MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Glaciecola nitratireducens FR1064 chromosome

Total Repeats: 80725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016041	ATTCA	2	10	259895	259904	40 %	40 %	0 %	20 %	348027689
5002	NC_016041	ATTAA	2	10	259914	259923	60 %	40 %	0 %	0 %	348027689
5003	NC_016041	CATA	2	8	259981	259988	50 %	25 %	0 %	25 %	348027689
5004	NC_016041	GTT	2	6	259994	259999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027689
5005	NC_016041	GAA	2	6	260035	260040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027689
5006	NC_016041	ACA	2	6	260057	260062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027689
5007	NC_016041	A	6	6	260070	260075	100 %	0 %	0 %	0 %	348027689
5008	NC_016041	GT	4	8	260204	260211	0 %	50 %	50 %	0 %	348027689
5009	NC_016041	TTG	2	6	260213	260218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027689
5010	NC_016041	AAG	2	6	260352	260357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027689
5011	NC_016041	CAA	2	6	260468	260473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027689
5012	NC_016041	TGA	2	6	260491	260496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027689
5013	NC_016041	A	8	8	260567	260574	100 %	0 %	0 %	0 %	348027689
5014	NC_016041	CAA	2	6	260590	260595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027689
5015	NC_016041	AGT	2	6	260608	260613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027689
5016	NC_016041	TTC	2	6	260624	260629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027689
5017	NC_016041	GAA	2	6	260663	260668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027689
5018	NC_016041	ATAA	2	8	260700	260707	75 %	25 %	0 %	0 %	348027689
5019	NC_016041	ATA	2	6	260716	260721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027689
5020	NC_016041	AGTTT	2	10	260778	260787	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_016041	GTT	2	6	260823	260828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_016041	TTGA	2	8	261005	261012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_016041	ATT	2	6	261020	261025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_016041	AAAT	2	8	261056	261063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_016041	AT	3	6	261062	261067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_016041	ATC	2	6	261109	261114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_016041	CTGAA	2	10	261235	261244	40 %	20 %	20 %	20 %	348027690
5028	NC_016041	AGTG	2	8	261245	261252	25 %	25 %	50 %	0 %	348027690
5029	NC_016041	TAG	2	6	261316	261321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027690
5030	NC_016041	TGA	2	6	261332	261337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027690
5031	NC_016041	TAA	2	6	261508	261513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_016041	A	6	6	261512	261517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_016041	CCG	2	6	261623	261628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348027691
5034	NC_016041	ACC	2	6	261658	261663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348027691
5035	NC_016041	TGC	2	6	261805	261810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027691
5036	NC_016041	CAT	2	6	261909	261914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027691
5037	NC_016041	ATT	2	6	261964	261969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027691
5038	NC_016041	AAG	2	6	262001	262006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027691
5039	NC_016041	T	6	6	262057	262062	0 %	100 %	0 %	0 %	348027691
5040	NC_016041	CTG	2	6	262092	262097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027691
5041	NC_016041	TCA	2	6	262118	262123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027691
5042	NC_016041	TGC	2	6	262137	262142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027691
5043	NC_016041	AGTAA	2	10	262180	262189	60 %	20 %	20 %	0 %	348027691
5044	NC_016041	CGC	2	6	262201	262206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	348027691
5045	NC_016041	CTG	2	6	262243	262248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027691
5046	NC_016041	CCA	2	6	262332	262337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348027691
5047	NC_016041	TGC	2	6	262350	262355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027691
5048	NC_016041	ATAA	2	8	262392	262399	75 %	25 %	0 %	0 %	348027691
5049	NC_016041	CCA	2	6	262424	262429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348027691
5050	NC_016041	CG	3	6	262563	262568	0 %	0 %	50 %	50 %	348027691
5051	NC_016041	ATG	2	6	262610	262615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027691
5052	NC_016041	CTG	2	6	262686	262691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027691
5053	NC_016041	CTG	2	6	262728	262733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027691
5054	NC_016041	AACG	2	8	262734	262741	50 %	0 %	25 %	25 %	348027691
5055	NC_016041	TAC	2	6	262750	262755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027691
5056	NC_016041	TA	3	6	262824	262829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_016041	TGA	2	6	262895	262900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_016041	T	6	6	262937	262942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_016041	T	6	6	263028	263033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_016041	GT	3	6	263096	263101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_016041	TGA	2	6	263186	263191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027692
5062	NC_016041	ACG	2	6	263192	263197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027692
5063	NC_016041	TGC	2	6	263264	263269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027692
5064	NC_016041	GCA	2	6	263295	263300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027692
5065	NC_016041	TTG	2	6	263339	263344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027692
5066	NC_016041	ACT	2	6	263358	263363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_016041	GC	3	6	263371	263376	0 %	0 %	50 %	50 %	348027693
5068	NC_016041	GAC	2	6	263572	263577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027693
5069	NC_016041	GTC	2	6	263602	263607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027693
5070	NC_016041	CTG	2	6	263621	263626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027693
5071	NC_016041	CGA	2	6	263706	263711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027693
5072	NC_016041	ATA	2	6	263752	263757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027693
5073	NC_016041	CAA	2	6	263856	263861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027694
5074	NC_016041	AG	3	6	263882	263887	50 %	0 %	50 %	0 %	348027694
5075	NC_016041	GCTC	2	8	263965	263972	0 %	25 %	25 %	50 %	348027694
5076	NC_016041	TTCA	2	8	263981	263988	25 %	50 %	0 %	25 %	348027694
5077	NC_016041	GTC	2	6	263989	263994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027694
5078	NC_016041	AG	3	6	264005	264010	50 %	0 %	50 %	0 %	348027694
5079	NC_016041	AGA	2	6	264083	264088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027694
5080	NC_016041	TGA	2	6	264124	264129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027694
5081	NC_016041	GCGT	2	8	264229	264236	0 %	25 %	50 %	25 %	348027694
5082	NC_016041	TAT	2	6	264260	264265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027694
5083	NC_016041	TGG	2	6	264275	264280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027694
5084	NC_016041	AATC	2	8	264351	264358	50 %	25 %	0 %	25 %	348027694
5085	NC_016041	GAA	2	6	264387	264392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027694
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5087	NC_016041	GGA	2	6	264443	264448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	348027694
5088	NC_016041	TGA	2	6	264451	264456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027694
5089	NC_016041	CTG	2	6	264468	264473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027694
5090	NC_016041	ATA	2	6	264478	264483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027694
5091	NC_016041	TTG	2	6	264493	264498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027694
5092	NC_016041	CGAG	2	8	264509	264516	25 %	0 %	50 %	25 %	348027694
5093	NC_016041	TGA	2	6	264558	264563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027694
5094	NC_016041	ATG	2	6	264574	264579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027695
5095	NC_016041	ATT	2	6	264634	264639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027695
5096	NC_016041	GAT	2	6	264741	264746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027695
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5098	NC_016041	TTGG	2	8	264854	264861	0 %	50 %	50 %	0 %	348027695
5099	NC_016041	GTT	2	6	264876	264881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027695
5100	NC_016041	GAT	2	6	264927	264932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027695
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5104	NC_016041	TTGG	2	8	265374	265381	0 %	50 %	50 %	0 %	348027695
5105	NC_016041	CA	3	6	265400	265405	50 %	0 %	0 %	50 %	348027695
5106	NC_016041	ATT	2	6	265476	265481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027695
5107	NC_016041	GGT	2	6	265512	265517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027695
5108	NC_016041	TTG	2	6	265526	265531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027695
5109	NC_016041	GGT	2	6	265608	265613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_016041	TCG	2	6	265692	265697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_016041	ACT	2	6	265701	265706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_016041	A	6	6	265791	265796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_016041	TCA	2	6	265804	265809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027696
5114	NC_016041	CA	3	6	265815	265820	50 %	0 %	0 %	50 %	348027696
5115	NC_016041	GGAT	2	8	265977	265984	25 %	25 %	50 %	0 %	348027696
5116	NC_016041	TTA	2	6	266287	266292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027696
5117	NC_016041	AGA	2	6	266382	266387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027696
5118	NC_016041	TA	3	6	266445	266450	50 %	50 %	0 %	0 %	348027696
5119	NC_016041	GT	3	6	266477	266482	0 %	50 %	50 %	0 %	348027696
5120	NC_016041	GTG	2	6	266497	266502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	348027696
5121	NC_016041	ATG	2	6	266580	266585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027696
5122	NC_016041	AG	3	6	266591	266596	50 %	0 %	50 %	0 %	348027696
5123	NC_016041	GGC	2	6	266628	266633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	348027696
5124	NC_016041	CTA	2	6	266816	266821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027697
5125	NC_016041	ATACTG	2	12	266874	266885	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	348027697
5126	NC_016041	ATGT	2	8	266936	266943	25 %	50 %	25 %	0 %	348027697
5127	NC_016041	AGC	2	6	267015	267020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027697
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5129	NC_016041	CAA	2	6	267167	267172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	348027697
5130	NC_016041	ATG	2	6	267181	267186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027697
5131	NC_016041	GAT	2	6	267189	267194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027697
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5134	NC_016041	TAA	2	6	267261	267266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027698
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5144	NC_016041	TTC	2	6	267763	267768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027698
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5146	NC_016041	TGT	2	6	267921	267926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027698
5147	NC_016041	CTT	2	6	268029	268034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027698
5148	NC_016041	TGC	2	6	268098	268103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027698
5149	NC_016041	AAG	2	6	268109	268114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027698
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5151	NC_016041	TAC	2	6	268178	268183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5152	NC_016041	ACG	2	6	268207	268212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5153	NC_016041	TAC	3	9	268253	268261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5154	NC_016041	TGA	2	6	268276	268281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5156	NC_016041	GTC	2	6	268344	268349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027699
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5161	NC_016041	CGAA	2	8	268671	268678	50 %	0 %	25 %	25 %	348027699
5162	NC_016041	AGGA	2	8	268732	268739	50 %	0 %	50 %	0 %	348027699
5163	NC_016041	TGCC	2	8	268763	268770	0 %	25 %	25 %	50 %	348027699
5164	NC_016041	GTTTG	2	10	268786	268795	0 %	60 %	40 %	0 %	348027699
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5188	NC_016041	ATC	2	6	269875	269880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027700
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5192	NC_016041	GCT	2	6	270372	270377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027700
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5196	NC_016041	T	6	6	270716	270721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5197	NC_016041	ATT	2	6	270773	270778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	348027701
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5202	NC_016041	TAA	2	6	270963	270968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027701
5203	NC_016041	GT	3	6	271014	271019	0 %	50 %	50 %	0 %	348027701
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5218	NC_016041	ACT	2	6	271924	271929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5232	NC_016041	CTT	2	6	272596	272601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027702
5233	NC_016041	ATAA	2	8	272604	272611	75 %	25 %	0 %	0 %	348027702
5234	NC_016041	GAA	2	6	272644	272649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027702
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5240	NC_016041	TAG	2	6	273011	273016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027702
5241	NC_016041	ATA	2	6	273041	273046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027702
5242	NC_016041	TCT	2	6	273057	273062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027702
5243	NC_016041	TCA	2	6	273088	273093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027702
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5245	NC_016041	CGT	2	6	273155	273160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027702
5246	NC_016041	TA	3	6	273184	273189	50 %	50 %	0 %	0 %	348027702
5247	NC_016041	GT	3	6	273208	273213	0 %	50 %	50 %	0 %	348027702
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5251	NC_016041	CG	3	6	273325	273330	0 %	0 %	50 %	50 %	348027702
5252	NC_016041	AAT	2	6	273331	273336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	348027702
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5259	NC_016041	AAT	2	6	273902	273907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_016041	T	6	6	273985	273990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5268	NC_016041	TA	4	8	274409	274416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5275	NC_016041	T	6	6	274792	274797	0 %	100 %	0 %	0 %	348027704
5276	NC_016041	TCA	2	6	274832	274837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	348027704
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5370	NC_016041	GCT	2	6	280052	280057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	348027708
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5394	NC_016041	TAATT	2	10	281255	281264	40 %	60 %	0 %	0 %	348027708
5395	NC_016041	ATG	2	6	281343	281348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	348027708
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5397	NC_016041	GCA	2	6	281500	281505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027709
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5399	NC_016041	AT	3	6	281651	281656	50 %	50 %	0 %	0 %	348027709
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5402	NC_016041	AGC	2	6	281731	281736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027709
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5413	NC_016041	ATT	3	9	282132	282140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5414	NC_016041	T	7	7	282211	282217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5479	NC_016041	TGT	2	6	286216	286221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027713
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5482	NC_016041	GCGTT	2	10	286286	286295	0 %	40 %	40 %	20 %	348027713
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5486	NC_016041	ATTTT	2	10	286487	286496	20 %	80 %	0 %	0 %	348027713
5487	NC_016041	CCA	2	6	286532	286537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	348027713
5488	NC_016041	TTAT	2	8	286677	286684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5489	NC_016041	CTTT	2	8	286721	286728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5490	NC_016041	TAA	2	6	286784	286789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5491	NC_016041	AG	4	8	286867	286874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5492	NC_016041	A	7	7	286902	286908	100 %	0 %	0 %	0 %	348027714
5493	NC_016041	GAA	2	6	286981	286986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	348027714
5494	NC_016041	TATT	2	8	287055	287062	25 %	75 %	0 %	0 %	348027714
5495	NC_016041	A	6	6	287115	287120	100 %	0 %	0 %	0 %	348027715
5496	NC_016041	TTC	2	6	287121	287126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	348027715
5497	NC_016041	TTG	2	6	287127	287132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	348027715
5498	NC_016041	TCAA	2	8	287163	287170	50 %	25 %	0 %	25 %	348027715
5499	NC_016041	AGC	3	9	287271	287279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	348027715
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