MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017456	GCT	3	9	240084	240092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801182
5002	NC_017456	TTG	2	6	240150	240155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801182
5003	NC_017456	AGC	2	6	240196	240201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801182
5004	NC_017456	CTG	2	6	240211	240216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801182
5005	NC_017456	TGC	2	6	240230	240235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801182
5006	NC_017456	GCT	2	6	240240	240245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801182
5007	NC_017456	AAG	2	6	240303	240308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801182
5008	NC_017456	TTG	2	6	240412	240417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801182
5009	NC_017456	T	6	6	240548	240553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017456	CGC	2	6	240578	240583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_017456	TGT	2	6	240604	240609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_017456	TTG	2	6	240621	240626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017456	CGT	2	6	240659	240664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_017456	T	6	6	240866	240871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017456	T	7	7	240958	240964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017456	TGA	2	6	240991	240996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017456	T	6	6	241010	241015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017456	TGT	2	6	241080	241085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_017456	TGT	2	6	241138	241143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_017456	GTT	2	6	241148	241153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017456	GTTTTG	2	12	241156	241167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017456	T	6	6	241174	241179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017456	TGTT	2	8	241187	241194	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_017456	GTA	2	6	241196	241201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017456	ATT	2	6	241214	241219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017456	CG	3	6	241341	241346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_017456	TG	3	6	241348	241353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017456	ATG	2	6	241388	241393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017456	TAA	2	6	241414	241419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017456	T	6	6	241486	241491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_017456	TGT	2	6	241502	241507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017456	T	6	6	241521	241526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017456	ATT	2	6	241529	241534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017456	TGT	2	6	241557	241562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017456	G	9	9	241584	241592	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017456	GCT	2	6	241607	241612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017456	T	6	6	241753	241758	0 %	100 %	0 %	0 %	385801183
5038	NC_017456	TTG	2	6	241787	241792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801183
5039	NC_017456	ATT	2	6	241799	241804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801183
5040	NC_017456	TCT	2	6	241837	241842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801183
5041	NC_017456	T	6	6	241885	241890	0 %	100 %	0 %	0 %	385801183
5042	NC_017456	TTA	2	6	241907	241912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801183
5043	NC_017456	CAA	2	6	242008	242013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801183
5044	NC_017456	TAA	2	6	242049	242054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
5045	NC_017456	GCC	2	6	242088	242093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801183
5046	NC_017456	AGT	2	6	242119	242124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801183
5047	NC_017456	ATA	2	6	242150	242155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
5048	NC_017456	A	6	6	242155	242160	100 %	0 %	0 %	0 %	385801183
5049	NC_017456	AGC	2	6	242188	242193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801183
5050	NC_017456	ATAACA	2	12	242237	242248	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385801183
5051	NC_017456	ATAA	2	8	242251	242258	75 %	25 %	0 %	0 %	385801183
5052	NC_017456	ATA	2	6	242336	242341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
5053	NC_017456	TAA	2	6	242352	242357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
5054	NC_017456	CAA	2	6	242367	242372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801183
5055	NC_017456	CAA	2	6	242382	242387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801183
5056	NC_017456	GGCG	2	8	242388	242395	0 %	0 %	75 %	25 %	385801183
5057	NC_017456	A	6	6	242509	242514	100 %	0 %	0 %	0 %	385801183
5058	NC_017456	TA	4	8	242550	242557	50 %	50 %	0 %	0 %	385801183
5059	NC_017456	ATAG	2	8	242572	242579	50 %	25 %	25 %	0 %	385801183
5060	NC_017456	T	6	6	242589	242594	0 %	100 %	0 %	0 %	385801183
5061	NC_017456	AGA	2	6	242595	242600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801183
5062	NC_017456	GGC	2	6	242608	242613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801183
5063	NC_017456	TAT	2	6	242671	242676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801183
5064	NC_017456	CTG	2	6	242705	242710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801183
5065	NC_017456	AAT	2	6	242806	242811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
5066	NC_017456	CAA	2	6	242831	242836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801183
5067	NC_017456	ACT	2	6	242854	242859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801183
5068	NC_017456	CG	3	6	242866	242871	0 %	0 %	50 %	50 %	385801183
5069	NC_017456	AAATA	2	10	242879	242888	80 %	20 %	0 %	0 %	385801183
5070	NC_017456	ATT	2	6	242912	242917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801183
5071	NC_017456	TAA	2	6	242976	242981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
5072	NC_017456	A	6	6	243027	243032	100 %	0 %	0 %	0 %	385801183
5073	NC_017456	TAG	2	6	243213	243218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801183
5074	NC_017456	TAA	2	6	243282	243287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
5075	NC_017456	GAT	3	9	243313	243321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801183
5076	NC_017456	ATC	2	6	243440	243445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801183
5077	NC_017456	A	6	6	243525	243530	100 %	0 %	0 %	0 %	385801183
5078	NC_017456	TGA	2	6	243585	243590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801183
5079	NC_017456	T	6	6	243649	243654	0 %	100 %	0 %	0 %	385801183
5080	NC_017456	TC	3	6	243680	243685	0 %	50 %	0 %	50 %	385801183
5081	NC_017456	ATTG	2	8	243709	243716	25 %	50 %	25 %	0 %	385801183
5082	NC_017456	TCC	2	6	243756	243761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801183
5083	NC_017456	TTC	2	6	243798	243803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801183
5084	NC_017456	AAT	2	6	243814	243819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
5085	NC_017456	AGC	2	6	243823	243828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801183
5086	NC_017456	TAATG	2	10	243870	243879	40 %	40 %	20 %	0 %	385801183
5087	NC_017456	TA	3	6	244044	244049	50 %	50 %	0 %	0 %	385801183
5088	NC_017456	GAT	2	6	244063	244068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801183
5089	NC_017456	A	6	6	244088	244093	100 %	0 %	0 %	0 %	385801183
5090	NC_017456	TAA	2	6	244104	244109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801183
5091	NC_017456	GAT	2	6	244129	244134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801183
5092	NC_017456	ACA	2	6	244153	244158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801183
5093	NC_017456	GT	3	6	244200	244205	0 %	50 %	50 %	0 %	385801183
5094	NC_017456	AGA	2	6	244233	244238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801183
5095	NC_017456	AAC	2	6	244251	244256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801183
5096	NC_017456	TTG	2	6	244304	244309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801183
5097	NC_017456	CGAA	2	8	244374	244381	50 %	0 %	25 %	25 %	385801183
5098	NC_017456	GCC	2	6	244408	244413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801183
5099	NC_017456	GCA	2	6	244432	244437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801183
5100	NC_017456	GCT	2	6	244477	244482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801183
5101	NC_017456	GGC	2	6	244491	244496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801183
5102	NC_017456	ATT	2	6	244541	244546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017456	TCGG	2	8	244569	244576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5104	NC_017456	ATT	2	6	244608	244613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_017456	A	6	6	244654	244659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_017456	TAA	2	6	244667	244672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_017456	GCG	2	6	244721	244726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801184
5108	NC_017456	TCGC	2	8	244733	244740	0 %	25 %	25 %	50 %	385801184
5109	NC_017456	TGGC	2	8	244743	244750	0 %	25 %	50 %	25 %	385801184
5110	NC_017456	CCA	2	6	244808	244813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801184
5111	NC_017456	TTC	2	6	245035	245040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801184
5112	NC_017456	GCAA	2	8	245044	245051	50 %	0 %	25 %	25 %	385801184
5113	NC_017456	TGC	2	6	245089	245094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801184
5114	NC_017456	CTA	2	6	245112	245117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801184
5115	NC_017456	AGA	2	6	245157	245162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801184
5116	NC_017456	GAA	2	6	245192	245197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801184
5117	NC_017456	CTACAA	2	12	245299	245310	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385801184
5118	NC_017456	AGT	2	6	245314	245319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801184
5119	NC_017456	GAT	2	6	245465	245470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801184
5120	NC_017456	TGA	2	6	245491	245496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801184
5121	NC_017456	GCT	2	6	245507	245512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801184
5122	NC_017456	GAA	2	6	245539	245544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801184
5123	NC_017456	ACT	2	6	245585	245590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801184
5124	NC_017456	GT	3	6	245598	245603	0 %	50 %	50 %	0 %	385801184
5125	NC_017456	TGC	2	6	245611	245616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801184
5126	NC_017456	TGC	2	6	245644	245649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801184
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5247	NC_017456	CA	3	6	251917	251922	50 %	0 %	0 %	50 %	385801187
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5250	NC_017456	TGC	2	6	251991	251996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801187
5251	NC_017456	ATG	2	6	252034	252039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801187
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5369	NC_017456	GACT	2	8	257722	257729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5370	NC_017456	CT	3	6	257849	257854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5371	NC_017456	CAG	2	6	257936	257941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5372	NC_017456	AC	3	6	257952	257957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5500	NC_017456	TG	3	6	264259	264264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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