MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017456	GC	3	6	21231	21236	0 %	0 %	50 %	50 %	385801002
502	NC_017456	GA	3	6	21267	21272	50 %	0 %	50 %	0 %	385801002
503	NC_017456	TTG	2	6	21280	21285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801002
504	NC_017456	TTA	2	6	21290	21295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801002
505	NC_017456	AACTT	2	10	21299	21308	40 %	40 %	0 %	20 %	385801002
506	NC_017456	TAA	2	6	21429	21434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801002
507	NC_017456	AAT	2	6	21546	21551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801002
508	NC_017456	GAA	2	6	21561	21566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801002
509	NC_017456	AAT	2	6	21634	21639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801002
510	NC_017456	CGA	2	6	21695	21700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801002
511	NC_017456	AGA	2	6	21779	21784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801002
512	NC_017456	AGG	2	6	21811	21816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801002
513	NC_017456	CAG	3	9	21855	21863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801002
514	NC_017456	CCA	2	6	21925	21930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801002
515	NC_017456	GAAA	2	8	21967	21974	75 %	0 %	25 %	0 %	385801002
516	NC_017456	AAG	2	6	21976	21981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801002
517	NC_017456	ACA	2	6	21989	21994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801002
518	NC_017456	ATA	2	6	22010	22015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801002
519	NC_017456	TAC	2	6	22116	22121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801003
520	NC_017456	TAA	2	6	22122	22127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801003
521	NC_017456	AGA	2	6	22177	22182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801003
522	NC_017456	T	7	7	22205	22211	0 %	100 %	0 %	0 %	385801003
523	NC_017456	CCCAA	2	10	22223	22232	40 %	0 %	0 %	60 %	385801003
524	NC_017456	TGA	2	6	22340	22345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801003
525	NC_017456	ACAA	2	8	22372	22379	75 %	0 %	0 %	25 %	385801003
526	NC_017456	CAG	2	6	22380	22385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801003
527	NC_017456	ACC	2	6	22451	22456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801003
528	NC_017456	TTG	2	6	22468	22473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801003
529	NC_017456	GTG	2	6	22536	22541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801003
530	NC_017456	TCG	2	6	22607	22612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801003
531	NC_017456	GAA	2	6	22613	22618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801003
532	NC_017456	CAT	2	6	22623	22628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801003
533	NC_017456	TAT	2	6	22632	22637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801003
534	NC_017456	AGA	2	6	22655	22660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801003
535	NC_017456	TCT	2	6	22688	22693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801003
536	NC_017456	TTTC	2	8	22718	22725	0 %	75 %	0 %	25 %	385801003
537	NC_017456	TAA	2	6	22782	22787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801003
538	NC_017456	T	6	6	22843	22848	0 %	100 %	0 %	0 %	385801003
539	NC_017456	TCT	2	6	22888	22893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017456	TAT	3	9	22913	22921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017456	GATT	2	8	22933	22940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017456	GAA	2	6	22964	22969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801004
543	NC_017456	TGC	2	6	22984	22989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801004
544	NC_017456	TCT	2	6	23021	23026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801004
545	NC_017456	AGA	2	6	23029	23034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801004
546	NC_017456	ATG	2	6	23120	23125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801004
547	NC_017456	AAG	2	6	23133	23138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801004
548	NC_017456	TGGT	2	8	23188	23195	0 %	50 %	50 %	0 %	385801004
549	NC_017456	TTG	2	6	23223	23228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801004
550	NC_017456	GTT	2	6	23243	23248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801004
551	NC_017456	TAC	2	6	23249	23254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801004
552	NC_017456	GCA	2	6	23306	23311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801004
553	NC_017456	ATTT	2	8	23418	23425	25 %	75 %	0 %	0 %	385801005
554	NC_017456	TAT	2	6	23432	23437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801005
555	NC_017456	ACTTG	2	10	23451	23460	20 %	40 %	20 %	20 %	385801005
556	NC_017456	TAA	2	6	23464	23469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801005
557	NC_017456	GTA	2	6	23493	23498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801005
558	NC_017456	ACC	2	6	23516	23521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801005
559	NC_017456	T	6	6	23537	23542	0 %	100 %	0 %	0 %	385801005
560	NC_017456	AAT	2	6	23606	23611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801005
561	NC_017456	T	6	6	23624	23629	0 %	100 %	0 %	0 %	385801005
562	NC_017456	TGC	2	6	23635	23640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801005
563	NC_017456	TTGC	2	8	23712	23719	0 %	50 %	25 %	25 %	385801005
564	NC_017456	ATA	2	6	23772	23777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801005
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568	NC_017456	AAT	2	6	23939	23944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801005
569	NC_017456	CATT	2	8	23985	23992	25 %	50 %	0 %	25 %	385801005
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571	NC_017456	AAT	2	6	24197	24202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801005
572	NC_017456	T	6	6	24261	24266	0 %	100 %	0 %	0 %	385801005
573	NC_017456	TTC	2	6	24308	24313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801005
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576	NC_017456	TTA	2	6	24420	24425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801005
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578	NC_017456	AT	3	6	24509	24514	50 %	50 %	0 %	0 %	385801005
579	NC_017456	GTTTT	2	10	24544	24553	0 %	80 %	20 %	0 %	385801005
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582	NC_017456	TAA	2	6	24661	24666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801005
583	NC_017456	GAT	2	6	24706	24711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801005
584	NC_017456	TTA	2	6	24739	24744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017456	A	6	6	24769	24774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017456	ACA	2	6	24837	24842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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588	NC_017456	AT	3	6	24995	25000	50 %	50 %	0 %	0 %	385801006
589	NC_017456	T	6	6	25025	25030	0 %	100 %	0 %	0 %	385801006
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592	NC_017456	AAT	3	9	25118	25126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801006
593	NC_017456	AAG	2	6	25199	25204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801006
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596	NC_017456	GA	3	6	25370	25375	50 %	0 %	50 %	0 %	385801006
597	NC_017456	AACA	2	8	25424	25431	75 %	0 %	0 %	25 %	385801006
598	NC_017456	T	6	6	25457	25462	0 %	100 %	0 %	0 %	385801006
599	NC_017456	GAA	2	6	25528	25533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801006
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601	NC_017456	CAAA	2	8	25548	25555	75 %	0 %	0 %	25 %	385801006
602	NC_017456	CA	3	6	25556	25561	50 %	0 %	0 %	50 %	385801006
603	NC_017456	TAA	2	6	25612	25617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801006
604	NC_017456	T	6	6	25620	25625	0 %	100 %	0 %	0 %	385801006
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610	NC_017456	TGTA	2	8	25889	25896	25 %	50 %	25 %	0 %	385801007
611	NC_017456	AGC	2	6	25901	25906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801007
612	NC_017456	AGC	2	6	25931	25936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801007
613	NC_017456	A	6	6	25976	25981	100 %	0 %	0 %	0 %	385801007
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615	NC_017456	TAGA	2	8	26023	26030	50 %	25 %	25 %	0 %	385801007
616	NC_017456	TA	3	6	26060	26065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017456	T	7	7	26109	26115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017456	ATTT	2	8	26124	26131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017456	ATT	2	6	26135	26140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017456	TAAA	2	8	26145	26152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017456	A	6	6	26150	26155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017456	CAA	2	6	26165	26170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017456	T	6	6	26186	26191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017456	ATT	2	6	26223	26228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801008
625	NC_017456	AGA	2	6	26290	26295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801008
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629	NC_017456	TGT	2	6	26790	26795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801008
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631	NC_017456	GTT	2	6	26842	26847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801008
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754	NC_017456	T	6	6	32371	32376	0 %	100 %	0 %	0 %	385801012
755	NC_017456	GCA	2	6	32454	32459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801012
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