	0 %	0 %	50 %	50 %	404212470
2509	NC_018580	GGA	2	6	109729	109734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212470
2510	NC_018580	ACA	2	6	109794	109799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212470
2511	NC_018580	CCG	2	6	109807	109812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212470
2512	NC_018580	CGA	2	6	109831	109836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212470
2513	NC_018580	GTC	2	6	109846	109851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212470
2514	NC_018580	C	6	6	110014	110019	0 %	0 %	0 %	100 %	404212470
2515	NC_018580	CGC	2	6	110077	110082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212470
2516	NC_018580	CGA	2	6	110171	110176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212470
2517	NC_018580	GC	3	6	110201	110206	0 %	0 %	50 %	50 %	404212470
2518	NC_018580	GTG	2	6	110260	110265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212470
2519	NC_018580	AAG	2	6	110276	110281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212470
2520	NC_018580	ACC	2	6	110325	110330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212470
2521	NC_018580	CGCGG	2	10	110414	110423	0 %	0 %	60 %	40 %	404212470
2522	NC_018580	TCG	2	6	110511	110516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212470
2523	NC_018580	GAT	2	6	110591	110596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212470
2524	NC_018580	CCA	2	6	110641	110646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212470
2525	NC_018580	GTC	2	6	110753	110758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212470
2526	NC_018580	GGT	2	6	110765	110770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212470
2527	NC_018580	ACCT	2	8	110798	110805	25 %	25 %	0 %	50 %	404212470
2528	NC_018580	CAA	2	6	110841	110846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212470
2529	NC_018580	CGCC	2	8	110890	110897	0 %	0 %	25 %	75 %	404212470
2530	NC_018580	TCG	2	6	110922	110927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212470
2531	NC_018580	TCCA	2	8	111004	111011	25 %	25 %	0 %	50 %	404212470
2532	NC_018580	TCG	2	6	111069	111074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212470
2533	NC_018580	TAC	2	6	111092	111097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212470
2534	NC_018580	ACA	2	6	111099	111104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212470
2535	NC_018580	TCT	2	6	111129	111134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212470
2536	NC_018580	ATCC	2	8	111164	111171	25 %	25 %	0 %	50 %	404212470
2537	NC_018580	TCG	2	6	111213	111218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212470
2538	NC_018580	CTT	2	6	111259	111264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212470
2539	NC_018580	CG	3	6	111289	111294	0 %	0 %	50 %	50 %	404212470
2540	NC_018580	AGCGAT	2	12	111353	111364	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	404212470
2541	NC_018580	CTC	2	6	111398	111403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212470
2542	NC_018580	GAT	2	6	111472	111477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212470
2543	NC_018580	CGA	2	6	111535	111540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212470
2544	NC_018580	ACC	2	6	111548	111553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212470
2545	NC_018580	TGC	2	6	111571	111576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212470
2546	NC_018580	GCC	2	6	111650	111655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212470
2547	NC_018580	CGC	2	6	111688	111693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212470
2548	NC_018580	TGTC	2	8	111720	111727	0 %	50 %	25 %	25 %	404212470
2549	NC_018580	AGG	2	6	111780	111785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212470
2550	NC_018580	GCA	2	6	111829	111834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212470
2551	NC_018580	AAC	2	6	111866	111871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212470
2552	NC_018580	ACC	2	6	111890	111895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212470
2553	NC_018580	TCA	2	6	111951	111956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212470
2554	NC_018580	CAC	2	6	112025	112030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404212470
2555	NC_018580	TCA	2	6	112032	112037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212470
2556	NC_018580	TTC	2	6	112077	112082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212470
2557	NC_018580	CT	3	6	112188	112193	0 %	50 %	0 %	50 %	404212470
2558	NC_018580	ACCGCG	2	12	112315	112326	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	404212471
2559	NC_018580	TCG	2	6	112426	112431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2560	NC_018580	AC	3	6	112445	112450	50 %	0 %	0 %	50 %	404212471
2561	NC_018580	CAAC	2	8	112516	112523	50 %	0 %	0 %	50 %	404212471
2562	NC_018580	AC	3	6	112552	112557	50 %	0 %	0 %	50 %	404212471
2563	NC_018580	GGGTGA	2	12	112697	112708	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	404212471
2564	NC_018580	CCG	2	6	112736	112741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212471
2565	NC_018580	CCG	2	6	112747	112752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212471
2566	NC_018580	CGA	2	6	112757	112762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2567	NC_018580	GGC	2	6	112778	112783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212471
2568	NC_018580	G	6	6	112806	112811	0 %	0 %	100 %	0 %	404212471
2569	NC_018580	TTC	2	6	112831	112836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212471
2570	NC_018580	ATG	3	9	112843	112851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212471
2571	NC_018580	TTC	2	6	112950	112955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212471
2572	NC_018580	CGC	2	6	112956	112961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212471
2573	NC_018580	TCGG	2	8	112993	113000	0 %	25 %	50 %	25 %	404212471
2574	NC_018580	GCG	2	6	113006	113011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212471
2575	NC_018580	TC	3	6	113032	113037	0 %	50 %	0 %	50 %	404212471
2576	NC_018580	TCA	2	6	113041	113046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212471
2577	NC_018580	GGC	2	6	113067	113072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212471
2578	NC_018580	CT	4	8	113088	113095	0 %	50 %	0 %	50 %	404212471
2579	NC_018580	GCC	2	6	113106	113111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212471
2580	NC_018580	GGT	2	6	113228	113233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212471
2581	NC_018580	GAC	2	6	113238	113243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2582	NC_018580	CGG	2	6	113288	113293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212471
2583	NC_018580	TCG	2	6	113311	113316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2584	NC_018580	CA	3	6	113336	113341	50 %	0 %	0 %	50 %	404212471
2585	NC_018580	CGA	2	6	113399	113404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2586	NC_018580	GTGG	2	8	113405	113412	0 %	25 %	75 %	0 %	404212471
2587	NC_018580	TCG	2	6	113428	113433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2588	NC_018580	GAT	2	6	113439	113444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212471
2589	NC_018580	CGG	2	6	113450	113455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212471
2590	NC_018580	CGA	2	6	113462	113467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2591	NC_018580	CTG	2	6	113523	113528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2592	NC_018580	GAG	2	6	113592	113597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212471
2593	NC_018580	GGT	2	6	113601	113606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212471
2594	NC_018580	GGC	2	6	113668	113673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212471
2595	NC_018580	CGT	2	6	113677	113682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2596	NC_018580	AGC	2	6	113707	113712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2597	NC_018580	CGC	3	9	113732	113740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212471
2598	NC_018580	CGA	2	6	113798	113803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2599	NC_018580	CG	3	6	113809	113814	0 %	0 %	50 %	50 %	404212471
2600	NC_018580	CT	3	6	113884	113889	0 %	50 %	0 %	50 %	404212471
2601	NC_018580	GAG	2	6	113892	113897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212471
2602	NC_018580	GTC	2	6	113900	113905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2603	NC_018580	GTG	2	6	113929	113934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	404212471
2604	NC_018580	TGC	2	6	113935	113940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2605	NC_018580	TGA	2	6	113944	113949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212471
2606	NC_018580	ATC	2	6	114078	114083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212471
2607	NC_018580	CG	3	6	114173	114178	0 %	0 %	50 %	50 %	404212471
2608	NC_018580	TTC	2	6	114186	114191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404212471
2609	NC_018580	GCG	2	6	114195	114200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212471
2610	NC_018580	AGG	2	6	114418	114423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212471
2611	NC_018580	CCG	2	6	114443	114448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212471
2612	NC_018580	CGA	2	6	114530	114535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2613	NC_018580	AGC	2	6	114622	114627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2614	NC_018580	GTC	2	6	114660	114665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2615	NC_018580	GAA	2	6	114693	114698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404212471
2616	NC_018580	CGACCT	2	12	114755	114766	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	404212471
2617	NC_018580	GCG	2	6	114789	114794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212471
2618	NC_018580	CG	3	6	114827	114832	0 %	0 %	50 %	50 %	404212471
2619	NC_018580	ACG	2	6	114964	114969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2620	NC_018580	TC	3	6	114974	114979	0 %	50 %	0 %	50 %	404212471
2621	NC_018580	CGA	2	6	114997	115002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2622	NC_018580	CAA	2	6	115016	115021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404212471
2623	NC_018580	CGA	2	6	115124	115129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212471
2624	NC_018580	GAT	2	6	115148	115153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212471
2625	NC_018580	GGC	2	6	115196	115201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212471
2626	NC_018580	AGC	2	6	115297	115302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212471
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2629	NC_018580	CCG	2	6	115377	115382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	404212471
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2631	NC_018580	GACT	2	8	115553	115560	25 %	25 %	25 %	25 %	404212471
2632	NC_018580	AGG	2	6	115694	115699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_018580	GAC	2	6	115738	115743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212472
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2643	NC_018580	GAT	2	6	116380	116385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212472
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2661	NC_018580	GC	3	6	117252	117257	0 %	0 %	50 %	50 %	404212472
2662	NC_018580	ACG	2	6	117275	117280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212472
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2700	NC_018580	GAT	2	6	118913	118918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2703	NC_018580	CAG	2	6	119236	119241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2706	NC_018580	CACC	2	8	119358	119365	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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2727	NC_018580	TCC	2	6	120698	120703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212474
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2732	NC_018580	CG	3	6	120886	120891	0 %	0 %	50 %	50 %	404212474
2733	NC_018580	CGA	2	6	121016	121021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212474
2734	NC_018580	GAT	2	6	121275	121280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212474
2735	NC_018580	GATA	2	8	121294	121301	50 %	25 %	25 %	0 %	404212474
2736	NC_018580	AGC	2	6	121308	121313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212474
2737	NC_018580	AG	3	6	121353	121358	50 %	0 %	50 %	0 %	404212474
2738	NC_018580	GTTTG	2	10	121368	121377	0 %	60 %	40 %	0 %	404212474
2739	NC_018580	AAT	2	6	121412	121417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404212474
2740	NC_018580	ACGT	2	8	121439	121446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2741	NC_018580	GGC	2	6	121503	121508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2742	NC_018580	GCA	2	6	121517	121522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2743	NC_018580	G	6	6	121567	121572	0 %	0 %	100 %	0 %	404212475
2744	NC_018580	AGCG	2	8	121691	121698	25 %	0 %	50 %	25 %	404212475
2745	NC_018580	CGT	2	6	121701	121706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212475
2746	NC_018580	GTC	2	6	121782	121787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404212475
2747	NC_018580	CCAT	2	8	121788	121795	25 %	25 %	0 %	50 %	404212475
2748	NC_018580	TCC	2	6	121808	121813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	404212475
2749	NC_018580	AGG	2	6	121824	121829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	404212475
2750	NC_018580	GC	3	6	121836	121841	0 %	0 %	50 %	50 %	404212475
2751	NC_018580	GTA	2	6	121904	121909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212475
2752	NC_018580	CGG	2	6	121929	121934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212475
2753	NC_018580	GAT	2	6	121963	121968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212475
2754	NC_018580	GGCAG	2	10	121993	122002	20 %	0 %	60 %	20 %	404212475
2755	NC_018580	TCGG	2	8	122029	122036	0 %	25 %	50 %	25 %	404212475
2756	NC_018580	TTC	2	6	122045	122050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2757	NC_018580	CTG	2	6	122078	122083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2758	NC_018580	ACT	2	6	122084	122089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2759	NC_018580	GAT	2	6	122114	122119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2760	NC_018580	CGCGAG	2	12	122153	122164	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2761	NC_018580	GCG	2	6	122211	122216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2762	NC_018580	AGGA	2	8	122244	122251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2763	NC_018580	CGC	2	6	122337	122342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2764	NC_018580	GCG	2	6	122359	122364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2765	NC_018580	GCG	2	6	122383	122388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212476
2766	NC_018580	GAC	2	6	122413	122418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212476
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2771	NC_018580	GAC	2	6	122570	122575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212476
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2780	NC_018580	TCC	2	6	122741	122746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2781	NC_018580	CGA	2	6	122770	122775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2784	NC_018580	TGTC	2	8	122945	122952	0 %	50 %	25 %	25 %	404212477
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2793	NC_018580	GGT	2	6	123524	123529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2812	NC_018580	GGC	2	6	124701	124706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	404212479
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2849	NC_018580	CGG	2	6	126258	126263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2850	NC_018580	ACA	2	6	126285	126290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2851	NC_018580	AGC	3	9	126318	126326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2852	NC_018580	GCT	2	6	126350	126355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2853	NC_018580	TCA	2	6	126397	126402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404212481
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2856	NC_018580	CGA	2	6	126476	126481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404212481
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2860	NC_018580	CACGAC	2	12	126756	126767	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	404212481
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2863	NC_018580	GAAG	2	8	126929	126936	50 %	0 %	50 %	0 %	404212481
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2988	NC_018580	GAC	2	6	132784	132789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2989	NC_018580	GTG	2	6	132800	132805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2990	NC_018580	CGGA	2	8	132834	132841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2991	NC_018580	TGA	2	6	132954	132959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404212485
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