MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017456	GCGCGA	2	12	166741	166752	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	385801117
3502	NC_017456	AAT	2	6	166778	166783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801117
3503	NC_017456	ATT	2	6	166824	166829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801117
3504	NC_017456	ACG	2	6	166830	166835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801117
3505	NC_017456	TTG	2	6	166854	166859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801117
3506	NC_017456	GCT	2	6	166864	166869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801117
3507	NC_017456	TCGC	2	8	166913	166920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_017456	A	6	6	167032	167037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_017456	TCA	2	6	167130	167135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801118
3510	NC_017456	GTT	2	6	167184	167189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801118
3511	NC_017456	TTC	2	6	167327	167332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801118
3512	NC_017456	GTC	2	6	167376	167381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801118
3513	NC_017456	CTT	2	6	167399	167404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801119
3514	NC_017456	TAT	2	6	167408	167413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801119
3515	NC_017456	TTTA	2	8	167442	167449	25 %	75 %	0 %	0 %	385801119
3516	NC_017456	CTTT	2	8	167556	167563	0 %	75 %	0 %	25 %	385801119
3517	NC_017456	GCC	2	6	167607	167612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801119
3518	NC_017456	T	6	6	167781	167786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017456	TAA	2	6	167859	167864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_017456	ATT	2	6	167869	167874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017456	GCAA	2	8	167895	167902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3522	NC_017456	GCAA	2	8	167909	167916	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_017456	TAC	2	6	167918	167923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_017456	AAT	2	6	167933	167938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_017456	GAA	2	6	168039	168044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801120
3526	NC_017456	TG	3	6	168121	168126	0 %	50 %	50 %	0 %	385801120
3527	NC_017456	GAT	2	6	168150	168155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801120
3528	NC_017456	GC	3	6	168161	168166	0 %	0 %	50 %	50 %	385801120
3529	NC_017456	A	6	6	168169	168174	100 %	0 %	0 %	0 %	385801120
3530	NC_017456	AAG	2	6	168244	168249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801120
3531	NC_017456	ATT	2	6	168264	168269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801120
3532	NC_017456	TAT	2	6	168446	168451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801120
3533	NC_017456	ATA	2	6	168472	168477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801120
3534	NC_017456	AGTA	2	8	168509	168516	50 %	25 %	25 %	0 %	385801120
3535	NC_017456	AAT	2	6	168531	168536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801120
3536	NC_017456	TGA	2	6	168601	168606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801120
3537	NC_017456	ATG	2	6	168679	168684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801120
3538	NC_017456	TGCT	2	8	168709	168716	0 %	50 %	25 %	25 %	385801120
3539	NC_017456	AGC	2	6	168730	168735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801120
3540	NC_017456	TGC	2	6	168797	168802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801120
3541	NC_017456	TTG	2	6	168851	168856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801120
3542	NC_017456	AT	3	6	168869	168874	50 %	50 %	0 %	0 %	385801120
3543	NC_017456	A	6	6	168876	168881	100 %	0 %	0 %	0 %	385801120
3544	NC_017456	ATT	2	6	168927	168932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801120
3545	NC_017456	AGGA	2	8	168967	168974	50 %	0 %	50 %	0 %	385801120
3546	NC_017456	TTG	2	6	169008	169013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801120
3547	NC_017456	T	6	6	169024	169029	0 %	100 %	0 %	0 %	385801120
3548	NC_017456	GCAA	2	8	169054	169061	50 %	0 %	25 %	25 %	385801120
3549	NC_017456	TGA	2	6	169088	169093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801120
3550	NC_017456	GA	3	6	169104	169109	50 %	0 %	50 %	0 %	385801120
3551	NC_017456	GC	3	6	169120	169125	0 %	0 %	50 %	50 %	385801120
3552	NC_017456	TTGA	2	8	169134	169141	25 %	50 %	25 %	0 %	385801120
3553	NC_017456	A	6	6	169194	169199	100 %	0 %	0 %	0 %	385801120
3554	NC_017456	TGTT	2	8	169230	169237	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_017456	A	6	6	169253	169258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_017456	TA	3	6	169421	169426	50 %	50 %	0 %	0 %	385801121
3557	NC_017456	TAA	2	6	169475	169480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_017456	ATT	2	6	169487	169492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_017456	TGT	2	6	169507	169512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017456	T	6	6	169521	169526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_017456	ATT	2	6	169532	169537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017456	TAA	2	6	169699	169704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_017456	TCCAA	2	10	169710	169719	40 %	20 %	0 %	40 %	385801122
3564	NC_017456	CTT	2	6	169720	169725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801122
3565	NC_017456	AT	3	6	169778	169783	50 %	50 %	0 %	0 %	385801122
3566	NC_017456	CGCCAG	2	12	169858	169869	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385801122
3567	NC_017456	GA	3	6	170051	170056	50 %	0 %	50 %	0 %	385801122
3568	NC_017456	CTG	2	6	170122	170127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801122
3569	NC_017456	TTG	2	6	170176	170181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801122
3570	NC_017456	CAT	2	6	170260	170265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801122
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3572	NC_017456	TGC	2	6	170477	170482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801122
3573	NC_017456	TCC	2	6	170504	170509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801122
3574	NC_017456	AAATC	2	10	170575	170584	60 %	20 %	0 %	20 %	385801122
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3582	NC_017456	GAA	2	6	171164	171169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801123
3583	NC_017456	TAA	2	6	171264	171269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801123
3584	NC_017456	GAATG	2	10	171362	171371	40 %	20 %	40 %	0 %	385801123
3585	NC_017456	AAT	2	6	171469	171474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801123
3586	NC_017456	CATT	2	8	171569	171576	25 %	50 %	0 %	25 %	385801123
3587	NC_017456	TGACA	2	10	171640	171649	40 %	20 %	20 %	20 %	385801123
3588	NC_017456	CTTT	2	8	171655	171662	0 %	75 %	0 %	25 %	385801124
3589	NC_017456	T	6	6	171660	171665	0 %	100 %	0 %	0 %	385801124
3590	NC_017456	T	6	6	171669	171674	0 %	100 %	0 %	0 %	385801124
3591	NC_017456	ATGA	2	8	171727	171734	50 %	25 %	25 %	0 %	385801124
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3595	NC_017456	CTG	2	6	171917	171922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801124
3596	NC_017456	TACA	2	8	171954	171961	50 %	25 %	0 %	25 %	385801124
3597	NC_017456	TAAG	2	8	172025	172032	50 %	25 %	25 %	0 %	385801124
3598	NC_017456	GAA	2	6	172053	172058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801124
3599	NC_017456	AATG	2	8	172062	172069	50 %	25 %	25 %	0 %	385801124
3600	NC_017456	TGC	2	6	172086	172091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801124
3601	NC_017456	TACA	2	8	172167	172174	50 %	25 %	0 %	25 %	385801124
3602	NC_017456	T	6	6	172210	172215	0 %	100 %	0 %	0 %	385801124
3603	NC_017456	TCA	2	6	172264	172269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801124
3604	NC_017456	GT	4	8	172270	172277	0 %	50 %	50 %	0 %	385801124
3605	NC_017456	AAT	3	9	172308	172316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801124
3606	NC_017456	CT	3	6	172396	172401	0 %	50 %	0 %	50 %	385801124
3607	NC_017456	ATC	2	6	172549	172554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801124
3608	NC_017456	ATG	2	6	172571	172576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801124
3609	NC_017456	GAA	2	6	172656	172661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801124
3610	NC_017456	C	6	6	172764	172769	0 %	0 %	0 %	100 %	385801124
3611	NC_017456	CAT	2	6	172844	172849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801124
3612	NC_017456	TGC	2	6	172857	172862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801124
3613	NC_017456	ATA	2	6	172889	172894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801124
3614	NC_017456	TTTA	2	8	172917	172924	25 %	75 %	0 %	0 %	385801124
3615	NC_017456	TAG	2	6	172979	172984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801124
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3618	NC_017456	TTC	2	6	173030	173035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801125
3619	NC_017456	GA	3	6	173040	173045	50 %	0 %	50 %	0 %	385801125
3620	NC_017456	CAG	2	6	173056	173061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801125
3621	NC_017456	TCT	2	6	173106	173111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801125
3622	NC_017456	CAG	2	6	173128	173133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801125
3623	NC_017456	CTC	2	6	173194	173199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801125
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3997	NC_017456	CTG	2	6	190730	190735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801139
3998	NC_017456	GC	3	6	190788	190793	0 %	0 %	50 %	50 %	385801139
3999	NC_017456	GTG	2	6	190808	190813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801139
4000	NC_017456	TGG	2	6	190822	190827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801139

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