MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 2844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017456	CA	3	6	43	48	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017456	AT	3	6	893	898	50 %	50 %	0 %	0 %	385800987
3	NC_017456	CT	3	6	2303	2308	0 %	50 %	0 %	50 %	385800988
4	NC_017456	AT	3	6	4410	4415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017456	TA	3	6	4839	4844	50 %	50 %	0 %	0 %	385800989
6	NC_017456	GC	3	6	6716	6721	0 %	0 %	50 %	50 %	385800990
7	NC_017456	GC	3	6	7544	7549	0 %	0 %	50 %	50 %	385800991
8	NC_017456	TC	3	6	10322	10327	0 %	50 %	0 %	50 %	385800992
9	NC_017456	TA	3	6	10412	10417	50 %	50 %	0 %	0 %	385800992
10	NC_017456	TC	3	6	10680	10685	0 %	50 %	0 %	50 %	385800993
11	NC_017456	AT	4	8	11685	11692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017456	GA	3	6	11977	11982	50 %	0 %	50 %	0 %	385800995
13	NC_017456	AT	3	6	12565	12570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017456	TA	3	6	13166	13171	50 %	50 %	0 %	0 %	385800997
15	NC_017456	AT	3	6	14897	14902	50 %	50 %	0 %	0 %	385800998
16	NC_017456	AT	3	6	16007	16012	50 %	50 %	0 %	0 %	385800998
17	NC_017456	GA	4	8	16164	16171	50 %	0 %	50 %	0 %	385800998
18	NC_017456	AT	3	6	18206	18211	50 %	50 %	0 %	0 %	385801000
19	NC_017456	AT	3	6	18258	18263	50 %	50 %	0 %	0 %	385801000
20	NC_017456	TC	3	6	18264	18269	0 %	50 %	0 %	50 %	385801000
21	NC_017456	AG	3	6	18818	18823	50 %	0 %	50 %	0 %	385801001
22	NC_017456	GA	3	6	21071	21076	50 %	0 %	50 %	0 %	385801002
23	NC_017456	GC	3	6	21231	21236	0 %	0 %	50 %	50 %	385801002
24	NC_017456	GA	3	6	21267	21272	50 %	0 %	50 %	0 %	385801002
25	NC_017456	AT	3	6	24509	24514	50 %	50 %	0 %	0 %	385801005
26	NC_017456	AT	3	6	24995	25000	50 %	50 %	0 %	0 %	385801006
27	NC_017456	GA	3	6	25370	25375	50 %	0 %	50 %	0 %	385801006
28	NC_017456	CA	3	6	25556	25561	50 %	0 %	0 %	50 %	385801006
29	NC_017456	TA	3	6	26060	26065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017456	AT	3	6	28732	28737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017456	CA	3	6	29244	29249	50 %	0 %	0 %	50 %	385801009
32	NC_017456	CA	3	6	29915	29920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017456	AC	3	6	30383	30388	50 %	0 %	0 %	50 %	385801011
34	NC_017456	CA	3	6	30597	30602	50 %	0 %	0 %	50 %	385801011
35	NC_017456	GA	3	6	30638	30643	50 %	0 %	50 %	0 %	385801011
36	NC_017456	GC	3	6	32721	32726	0 %	0 %	50 %	50 %	385801012
37	NC_017456	CG	3	6	34192	34197	0 %	0 %	50 %	50 %	385801013
38	NC_017456	CG	3	6	34573	34578	0 %	0 %	50 %	50 %	385801013
39	NC_017456	CG	3	6	34662	34667	0 %	0 %	50 %	50 %	385801013
40	NC_017456	AT	3	6	36091	36096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017456	TG	3	6	37167	37172	0 %	50 %	50 %	0 %	385801015
42	NC_017456	GC	3	6	37719	37724	0 %	0 %	50 %	50 %	385801015
43	NC_017456	CG	3	6	38085	38090	0 %	0 %	50 %	50 %	385801016
44	NC_017456	GC	3	6	38305	38310	0 %	0 %	50 %	50 %	385801016
45	NC_017456	CA	3	6	38667	38672	50 %	0 %	0 %	50 %	385801016
46	NC_017456	TA	3	6	38784	38789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017456	AT	3	6	39243	39248	50 %	50 %	0 %	0 %	385801017
48	NC_017456	GC	3	6	41007	41012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017456	GT	3	6	41148	41153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017456	GT	3	6	41679	41684	0 %	50 %	50 %	0 %	385801020
51	NC_017456	CG	3	6	42013	42018	0 %	0 %	50 %	50 %	385801020
52	NC_017456	GC	3	6	43354	43359	0 %	0 %	50 %	50 %	385801020
53	NC_017456	AC	3	6	43418	43423	50 %	0 %	0 %	50 %	385801020
54	NC_017456	CG	3	6	43587	43592	0 %	0 %	50 %	50 %	385801020
55	NC_017456	TA	3	6	43652	43657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017456	GC	3	6	44329	44334	0 %	0 %	50 %	50 %	385801021
57	NC_017456	AC	3	6	44367	44372	50 %	0 %	0 %	50 %	385801021
58	NC_017456	AG	3	6	45130	45135	50 %	0 %	50 %	0 %	385801021
59	NC_017456	GT	3	6	45634	45639	0 %	50 %	50 %	0 %	385801022
60	NC_017456	AC	3	6	47290	47295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017456	TA	3	6	47310	47315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017456	GA	3	6	47360	47365	50 %	0 %	50 %	0 %	385801023
63	NC_017456	GA	3	6	47546	47551	50 %	0 %	50 %	0 %	385801023
64	NC_017456	TG	3	6	48289	48294	0 %	50 %	50 %	0 %	385801024
65	NC_017456	TA	3	6	48589	48594	50 %	50 %	0 %	0 %	385801024
66	NC_017456	AG	3	6	48631	48636	50 %	0 %	50 %	0 %	385801024
67	NC_017456	AT	3	6	48779	48784	50 %	50 %	0 %	0 %	385801024
68	NC_017456	GT	3	6	49633	49638	0 %	50 %	50 %	0 %	385801025
69	NC_017456	GT	4	8	50506	50513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017456	TA	3	6	50607	50612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017456	GC	3	6	50624	50629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017456	TG	3	6	50672	50677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017456	GA	3	6	50727	50732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017456	CT	3	6	51173	51178	0 %	50 %	0 %	50 %	385801028
75	NC_017456	TA	3	6	51660	51665	50 %	50 %	0 %	0 %	385801028
76	NC_017456	AC	3	6	51904	51909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017456	TG	4	8	51947	51954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017456	TA	3	6	52558	52563	50 %	50 %	0 %	0 %	385801029
79	NC_017456	TG	3	6	53554	53559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017456	TG	3	6	53585	53590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017456	GC	4	8	54414	54421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017456	CA	3	6	54496	54501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017456	AT	3	6	55168	55173	50 %	50 %	0 %	0 %	385801032
84	NC_017456	AT	3	6	55515	55520	50 %	50 %	0 %	0 %	385801032
85	NC_017456	GT	3	6	55533	55538	0 %	50 %	50 %	0 %	385801032
86	NC_017456	TA	3	6	55850	55855	50 %	50 %	0 %	0 %	385801032
87	NC_017456	GT	3	6	56178	56183	0 %	50 %	50 %	0 %	385801032
88	NC_017456	CT	3	6	56483	56488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017456	AT	3	6	57240	57245	50 %	50 %	0 %	0 %	385801033
90	NC_017456	AC	3	6	57259	57264	50 %	0 %	0 %	50 %	385801033
91	NC_017456	AT	3	6	57370	57375	50 %	50 %	0 %	0 %	385801033
92	NC_017456	GC	3	6	59288	59293	0 %	0 %	50 %	50 %	385801035
93	NC_017456	TG	3	6	59630	59635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017456	AC	3	6	59703	59708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017456	TA	3	6	60253	60258	50 %	50 %	0 %	0 %	385801036
96	NC_017456	CT	3	6	61019	61024	0 %	50 %	0 %	50 %	385801036
97	NC_017456	TG	3	6	61541	61546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017456	AG	3	6	61829	61834	50 %	0 %	50 %	0 %	385801037
99	NC_017456	CG	3	6	62647	62652	0 %	0 %	50 %	50 %	385801038
100	NC_017456	CG	3	6	62754	62759	0 %	0 %	50 %	50 %	385801038
101	NC_017456	GC	3	6	63019	63024	0 %	0 %	50 %	50 %	385801038
102	NC_017456	CG	3	6	64272	64277	0 %	0 %	50 %	50 %	385801038
103	NC_017456	GC	3	6	64900	64905	0 %	0 %	50 %	50 %	385801039
104	NC_017456	AC	3	6	65994	65999	50 %	0 %	0 %	50 %	385801040
105	NC_017456	GC	3	6	67290	67295	0 %	0 %	50 %	50 %	385801041
106	NC_017456	GC	4	8	67918	67925	0 %	0 %	50 %	50 %	385801042
107	NC_017456	GC	3	6	68090	68095	0 %	0 %	50 %	50 %	385801042
108	NC_017456	CG	5	10	68280	68289	0 %	0 %	50 %	50 %	385801042
109	NC_017456	GC	3	6	68631	68636	0 %	0 %	50 %	50 %	385801042
110	NC_017456	CG	3	6	68698	68703	0 %	0 %	50 %	50 %	385801042
111	NC_017456	CG	3	6	69566	69571	0 %	0 %	50 %	50 %	385801043
112	NC_017456	TA	3	6	70305	70310	50 %	50 %	0 %	0 %	385801044
113	NC_017456	CT	3	6	70323	70328	0 %	50 %	0 %	50 %	385801044
114	NC_017456	TA	3	6	71028	71033	50 %	50 %	0 %	0 %	385801044
115	NC_017456	AC	3	6	71956	71961	50 %	0 %	0 %	50 %	385801044
116	NC_017456	CA	3	6	72287	72292	50 %	0 %	0 %	50 %	385801044
117	NC_017456	TG	3	6	72555	72560	0 %	50 %	50 %	0 %	385801044
118	NC_017456	GT	3	6	73144	73149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017456	GC	3	6	73262	73267	0 %	0 %	50 %	50 %	385801045
120	NC_017456	CG	3	6	73274	73279	0 %	0 %	50 %	50 %	385801045
121	NC_017456	CG	3	6	73346	73351	0 %	0 %	50 %	50 %	385801046
122	NC_017456	CG	3	6	73419	73424	0 %	0 %	50 %	50 %	385801046
123	NC_017456	GC	3	6	73498	73503	0 %	0 %	50 %	50 %	385801046
124	NC_017456	GC	3	6	73594	73599	0 %	0 %	50 %	50 %	385801046
125	NC_017456	CA	3	6	75649	75654	50 %	0 %	0 %	50 %	385801047
126	NC_017456	GC	3	6	75752	75757	0 %	0 %	50 %	50 %	385801047
127	NC_017456	CG	3	6	76389	76394	0 %	0 %	50 %	50 %	385801047
128	NC_017456	GC	3	6	76522	76527	0 %	0 %	50 %	50 %	385801047
129	NC_017456	GC	3	6	77080	77085	0 %	0 %	50 %	50 %	385801048
130	NC_017456	CA	3	6	77492	77497	50 %	0 %	0 %	50 %	385801048
131	NC_017456	CG	3	6	79117	79122	0 %	0 %	50 %	50 %	385801049
132	NC_017456	GC	3	6	79226	79231	0 %	0 %	50 %	50 %	385801049
133	NC_017456	CG	3	6	79995	80000	0 %	0 %	50 %	50 %	385801050
134	NC_017456	GC	3	6	80772	80777	0 %	0 %	50 %	50 %	385801051
135	NC_017456	CG	4	8	80879	80886	0 %	0 %	50 %	50 %	385801051
136	NC_017456	GT	3	6	81325	81330	0 %	50 %	50 %	0 %	385801051
137	NC_017456	GC	3	6	81743	81748	0 %	0 %	50 %	50 %	385801051
138	NC_017456	GC	3	6	81853	81858	0 %	0 %	50 %	50 %	385801051
139	NC_017456	CT	3	6	82099	82104	0 %	50 %	0 %	50 %	385801051
140	NC_017456	CG	3	6	83145	83150	0 %	0 %	50 %	50 %	385801051
141	NC_017456	TA	3	6	83302	83307	50 %	50 %	0 %	0 %	385801051
142	NC_017456	GC	3	6	83848	83853	0 %	0 %	50 %	50 %	385801052
143	NC_017456	GC	3	6	84752	84757	0 %	0 %	50 %	50 %	385801053
144	NC_017456	GC	4	8	85263	85270	0 %	0 %	50 %	50 %	385801054
145	NC_017456	GT	3	6	85675	85680	0 %	50 %	50 %	0 %	385801054
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