MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 149899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016906	TGC	2	6	36465	36470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1002	NC_016906	CTG	2	6	36485	36490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1003	NC_016906	CGCAG	2	10	36499	36508	20 %	0 %	40 %	40 %	378715586
1004	NC_016906	CCG	2	6	36534	36539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715586
1005	NC_016906	GTG	2	6	36593	36598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715586
1006	NC_016906	CGG	2	6	36643	36648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715586
1007	NC_016906	GCG	2	6	36673	36678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715586
1008	NC_016906	CTC	2	6	36707	36712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715586
1009	NC_016906	CGGC	2	8	36728	36735	0 %	0 %	50 %	50 %	378715586
1010	NC_016906	CGA	2	6	36738	36743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1011	NC_016906	ACG	2	6	36783	36788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1012	NC_016906	TCA	2	6	36822	36827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715586
1013	NC_016906	ACC	2	6	36842	36847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715586
1014	NC_016906	TCG	2	6	36852	36857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1015	NC_016906	CGA	2	6	36879	36884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1016	NC_016906	CGG	2	6	36918	36923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715586
1017	NC_016906	GCC	2	6	36950	36955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715586
1018	NC_016906	CG	3	6	36977	36982	0 %	0 %	50 %	50 %	378715586
1019	NC_016906	GTG	2	6	36992	36997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715586
1020	NC_016906	CAG	2	6	37001	37006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1021	NC_016906	GCA	2	6	37023	37028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1022	NC_016906	CGC	2	6	37042	37047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715586
1023	NC_016906	CGA	2	6	37105	37110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1024	NC_016906	CGG	2	6	37143	37148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715586
1025	NC_016906	GAGG	2	8	37154	37161	25 %	0 %	75 %	0 %	378715586
1026	NC_016906	TC	3	6	37168	37173	0 %	50 %	0 %	50 %	378715586
1027	NC_016906	CGG	2	6	37174	37179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715586
1028	NC_016906	TGC	2	6	37230	37235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1029	NC_016906	CGA	2	6	37240	37245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1030	NC_016906	ACA	2	6	37263	37268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715586
1031	NC_016906	GC	3	6	37276	37281	0 %	0 %	50 %	50 %	378715586
1032	NC_016906	TCG	2	6	37284	37289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1033	NC_016906	TCG	2	6	37329	37334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1034	NC_016906	CCG	2	6	37354	37359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715586
1035	NC_016906	TCG	2	6	37395	37400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1036	NC_016906	CGA	2	6	37414	37419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715586
1037	NC_016906	CGC	2	6	37426	37431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715586
1038	NC_016906	CGC	2	6	37468	37473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715586
1039	NC_016906	GCGG	2	8	37496	37503	0 %	0 %	75 %	25 %	378715586
1040	NC_016906	GC	3	6	37519	37524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_016906	TCCGC	2	10	37533	37542	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1042	NC_016906	CGA	2	6	37554	37559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_016906	CGAT	2	8	37577	37584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_016906	TCG	2	6	37631	37636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_016906	GCC	2	6	37661	37666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_016906	TGA	2	6	37726	37731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016906	TCC	2	6	37732	37737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_016906	CCA	2	6	37754	37759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_016906	CCG	2	6	37856	37861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_016906	ACC	2	6	37897	37902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_016906	CCG	2	6	37946	37951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_016906	TCGG	2	8	38044	38051	0 %	25 %	50 %	25 %	378715587
1053	NC_016906	TCG	2	6	38197	38202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715587
1054	NC_016906	CGC	2	6	38213	38218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715587
1055	NC_016906	CGA	2	6	38237	38242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715587
1056	NC_016906	CGT	2	6	38243	38248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715587
1057	NC_016906	GTC	2	6	38277	38282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715587
1058	NC_016906	CCGC	2	8	38317	38324	0 %	0 %	25 %	75 %	378715587
1059	NC_016906	GCC	2	6	38325	38330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715587
1060	NC_016906	CGC	2	6	38333	38338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715587
1061	NC_016906	ACC	2	6	38389	38394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715587
1062	NC_016906	TCG	2	6	38422	38427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715587
1063	NC_016906	CAC	2	6	38432	38437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715587
1064	NC_016906	ACGC	2	8	38449	38456	25 %	0 %	25 %	50 %	378715587
1065	NC_016906	TCG	2	6	38467	38472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715587
1066	NC_016906	CGGG	2	8	38480	38487	0 %	0 %	75 %	25 %	378715587
1067	NC_016906	CCG	2	6	38517	38522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715587
1068	NC_016906	CGA	2	6	38579	38584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715587
1069	NC_016906	GAC	2	6	38642	38647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715587
1070	NC_016906	CCGGCG	2	12	38685	38696	0 %	0 %	50 %	50 %	378715587
1071	NC_016906	ACT	2	6	38701	38706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715587
1072	NC_016906	AGC	2	6	38734	38739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715587
1073	NC_016906	TCG	2	6	38755	38760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715587
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1075	NC_016906	CCA	2	6	38876	38881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715587
1076	NC_016906	CCG	2	6	38893	38898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715587
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1078	NC_016906	CG	4	8	38932	38939	0 %	0 %	50 %	50 %	378715587
1079	NC_016906	CGG	2	6	38968	38973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715587
1080	NC_016906	ACG	2	6	39013	39018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715587
1081	NC_016906	ACC	2	6	39036	39041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715587
1082	NC_016906	GCG	2	6	39059	39064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715587
1083	NC_016906	GC	3	6	39119	39124	0 %	0 %	50 %	50 %	378715587
1084	NC_016906	CGG	2	6	39245	39250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715587
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1086	NC_016906	CGA	2	6	39278	39283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715587
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1088	NC_016906	GCC	2	6	39291	39296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715587
1089	NC_016906	CGA	2	6	39392	39397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715587
1090	NC_016906	TGC	2	6	39412	39417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715587
1091	NC_016906	CTG	2	6	39435	39440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715587
1092	NC_016906	CATC	2	8	39449	39456	25 %	25 %	0 %	50 %	378715587
1093	NC_016906	CAC	2	6	39489	39494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_016906	CA	4	8	39515	39522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_016906	GGAG	2	8	39528	39535	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016906	TCT	2	6	39545	39550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715588
1097	NC_016906	CGT	2	6	39605	39610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715588
1098	NC_016906	TCG	2	6	39619	39624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715588
1099	NC_016906	CCA	2	6	39631	39636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715588
1100	NC_016906	CGA	2	6	39650	39655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715588
1101	NC_016906	GC	3	6	39687	39692	0 %	0 %	50 %	50 %	378715588
1102	NC_016906	GTC	2	6	39747	39752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715588
1103	NC_016906	GACG	2	8	39822	39829	25 %	0 %	50 %	25 %	378715588
1104	NC_016906	CGT	2	6	39856	39861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715588
1105	NC_016906	TCG	2	6	39934	39939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715588
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1108	NC_016906	CGA	2	6	40235	40240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715588
1109	NC_016906	CTG	2	6	40277	40282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715588
1110	NC_016906	CGA	2	6	40307	40312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715588
1111	NC_016906	CGG	3	9	40330	40338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715588
1112	NC_016906	CG	3	6	40376	40381	0 %	0 %	50 %	50 %	378715588
1113	NC_016906	AGA	2	6	40429	40434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715588
1114	NC_016906	CCG	2	6	40435	40440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715588
1115	NC_016906	CCA	2	6	40453	40458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715588
1116	NC_016906	TG	3	6	40530	40535	0 %	50 %	50 %	0 %	378715588
1117	NC_016906	C	7	7	40688	40694	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1118	NC_016906	CGC	2	6	40706	40711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_016906	ATC	2	6	40723	40728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_016906	GGA	2	6	40730	40735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016906	GAA	2	6	40837	40842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715589
1122	NC_016906	CG	3	6	40844	40849	0 %	0 %	50 %	50 %	378715589
1123	NC_016906	GC	3	6	40893	40898	0 %	0 %	50 %	50 %	378715589
1124	NC_016906	GCC	2	6	40903	40908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715589
1125	NC_016906	ATC	2	6	40987	40992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715589
1126	NC_016906	TCG	2	6	41062	41067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715589
1127	NC_016906	CA	3	6	41114	41119	50 %	0 %	0 %	50 %	378715589
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1251	NC_016906	CGC	2	6	45863	45868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715594
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1253	NC_016906	CGC	2	6	45913	45918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715594
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