MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017456	GT	3	6	264269	264274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017456	TC	3	6	264421	264426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_017456	T	7	7	264511	264517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_017456	TTTA	2	8	264641	264648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017456	AAC	2	6	264733	264738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_017456	ATGT	2	8	264764	264771	25 %	50 %	25 %	0 %	385801200
5507	NC_017456	TTG	3	9	264851	264859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801200
5508	NC_017456	TA	3	6	264907	264912	50 %	50 %	0 %	0 %	385801200
5509	NC_017456	GAC	2	6	264967	264972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801200
5510	NC_017456	CTT	2	6	265022	265027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801200
5511	NC_017456	GTA	2	6	265036	265041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801200
5512	NC_017456	AAT	2	6	265042	265047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
5513	NC_017456	TGC	2	6	265062	265067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801200
5514	NC_017456	ATG	2	6	265069	265074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801200
5515	NC_017456	AAT	2	6	265177	265182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
5516	NC_017456	GCT	2	6	265228	265233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801200
5517	NC_017456	TGA	2	6	265239	265244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801200
5518	NC_017456	GCT	2	6	265258	265263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801200
5519	NC_017456	TAAAAG	2	12	265328	265339	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385801200
5520	NC_017456	TGA	2	6	265371	265376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801200
5521	NC_017456	TAT	2	6	265432	265437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801200
5522	NC_017456	ACA	2	6	265439	265444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801200
5523	NC_017456	ATT	2	6	265493	265498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801200
5524	NC_017456	TTTG	2	8	265507	265514	0 %	75 %	25 %	0 %	385801200
5525	NC_017456	GA	3	6	265573	265578	50 %	0 %	50 %	0 %	385801200
5526	NC_017456	ATA	2	6	265634	265639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
5527	NC_017456	TAA	2	6	265758	265763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
5528	NC_017456	AAG	2	6	265792	265797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801200
5529	NC_017456	GC	3	6	265804	265809	0 %	0 %	50 %	50 %	385801200
5530	NC_017456	TAC	2	6	265813	265818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801200
5531	NC_017456	GTA	2	6	265862	265867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801200
5532	NC_017456	GC	3	6	265893	265898	0 %	0 %	50 %	50 %	385801200
5533	NC_017456	TTTAC	2	10	265934	265943	20 %	60 %	0 %	20 %	385801200
5534	NC_017456	GAA	2	6	265954	265959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801200
5535	NC_017456	GTT	2	6	265969	265974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801200
5536	NC_017456	TTG	2	6	266240	266245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801200
5537	NC_017456	GC	3	6	266252	266257	0 %	0 %	50 %	50 %	385801200
5538	NC_017456	TGG	2	6	266332	266337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
5539	NC_017456	GTG	2	6	266531	266536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
5540	NC_017456	AGA	2	6	266568	266573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801200
5541	NC_017456	A	7	7	266586	266592	100 %	0 %	0 %	0 %	385801200
5542	NC_017456	ATGT	2	8	266641	266648	25 %	50 %	25 %	0 %	385801200
5543	NC_017456	TTC	2	6	266670	266675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801200
5544	NC_017456	AGA	2	6	266742	266747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801200
5545	NC_017456	ATA	2	6	266762	266767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
5546	NC_017456	GTG	2	6	266801	266806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
5547	NC_017456	TGG	2	6	266835	266840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
5548	NC_017456	ATG	2	6	266873	266878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801200
5549	NC_017456	TAA	2	6	266895	266900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
5550	NC_017456	TGA	2	6	266910	266915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801200
5551	NC_017456	TGG	2	6	266943	266948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
5552	NC_017456	GTG	2	6	266960	266965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
5553	NC_017456	GTG	2	6	266978	266983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
5554	NC_017456	TGG	2	6	266997	267002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
5555	NC_017456	TAA	2	6	267003	267008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
5556	NC_017456	ATA	2	6	267038	267043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
5557	NC_017456	ACA	2	6	267050	267055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801200
5558	NC_017456	ATA	2	6	267059	267064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
5559	NC_017456	AGA	2	6	267069	267074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801200
5560	NC_017456	CTG	2	6	267116	267121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801200
5561	NC_017456	TGT	2	6	267129	267134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801200
5562	NC_017456	CAA	2	6	267147	267152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801200
5563	NC_017456	CAA	2	6	267178	267183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801200
5564	NC_017456	AAT	2	6	267184	267189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
5565	NC_017456	GGT	2	6	267277	267282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801200
5566	NC_017456	ACA	2	6	267303	267308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801200
5567	NC_017456	CTG	2	6	267389	267394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801200
5568	NC_017456	ATA	2	6	267404	267409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
5569	NC_017456	TTC	2	6	267423	267428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801200
5570	NC_017456	AAT	2	6	267436	267441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
5571	NC_017456	AAT	2	6	267475	267480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
5572	NC_017456	GTA	2	6	267487	267492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801200
5573	NC_017456	AAAC	2	8	267497	267504	75 %	0 %	0 %	25 %	385801200
5574	NC_017456	AAGA	2	8	267700	267707	75 %	0 %	25 %	0 %	385801200
5575	NC_017456	GTA	2	6	267713	267718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801200
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5577	NC_017456	CAA	2	6	267770	267775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801200
5578	NC_017456	TGA	2	6	267813	267818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801200
5579	NC_017456	ATA	2	6	267827	267832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801200
5580	NC_017456	A	6	6	267838	267843	100 %	0 %	0 %	0 %	385801200
5581	NC_017456	TACAAA	2	12	267894	267905	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385801200
5582	NC_017456	TTTA	2	8	267954	267961	25 %	75 %	0 %	0 %	385801200
5583	NC_017456	A	6	6	268038	268043	100 %	0 %	0 %	0 %	385801200
5584	NC_017456	TA	3	6	268044	268049	50 %	50 %	0 %	0 %	385801200
5585	NC_017456	TTG	2	6	268089	268094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_017456	ATGC	2	8	268169	268176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5587	NC_017456	AAG	2	6	268215	268220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_017456	TAC	2	6	268230	268235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_017456	ACA	2	6	268256	268261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801201
5590	NC_017456	A	6	6	268271	268276	100 %	0 %	0 %	0 %	385801201
5591	NC_017456	TCA	2	6	268416	268421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801201
5592	NC_017456	GGC	2	6	268443	268448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801201
5593	NC_017456	TTG	2	6	268496	268501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801201
5594	NC_017456	TGT	2	6	268503	268508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801201
5595	NC_017456	TTGAA	2	10	268589	268598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_017456	AAT	2	6	268621	268626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801202
5597	NC_017456	AAG	2	6	268681	268686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801202
5598	NC_017456	ATTT	2	8	268692	268699	25 %	75 %	0 %	0 %	385801202
5599	NC_017456	AAC	2	6	268716	268721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801202
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5601	NC_017456	TGC	2	6	268791	268796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801202
5602	NC_017456	TG	3	6	268797	268802	0 %	50 %	50 %	0 %	385801202
5603	NC_017456	AAT	2	6	268810	268815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801202
5604	NC_017456	TG	3	6	268823	268828	0 %	50 %	50 %	0 %	385801202
5605	NC_017456	GAC	2	6	268840	268845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801202
5606	NC_017456	CTG	2	6	268862	268867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801202
5607	NC_017456	TGG	2	6	268938	268943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801202
5608	NC_017456	TGG	2	6	268959	268964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801202
5609	NC_017456	GC	3	6	268971	268976	0 %	0 %	50 %	50 %	385801202
5610	NC_017456	GCA	2	6	268987	268992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801202
5611	NC_017456	GAA	2	6	269122	269127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801202
5612	NC_017456	AGAT	2	8	269175	269182	50 %	25 %	25 %	0 %	385801202
5613	NC_017456	TAA	2	6	269216	269221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801202
5614	NC_017456	AAT	2	6	269374	269379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801203
5615	NC_017456	ATG	2	6	269390	269395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801203
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5617	NC_017456	AGA	3	9	269595	269603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801203
5618	NC_017456	CGTT	2	8	269676	269683	0 %	50 %	25 %	25 %	385801203
5619	NC_017456	TAG	2	6	269720	269725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801203
5620	NC_017456	TGC	2	6	269763	269768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801203
5621	NC_017456	CAT	2	6	269786	269791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801203
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5988	NC_017456	A	6	6	286753	286758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5989	NC_017456	GGA	2	6	286760	286765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5990	NC_017456	ATC	2	6	286846	286851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801224
5991	NC_017456	TTGGT	2	10	286946	286955	0 %	60 %	40 %	0 %	385801224
5992	NC_017456	TGG	2	6	286968	286973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801224
5993	NC_017456	GCT	2	6	287043	287048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801224
5994	NC_017456	AAGG	2	8	287083	287090	50 %	0 %	50 %	0 %	385801224
5995	NC_017456	TTGGC	2	10	287138	287147	0 %	40 %	40 %	20 %	385801224
5996	NC_017456	TGG	2	6	287271	287276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801224
5997	NC_017456	TTA	2	6	287306	287311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801224
5998	NC_017456	CTTC	2	8	287370	287377	0 %	50 %	0 %	50 %	385801224
5999	NC_017456	TTGG	2	8	287393	287400	0 %	50 %	50 %	0 %	385801224
6000	NC_017456	GCTC	2	8	287490	287497	0 %	25 %	25 %	50 %	385801224

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