MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017456	TA	3	6	70305	70310	50 %	50 %	0 %	0 %	385801044
1502	NC_017456	AGT	2	6	70317	70322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801044
1503	NC_017456	CT	3	6	70323	70328	0 %	50 %	0 %	50 %	385801044
1504	NC_017456	AGT	2	6	70336	70341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801044
1505	NC_017456	GTG	2	6	70383	70388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801044
1506	NC_017456	T	6	6	70408	70413	0 %	100 %	0 %	0 %	385801044
1507	NC_017456	CCG	2	6	70426	70431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801044
1508	NC_017456	CCGCGA	2	12	70453	70464	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385801044
1509	NC_017456	CAT	2	6	70470	70475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801044
1510	NC_017456	GGCT	2	8	70546	70553	0 %	25 %	50 %	25 %	385801044
1511	NC_017456	GCTC	2	8	70586	70593	0 %	25 %	25 %	50 %	385801044
1512	NC_017456	GAA	2	6	70656	70661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801044
1513	NC_017456	CAA	2	6	70688	70693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801044
1514	NC_017456	TTG	2	6	70709	70714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801044
1515	NC_017456	TCG	2	6	70717	70722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801044
1516	NC_017456	CCG	2	6	70804	70809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801044
1517	NC_017456	GAA	2	6	70831	70836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801044
1518	NC_017456	TAA	2	6	70907	70912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801044
1519	NC_017456	GCGTG	2	10	70980	70989	0 %	20 %	60 %	20 %	385801044
1520	NC_017456	TA	3	6	71028	71033	50 %	50 %	0 %	0 %	385801044
1521	NC_017456	T	6	6	71039	71044	0 %	100 %	0 %	0 %	385801044
1522	NC_017456	AAT	2	6	71050	71055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801044
1523	NC_017456	T	6	6	71164	71169	0 %	100 %	0 %	0 %	385801044
1524	NC_017456	TTG	2	6	71198	71203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801044
1525	NC_017456	GCC	2	6	71260	71265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801044
1526	NC_017456	GCC	2	6	71274	71279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801044
1527	NC_017456	TTC	2	6	71300	71305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801044
1528	NC_017456	CGT	2	6	71549	71554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801044
1529	NC_017456	GTT	2	6	71668	71673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801044
1530	NC_017456	TGT	2	6	71837	71842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801044
1531	NC_017456	AAT	2	6	71895	71900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801044
1532	NC_017456	CGT	2	6	71918	71923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801044
1533	NC_017456	GCT	2	6	71935	71940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801044
1534	NC_017456	AC	3	6	71956	71961	50 %	0 %	0 %	50 %	385801044
1535	NC_017456	T	6	6	72017	72022	0 %	100 %	0 %	0 %	385801044
1536	NC_017456	CAG	2	6	72050	72055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801044
1537	NC_017456	CAG	2	6	72059	72064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801044
1538	NC_017456	TCT	2	6	72220	72225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801044
1539	NC_017456	AGT	2	6	72245	72250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801044
1540	NC_017456	CTGC	2	8	72275	72282	0 %	25 %	25 %	50 %	385801044
1541	NC_017456	CA	3	6	72287	72292	50 %	0 %	0 %	50 %	385801044
1542	NC_017456	TTTC	2	8	72458	72465	0 %	75 %	0 %	25 %	385801044
1543	NC_017456	TCT	2	6	72487	72492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801044
1544	NC_017456	TCT	2	6	72523	72528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801044
1545	NC_017456	TAT	2	6	72543	72548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801044
1546	NC_017456	TG	3	6	72555	72560	0 %	50 %	50 %	0 %	385801044
1547	NC_017456	TTG	2	6	72564	72569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801044
1548	NC_017456	TTGC	2	8	72575	72582	0 %	50 %	25 %	25 %	385801044
1549	NC_017456	TAA	2	6	72606	72611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801044
1550	NC_017456	TAT	2	6	72645	72650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801044
1551	NC_017456	ATTT	2	8	72663	72670	25 %	75 %	0 %	0 %	385801044
1552	NC_017456	GATT	2	8	72689	72696	25 %	50 %	25 %	0 %	385801044
1553	NC_017456	T	6	6	72717	72722	0 %	100 %	0 %	0 %	385801044
1554	NC_017456	TCG	2	6	72812	72817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801044
1555	NC_017456	ACG	2	6	72828	72833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801044
1556	NC_017456	TCC	2	6	72845	72850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_017456	TGT	2	6	72949	72954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_017456	GAT	2	6	72957	72962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017456	ACAAA	2	10	72966	72975	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1560	NC_017456	A	6	6	72973	72978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017456	CGG	2	6	73015	73020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_017456	CACT	2	8	73043	73050	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_017456	GT	3	6	73144	73149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017456	CGA	2	6	73154	73159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_017456	GC	3	6	73262	73267	0 %	0 %	50 %	50 %	385801045
1566	NC_017456	CG	3	6	73274	73279	0 %	0 %	50 %	50 %	385801045
1567	NC_017456	CG	3	6	73346	73351	0 %	0 %	50 %	50 %	385801046
1568	NC_017456	GTA	2	6	73362	73367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801046
1569	NC_017456	CCG	2	6	73405	73410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801046
1570	NC_017456	CG	3	6	73419	73424	0 %	0 %	50 %	50 %	385801046
1571	NC_017456	GTC	2	6	73428	73433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801046
1572	NC_017456	GC	3	6	73498	73503	0 %	0 %	50 %	50 %	385801046
1573	NC_017456	ACAT	2	8	73516	73523	50 %	25 %	0 %	25 %	385801046
1574	NC_017456	AAT	2	6	73529	73534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801046
1575	NC_017456	GC	3	6	73594	73599	0 %	0 %	50 %	50 %	385801046
1576	NC_017456	CCG	2	6	73681	73686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801046
1577	NC_017456	GCAA	2	8	73695	73702	50 %	0 %	25 %	25 %	385801046
1578	NC_017456	GTC	2	6	73707	73712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801046
1579	NC_017456	GCA	2	6	73717	73722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801046
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1581	NC_017456	CCA	2	6	73810	73815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801046
1582	NC_017456	TCTGC	2	10	73847	73856	0 %	40 %	20 %	40 %	385801046
1583	NC_017456	ACT	2	6	73894	73899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801046
1584	NC_017456	CTT	2	6	74000	74005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801046
1585	NC_017456	CGA	2	6	74011	74016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801046
1586	NC_017456	TCA	2	6	74021	74026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801046
1587	NC_017456	ATA	2	6	74053	74058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801046
1588	NC_017456	TCG	2	6	74194	74199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801046
1589	NC_017456	GCAT	2	8	74381	74388	25 %	25 %	25 %	25 %	385801046
1590	NC_017456	GCC	2	6	74391	74396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801046
1591	NC_017456	GCA	2	6	74417	74422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801046
1592	NC_017456	CCG	2	6	74540	74545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801046
1593	NC_017456	TGT	2	6	74565	74570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801046
1594	NC_017456	GTC	2	6	74706	74711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_017456	CGTT	2	8	74718	74725	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1596	NC_017456	GCTA	2	8	74761	74768	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_017456	TGT	2	6	74979	74984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017456	AGG	2	6	74998	75003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017456	GGA	2	6	75091	75096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801047
1600	NC_017456	TGA	2	6	75187	75192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801047
1601	NC_017456	AAT	2	6	75194	75199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801047
1602	NC_017456	ATG	2	6	75237	75242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801047
1603	NC_017456	GAA	2	6	75245	75250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801047
1604	NC_017456	TGA	2	6	75382	75387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801047
1605	NC_017456	TGC	2	6	75388	75393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801047
1606	NC_017456	GAT	2	6	75419	75424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801047
1607	NC_017456	ATT	2	6	75554	75559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801047
1608	NC_017456	GTT	2	6	75575	75580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801047
1609	NC_017456	CA	3	6	75649	75654	50 %	0 %	0 %	50 %	385801047
1610	NC_017456	ATC	2	6	75655	75660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801047
1611	NC_017456	CAG	2	6	75672	75677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801047
1612	NC_017456	GGT	2	6	75686	75691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801047
1613	NC_017456	GGC	2	6	75731	75736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801047
1614	NC_017456	GC	3	6	75752	75757	0 %	0 %	50 %	50 %	385801047
1615	NC_017456	AAT	2	6	75790	75795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801047
1616	NC_017456	CAAG	2	8	75799	75806	50 %	0 %	25 %	25 %	385801047
1617	NC_017456	TGT	2	6	75811	75816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801047
1618	NC_017456	ACAA	2	8	75818	75825	75 %	0 %	0 %	25 %	385801047
1619	NC_017456	TTG	2	6	75894	75899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801047
1620	NC_017456	ACG	2	6	76035	76040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801047
1621	NC_017456	ACA	2	6	76049	76054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801047
1622	NC_017456	GAT	2	6	76094	76099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801047
1623	NC_017456	TGC	2	6	76141	76146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801047
1624	NC_017456	AATC	2	8	76147	76154	50 %	25 %	0 %	25 %	385801047
1625	NC_017456	TGG	2	6	76165	76170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801047
1626	NC_017456	TGC	2	6	76183	76188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801047
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