MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017456	GTG	2	6	143285	143290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_017456	TG	4	8	143289	143296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017456	TGG	2	6	143302	143307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_017456	GT	3	6	143308	143313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017456	GCAC	2	8	143330	143337	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_017456	GGC	2	6	143351	143356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_017456	GCA	2	6	143363	143368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_017456	TGC	2	6	143373	143378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_017456	AT	3	6	143428	143433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017456	AT	3	6	143443	143448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_017456	CCATTT	2	12	143483	143494	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_017456	TGG	3	9	143495	143503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017456	ACC	2	6	143530	143535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_017456	TA	3	6	143581	143586	50 %	50 %	0 %	0 %	385801097
3015	NC_017456	CTT	2	6	143593	143598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801097
3016	NC_017456	GA	3	6	143652	143657	50 %	0 %	50 %	0 %	385801097
3017	NC_017456	AAG	2	6	143814	143819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801097
3018	NC_017456	AAAT	2	8	143853	143860	75 %	25 %	0 %	0 %	385801097
3019	NC_017456	CTT	2	6	143925	143930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801098
3020	NC_017456	CTTGT	2	10	143968	143977	0 %	60 %	20 %	20 %	385801098
3021	NC_017456	CCA	2	6	143990	143995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801098
3022	NC_017456	TCTTG	2	10	144012	144021	0 %	60 %	20 %	20 %	385801098
3023	NC_017456	CTT	2	6	144069	144074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801098
3024	NC_017456	TTC	2	6	144199	144204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801098
3025	NC_017456	TAT	2	6	144211	144216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801098
3026	NC_017456	CA	3	6	144220	144225	50 %	0 %	0 %	50 %	385801098
3027	NC_017456	TC	3	6	144280	144285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_017456	TCT	2	6	144292	144297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_017456	AG	3	6	144302	144307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017456	TGA	2	6	144386	144391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017456	GTT	2	6	144397	144402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017456	AGC	2	6	144407	144412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_017456	GGTGT	2	10	144417	144426	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017456	CTG	2	6	144649	144654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_017456	CTG	2	6	144733	144738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_017456	TCA	2	6	144799	144804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_017456	GTT	2	6	144826	144831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_017456	GTCG	2	8	144925	144932	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_017456	TGA	2	6	144936	144941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017456	TGA	2	6	145050	145055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017456	TCAT	2	8	145085	145092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_017456	TTCT	2	8	145155	145162	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_017456	T	6	6	145181	145186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017456	TCGT	2	8	145241	145248	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_017456	CT	3	6	145363	145368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_017456	TTA	2	6	145421	145426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017456	TGC	2	6	145434	145439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_017456	CTTT	2	8	145465	145472	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_017456	T	6	6	145620	145625	0 %	100 %	0 %	0 %	385801099
3050	NC_017456	TG	3	6	145643	145648	0 %	50 %	50 %	0 %	385801099
3051	NC_017456	CGT	2	6	145677	145682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_017456	TGGTT	2	10	145763	145772	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017456	TA	3	6	145774	145779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017456	ATT	2	6	145794	145799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_017456	TCGT	2	8	145802	145809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_017456	GTT	2	6	145810	145815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_017456	CG	3	6	145876	145881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_017456	GGA	2	6	145898	145903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017456	T	6	6	145931	145936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_017456	A	6	6	145972	145977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_017456	GAT	2	6	146005	146010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017456	GCC	2	6	146020	146025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_017456	GTG	2	6	146032	146037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_017456	CTG	2	6	146052	146057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_017456	GGC	2	6	146060	146065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_017456	CA	3	6	146071	146076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3067	NC_017456	TG	3	6	146081	146086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017456	TAG	2	6	146101	146106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017456	CG	3	6	146208	146213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_017456	CCA	2	6	146233	146238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_017456	CTT	2	6	146261	146266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_017456	GTA	2	6	146332	146337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801100
3073	NC_017456	TGG	2	6	146492	146497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801100
3074	NC_017456	CAG	2	6	146499	146504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801100
3075	NC_017456	GATG	2	8	146516	146523	25 %	25 %	50 %	0 %	385801100
3076	NC_017456	GT	3	6	146528	146533	0 %	50 %	50 %	0 %	385801100
3077	NC_017456	CACG	2	8	146675	146682	25 %	0 %	25 %	50 %	385801100
3078	NC_017456	GAG	2	6	146685	146690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801100
3079	NC_017456	CGTAG	2	10	146711	146720	20 %	20 %	40 %	20 %	385801100
3080	NC_017456	T	8	8	146837	146844	0 %	100 %	0 %	0 %	385801100
3081	NC_017456	TCCTT	2	10	146846	146855	0 %	60 %	0 %	40 %	385801100
3082	NC_017456	GT	3	6	146856	146861	0 %	50 %	50 %	0 %	385801100
3083	NC_017456	GGCA	2	8	146874	146881	25 %	0 %	50 %	25 %	385801100
3084	NC_017456	TGT	2	6	146957	146962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801100
3085	NC_017456	TTG	2	6	146986	146991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801100
3086	NC_017456	GCG	2	6	147069	147074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801100
3087	NC_017456	GCA	2	6	147082	147087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801100
3088	NC_017456	TGC	2	6	147092	147097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801100
3089	NC_017456	ACAGT	2	10	147104	147113	40 %	20 %	20 %	20 %	385801100
3090	NC_017456	GCC	2	6	147143	147148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801100
3091	NC_017456	ATG	2	6	147199	147204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801100
3092	NC_017456	AGC	2	6	147516	147521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801101
3093	NC_017456	ATT	2	6	147529	147534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801101
3094	NC_017456	CAA	2	6	147617	147622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801101
3095	NC_017456	ATC	2	6	147660	147665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801101
3096	NC_017456	AATA	2	8	147675	147682	75 %	25 %	0 %	0 %	385801101
3097	NC_017456	TGG	2	6	147693	147698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801101
3098	NC_017456	TAC	2	6	147702	147707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801101
3099	NC_017456	GAA	2	6	147714	147719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801101
3100	NC_017456	CTG	2	6	147743	147748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801101
3101	NC_017456	TAT	2	6	147777	147782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801101
3102	NC_017456	T	6	6	148021	148026	0 %	100 %	0 %	0 %	385801101
3103	NC_017456	TAAA	2	8	148135	148142	75 %	25 %	0 %	0 %	385801101
3104	NC_017456	ATAA	2	8	148143	148150	75 %	25 %	0 %	0 %	385801101
3105	NC_017456	ATT	3	9	148153	148161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801101
3106	NC_017456	TAC	2	6	148211	148216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801101
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3108	NC_017456	CTA	2	6	148241	148246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801101
3109	NC_017456	GAA	2	6	148271	148276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801101
3110	NC_017456	TAA	2	6	148289	148294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801101
3111	NC_017456	ATC	2	6	148296	148301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801101
3112	NC_017456	T	6	6	148303	148308	0 %	100 %	0 %	0 %	385801101
3113	NC_017456	AC	3	6	148387	148392	50 %	0 %	0 %	50 %	385801101
3114	NC_017456	ATA	2	6	148450	148455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801101
3115	NC_017456	GCA	2	6	148486	148491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801101
3116	NC_017456	TGT	2	6	148494	148499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801101
3117	NC_017456	CTA	2	6	148547	148552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801101
3118	NC_017456	GTGAGG	2	12	148567	148578	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385801101
3119	NC_017456	ATAA	2	8	148586	148593	75 %	25 %	0 %	0 %	385801101
3120	NC_017456	CTG	2	6	148602	148607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801101
3121	NC_017456	TAG	2	6	148646	148651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801101
3122	NC_017456	AGAA	2	8	148677	148684	75 %	0 %	25 %	0 %	385801101
3123	NC_017456	GCT	2	6	148693	148698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801101
3124	NC_017456	ATT	2	6	148772	148777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_017456	GA	3	6	148782	148787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017456	TAG	2	6	148800	148805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_017456	TGT	2	6	148813	148818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017456	GTC	2	6	148822	148827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_017456	TCA	2	6	148859	148864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_017456	AAT	2	6	148885	148890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_017456	TA	3	6	148918	148923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_017456	TTG	2	6	148930	148935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_017456	GTAT	2	8	148973	148980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_017456	GTA	2	6	148995	149000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3143	NC_017456	CCT	2	6	149327	149332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3144	NC_017456	AAT	2	6	149384	149389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3145	NC_017456	GT	3	6	149418	149423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_017456	AAT	2	6	149436	149441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_017456	TA	3	6	149444	149449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_017456	TAG	2	6	149455	149460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3150	NC_017456	GTA	2	6	149499	149504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3153	NC_017456	TCAA	2	8	149601	149608	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3154	NC_017456	CTTG	2	8	149651	149658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3227	NC_017456	TTTTA	2	10	153559	153568	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3228	NC_017456	TGGT	2	8	153598	153605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3229	NC_017456	GTC	2	6	153613	153618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3231	NC_017456	TCCA	2	8	153713	153720	25 %	25 %	0 %	50 %	385801104
3232	NC_017456	GATA	2	8	153731	153738	50 %	25 %	25 %	0 %	385801104
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3243	NC_017456	GCTGT	2	10	154265	154274	0 %	40 %	40 %	20 %	385801104
3244	NC_017456	CTTA	2	8	154347	154354	25 %	50 %	0 %	25 %	385801104
3245	NC_017456	TCA	2	6	154444	154449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801104
3246	NC_017456	TCT	2	6	154463	154468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801104
3247	NC_017456	ACA	2	6	154582	154587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801104
3248	NC_017456	ATG	2	6	154600	154605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801104
3249	NC_017456	CTT	3	9	154617	154625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801104
3250	NC_017456	TAA	2	6	154691	154696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801104
3251	NC_017456	TCTA	2	8	154738	154745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3252	NC_017456	AT	3	6	154779	154784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3254	NC_017456	TAG	2	6	154844	154849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3471	NC_017456	TGC	2	6	164884	164889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801115
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3474	NC_017456	TTC	2	6	165105	165110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3480	NC_017456	TGCAT	2	10	165593	165602	20 %	40 %	20 %	20 %	385801116
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3483	NC_017456	CTA	2	6	165763	165768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801116
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3485	NC_017456	TGT	2	6	165861	165866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801116
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3487	NC_017456	TAAG	2	8	165994	166001	50 %	25 %	25 %	0 %	385801116
3488	NC_017456	TATT	2	8	166032	166039	25 %	75 %	0 %	0 %	385801116
3489	NC_017456	TA	3	6	166124	166129	50 %	50 %	0 %	0 %	385801116
3490	NC_017456	TTA	2	6	166188	166193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801116
3491	NC_017456	GTT	2	6	166223	166228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801116
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3493	NC_017456	GCA	2	6	166339	166344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801116
3494	NC_017456	TGA	2	6	166375	166380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801116
3495	NC_017456	TC	3	6	166433	166438	0 %	50 %	0 %	50 %	385801116
3496	NC_017456	TTTCA	2	10	166445	166454	20 %	60 %	0 %	20 %	385801116
3497	NC_017456	GTA	2	6	166477	166482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_017456	GTG	2	6	166550	166555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3499	NC_017456	TTG	2	6	166674	166679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801117
3500	NC_017456	TAT	2	6	166723	166728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801117

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