MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_017456	CAA	2	6	1177038	1177043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801902
24502	NC_017456	AAC	2	6	1177053	1177058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801902
24503	NC_017456	CAT	3	9	1177169	1177177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801902
24504	NC_017456	ATT	2	6	1177192	1177197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801902
24505	NC_017456	CTAT	2	8	1177216	1177223	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24506	NC_017456	TAC	2	6	1177396	1177401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801903
24507	NC_017456	AT	3	6	1177771	1177776	50 %	50 %	0 %	0 %	385801903
24508	NC_017456	AGC	2	6	1177826	1177831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801903
24509	NC_017456	GCAA	2	8	1177954	1177961	50 %	0 %	25 %	25 %	385801903
24510	NC_017456	TAA	2	6	1177964	1177969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801903
24511	NC_017456	AAG	2	6	1178014	1178019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801903
24512	NC_017456	AGA	2	6	1178051	1178056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801903
24513	NC_017456	TAA	2	6	1178084	1178089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801903
24514	NC_017456	CTTTAA	2	12	1178101	1178112	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385801903
24515	NC_017456	TTC	2	6	1178123	1178128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801903
24516	NC_017456	ACT	2	6	1178132	1178137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801903
24517	NC_017456	T	6	6	1178193	1178198	0 %	100 %	0 %	0 %	385801904
24518	NC_017456	TTA	2	6	1178211	1178216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801904
24519	NC_017456	TCA	2	6	1178243	1178248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801904
24520	NC_017456	ATA	2	6	1178354	1178359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801904
24521	NC_017456	ACA	2	6	1178360	1178365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801904
24522	NC_017456	AGC	3	9	1178371	1178379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801904
24523	NC_017456	TCC	2	6	1178413	1178418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801904
24524	NC_017456	AGA	2	6	1178551	1178556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801904
24525	NC_017456	TAA	2	6	1178605	1178610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801904
24526	NC_017456	ATT	2	6	1178635	1178640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801904
24527	NC_017456	CGT	2	6	1178645	1178650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801904
24528	NC_017456	CAT	2	6	1178668	1178673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801904
24529	NC_017456	CA	3	6	1178675	1178680	50 %	0 %	0 %	50 %	385801904
24530	NC_017456	TTC	2	6	1178814	1178819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801904
24531	NC_017456	TTC	2	6	1178854	1178859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801904
24532	NC_017456	TCA	2	6	1178885	1178890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801904
24533	NC_017456	TTC	2	6	1178922	1178927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801904
24534	NC_017456	CAC	2	6	1178940	1178945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801904
24535	NC_017456	ATT	3	9	1179025	1179033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801904
24536	NC_017456	T	6	6	1179038	1179043	0 %	100 %	0 %	0 %	385801904
24537	NC_017456	CAATAA	2	12	1179045	1179056	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385801904
24538	NC_017456	ATCA	2	8	1179061	1179068	50 %	25 %	0 %	25 %	385801904
24539	NC_017456	CA	3	6	1179077	1179082	50 %	0 %	0 %	50 %	385801904
24540	NC_017456	ATG	2	6	1179088	1179093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801904
24541	NC_017456	T	7	7	1179120	1179126	0 %	100 %	0 %	0 %	385801904
24542	NC_017456	CAT	2	6	1179144	1179149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801904
24543	NC_017456	AGC	2	6	1179200	1179205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801904
24544	NC_017456	TCG	2	6	1179401	1179406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801904
24545	NC_017456	ACC	2	6	1179487	1179492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801904
24546	NC_017456	CTT	2	6	1179507	1179512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801904
24547	NC_017456	ACAA	2	8	1179730	1179737	75 %	0 %	0 %	25 %	385801904
24548	NC_017456	A	6	6	1179809	1179814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24549	NC_017456	CAT	2	6	1179844	1179849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24551	NC_017456	ATA	2	6	1180037	1180042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801905
24552	NC_017456	CAA	2	6	1180059	1180064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801905
24553	NC_017456	CCG	2	6	1180088	1180093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801905
24554	NC_017456	TAAA	2	8	1180106	1180113	75 %	25 %	0 %	0 %	385801905
24555	NC_017456	AATG	2	8	1180183	1180190	50 %	25 %	25 %	0 %	385801905
24556	NC_017456	AAT	2	6	1180213	1180218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801905
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24559	NC_017456	GCA	2	6	1180301	1180306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801905
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24567	NC_017456	AAT	2	6	1180698	1180703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24569	NC_017456	TA	3	6	1180799	1180804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24570	NC_017456	A	6	6	1180870	1180875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24571	NC_017456	GC	3	6	1180923	1180928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24572	NC_017456	T	6	6	1181126	1181131	0 %	100 %	0 %	0 %	385801906
24573	NC_017456	ATT	2	6	1181210	1181215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801906
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24587	NC_017456	ACA	2	6	1181631	1181636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801906
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24591	NC_017456	ACC	2	6	1181787	1181792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801906
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24598	NC_017456	TGCAA	2	10	1182107	1182116	40 %	20 %	20 %	20 %	385801906
24599	NC_017456	AAAT	2	8	1182136	1182143	75 %	25 %	0 %	0 %	385801906
24600	NC_017456	A	6	6	1182188	1182193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24601	NC_017456	TA	3	6	1182241	1182246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24602	NC_017456	ATT	2	6	1182265	1182270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801907
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24605	NC_017456	CAA	2	6	1182378	1182383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801907
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24607	NC_017456	AAAT	2	8	1182521	1182528	75 %	25 %	0 %	0 %	385801907
24608	NC_017456	TCCATA	2	12	1182563	1182574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801907
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24612	NC_017456	TG	3	6	1182725	1182730	0 %	50 %	50 %	0 %	385801907
24613	NC_017456	GTT	3	9	1182781	1182789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801907
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24723	NC_017456	AAAT	2	8	1188302	1188309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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