MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_017456	TC	3	6	1153064	1153069	0 %	50 %	0 %	50 %	385801887
24002	NC_017456	GCGT	2	8	1153145	1153152	0 %	25 %	50 %	25 %	385801887
24003	NC_017456	CAC	2	6	1153190	1153195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801887
24004	NC_017456	GAT	2	6	1153211	1153216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801887
24005	NC_017456	TAA	2	6	1153244	1153249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801887
24006	NC_017456	AGC	2	6	1153278	1153283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801887
24007	NC_017456	AAT	2	6	1153301	1153306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801887
24008	NC_017456	GCT	3	9	1153340	1153348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801887
24009	NC_017456	CCTGA	2	10	1153425	1153434	20 %	20 %	20 %	40 %	385801887
24010	NC_017456	TTA	2	6	1153450	1153455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24011	NC_017456	GCA	2	6	1153515	1153520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801888
24012	NC_017456	TCA	2	6	1153579	1153584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801888
24013	NC_017456	AGAA	2	8	1153674	1153681	75 %	0 %	25 %	0 %	385801888
24014	NC_017456	ATC	3	9	1153740	1153748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801888
24015	NC_017456	TTC	2	6	1153776	1153781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801888
24016	NC_017456	TCT	2	6	1153996	1154001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801888
24017	NC_017456	TTC	2	6	1154113	1154118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801888
24018	NC_017456	ATA	2	6	1154128	1154133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801888
24019	NC_017456	ATA	2	6	1154194	1154199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801888
24020	NC_017456	CAA	2	6	1154261	1154266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801888
24021	NC_017456	CAG	2	6	1154306	1154311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801888
24022	NC_017456	CTT	2	6	1154333	1154338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801888
24023	NC_017456	GC	3	6	1154398	1154403	0 %	0 %	50 %	50 %	385801888
24024	NC_017456	GCAA	2	8	1154470	1154477	50 %	0 %	25 %	25 %	385801888
24025	NC_017456	TGC	2	6	1154491	1154496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801888
24026	NC_017456	CG	3	6	1154588	1154593	0 %	0 %	50 %	50 %	385801888
24027	NC_017456	TCC	2	6	1154664	1154669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801888
24028	NC_017456	TCT	2	6	1154728	1154733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801888
24029	NC_017456	CGCATG	2	12	1154838	1154849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385801888
24030	NC_017456	ATC	3	9	1154868	1154876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801888
24031	NC_017456	GAT	2	6	1154969	1154974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801888
24032	NC_017456	GTATTT	2	12	1154977	1154988	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385801888
24033	NC_017456	TTC	2	6	1155019	1155024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24034	NC_017456	GTT	2	6	1155045	1155050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801889
24035	NC_017456	GC	3	6	1155124	1155129	0 %	0 %	50 %	50 %	385801889
24036	NC_017456	GAA	2	6	1155145	1155150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801889
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24038	NC_017456	CGTTT	2	10	1155261	1155270	0 %	60 %	20 %	20 %	385801889
24039	NC_017456	AGC	2	6	1155380	1155385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801889
24040	NC_017456	TGA	2	6	1155400	1155405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801889
24041	NC_017456	GC	3	6	1155422	1155427	0 %	0 %	50 %	50 %	385801889
24042	NC_017456	AAT	2	6	1155477	1155482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801889
24043	NC_017456	CT	3	6	1155512	1155517	0 %	50 %	0 %	50 %	385801889
24044	NC_017456	TTGC	2	8	1155533	1155540	0 %	50 %	25 %	25 %	385801889
24045	NC_017456	TTC	2	6	1155651	1155656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801889
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24047	NC_017456	TAA	2	6	1155956	1155961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801889
24048	NC_017456	TTC	2	6	1156050	1156055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801889
24049	NC_017456	CAC	2	6	1156085	1156090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801889
24050	NC_017456	TGTT	2	8	1156173	1156180	0 %	75 %	25 %	0 %	385801889
24051	NC_017456	AATAC	2	10	1156231	1156240	60 %	20 %	0 %	20 %	385801889
24052	NC_017456	AT	3	6	1156274	1156279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24053	NC_017456	AATA	2	8	1156282	1156289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24054	NC_017456	AT	3	6	1156294	1156299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24055	NC_017456	TAT	2	6	1156304	1156309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24056	NC_017456	ATA	2	6	1156371	1156376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24057	NC_017456	A	7	7	1156380	1156386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24058	NC_017456	AAT	2	6	1156399	1156404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24059	NC_017456	ATTG	2	8	1156414	1156421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24060	NC_017456	GCA	2	6	1156462	1156467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24061	NC_017456	TAT	2	6	1156470	1156475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24062	NC_017456	CATC	2	8	1156484	1156491	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24063	NC_017456	TA	3	6	1156533	1156538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24064	NC_017456	TCT	2	6	1156581	1156586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801890
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24072	NC_017456	ATTT	2	8	1156874	1156881	25 %	75 %	0 %	0 %	385801890
24073	NC_017456	TAA	2	6	1156963	1156968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801890
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24079	NC_017456	AT	3	6	1157234	1157239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24080	NC_017456	TATTT	2	10	1157264	1157273	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24084	NC_017456	A	6	6	1157330	1157335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24085	NC_017456	TGCA	2	8	1157377	1157384	25 %	25 %	25 %	25 %	385801891
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24101	NC_017456	CCAA	2	8	1158449	1158456	50 %	0 %	0 %	50 %	385801891
24102	NC_017456	CG	3	6	1158458	1158463	0 %	0 %	50 %	50 %	385801891
24103	NC_017456	TTC	2	6	1158466	1158471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801891
24104	NC_017456	GAAC	2	8	1158526	1158533	50 %	0 %	25 %	25 %	385801891
24105	NC_017456	CCG	2	6	1158539	1158544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801891
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24107	NC_017456	TTC	2	6	1158866	1158871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801891
24108	NC_017456	CT	3	6	1158985	1158990	0 %	50 %	0 %	50 %	385801891
24109	NC_017456	GTT	2	6	1159007	1159012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801891
24110	NC_017456	GCG	2	6	1159033	1159038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801891
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24118	NC_017456	TAT	2	6	1159329	1159334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801891
24119	NC_017456	CG	3	6	1159386	1159391	0 %	0 %	50 %	50 %	385801891
24120	NC_017456	GAA	2	6	1159464	1159469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801891
24121	NC_017456	CGT	2	6	1159479	1159484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801891
24122	NC_017456	CAT	2	6	1159500	1159505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801891
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24147	NC_017456	CTT	2	6	1160870	1160875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801892
24148	NC_017456	TCT	2	6	1160881	1160886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801892
24149	NC_017456	TAC	2	6	1161012	1161017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801892
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24152	NC_017456	TTTA	2	8	1161237	1161244	25 %	75 %	0 %	0 %	385801893
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24159	NC_017456	ATC	2	6	1161435	1161440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801893
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24204	NC_017456	TAT	2	6	1163299	1163304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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24226	NC_017456	TAA	2	6	1164307	1164312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24227	NC_017456	AGA	2	6	1164343	1164348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24228	NC_017456	ACAT	2	8	1164376	1164383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24229	NC_017456	AGT	2	6	1164397	1164402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24230	NC_017456	AGT	2	6	1164429	1164434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24231	NC_017456	GAC	2	6	1164468	1164473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24232	NC_017456	TTG	2	6	1164482	1164487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24233	NC_017456	TTTTA	2	10	1164493	1164502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24234	NC_017456	ATT	2	6	1164578	1164583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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