MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 plasmid p174

Total Repeats: 4319

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_016907	GGCA	2	8	119828	119835	25 %	0 %	50 %	25 %	378720616
3002	NC_016907	GGT	2	6	119867	119872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_016907	CCT	2	6	119889	119894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_016907	GCC	3	9	119927	119935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_016907	CCG	2	6	120009	120014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720617
3006	NC_016907	ACGG	2	8	120019	120026	25 %	0 %	50 %	25 %	378720617
3007	NC_016907	CAG	2	6	120134	120139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720617
3008	NC_016907	CCG	2	6	120141	120146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720617
3009	NC_016907	GCA	2	6	120172	120177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720617
3010	NC_016907	ATC	2	6	120207	120212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720617
3011	NC_016907	GAC	2	6	120227	120232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720617
3012	NC_016907	TCG	2	6	120246	120251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720617
3013	NC_016907	CGA	2	6	120349	120354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720617
3014	NC_016907	CGG	2	6	120366	120371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720617
3015	NC_016907	GCG	2	6	120419	120424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720617
3016	NC_016907	ACC	2	6	120425	120430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720617
3017	NC_016907	CGG	2	6	120487	120492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720617
3018	NC_016907	CGA	2	6	120497	120502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720617
3019	NC_016907	TCG	2	6	120510	120515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720617
3020	NC_016907	TCG	2	6	120519	120524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720617
3021	NC_016907	GCC	2	6	120534	120539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720617
3022	NC_016907	CCATC	2	10	120543	120552	20 %	20 %	0 %	60 %	378720617
3023	NC_016907	GT	3	6	120567	120572	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_016907	CGG	3	9	120593	120601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_016907	GCCG	2	8	120704	120711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_016907	TGG	2	6	120746	120751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_016907	CG	3	6	120756	120761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_016907	CAC	2	6	120799	120804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_016907	CAC	2	6	120815	120820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_016907	CGGC	2	8	120826	120833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3031	NC_016907	CGC	2	6	120840	120845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_016907	CGG	2	6	120853	120858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_016907	CG	3	6	120867	120872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_016907	TCC	2	6	120890	120895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3035	NC_016907	TCGT	2	8	120929	120936	0 %	50 %	25 %	25 %	378720618
3036	NC_016907	AC	3	6	121077	121082	50 %	0 %	0 %	50 %	378720618
3037	NC_016907	GAC	2	6	121085	121090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720618
3038	NC_016907	GCG	2	6	121101	121106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720618
3039	NC_016907	GCCGA	2	10	121109	121118	20 %	0 %	40 %	40 %	378720618
3040	NC_016907	TGC	2	6	121128	121133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720618
3041	NC_016907	CG	3	6	121219	121224	0 %	0 %	50 %	50 %	378720618
3042	NC_016907	GC	3	6	121225	121230	0 %	0 %	50 %	50 %	378720618
3043	NC_016907	CGT	2	6	121314	121319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720618
3044	NC_016907	TCG	2	6	121395	121400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720618
3045	NC_016907	CGA	2	6	121464	121469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_016907	GAT	2	6	121487	121492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_016907	CGA	2	6	121548	121553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720619
3048	NC_016907	GC	3	6	121665	121670	0 %	0 %	50 %	50 %	378720619
3049	NC_016907	CGGC	2	8	121707	121714	0 %	0 %	50 %	50 %	378720619
3050	NC_016907	GAA	2	6	121753	121758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720619
3051	NC_016907	ACC	2	6	121837	121842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720619
3052	NC_016907	CAG	2	6	121876	121881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720619
3053	NC_016907	CGG	2	6	121908	121913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720619
3054	NC_016907	TTGCCC	2	12	121922	121933	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	378720619
3055	NC_016907	CGT	2	6	121950	121955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720619
3056	NC_016907	CACCGA	2	12	122032	122043	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	378720619
3057	NC_016907	GCC	2	6	122060	122065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720619
3058	NC_016907	CGA	2	6	122076	122081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720619
3059	NC_016907	CCG	2	6	122084	122089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720619
3060	NC_016907	CAC	2	6	122092	122097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720619
3061	NC_016907	TTG	2	6	122132	122137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378720619
3062	NC_016907	TGA	2	6	122166	122171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720619
3063	NC_016907	CCCAA	2	10	122202	122211	40 %	0 %	0 %	60 %	378720619
3064	NC_016907	GCC	2	6	122233	122238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720619
3065	NC_016907	CGC	2	6	122275	122280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720619
3066	NC_016907	CGA	2	6	122335	122340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720619
3067	NC_016907	CGTCGG	2	12	122355	122366	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378720619
3068	NC_016907	TCG	2	6	122370	122375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720619
3069	NC_016907	CTG	2	6	122380	122385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720619
3070	NC_016907	CGG	2	6	122418	122423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720619
3071	NC_016907	GCA	2	6	122469	122474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720619
3072	NC_016907	TCG	2	6	122498	122503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720619
3073	NC_016907	TTC	2	6	122509	122514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720619
3074	NC_016907	GAT	2	6	122517	122522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720619
3075	NC_016907	GATCG	2	10	122551	122560	20 %	20 %	40 %	20 %	378720619
3076	NC_016907	GGT	2	6	122578	122583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720619
3077	NC_016907	GGGT	2	8	122594	122601	0 %	25 %	75 %	0 %	378720619
3078	NC_016907	CCGG	2	8	122672	122679	0 %	0 %	50 %	50 %	378720619
3079	NC_016907	TGG	2	6	122739	122744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720619
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3081	NC_016907	CAGCC	2	10	122819	122828	20 %	0 %	20 %	60 %	378720619
3082	NC_016907	CTCGGG	2	12	122851	122862	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378720619
3083	NC_016907	GT	3	6	122906	122911	0 %	50 %	50 %	0 %	378720619
3084	NC_016907	CCG	2	6	122912	122917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720619
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3088	NC_016907	CCAG	2	8	123105	123112	25 %	0 %	25 %	50 %	378720619
3089	NC_016907	CCT	2	6	123135	123140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378720619
3090	NC_016907	TCG	2	6	123152	123157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720619
3091	NC_016907	GGC	2	6	123159	123164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720619
3092	NC_016907	CAG	2	6	123226	123231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720619
3093	NC_016907	CTT	3	9	123259	123267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720619
3094	NC_016907	GC	3	6	123286	123291	0 %	0 %	50 %	50 %	378720619
3095	NC_016907	GCG	2	6	123327	123332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720619
3096	NC_016907	TGCCGG	2	12	123345	123356	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378720619
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3098	NC_016907	GGTA	2	8	123381	123388	25 %	25 %	50 %	0 %	378720619
3099	NC_016907	GAA	2	6	123415	123420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378720619
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3103	NC_016907	CGTCGA	2	12	123498	123509	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378720619
3104	NC_016907	GCG	2	6	123521	123526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720619
3105	NC_016907	CGC	3	9	123540	123548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720619
3106	NC_016907	GCGG	2	8	123549	123556	0 %	0 %	75 %	25 %	378720619
3107	NC_016907	CCA	2	6	123604	123609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720619
3108	NC_016907	GTT	2	6	123613	123618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378720619
3109	NC_016907	GCC	3	9	123619	123627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720619
3110	NC_016907	CGG	2	6	123678	123683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_016907	ACG	2	6	123728	123733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_016907	GAG	2	6	123788	123793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720620
3113	NC_016907	TCG	2	6	123836	123841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720620
3114	NC_016907	AGG	2	6	123842	123847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720620
3115	NC_016907	GTC	2	6	123856	123861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720620
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3117	NC_016907	CGG	2	6	123998	124003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720620
3118	NC_016907	GA	3	6	124053	124058	50 %	0 %	50 %	0 %	378720620
3119	NC_016907	CG	3	6	124072	124077	0 %	0 %	50 %	50 %	378720620
3120	NC_016907	GGC	2	6	124078	124083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720620
3121	NC_016907	CGA	2	6	124195	124200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720620
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3123	NC_016907	GTT	2	6	124274	124279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3237	NC_016907	CGCT	2	8	128571	128578	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3244	NC_016907	CCGGG	2	10	128913	128922	0 %	0 %	60 %	40 %	378720625
3245	NC_016907	GACC	2	8	128923	128930	25 %	0 %	25 %	50 %	378720625
3246	NC_016907	CGGA	2	8	128931	128938	25 %	0 %	50 %	25 %	378720625
3247	NC_016907	TCG	2	6	128955	128960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720625
3248	NC_016907	TAC	2	6	128963	128968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720625
3249	NC_016907	GCGGG	2	10	128973	128982	0 %	0 %	80 %	20 %	378720625
3250	NC_016907	CGG	2	6	129029	129034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720625
3251	NC_016907	CGC	2	6	129088	129093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720626
3252	NC_016907	CGGC	2	8	129100	129107	0 %	0 %	50 %	50 %	378720626
3253	NC_016907	CG	3	6	129110	129115	0 %	0 %	50 %	50 %	378720626
3254	NC_016907	CCA	2	6	129145	129150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720626
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3257	NC_016907	CGA	2	6	129202	129207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720626
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3261	NC_016907	GTC	2	6	129317	129322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720626
3262	NC_016907	GAT	2	6	129326	129331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720626
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3264	NC_016907	ACC	2	6	129371	129376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720626
3265	NC_016907	CGG	2	6	129394	129399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720626
3266	NC_016907	CGT	2	6	129415	129420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720626
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3269	NC_016907	CCCA	2	8	129525	129532	25 %	0 %	0 %	75 %	378720626
3270	NC_016907	TGC	2	6	129548	129553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720626
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3275	NC_016907	CGGTG	2	10	129746	129755	0 %	20 %	60 %	20 %	378720626
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3280	NC_016907	CGG	2	6	129973	129978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720626
3281	NC_016907	GC	3	6	129988	129993	0 %	0 %	50 %	50 %	378720626
3282	NC_016907	GGT	2	6	129995	130000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720626
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3289	NC_016907	GAC	2	6	130244	130249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720626
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3303	NC_016907	CGC	2	6	130831	130836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720626
3304	NC_016907	ACC	2	6	130880	130885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720626
3305	NC_016907	CA	3	6	130887	130892	50 %	0 %	0 %	50 %	378720626
3306	NC_016907	CACCG	2	10	130938	130947	20 %	0 %	20 %	60 %	378720626
3307	NC_016907	AGA	2	6	131031	131036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3308	NC_016907	GCT	2	6	131135	131140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720627
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3310	NC_016907	TGA	2	6	131193	131198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720627
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3313	NC_016907	GTG	2	6	131312	131317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720627
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3316	NC_016907	GCATCT	2	12	131404	131415	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378720627
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3318	NC_016907	CGC	2	6	131447	131452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3319	NC_016907	TCT	2	6	131506	131511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378720628
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3329	NC_016907	CGAC	2	8	131830	131837	25 %	0 %	25 %	50 %	378720628
3330	NC_016907	CTG	2	6	131861	131866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720628
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3337	NC_016907	GTC	2	6	132101	132106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720628
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3340	NC_016907	TCA	2	6	132204	132209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720628
3341	NC_016907	GC	3	6	132221	132226	0 %	0 %	50 %	50 %	378720628
3342	NC_016907	CCGG	3	12	132236	132247	0 %	0 %	50 %	50 %	378720628
3343	NC_016907	CTCG	2	8	132277	132284	0 %	25 %	25 %	50 %	378720628
3344	NC_016907	CGTTGG	2	12	132294	132305	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378720628
3345	NC_016907	GGC	2	6	132325	132330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720628
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3347	NC_016907	TCG	2	6	132357	132362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720628
3348	NC_016907	TGG	2	6	132375	132380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720628
3349	NC_016907	TGCG	2	8	132383	132390	0 %	25 %	50 %	25 %	378720628
3350	NC_016907	GGT	2	6	132391	132396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378720628
3351	NC_016907	CCGTG	2	10	132427	132436	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3352	NC_016907	GGCA	2	8	132437	132444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3353	NC_016907	TCT	2	6	132446	132451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3354	NC_016907	CGA	2	6	132503	132508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720629
3355	NC_016907	GACGG	2	10	132529	132538	20 %	0 %	60 %	20 %	378720629
3356	NC_016907	CCGGC	2	10	132560	132569	0 %	0 %	40 %	60 %	378720629
3357	NC_016907	GC	3	6	132614	132619	0 %	0 %	50 %	50 %	378720629
3358	NC_016907	TCG	3	9	132665	132673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720629
3359	NC_016907	GTCCG	2	10	132717	132726	0 %	20 %	40 %	40 %	378720629
3360	NC_016907	ATC	2	6	132808	132813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378720629
3361	NC_016907	CAC	2	6	132921	132926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720629
3362	NC_016907	TGA	2	6	132974	132979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378720629
3363	NC_016907	CGA	2	6	132999	133004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378720629
3364	NC_016907	GGTGAC	2	12	133005	133016	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378720629
3365	NC_016907	ACC	2	6	133028	133033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378720629
3366	NC_016907	CGA	2	6	133043	133048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3367	NC_016907	TCT	2	6	133160	133165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3368	NC_016907	GT	3	6	133168	133173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3369	NC_016907	GTAC	2	8	133177	133184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3370	NC_016907	CG	3	6	133186	133191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3371	NC_016907	CCG	2	6	133248	133253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3372	NC_016907	CG	4	8	133305	133312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3373	NC_016907	GAG	2	6	133339	133344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378720630
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3375	NC_016907	GTC	2	6	133450	133455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378720630
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3380	NC_016907	CGC	2	6	133800	133805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720630
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3395	NC_016907	CCG	2	6	134498	134503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720630
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3487	NC_016907	CCG	2	6	138086	138091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378720630
3488	NC_016907	CGG	2	6	138111	138116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378720630
3489	NC_016907	GT	3	6	138124	138129	0 %	50 %	50 %	0 %	378720630
3490	NC_016907	CCGA	2	8	138175	138182	25 %	0 %	25 %	50 %	378720630
3491	NC_016907	GTT	2	6	138210	138215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378720630
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