MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017456	GCA	2	6	45508	45513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801022
1002	NC_017456	CAG	2	6	45526	45531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801022
1003	NC_017456	AAT	2	6	45623	45628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801022
1004	NC_017456	GT	3	6	45634	45639	0 %	50 %	50 %	0 %	385801022
1005	NC_017456	TGAAGA	2	12	45698	45709	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385801022
1006	NC_017456	TGT	2	6	45840	45845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801022
1007	NC_017456	AAG	3	9	46002	46010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801022
1008	NC_017456	TCT	2	6	46047	46052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801022
1009	NC_017456	TTG	2	6	46078	46083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801022
1010	NC_017456	TGG	2	6	46135	46140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801022
1011	NC_017456	TAAA	2	8	46219	46226	75 %	25 %	0 %	0 %	385801022
1012	NC_017456	ATGAG	2	10	46249	46258	40 %	20 %	40 %	0 %	385801022
1013	NC_017456	TGA	2	6	46291	46296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801022
1014	NC_017456	GAT	2	6	46314	46319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801022
1015	NC_017456	ATT	2	6	46328	46333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801022
1016	NC_017456	TCA	2	6	46346	46351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801022
1017	NC_017456	CTT	2	6	46376	46381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801022
1018	NC_017456	GCT	2	6	46455	46460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801022
1019	NC_017456	TGT	2	6	46572	46577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017456	GATT	2	8	46581	46588	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017456	CAG	2	6	46617	46622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017456	CAT	2	6	46746	46751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017456	AGG	2	6	46789	46794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017456	CTG	2	6	46844	46849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_017456	ACA	2	6	46914	46919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017456	TCG	2	6	46968	46973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_017456	GGA	2	6	46974	46979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017456	TAT	2	6	47088	47093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017456	CGAA	2	8	47184	47191	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_017456	AC	3	6	47290	47295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_017456	TA	3	6	47310	47315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017456	GA	3	6	47360	47365	50 %	0 %	50 %	0 %	385801023
1033	NC_017456	A	6	6	47430	47435	100 %	0 %	0 %	0 %	385801023
1034	NC_017456	TGG	2	6	47457	47462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801023
1035	NC_017456	GA	3	6	47546	47551	50 %	0 %	50 %	0 %	385801023
1036	NC_017456	CTGT	2	8	47555	47562	0 %	50 %	25 %	25 %	385801023
1037	NC_017456	AAG	2	6	47590	47595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801023
1038	NC_017456	TTC	2	6	47603	47608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801023
1039	NC_017456	TCAT	2	8	47663	47670	25 %	50 %	0 %	25 %	385801023
1040	NC_017456	TAG	2	6	47718	47723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801023
1041	NC_017456	ATC	2	6	47735	47740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801023
1042	NC_017456	ATT	2	6	47762	47767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801023
1043	NC_017456	AAT	2	6	47805	47810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801023
1044	NC_017456	TGAT	2	8	47831	47838	25 %	50 %	25 %	0 %	385801023
1045	NC_017456	TTC	2	6	47921	47926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801023
1046	NC_017456	AATACT	2	12	48095	48106	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385801023
1047	NC_017456	TCTGTT	2	12	48124	48135	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385801024
1048	NC_017456	GTT	2	6	48148	48153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801024
1049	NC_017456	TTC	2	6	48189	48194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801024
1050	NC_017456	T	6	6	48197	48202	0 %	100 %	0 %	0 %	385801024
1051	NC_017456	TTG	2	6	48246	48251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801024
1052	NC_017456	CAG	2	6	48268	48273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801024
1053	NC_017456	TG	3	6	48289	48294	0 %	50 %	50 %	0 %	385801024
1054	NC_017456	TAT	2	6	48456	48461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801024
1055	NC_017456	T	8	8	48537	48544	0 %	100 %	0 %	0 %	385801024
1056	NC_017456	ATT	2	6	48548	48553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801024
1057	NC_017456	TTTA	2	8	48570	48577	25 %	75 %	0 %	0 %	385801024
1058	NC_017456	TTG	2	6	48578	48583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801024
1059	NC_017456	TA	3	6	48589	48594	50 %	50 %	0 %	0 %	385801024
1060	NC_017456	AG	3	6	48631	48636	50 %	0 %	50 %	0 %	385801024
1061	NC_017456	CTT	2	6	48661	48666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801024
1062	NC_017456	TATG	2	8	48691	48698	25 %	50 %	25 %	0 %	385801024
1063	NC_017456	CTA	2	6	48748	48753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801024
1064	NC_017456	T	6	6	48767	48772	0 %	100 %	0 %	0 %	385801024
1065	NC_017456	AT	3	6	48779	48784	50 %	50 %	0 %	0 %	385801024
1066	NC_017456	CAG	2	6	48804	48809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801024
1067	NC_017456	GTT	2	6	48812	48817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801024
1068	NC_017456	CTG	2	6	48828	48833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801024
1069	NC_017456	CTT	2	6	48892	48897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801024
1070	NC_017456	GTG	2	6	48960	48965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801024
1071	NC_017456	T	6	6	48983	48988	0 %	100 %	0 %	0 %	385801024
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1073	NC_017456	TAT	2	6	49051	49056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801024
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1075	NC_017456	TTGG	2	8	49331	49338	0 %	50 %	50 %	0 %	385801024
1076	NC_017456	TTTG	2	8	49385	49392	0 %	75 %	25 %	0 %	385801024
1077	NC_017456	TAT	2	6	49419	49424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801024
1078	NC_017456	AAT	2	6	49459	49464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801024
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1081	NC_017456	GTC	2	6	49609	49614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801025
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1083	NC_017456	T	6	6	49638	49643	0 %	100 %	0 %	0 %	385801025
1084	NC_017456	TAT	2	6	49670	49675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801025
1085	NC_017456	T	6	6	49735	49740	0 %	100 %	0 %	0 %	385801025
1086	NC_017456	T	6	6	49749	49754	0 %	100 %	0 %	0 %	385801025
1087	NC_017456	A	6	6	49774	49779	100 %	0 %	0 %	0 %	385801025
1088	NC_017456	GAAA	2	8	49780	49787	75 %	0 %	25 %	0 %	385801025
1089	NC_017456	TAT	2	6	49888	49893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801026
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1091	NC_017456	TAT	2	6	49919	49924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801026
1092	NC_017456	GATA	2	8	49925	49932	50 %	25 %	25 %	0 %	385801026
1093	NC_017456	AGG	2	6	50046	50051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_017456	TGT	2	6	50194	50199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801027
1099	NC_017456	TGC	2	6	50227	50232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801027
1100	NC_017456	ATT	2	6	50277	50282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801027
1101	NC_017456	ATTG	2	8	50293	50300	25 %	50 %	25 %	0 %	385801027
1102	NC_017456	TTG	2	6	50313	50318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801027
1103	NC_017456	TGC	2	6	50326	50331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801027
1104	NC_017456	TTA	2	6	50388	50393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017456	ATA	2	6	50397	50402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017456	TTAA	2	8	50414	50421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017456	TGTT	2	8	50436	50443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_017456	TGT	2	6	50447	50452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_017456	TGT	2	6	50463	50468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017456	GTTTG	2	10	50469	50478	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017456	TTG	2	6	50487	50492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017456	GT	4	8	50506	50513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017456	A	6	6	50565	50570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017456	A	6	6	50588	50593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017456	T	6	6	50598	50603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017456	TA	3	6	50607	50612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017456	GC	3	6	50624	50629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_017456	ATGCG	2	10	50637	50646	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1119	NC_017456	TG	3	6	50672	50677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017456	GA	3	6	50727	50732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017456	TTAA	2	8	50761	50768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017456	ACAAAT	2	12	50792	50803	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385801028
1123	NC_017456	TCA	2	6	50872	50877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801028
1124	NC_017456	ATA	2	6	50886	50891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801028
1125	NC_017456	TGG	2	6	50922	50927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801028
1126	NC_017456	TCA	2	6	50939	50944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801028
1127	NC_017456	CAG	2	6	50958	50963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801028
1128	NC_017456	TTC	2	6	50972	50977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801028
1129	NC_017456	T	6	6	51066	51071	0 %	100 %	0 %	0 %	385801028
1130	NC_017456	AAT	2	6	51073	51078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801028
1131	NC_017456	TGG	2	6	51111	51116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801028
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1253	NC_017456	T	6	6	56371	56376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1262	NC_017456	TAC	2	6	56951	56956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801033
1263	NC_017456	AT	3	6	57240	57245	50 %	50 %	0 %	0 %	385801033
1264	NC_017456	AC	3	6	57259	57264	50 %	0 %	0 %	50 %	385801033
1265	NC_017456	GAA	2	6	57311	57316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801033
1266	NC_017456	CGAT	2	8	57364	57371	25 %	25 %	25 %	25 %	385801033
1267	NC_017456	AT	3	6	57370	57375	50 %	50 %	0 %	0 %	385801033
1268	NC_017456	AGA	3	9	57412	57420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801033
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1270	NC_017456	AGA	2	6	57481	57486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801033
1271	NC_017456	GCT	2	6	57500	57505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801033
1272	NC_017456	GCAAG	2	10	57524	57533	40 %	0 %	40 %	20 %	385801033
1273	NC_017456	ACT	2	6	57671	57676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801033
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1275	NC_017456	ACT	2	6	57851	57856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1276	NC_017456	ATGA	2	8	57858	57865	50 %	25 %	25 %	0 %	385801034
1277	NC_017456	AGA	2	6	58079	58084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801034
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1290	NC_017456	AGG	2	6	58871	58876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1291	NC_017456	A	6	6	58900	58905	100 %	0 %	0 %	0 %	385801035
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1301	NC_017456	GGT	2	6	59489	59494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801035
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1303	NC_017456	TG	3	6	59630	59635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1306	NC_017456	GAA	2	6	59811	59816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1375	NC_017456	ATA	2	6	63029	63034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801038
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1379	NC_017456	TTCT	2	8	63336	63343	0 %	75 %	0 %	25 %	385801038
1380	NC_017456	TGC	2	6	63367	63372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801038
1381	NC_017456	GATGCG	2	12	63404	63415	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385801038
1382	NC_017456	AGC	2	6	63465	63470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801038
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1385	NC_017456	TTGG	2	8	63662	63669	0 %	50 %	50 %	0 %	385801038
1386	NC_017456	AGC	2	6	63885	63890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801038
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