MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35001	NC_017456	CTGC	2	8	1685566	1685573	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35002	NC_017456	ACA	2	6	1685574	1685579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35003	NC_017456	CAC	2	6	1685590	1685595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35004	NC_017456	TCA	2	6	1685607	1685612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35005	NC_017456	TTG	2	6	1685624	1685629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35006	NC_017456	GGC	2	6	1685660	1685665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35007	NC_017456	AT	3	6	1685701	1685706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35008	NC_017456	CAA	2	6	1685710	1685715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35009	NC_017456	CAT	2	6	1685740	1685745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35010	NC_017456	AGCA	2	8	1685771	1685778	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35011	NC_017456	GTC	2	6	1685814	1685819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35012	NC_017456	TTC	3	9	1685842	1685850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35013	NC_017456	TGC	2	6	1685858	1685863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35014	NC_017456	AAC	2	6	1685881	1685886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35015	NC_017456	CAA	2	6	1685923	1685928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35016	NC_017456	GCA	2	6	1685949	1685954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35017	NC_017456	TGA	2	6	1685955	1685960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35018	NC_017456	ATC	2	6	1685978	1685983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35019	NC_017456	TGC	2	6	1685993	1685998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35020	NC_017456	CAT	2	6	1686082	1686087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35021	NC_017456	TGT	2	6	1686114	1686119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35022	NC_017456	TTC	2	6	1686144	1686149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35023	NC_017456	ACT	2	6	1686171	1686176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35024	NC_017456	TCA	2	6	1686186	1686191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35025	NC_017456	AGT	2	6	1686243	1686248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35026	NC_017456	CAG	2	6	1686346	1686351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35027	NC_017456	CAA	2	6	1686356	1686361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35028	NC_017456	AAC	2	6	1686383	1686388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35029	NC_017456	ATC	2	6	1686404	1686409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35030	NC_017456	T	6	6	1686428	1686433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35031	NC_017456	GTTG	2	8	1686444	1686451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35032	NC_017456	CGCA	2	8	1686505	1686512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35033	NC_017456	ATG	2	6	1686565	1686570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35034	NC_017456	A	6	6	1686571	1686576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35035	NC_017456	CAT	2	6	1686590	1686595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35036	NC_017456	ATT	2	6	1686599	1686604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35037	NC_017456	T	6	6	1686629	1686634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35038	NC_017456	ATC	2	6	1686677	1686682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35039	NC_017456	GTT	2	6	1686684	1686689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35040	NC_017456	CTC	2	6	1686702	1686707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35041	NC_017456	GCA	2	6	1686723	1686728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35042	NC_017456	AGTA	2	8	1686736	1686743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35043	NC_017456	CCA	2	6	1686759	1686764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35044	NC_017456	ATC	2	6	1686774	1686779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35045	NC_017456	TGT	2	6	1686788	1686793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35046	NC_017456	CAA	2	6	1686809	1686814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35047	NC_017456	ATT	2	6	1686895	1686900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35048	NC_017456	AAT	2	6	1686904	1686909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35049	NC_017456	AC	3	6	1686923	1686928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35050	NC_017456	ACA	2	6	1686955	1686960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35051	NC_017456	AATA	2	8	1686961	1686968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35052	NC_017456	GCC	2	6	1687012	1687017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35053	NC_017456	CAAT	2	8	1687020	1687027	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35054	NC_017456	AAAG	2	8	1687061	1687068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35055	NC_017456	GAAA	2	8	1687087	1687094	75 %	0 %	25 %	0 %	385802279
35056	NC_017456	ATT	2	6	1687095	1687100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802279
35057	NC_017456	CAT	2	6	1687103	1687108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802279
35058	NC_017456	GCA	2	6	1687110	1687115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802279
35059	NC_017456	CTA	2	6	1687128	1687133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802279
35060	NC_017456	TCA	2	6	1687170	1687175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802279
35061	NC_017456	TG	3	6	1687211	1687216	0 %	50 %	50 %	0 %	385802279
35062	NC_017456	ACA	2	6	1687227	1687232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802279
35063	NC_017456	CAA	2	6	1687234	1687239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802279
35064	NC_017456	AGC	4	12	1687241	1687252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802279
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35066	NC_017456	AAT	2	6	1687437	1687442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802279
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35069	NC_017456	AGC	2	6	1687607	1687612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802279
35070	NC_017456	TAC	2	6	1687641	1687646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802279
35071	NC_017456	AGA	2	6	1687786	1687791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802279
35072	NC_017456	AAG	2	6	1687798	1687803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802279
35073	NC_017456	GATT	2	8	1687804	1687811	25 %	50 %	25 %	0 %	385802279
35074	NC_017456	GAT	2	6	1687836	1687841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802279
35075	NC_017456	CA	3	6	1687874	1687879	50 %	0 %	0 %	50 %	385802279
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35080	NC_017456	TCT	2	6	1688157	1688162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802279
35081	NC_017456	AAAC	2	8	1688366	1688373	75 %	0 %	0 %	25 %	385802279
35082	NC_017456	AAT	2	6	1688392	1688397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802279
35083	NC_017456	TAA	2	6	1688404	1688409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35086	NC_017456	TAT	2	6	1688630	1688635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802280
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35088	NC_017456	AATT	2	8	1688677	1688684	50 %	50 %	0 %	0 %	385802280
35089	NC_017456	A	6	6	1688708	1688713	100 %	0 %	0 %	0 %	385802280
35090	NC_017456	ATT	2	6	1688738	1688743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802280
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35093	NC_017456	GCT	2	6	1689042	1689047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802280
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35095	NC_017456	TTC	2	6	1689074	1689079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802280
35096	NC_017456	GCT	2	6	1689111	1689116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802280
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35100	NC_017456	TGC	3	9	1689341	1689349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802280
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35103	NC_017456	GAA	2	6	1689472	1689477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802281
35104	NC_017456	ACA	2	6	1689490	1689495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802281
35105	NC_017456	ATC	2	6	1689498	1689503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802281
35106	NC_017456	AAT	2	6	1689505	1689510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802281
35107	NC_017456	AGA	2	6	1689560	1689565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802281
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35109	NC_017456	TATCTA	2	12	1689589	1689600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385802281
35110	NC_017456	TTTG	2	8	1689619	1689626	0 %	75 %	25 %	0 %	385802281
35111	NC_017456	ACA	2	6	1689710	1689715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802281
35112	NC_017456	TAG	2	6	1689716	1689721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802281
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35116	NC_017456	TAA	2	6	1689974	1689979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802281
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35240	NC_017456	GCT	2	6	1697184	1697189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802284
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35349	NC_017456	TTAC	2	8	1703156	1703163	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35350	NC_017456	AT	3	6	1703203	1703208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35351	NC_017456	TTTA	2	8	1703213	1703220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35352	NC_017456	AACA	2	8	1703296	1703303	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35353	NC_017456	AT	3	6	1703322	1703327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35354	NC_017456	CCA	2	6	1703361	1703366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35355	NC_017456	ATTTG	2	10	1703425	1703434	20 %	60 %	20 %	0 %	385802288
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