MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY010

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016037	GACTTC	2	12	740	751	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347822693
2	NC_016037	GATGGC	2	12	6310	6321	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347822696
3	NC_016037	GAACTG	2	12	7360	7371	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347822696
4	NC_016037	GATGAA	2	12	15067	15078	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016037	AGAAAC	2	12	17162	17173	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016037	GTTCAT	2	12	22990	23001	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347822711
7	NC_016037	GTTCTG	2	12	23576	23587	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	347822713
8	NC_016037	GGAAAG	2	12	26201	26212	50 %	0 %	50 %	0 %	347822715
9	NC_016037	ACTTCG	2	12	32538	32549	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347822723
10	NC_016037	GATGCC	2	12	38759	38770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347822730
11	NC_016037	ATGCCG	2	12	45027	45038	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347822736
12	NC_016037	ATTGAG	2	12	56360	56371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347822746
13	NC_016037	GAGATG	3	18	57455	57472	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347822747
14	NC_016037	ATTGGA	2	12	63739	63750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347822755
15	NC_016037	AGGATA	2	12	67697	67708	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347822761
16	NC_016037	CCGGCT	2	12	71242	71253	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	347822763
17	NC_016037	GGGTCA	2	12	72648	72659	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347822764
18	NC_016037	GCGAGA	2	12	75525	75536	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347822768
19	NC_016037	CGATTT	2	12	75675	75686	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347822769
20	NC_016037	CCTGAT	2	12	78908	78919	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347822771
21	NC_016037	TCAGGC	2	12	81147	81158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347822774
22	NC_016037	TTCTGT	2	12	86103	86114	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	347822779
23	NC_016037	CAATAC	2	12	92636	92647	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	347822786
24	NC_016037	GGGGCA	2	12	95374	95385	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	347822789
25	NC_016037	GGCCAC	2	12	96531	96542	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347822790
26	NC_016037	TGCTGG	2	12	98019	98030	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	347822792
27	NC_016037	AACGGC	2	12	105387	105398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347822797
28	NC_016037	TTTCTG	2	12	105924	105935	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	347822797
29	NC_016037	CATGCG	2	12	110361	110372	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347822803
30	NC_016037	CTGTTT	4	24	113196	113219	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	347822806
31	NC_016037	CAGCCA	2	12	114044	114055	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	347822807
32	NC_016037	CCAGCA	2	12	119795	119806	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	347822811
33	NC_016037	TCCATA	2	12	122029	122040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347822814
34	NC_016037	TGGCCA	2	12	122279	122290	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016037	CCGGTT	2	12	126273	126284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347822820
36	NC_016037	CTGGCC	2	12	127028	127039	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	347822821
37	NC_016037	CGCCTG	2	12	127049	127060	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	347822821
38	NC_016037	CTGGCC	2	12	127517	127528	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	347822821
39	NC_016037	CGATGT	2	12	130234	130245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347822825
40	NC_016037	GTAGAT	2	12	133692	133703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347822827
41	NC_016037	CCGGAT	2	12	137861	137872	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347822832
42	NC_016037	GGGCAT	2	12	138109	138120	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016037	GGCCAC	2	12	139327	139338	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347822834
44	NC_016037	GCAGGC	2	12	142238	142249	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347822836
45	NC_016037	ATTGAA	2	12	143529	143540	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347822838
46	NC_016037	ACCCAC	2	12	143874	143885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347822838
47	NC_016037	AACCGG	2	12	143924	143935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347822838
48	NC_016037	GCGGTT	2	12	144315	144326	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	347822838
49	NC_016037	GCCAAG	2	12	144336	144347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347822838
50	NC_016037	GGACTT	2	12	147829	147840	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347822840
51	NC_016037	GCACAG	2	12	150900	150911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347822844
52	NC_016037	CTGGGT	2	12	154967	154978	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	347822846
53	NC_016037	CCCCAG	2	12	161202	161213	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	347822851
54	NC_016037	GGCGCG	2	12	163958	163969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347822852
55	NC_016037	CAGGAA	2	12	167170	167181	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347822855
56	NC_016037	ACGGGC	2	12	168406	168417	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347822855
57	NC_016037	AAGGAT	2	12	169318	169329	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347822855
58	NC_016037	GAACGA	2	12	169456	169467	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347822855
59	NC_016037	TGATTA	2	12	169736	169747	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347822855
60	NC_016037	GGCAAG	2	12	170560	170571	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347822855
61	NC_016037	CAAACG	2	12	172271	172282	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	347822857
62	NC_016037	CCCCGG	2	12	175265	175276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347822860
63	NC_016037	CCCTGC	2	12	176148	176159	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	347822861
64	NC_016037	AATCAC	2	12	183956	183967	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	347822866
65	NC_016037	GCAGGC	2	12	195038	195049	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347822878
66	NC_016037	CCCTGC	2	12	195154	195165	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	347822878
67	NC_016037	GGAAAG	2	12	201775	201786	50 %	0 %	50 %	0 %	347822883
68	NC_016037	TCGGCT	2	12	203813	203824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347822884
69	NC_016037	ATGGCG	2	12	203996	204007	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347822884
70	NC_016037	AGATCA	2	12	204884	204895	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347822885
71	NC_016037	GCCATC	2	12	207927	207938	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	347822888
72	NC_016037	GCCAGA	2	12	208868	208879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347822890
73	NC_016037	CGCTTG	2	12	209887	209898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347822891
74	NC_016037	GCCGTA	2	12	210861	210872	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347822892
75	NC_016037	GGCGCA	2	12	211866	211877	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347822894
76	NC_016037	CTTCCT	2	12	214177	214188	0 %	50 %	0 %	50 %	347822895
77	NC_016037	TGGCTG	4	24	215170	215193	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	347822896
78	NC_016037	ATGGCG	2	12	215772	215783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347822897
79	NC_016037	CCTGCC	2	12	215897	215908	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	347822897
80	NC_016037	ACCGCC	2	12	216496	216507	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	347822898
81	NC_016037	GCCCAG	2	12	218542	218553	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347822899
82	NC_016037	AGCATG	2	12	218567	218578	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347822899
83	NC_016037	CTTCCT	2	12	220558	220569	0 %	50 %	0 %	50 %	347822900
84	NC_016037	GGTCGG	2	12	220773	220784	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	347822901
85	NC_016037	GCATAA	2	12	225155	225166	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347822908
86	NC_016037	GATGCC	2	12	226687	226698	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347822910
87	NC_016037	GTATGA	2	12	229983	229994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347822914
88	NC_016037	CGTTTG	2	12	233553	233564	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	347822917
89	NC_016037	TGACGC	2	12	234324	234335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347822918
90	NC_016037	GCGTCA	2	12	236680	236691	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016037	CTGTAG	2	12	236916	236927	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347822924
92	NC_016037	GAGGAA	2	12	238012	238023	50 %	0 %	50 %	0 %	347822926
93	NC_016037	CTTCCT	2	12	245150	245161	0 %	50 %	0 %	50 %	347822931
94	NC_016037	CTTCCT	2	12	249314	249325	0 %	50 %	0 %	50 %	347822936
95	NC_016037	TCGATC	2	12	250703	250714	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347822938
96	NC_016037	GTCTCG	2	12	253331	253342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016037	GGGCCG	2	12	254587	254598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347822943
98	NC_016037	ATCAAC	2	12	255797	255808	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016037	GTTGAT	2	12	255816	255827	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.