MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017456	CA	4	8	190990	190997	50 %	0 %	0 %	50 %	385801139
4002	NC_017456	GCAA	2	8	191002	191009	50 %	0 %	25 %	25 %	385801139
4003	NC_017456	AAT	2	6	191070	191075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_017456	TAAC	2	8	191087	191094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4005	NC_017456	GAA	2	6	191111	191116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801140
4006	NC_017456	GAT	2	6	191123	191128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801140
4007	NC_017456	CTG	2	6	191203	191208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801140
4008	NC_017456	CGA	2	6	191237	191242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801140
4009	NC_017456	CCAG	2	8	191333	191340	25 %	0 %	25 %	50 %	385801140
4010	NC_017456	CAG	2	6	191353	191358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801140
4011	NC_017456	AAGG	2	8	191418	191425	50 %	0 %	50 %	0 %	385801140
4012	NC_017456	ATT	2	6	191484	191489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801140
4013	NC_017456	TGT	2	6	191510	191515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801140
4014	NC_017456	AAG	2	6	191628	191633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801140
4015	NC_017456	CGA	2	6	191708	191713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801140
4016	NC_017456	GTG	2	6	191749	191754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_017456	T	6	6	191755	191760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_017456	ACA	2	6	191786	191791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_017456	AATA	2	8	191792	191799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017456	ATAA	3	12	191811	191822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017456	AAT	2	6	191825	191830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_017456	AGG	2	6	191845	191850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_017456	GCT	2	6	191888	191893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801141
4024	NC_017456	GCT	2	6	191903	191908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801141
4025	NC_017456	GCG	2	6	192006	192011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801141
4026	NC_017456	GC	3	6	192029	192034	0 %	0 %	50 %	50 %	385801141
4027	NC_017456	GTG	2	6	192039	192044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801141
4028	NC_017456	GC	3	6	192193	192198	0 %	0 %	50 %	50 %	385801141
4029	NC_017456	CTT	2	6	192297	192302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801141
4030	NC_017456	CG	3	6	192303	192308	0 %	0 %	50 %	50 %	385801141
4031	NC_017456	GCT	2	6	192330	192335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801141
4032	NC_017456	GC	3	6	192368	192373	0 %	0 %	50 %	50 %	385801141
4033	NC_017456	ATT	2	6	192405	192410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801141
4034	NC_017456	ATA	2	6	192417	192422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801141
4035	NC_017456	CTG	2	6	192450	192455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801141
4036	NC_017456	TA	3	6	192483	192488	50 %	50 %	0 %	0 %	385801141
4037	NC_017456	AAC	2	6	192525	192530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801141
4038	NC_017456	CT	3	6	192584	192589	0 %	50 %	0 %	50 %	385801141
4039	NC_017456	AGCG	2	8	192646	192653	25 %	0 %	50 %	25 %	385801141
4040	NC_017456	GCG	2	6	192684	192689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801141
4041	NC_017456	GTA	2	6	192705	192710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801141
4042	NC_017456	CTG	2	6	192724	192729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801141
4043	NC_017456	GT	3	6	192730	192735	0 %	50 %	50 %	0 %	385801141
4044	NC_017456	CGC	2	6	192763	192768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801141
4045	NC_017456	ATG	2	6	192787	192792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801141
4046	NC_017456	CAA	2	6	192799	192804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801141
4047	NC_017456	ATC	2	6	192885	192890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801141
4048	NC_017456	TGG	2	6	192899	192904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801141
4049	NC_017456	CTA	2	6	192953	192958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801141
4050	NC_017456	ATA	2	6	192975	192980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801141
4051	NC_017456	ATTCC	2	10	193044	193053	20 %	40 %	0 %	40 %	385801141
4052	NC_017456	TGG	2	6	193064	193069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801141
4053	NC_017456	CA	3	6	193086	193091	50 %	0 %	0 %	50 %	385801141
4054	NC_017456	TTG	2	6	193207	193212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801142
4055	NC_017456	TG	3	6	193211	193216	0 %	50 %	50 %	0 %	385801142
4056	NC_017456	GT	3	6	193226	193231	0 %	50 %	50 %	0 %	385801142
4057	NC_017456	GTT	2	6	193251	193256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801142
4058	NC_017456	ATT	2	6	193308	193313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801142
4059	NC_017456	TGT	2	6	193334	193339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801142
4060	NC_017456	T	6	6	193442	193447	0 %	100 %	0 %	0 %	385801142
4061	NC_017456	TGC	2	6	193460	193465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801142
4062	NC_017456	T	6	6	193480	193485	0 %	100 %	0 %	0 %	385801142
4063	NC_017456	TTC	2	6	193547	193552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801142
4064	NC_017456	AGT	2	6	193580	193585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801142
4065	NC_017456	TTG	2	6	193591	193596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801142
4066	NC_017456	ACA	2	6	193638	193643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801142
4067	NC_017456	GTT	2	6	193644	193649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801142
4068	NC_017456	TGG	2	6	193671	193676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801142
4069	NC_017456	CG	3	6	193699	193704	0 %	0 %	50 %	50 %	385801142
4070	NC_017456	AACT	2	8	193777	193784	50 %	25 %	0 %	25 %	385801142
4071	NC_017456	TTG	2	6	193813	193818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801142
4072	NC_017456	CCAG	2	8	193867	193874	25 %	0 %	25 %	50 %	385801142
4073	NC_017456	GCG	2	6	193962	193967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801142
4074	NC_017456	GCG	2	6	193977	193982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801142
4075	NC_017456	AAG	2	6	193990	193995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801142
4076	NC_017456	TTAC	2	8	194035	194042	25 %	50 %	0 %	25 %	385801142
4077	NC_017456	GAA	2	6	194049	194054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801142
4078	NC_017456	CG	3	6	194125	194130	0 %	0 %	50 %	50 %	385801142
4079	NC_017456	GCG	2	6	194166	194171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801142
4080	NC_017456	GTTGCG	2	12	194175	194186	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385801142
4081	NC_017456	GGC	2	6	194195	194200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801142
4082	NC_017456	GCT	2	6	194231	194236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801142
4083	NC_017456	GC	3	6	194250	194255	0 %	0 %	50 %	50 %	385801142
4084	NC_017456	CTT	2	6	194421	194426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801142
4085	NC_017456	TGC	3	9	194441	194449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801142
4086	NC_017456	AGT	2	6	194601	194606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801143
4087	NC_017456	TTG	2	6	194615	194620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801143
4088	NC_017456	CGCTA	2	10	194625	194634	20 %	20 %	20 %	40 %	385801143
4089	NC_017456	TTG	2	6	194657	194662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801143
4090	NC_017456	CAA	2	6	194668	194673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801143
4091	NC_017456	GC	3	6	194688	194693	0 %	0 %	50 %	50 %	385801143
4092	NC_017456	ATT	2	6	194707	194712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801143
4093	NC_017456	CGC	2	6	194717	194722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801143
4094	NC_017456	CTAC	2	8	194810	194817	25 %	25 %	0 %	50 %	385801143
4095	NC_017456	TGCT	2	8	194855	194862	0 %	50 %	25 %	25 %	385801143
4096	NC_017456	TAA	2	6	194892	194897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801143
4097	NC_017456	TCGGAT	2	12	195025	195036	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385801143
4098	NC_017456	TCT	2	6	195100	195105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801143
4099	NC_017456	TTG	2	6	195116	195121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801143
4100	NC_017456	TGCG	2	8	195236	195243	0 %	25 %	50 %	25 %	385801143
4101	NC_017456	TCT	2	6	195286	195291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801143
4102	NC_017456	TGT	2	6	195309	195314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801143
4103	NC_017456	GCA	2	6	195317	195322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801143
4104	NC_017456	CAA	2	6	195355	195360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801143
4105	NC_017456	CGG	2	6	195374	195379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801143
4106	NC_017456	ATT	2	6	195391	195396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801143
4107	NC_017456	GTT	2	6	195433	195438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801143
4108	NC_017456	TGA	2	6	195446	195451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801143
4109	NC_017456	TTC	2	6	195474	195479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801143
4110	NC_017456	GCA	2	6	195486	195491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801143
4111	NC_017456	GCATTG	2	12	195542	195553	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385801143
4112	NC_017456	CAG	2	6	195605	195610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801143
4113	NC_017456	TTGC	2	8	195631	195638	0 %	50 %	25 %	25 %	385801143
4114	NC_017456	TGG	2	6	195673	195678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801143
4115	NC_017456	TGC	2	6	195723	195728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801143
4116	NC_017456	GCC	2	6	195732	195737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801143
4117	NC_017456	GC	3	6	195744	195749	0 %	0 %	50 %	50 %	385801143
4118	NC_017456	GAA	2	6	195781	195786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801143
4119	NC_017456	CT	3	6	195944	195949	0 %	50 %	0 %	50 %	385801144
4120	NC_017456	TTG	2	6	196003	196008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801144
4121	NC_017456	ATT	2	6	196044	196049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801144
4122	NC_017456	GCAA	2	8	196247	196254	50 %	0 %	25 %	25 %	385801144
4123	NC_017456	CAT	2	6	196293	196298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801144
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4231	NC_017456	TAAT	2	8	201091	201098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_017456	TAG	2	6	201106	201111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_017456	CTGTG	2	10	201112	201121	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4234	NC_017456	T	7	7	201175	201181	0 %	100 %	0 %	0 %	385801147
4235	NC_017456	TTTTG	2	10	201233	201242	0 %	80 %	20 %	0 %	385801147
4236	NC_017456	A	6	6	201302	201307	100 %	0 %	0 %	0 %	385801147
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4241	NC_017456	A	6	6	201547	201552	100 %	0 %	0 %	0 %	385801147
4242	NC_017456	TAT	2	6	201570	201575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801147
4243	NC_017456	TGA	2	6	201662	201667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801147
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4245	NC_017456	ATT	2	6	201734	201739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801147
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4251	NC_017456	GTA	2	6	202000	202005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4358	NC_017456	TTC	2	6	206471	206476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801154
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4366	NC_017456	GTAG	2	8	207042	207049	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4367	NC_017456	ATT	2	6	207057	207062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801155
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4369	NC_017456	ATG	2	6	207089	207094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801155
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4496	NC_017456	AGT	2	6	213190	213195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801162
4497	NC_017456	GAA	2	6	213208	213213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801162
4498	NC_017456	AAT	2	6	213268	213273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801162
4499	NC_017456	CCAA	2	8	213280	213287	50 %	0 %	0 %	50 %	385801162
4500	NC_017456	GCA	2	6	213335	213340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801162

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