MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017456	TTC	2	6	287556	287561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801224
6002	NC_017456	GTG	2	6	287591	287596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801224
6003	NC_017456	CCA	2	6	287602	287607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801224
6004	NC_017456	CTT	2	6	287641	287646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801224
6005	NC_017456	TG	3	6	287715	287720	0 %	50 %	50 %	0 %	385801224
6006	NC_017456	TTC	2	6	287752	287757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801224
6007	NC_017456	CTT	2	6	287760	287765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801224
6008	NC_017456	CGG	2	6	287820	287825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801224
6009	NC_017456	TGG	2	6	287982	287987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801224
6010	NC_017456	TAC	2	6	287988	287993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801224
6011	NC_017456	TTA	2	6	287999	288004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801224
6012	NC_017456	TGT	2	6	288132	288137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_017456	GCT	2	6	288226	288231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801225
6014	NC_017456	TTGC	2	8	288232	288239	0 %	50 %	25 %	25 %	385801225
6015	NC_017456	GAA	2	6	288294	288299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801225
6016	NC_017456	AAG	2	6	288316	288321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801225
6017	NC_017456	GAT	2	6	288400	288405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801225
6018	NC_017456	GAG	2	6	288478	288483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801225
6019	NC_017456	GTT	2	6	288505	288510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801225
6020	NC_017456	GAA	2	6	288549	288554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801225
6021	NC_017456	GC	3	6	288555	288560	0 %	0 %	50 %	50 %	385801225
6022	NC_017456	GAT	2	6	288580	288585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801225
6023	NC_017456	CTC	2	6	288635	288640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801225
6024	NC_017456	TTG	2	6	288671	288676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801225
6025	NC_017456	CAA	2	6	288708	288713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801225
6026	NC_017456	ATTT	2	8	288740	288747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_017456	AGA	2	6	288827	288832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017456	AGT	2	6	288856	288861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_017456	GGAAC	2	10	288870	288879	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6030	NC_017456	TTC	2	6	289026	289031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801226
6031	NC_017456	CCG	2	6	289177	289182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801227
6032	NC_017456	AGC	2	6	289224	289229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801227
6033	NC_017456	CAGGCC	2	12	289308	289319	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_017456	CGT	2	6	289583	289588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801228
6035	NC_017456	TCG	2	6	289606	289611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801228
6036	NC_017456	CTCGTA	2	12	289692	289703	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385801228
6037	NC_017456	GAA	3	9	289729	289737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801228
6038	NC_017456	CCA	2	6	289740	289745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801228
6039	NC_017456	TAG	2	6	289748	289753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801228
6040	NC_017456	GGT	2	6	289756	289761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017456	AAGC	2	8	289846	289853	50 %	0 %	25 %	25 %	385801229
6042	NC_017456	ATT	2	6	289933	289938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801229
6043	NC_017456	GCT	2	6	290038	290043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801229
6044	NC_017456	CTG	2	6	290048	290053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801229
6045	NC_017456	GAA	2	6	290079	290084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801229
6046	NC_017456	CCA	2	6	290209	290214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801229
6047	NC_017456	CGC	2	6	290221	290226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801229
6048	NC_017456	ATCC	3	12	290245	290256	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_017456	GCG	2	6	290270	290275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_017456	CAC	2	6	290280	290285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_017456	CGT	2	6	290426	290431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801230
6052	NC_017456	TGC	2	6	290455	290460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801230
6053	NC_017456	CTG	2	6	290540	290545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801230
6054	NC_017456	AGT	2	6	290587	290592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801230
6055	NC_017456	CTC	2	6	290643	290648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801230
6056	NC_017456	CTG	2	6	290649	290654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801230
6057	NC_017456	CTG	2	6	290940	290945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801230
6058	NC_017456	CGCAG	2	10	291081	291090	20 %	0 %	40 %	40 %	385801230
6059	NC_017456	GTA	2	6	291137	291142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801230
6060	NC_017456	CGC	2	6	291243	291248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801230
6061	NC_017456	AAT	2	6	291263	291268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801230
6062	NC_017456	TTC	2	6	291284	291289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801230
6063	NC_017456	AGA	2	6	291295	291300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801230
6064	NC_017456	TCG	2	6	291323	291328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6065	NC_017456	TAA	2	6	291382	291387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801231
6066	NC_017456	CTA	2	6	291460	291465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801231
6067	NC_017456	ACT	2	6	291492	291497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801231
6068	NC_017456	CGC	2	6	291573	291578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801231
6069	NC_017456	GT	3	6	291580	291585	0 %	50 %	50 %	0 %	385801231
6070	NC_017456	GTT	2	6	291609	291614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801231
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6072	NC_017456	CTC	2	6	291688	291693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801231
6073	NC_017456	GTG	2	6	291697	291702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801231
6074	NC_017456	TAT	2	6	291719	291724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801231
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6078	NC_017456	TGC	2	6	291794	291799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801231
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6080	NC_017456	AGC	2	6	291809	291814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801231
6081	NC_017456	GTAA	2	8	291847	291854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_017456	AGT	2	6	291866	291871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_017456	CGT	2	6	291872	291877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_017456	AT	3	6	291935	291940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_017456	ATT	3	9	291961	291969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_017456	TTC	2	6	292166	292171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801232
6087	NC_017456	TGA	2	6	292199	292204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801232
6088	NC_017456	TCT	3	9	292217	292225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801232
6089	NC_017456	TGA	2	6	292301	292306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801232
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6091	NC_017456	TGC	2	6	292325	292330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801232
6092	NC_017456	TTTGA	2	10	292338	292347	20 %	60 %	20 %	0 %	385801232
6093	NC_017456	TGT	2	6	292373	292378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801232
6094	NC_017456	TTG	2	6	292405	292410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801232
6095	NC_017456	GGAA	2	8	292414	292421	50 %	0 %	50 %	0 %	385801232
6096	NC_017456	CTG	2	6	292465	292470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801232
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6101	NC_017456	GAA	2	6	292580	292585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801232
6102	NC_017456	AAT	2	6	292644	292649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801232
6103	NC_017456	TGT	2	6	292664	292669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801232
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6105	NC_017456	TGT	2	6	292793	292798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801232
6106	NC_017456	T	6	6	292810	292815	0 %	100 %	0 %	0 %	385801232
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6108	NC_017456	GATT	2	8	292867	292874	25 %	50 %	25 %	0 %	385801232
6109	NC_017456	GCT	2	6	293016	293021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801232
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6111	NC_017456	TGA	2	6	293114	293119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801232
6112	NC_017456	TGG	2	6	293231	293236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801232
6113	NC_017456	ATT	2	6	293260	293265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_017456	T	8	8	293310	293317	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_017456	TAA	2	6	293319	293324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_017456	T	6	6	293333	293338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_017456	T	7	7	293345	293351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_017456	ATG	2	6	293378	293383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801233
6119	NC_017456	TA	3	6	293453	293458	50 %	50 %	0 %	0 %	385801233
6120	NC_017456	ATG	2	6	293474	293479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801233
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6122	NC_017456	AGA	2	6	293568	293573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801233
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6232	NC_017456	TA	3	6	298719	298724	50 %	50 %	0 %	0 %	385801237
6233	NC_017456	TTG	2	6	298760	298765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801237
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6242	NC_017456	TTC	2	6	299003	299008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6243	NC_017456	TA	3	6	299023	299028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6493	NC_017456	GGT	2	6	310003	310008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801245
6494	NC_017456	AGC	2	6	310020	310025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801245
6495	NC_017456	AAT	2	6	310144	310149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801245
6496	NC_017456	GAT	2	6	310150	310155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801245
6497	NC_017456	GCT	2	6	310246	310251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801245
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