MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 14683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016906	TCGG	2	8	416	423	0 %	25 %	50 %	25 %	378715557
2	NC_016906	CGAT	2	8	492	499	25 %	25 %	25 %	25 %	378715557
3	NC_016906	TCCG	2	8	607	614	0 %	25 %	25 %	50 %	378715557
4	NC_016906	AAGG	2	8	1082	1089	50 %	0 %	50 %	0 %	378715557
5	NC_016906	AGCA	2	8	1136	1143	50 %	0 %	25 %	25 %	378715557
6	NC_016906	CGCC	2	8	1163	1170	0 %	0 %	25 %	75 %	378715557
7	NC_016906	CCGC	2	8	1740	1747	0 %	0 %	25 %	75 %	378715557
8	NC_016906	TGGA	2	8	1908	1915	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016906	ATCG	2	8	2540	2547	25 %	25 %	25 %	25 %	378715558
10	NC_016906	CGTG	2	8	2900	2907	0 %	25 %	50 %	25 %	378715558
11	NC_016906	GCCG	2	8	3140	3147	0 %	0 %	50 %	50 %	378715558
12	NC_016906	GCCG	2	8	4813	4820	0 %	0 %	50 %	50 %	378715560
13	NC_016906	TGCC	2	8	5309	5316	0 %	25 %	25 %	50 %	378715560
14	NC_016906	GCCA	2	8	5473	5480	25 %	0 %	25 %	50 %	378715560
15	NC_016906	TCGC	2	8	5494	5501	0 %	25 %	25 %	50 %	378715560
16	NC_016906	GTCG	2	8	6008	6015	0 %	25 %	50 %	25 %	378715561
17	NC_016906	CGTG	2	8	6419	6426	0 %	25 %	50 %	25 %	378715561
18	NC_016906	CTGA	3	12	6639	6650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016906	ACCG	2	8	7481	7488	25 %	0 %	25 %	50 %	378715562
20	NC_016906	CGGC	2	8	8253	8260	0 %	0 %	50 %	50 %	378715562
21	NC_016906	ACCG	2	8	8618	8625	25 %	0 %	25 %	50 %	378715562
22	NC_016906	TGAC	2	8	8948	8955	25 %	25 %	25 %	25 %	378715563
23	NC_016906	CCCG	2	8	8964	8971	0 %	0 %	25 %	75 %	378715563
24	NC_016906	ATCG	2	8	9804	9811	25 %	25 %	25 %	25 %	378715563
25	NC_016906	CAGC	2	8	9951	9958	25 %	0 %	25 %	50 %	378715563
26	NC_016906	GACC	2	8	10539	10546	25 %	0 %	25 %	50 %	378715563
27	NC_016906	ACCT	2	8	11110	11117	25 %	25 %	0 %	50 %	378715563
28	NC_016906	CAGC	2	8	11825	11832	25 %	0 %	25 %	50 %	378715564
29	NC_016906	TCCC	2	8	11952	11959	0 %	25 %	0 %	75 %	378715564
30	NC_016906	CGCC	2	8	12842	12849	0 %	0 %	25 %	75 %	378715565
31	NC_016906	ACCG	2	8	13195	13202	25 %	0 %	25 %	50 %	378715566
32	NC_016906	GGCG	2	8	13268	13275	0 %	0 %	75 %	25 %	378715566
33	NC_016906	CGTG	2	8	13319	13326	0 %	25 %	50 %	25 %	378715566
34	NC_016906	CGGC	2	8	13405	13412	0 %	0 %	50 %	50 %	378715566
35	NC_016906	TCGA	2	8	13426	13433	25 %	25 %	25 %	25 %	378715566
36	NC_016906	GAGG	2	8	13602	13609	25 %	0 %	75 %	0 %	378715566
37	NC_016906	CGGA	2	8	14423	14430	25 %	0 %	50 %	25 %	378715567
38	NC_016906	CGAA	2	8	14495	14502	50 %	0 %	25 %	25 %	378715567
39	NC_016906	CCGG	2	8	14507	14514	0 %	0 %	50 %	50 %	378715567
40	NC_016906	CCGG	2	8	14534	14541	0 %	0 %	50 %	50 %	378715567
41	NC_016906	CCGG	2	8	15041	15048	0 %	0 %	50 %	50 %	378715568
42	NC_016906	GCAA	2	8	15221	15228	50 %	0 %	25 %	25 %	378715568
43	NC_016906	GCCC	2	8	15614	15621	0 %	0 %	25 %	75 %	378715569
44	NC_016906	TGGG	2	8	15701	15708	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016906	GGTC	2	8	15744	15751	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016906	CCGG	2	8	15829	15836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016906	GGGC	2	8	16309	16316	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016906	CCCG	2	8	16567	16574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_016906	TGGA	2	8	17040	17047	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016906	GCGG	2	8	17648	17655	0 %	0 %	75 %	25 %	378715572
51	NC_016906	GTGC	2	8	17709	17716	0 %	25 %	50 %	25 %	378715572
52	NC_016906	CGGT	2	8	17785	17792	0 %	25 %	50 %	25 %	378715572
53	NC_016906	TCGC	2	8	18292	18299	0 %	25 %	25 %	50 %	378715572
54	NC_016906	ACCG	2	8	18385	18392	25 %	0 %	25 %	50 %	378715572
55	NC_016906	GCCG	2	8	18852	18859	0 %	0 %	50 %	50 %	378715573
56	NC_016906	AGCG	2	8	19469	19476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016906	CTCG	2	8	20049	20056	0 %	25 %	25 %	50 %	378715575
58	NC_016906	TCAC	2	8	20118	20125	25 %	25 %	0 %	50 %	378715575
59	NC_016906	CGAC	2	8	20944	20951	25 %	0 %	25 %	50 %	378715576
60	NC_016906	GGGC	2	8	22728	22735	0 %	0 %	75 %	25 %	378715577
61	NC_016906	CACG	2	8	22964	22971	25 %	0 %	25 %	50 %	378715577
62	NC_016906	ACCG	2	8	23762	23769	25 %	0 %	25 %	50 %	378715578
63	NC_016906	CGTC	2	8	23821	23828	0 %	25 %	25 %	50 %	378715578
64	NC_016906	CGAC	2	8	25153	25160	25 %	0 %	25 %	50 %	378715578
65	NC_016906	CGGC	2	8	25231	25238	0 %	0 %	50 %	50 %	378715579
66	NC_016906	TGGG	2	8	26570	26577	0 %	25 %	75 %	0 %	378715579
67	NC_016906	CGTG	2	8	26579	26586	0 %	25 %	50 %	25 %	378715579
68	NC_016906	GTTC	2	8	26626	26633	0 %	50 %	25 %	25 %	378715580
69	NC_016906	GGCC	2	8	26812	26819	0 %	0 %	50 %	50 %	378715580
70	NC_016906	GGCG	2	8	26845	26852	0 %	0 %	75 %	25 %	378715580
71	NC_016906	CGGC	2	8	27371	27378	0 %	0 %	50 %	50 %	378715580
72	NC_016906	AGGT	2	8	28261	28268	25 %	25 %	50 %	0 %	378715581
73	NC_016906	CGTG	2	8	28324	28331	0 %	25 %	50 %	25 %	378715581
74	NC_016906	CGGG	2	8	28716	28723	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016906	ACCG	2	8	28843	28850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016906	GGGC	2	8	29514	29521	0 %	0 %	75 %	25 %	378715582
77	NC_016906	GGTC	2	8	29922	29929	0 %	25 %	50 %	25 %	378715582
78	NC_016906	CGTG	2	8	30157	30164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016906	GTGC	2	8	30381	30388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016906	AGCG	2	8	31955	31962	25 %	0 %	50 %	25 %	378715583
81	NC_016906	GCCG	2	8	31980	31987	0 %	0 %	50 %	50 %	378715583
82	NC_016906	CCCG	2	8	32329	32336	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_016906	CCCA	2	8	32426	32433	25 %	0 %	0 %	75 %	378715584
84	NC_016906	CGAC	2	8	33022	33029	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016906	TCGT	2	8	33244	33251	0 %	50 %	25 %	25 %	378715585
86	NC_016906	CCCG	2	8	33521	33528	0 %	0 %	25 %	75 %	378715585
87	NC_016906	GGCC	2	8	33761	33768	0 %	0 %	50 %	50 %	378715585
88	NC_016906	GCTC	2	8	34097	34104	0 %	25 %	25 %	50 %	378715585
89	NC_016906	CGAT	2	8	34816	34823	25 %	25 %	25 %	25 %	378715585
90	NC_016906	GGCT	2	8	35960	35967	0 %	25 %	50 %	25 %	378715586
91	NC_016906	CGCC	2	8	36430	36437	0 %	0 %	25 %	75 %	378715586
92	NC_016906	CGGC	2	8	36728	36735	0 %	0 %	50 %	50 %	378715586
93	NC_016906	GAGG	2	8	37154	37161	25 %	0 %	75 %	0 %	378715586
94	NC_016906	GCGG	2	8	37496	37503	0 %	0 %	75 %	25 %	378715586
95	NC_016906	CGAT	2	8	37577	37584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016906	TCGG	2	8	38044	38051	0 %	25 %	50 %	25 %	378715587
97	NC_016906	CCGC	2	8	38317	38324	0 %	0 %	25 %	75 %	378715587
98	NC_016906	ACGC	2	8	38449	38456	25 %	0 %	25 %	50 %	378715587
99	NC_016906	CGGG	2	8	38480	38487	0 %	0 %	75 %	25 %	378715587
100	NC_016906	CGCC	2	8	38864	38871	0 %	0 %	25 %	75 %	378715587
101	NC_016906	CATC	2	8	39449	39456	25 %	25 %	0 %	50 %	378715587
102	NC_016906	GGAG	2	8	39528	39535	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016906	GACG	2	8	39822	39829	25 %	0 %	50 %	25 %	378715588
104	NC_016906	GAGC	2	8	42020	42027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016906	CGCC	2	8	42159	42166	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_016906	CGGA	2	8	43276	43283	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016906	ACCG	2	8	43369	43376	25 %	0 %	25 %	50 %	378715591
108	NC_016906	GAAC	2	8	43468	43475	50 %	0 %	25 %	25 %	378715591
109	NC_016906	ACCG	2	8	44396	44403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016906	CGCC	2	8	45070	45077	0 %	0 %	25 %	75 %	378715593
111	NC_016906	CGGT	2	8	45148	45155	0 %	25 %	50 %	25 %	378715593
112	NC_016906	GCCC	2	8	45439	45446	0 %	0 %	25 %	75 %	378715594
113	NC_016906	GGCC	2	8	45610	45617	0 %	0 %	50 %	50 %	378715594
114	NC_016906	GCGG	2	8	45701	45708	0 %	0 %	75 %	25 %	378715594
115	NC_016906	TCGC	2	8	45786	45793	0 %	25 %	25 %	50 %	378715594
116	NC_016906	GCGG	2	8	45853	45860	0 %	0 %	75 %	25 %	378715594
117	NC_016906	CCGG	2	8	45901	45908	0 %	0 %	50 %	50 %	378715594
118	NC_016906	CCGT	2	8	45969	45976	0 %	25 %	25 %	50 %	378715594
119	NC_016906	CGGC	2	8	46236	46243	0 %	0 %	50 %	50 %	378715594
120	NC_016906	CGGC	2	8	46556	46563	0 %	0 %	50 %	50 %	378715595
121	NC_016906	GGCC	2	8	47471	47478	0 %	0 %	50 %	50 %	378715595
122	NC_016906	ATCG	2	8	47523	47530	25 %	25 %	25 %	25 %	378715595
123	NC_016906	GCGA	2	8	47578	47585	25 %	0 %	50 %	25 %	378715595
124	NC_016906	CGCC	2	8	47838	47845	0 %	0 %	25 %	75 %	378715595
125	NC_016906	TGCG	2	8	48520	48527	0 %	25 %	50 %	25 %	378715596
126	NC_016906	GCCC	2	8	49216	49223	0 %	0 %	25 %	75 %	378715597
127	NC_016906	CGGC	2	8	49594	49601	0 %	0 %	50 %	50 %	378715597
128	NC_016906	CTCG	2	8	49972	49979	0 %	25 %	25 %	50 %	378715597
129	NC_016906	GTTC	2	8	50554	50561	0 %	50 %	25 %	25 %	378715598
130	NC_016906	CCGG	2	8	51188	51195	0 %	0 %	50 %	50 %	378715598
131	NC_016906	CGGC	2	8	51402	51409	0 %	0 %	50 %	50 %	378715598
132	NC_016906	TGAC	2	8	51955	51962	25 %	25 %	25 %	25 %	378715599
133	NC_016906	CGGT	2	8	52117	52124	0 %	25 %	50 %	25 %	378715599
134	NC_016906	GTGG	2	8	52322	52329	0 %	25 %	75 %	0 %	378715599
135	NC_016906	CGGC	2	8	52709	52716	0 %	0 %	50 %	50 %	378715599
136	NC_016906	GACC	2	8	53752	53759	25 %	0 %	25 %	50 %	378715600
137	NC_016906	CCGG	2	8	53834	53841	0 %	0 %	50 %	50 %	378715600
138	NC_016906	GGAG	2	8	53932	53939	25 %	0 %	75 %	0 %	378715600
139	NC_016906	CCGG	2	8	54355	54362	0 %	0 %	50 %	50 %	378715601
140	NC_016906	CCTC	2	8	54767	54774	0 %	25 %	0 %	75 %	378715601
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