MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_017456	CAT	2	6	118815	118820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801079
2503	NC_017456	GCG	2	6	118853	118858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801079
2504	NC_017456	ATT	2	6	118872	118877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801079
2505	NC_017456	TGA	2	6	118890	118895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801079
2506	NC_017456	TTG	2	6	118905	118910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801079
2507	NC_017456	GCC	2	6	118937	118942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801079
2508	NC_017456	GAA	2	6	118972	118977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801079
2509	NC_017456	ATTC	2	8	118984	118991	25 %	50 %	0 %	25 %	385801079
2510	NC_017456	TGC	2	6	118992	118997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801079
2511	NC_017456	TGA	2	6	119007	119012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801079
2512	NC_017456	ATT	2	6	119120	119125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801079
2513	NC_017456	CAA	2	6	119145	119150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801079
2514	NC_017456	TGA	2	6	119164	119169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801079
2515	NC_017456	GC	3	6	119174	119179	0 %	0 %	50 %	50 %	385801079
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2517	NC_017456	GTC	2	6	119230	119235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801079
2518	NC_017456	ATT	2	6	119382	119387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801079
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2521	NC_017456	TTC	2	6	119438	119443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801079
2522	NC_017456	TAT	2	6	119520	119525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801080
2523	NC_017456	GGT	2	6	119671	119676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801080
2524	NC_017456	T	6	6	119750	119755	0 %	100 %	0 %	0 %	385801080
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2529	NC_017456	TGT	2	6	119928	119933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801080
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2531	NC_017456	CAT	2	6	120079	120084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801080
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2555	NC_017456	AAG	2	6	120919	120924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_017456	GAAA	2	8	120937	120944	75 %	0 %	25 %	0 %	385801081
2557	NC_017456	CTG	2	6	120988	120993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801081
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2561	NC_017456	TGC	2	6	121280	121285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801081
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2570	NC_017456	TCG	2	6	121535	121540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801081
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2580	NC_017456	GCT	2	6	121866	121871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801081
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2585	NC_017456	GTA	2	6	121997	122002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2587	NC_017456	T	7	7	122049	122055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_017456	T	6	6	122107	122112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_017456	TAG	2	6	122145	122150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801082
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2593	NC_017456	CCAT	2	8	122385	122392	25 %	25 %	0 %	50 %	385801082
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2602	NC_017456	CA	3	6	122905	122910	50 %	0 %	0 %	50 %	385801082
2603	NC_017456	GCC	2	6	122927	122932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801082
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2605	NC_017456	GC	3	6	123116	123121	0 %	0 %	50 %	50 %	385801082
2606	NC_017456	GCT	2	6	123166	123171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801082
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2609	NC_017456	CGT	2	6	123301	123306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801082
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2612	NC_017456	TCT	2	6	123372	123377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801082
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2614	NC_017456	TGC	2	6	123578	123583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801082
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2616	NC_017456	ACA	2	6	123718	123723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_017456	A	6	6	123784	123789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_017456	GAATT	2	10	123806	123815	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_017456	AATA	2	8	123881	123888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_017456	ATTT	2	8	123901	123908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2953	NC_017456	A	6	6	140806	140811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2979	NC_017456	TGA	2	6	142139	142144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2983	NC_017456	T	6	6	142321	142326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2984	NC_017456	AAGG	2	8	142327	142334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2985	NC_017456	GA	3	6	142428	142433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2986	NC_017456	AAG	2	6	142454	142459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2987	NC_017456	ATG	2	6	142534	142539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2988	NC_017456	ATG	2	6	142615	142620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2989	NC_017456	ATA	2	6	142621	142626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2990	NC_017456	AGT	2	6	142629	142634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2991	NC_017456	GAC	2	6	142652	142657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2992	NC_017456	GTG	2	6	142743	142748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2993	NC_017456	CGA	2	6	142865	142870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2994	NC_017456	CGAC	2	8	142952	142959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2995	NC_017456	T	6	6	142998	143003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2996	NC_017456	ATA	2	6	143062	143067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2997	NC_017456	TG	3	6	143082	143087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_017456	TG	3	6	143092	143097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2999	NC_017456	AGC	2	6	143112	143117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3000	NC_017456	GC	3	6	143180	143185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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