MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gardnerella vaginalis HMP9231 chromosome

Total Repeats: 35861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017456	GTA	2	6	213343	213348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801162
4502	NC_017456	GGA	2	6	213446	213451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385801162
4503	NC_017456	TCG	2	6	213494	213499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801162
4504	NC_017456	CAAA	2	8	213549	213556	75 %	0 %	0 %	25 %	385801162
4505	NC_017456	AGCG	2	8	213584	213591	25 %	0 %	50 %	25 %	385801162
4506	NC_017456	AGT	2	6	213615	213620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801162
4507	NC_017456	CGA	2	6	213851	213856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801162
4508	NC_017456	AATC	2	8	213870	213877	50 %	25 %	0 %	25 %	385801162
4509	NC_017456	GC	4	8	213903	213910	0 %	0 %	50 %	50 %	385801162
4510	NC_017456	TGCT	2	8	214029	214036	0 %	50 %	25 %	25 %	385801162
4511	NC_017456	CAAA	2	8	214119	214126	75 %	0 %	0 %	25 %	385801162
4512	NC_017456	CTT	2	6	214195	214200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801162
4513	NC_017456	CGT	2	6	214284	214289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801162
4514	NC_017456	AAAG	2	8	214361	214368	75 %	0 %	25 %	0 %	385801162
4515	NC_017456	TCT	2	6	214383	214388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801162
4516	NC_017456	ATA	2	6	214424	214429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801162
4517	NC_017456	GTG	2	6	214435	214440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801162
4518	NC_017456	GAAT	2	8	214498	214505	50 %	25 %	25 %	0 %	385801162
4519	NC_017456	AAG	2	6	214591	214596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801162
4520	NC_017456	CGC	4	12	214605	214616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801162
4521	NC_017456	AGC	2	6	214689	214694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801162
4522	NC_017456	TGGC	2	8	214743	214750	0 %	25 %	50 %	25 %	385801162
4523	NC_017456	GCT	2	6	214790	214795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801162
4524	NC_017456	GC	3	6	214835	214840	0 %	0 %	50 %	50 %	385801162
4525	NC_017456	TTGC	2	8	214861	214868	0 %	50 %	25 %	25 %	385801162
4526	NC_017456	AAG	2	6	214890	214895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801162
4527	NC_017456	GTG	2	6	214933	214938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801162
4528	NC_017456	GCT	2	6	214978	214983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801162
4529	NC_017456	GTA	3	9	215008	215016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801162
4530	NC_017456	CTG	2	6	215202	215207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801162
4531	NC_017456	TGC	2	6	215208	215213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801162
4532	NC_017456	GTC	2	6	215227	215232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801162
4533	NC_017456	TTCCT	2	10	215295	215304	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4534	NC_017456	T	6	6	215334	215339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_017456	TTG	2	6	215347	215352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_017456	TCT	2	6	215378	215383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801163
4537	NC_017456	TCT	2	6	215438	215443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801163
4538	NC_017456	AGA	2	6	215545	215550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801163
4539	NC_017456	CGC	2	6	215556	215561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385801163
4540	NC_017456	ACGA	2	8	215568	215575	50 %	0 %	25 %	25 %	385801163
4541	NC_017456	ATT	2	6	215584	215589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801163
4542	NC_017456	TCC	2	6	215632	215637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801163
4543	NC_017456	TTG	2	6	215726	215731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801163
4544	NC_017456	GT	3	6	215763	215768	0 %	50 %	50 %	0 %	385801163
4545	NC_017456	GAA	2	6	215780	215785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801163
4546	NC_017456	GATT	2	8	215803	215810	25 %	50 %	25 %	0 %	385801163
4547	NC_017456	GC	4	8	215819	215826	0 %	0 %	50 %	50 %	385801163
4548	NC_017456	CA	3	6	215862	215867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4549	NC_017456	CTT	2	6	215876	215881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_017456	ATT	2	6	215892	215897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_017456	TTG	2	6	215902	215907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_017456	TTG	2	6	215923	215928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_017456	ATT	2	6	215938	215943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801164
4554	NC_017456	TCT	2	6	215963	215968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801164
4555	NC_017456	ACG	2	6	216015	216020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801164
4556	NC_017456	CAC	2	6	216034	216039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801164
4557	NC_017456	CTG	2	6	216057	216062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801164
4558	NC_017456	TGA	2	6	216238	216243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_017456	CTA	2	6	216281	216286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_017456	T	7	7	216394	216400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_017456	TAA	2	6	216410	216415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_017456	ATGA	2	8	216486	216493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_017456	A	6	6	216521	216526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_017456	GT	3	6	216527	216532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_017456	ATA	2	6	216571	216576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_017456	GTT	2	6	216655	216660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385801165
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4568	NC_017456	AATG	2	8	216759	216766	50 %	25 %	25 %	0 %	385801165
4569	NC_017456	GAA	2	6	216808	216813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801165
4570	NC_017456	ATT	2	6	216922	216927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801165
4571	NC_017456	CGG	2	6	216933	216938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801165
4572	NC_017456	AG	3	6	216967	216972	50 %	0 %	50 %	0 %	385801165
4573	NC_017456	CG	5	10	216982	216991	0 %	0 %	50 %	50 %	385801165
4574	NC_017456	GTTG	2	8	217003	217010	0 %	50 %	50 %	0 %	385801165
4575	NC_017456	TGG	2	6	217020	217025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801165
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4579	NC_017456	TTGA	2	8	217324	217331	25 %	50 %	25 %	0 %	385801165
4580	NC_017456	CGG	2	6	217337	217342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801165
4581	NC_017456	GAT	2	6	217389	217394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385801165
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4583	NC_017456	CGA	2	6	217659	217664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801165
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4585	NC_017456	GCT	2	6	217708	217713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801165
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4587	NC_017456	GCT	2	6	217852	217857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801165
4588	NC_017456	CGT	2	6	217861	217866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385801165
4589	NC_017456	GC	4	8	217873	217880	0 %	0 %	50 %	50 %	385801165
4590	NC_017456	GCTT	2	8	217916	217923	0 %	50 %	25 %	25 %	385801165
4591	NC_017456	TAC	2	6	217927	217932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801165
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4593	NC_017456	ATA	2	6	218088	218093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_017456	TAAC	2	8	218098	218105	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4595	NC_017456	ATT	2	6	218116	218121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_017456	T	6	6	218150	218155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_017456	ATTG	2	8	218193	218200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_017456	GGT	2	6	218359	218364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385801166
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4602	NC_017456	GCG	2	6	218485	218490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385801166
4603	NC_017456	TCT	2	6	218687	218692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801166
4604	NC_017456	CTT	2	6	218754	218759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801166
4605	NC_017456	ATC	2	6	218770	218775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801166
4606	NC_017456	AAG	2	6	218833	218838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801166
4607	NC_017456	CCA	2	6	218902	218907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801166
4608	NC_017456	GCTA	2	8	218950	218957	25 %	25 %	25 %	25 %	385801166
4609	NC_017456	TTA	2	6	219014	219019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385801166
4610	NC_017456	GCA	2	6	219071	219076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801166
4611	NC_017456	CAG	2	6	219078	219083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385801166
4612	NC_017456	TAT	2	6	219163	219168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_017456	T	6	6	219168	219173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_017456	CAA	2	6	219209	219214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801167
4615	NC_017456	CTC	2	6	219265	219270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385801167
4616	NC_017456	TCT	2	6	219281	219286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801167
4617	NC_017456	TTC	2	6	219349	219354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385801167
4618	NC_017456	AAAG	2	8	219371	219378	75 %	0 %	25 %	0 %	385801167
4619	NC_017456	GC	3	6	219420	219425	0 %	0 %	50 %	50 %	385801167
4620	NC_017456	CAA	2	6	219435	219440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385801167
4621	NC_017456	TAA	2	6	219528	219533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385801167
4622	NC_017456	AAGA	2	8	219600	219607	75 %	0 %	25 %	0 %	385801167
4623	NC_017456	AGA	2	6	219619	219624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385801167
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4625	NC_017456	CCA	2	6	219748	219753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385801167
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4998	NC_017456	ACT	2	6	239815	239820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385801182
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