MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY020

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016021	AG	3	6	23	28	50 %	0 %	50 %	0 %	347626459
2	NC_016021	CG	4	8	96	103	0 %	0 %	50 %	50 %	347626459
3	NC_016021	GA	3	6	1618	1623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016021	AC	3	6	2337	2342	50 %	0 %	0 %	50 %	347626460
5	NC_016021	GC	3	6	3795	3800	0 %	0 %	50 %	50 %	347626461
6	NC_016021	CA	3	6	4636	4641	50 %	0 %	0 %	50 %	347626462
7	NC_016021	GA	3	6	5017	5022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016021	TC	3	6	5511	5516	0 %	50 %	0 %	50 %	347626463
9	NC_016021	CT	3	6	6517	6522	0 %	50 %	0 %	50 %	347626463
10	NC_016021	TC	3	6	7580	7585	0 %	50 %	0 %	50 %	347626464
11	NC_016021	AG	3	6	7923	7928	50 %	0 %	50 %	0 %	347626464
12	NC_016021	CT	4	8	8127	8134	0 %	50 %	0 %	50 %	347626464
13	NC_016021	TC	3	6	9189	9194	0 %	50 %	0 %	50 %	347626465
14	NC_016021	CT	3	6	9677	9682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016021	GC	4	8	9895	9902	0 %	0 %	50 %	50 %	347626466
16	NC_016021	GC	3	6	10156	10161	0 %	0 %	50 %	50 %	347626466
17	NC_016021	TC	3	6	10180	10185	0 %	50 %	0 %	50 %	347626466
18	NC_016021	AG	3	6	10204	10209	50 %	0 %	50 %	0 %	347626466
19	NC_016021	CT	3	6	10535	10540	0 %	50 %	0 %	50 %	347626467
20	NC_016021	CT	3	6	11455	11460	0 %	50 %	0 %	50 %	347626468
21	NC_016021	GC	5	10	11924	11933	0 %	0 %	50 %	50 %	347626468
22	NC_016021	TG	3	6	12032	12037	0 %	50 %	50 %	0 %	347626468
23	NC_016021	CG	4	8	12478	12485	0 %	0 %	50 %	50 %	347626468
24	NC_016021	GT	3	6	12658	12663	0 %	50 %	50 %	0 %	347626469
25	NC_016021	GT	3	6	12801	12806	0 %	50 %	50 %	0 %	347626469
26	NC_016021	GT	3	6	13010	13015	0 %	50 %	50 %	0 %	347626469
27	NC_016021	GC	3	6	13527	13532	0 %	0 %	50 %	50 %	347626469
28	NC_016021	GC	3	6	14630	14635	0 %	0 %	50 %	50 %	347626470
29	NC_016021	AC	3	6	14813	14818	50 %	0 %	0 %	50 %	347626470
30	NC_016021	CG	3	6	15206	15211	0 %	0 %	50 %	50 %	347626470
31	NC_016021	GC	4	8	15975	15982	0 %	0 %	50 %	50 %	347626472
32	NC_016021	AT	3	6	16386	16391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016021	AT	3	6	16404	16409	50 %	50 %	0 %	0 %	347626473
34	NC_016021	GC	3	6	16703	16708	0 %	0 %	50 %	50 %	347626473
35	NC_016021	CG	3	6	18555	18560	0 %	0 %	50 %	50 %	347626476
36	NC_016021	GC	3	6	19470	19475	0 %	0 %	50 %	50 %	347626477
37	NC_016021	GC	3	6	19922	19927	0 %	0 %	50 %	50 %	347626477
38	NC_016021	CT	3	6	20058	20063	0 %	50 %	0 %	50 %	347626477
39	NC_016021	CG	3	6	20210	20215	0 %	0 %	50 %	50 %	347626477
40	NC_016021	CT	3	6	20290	20295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016021	GC	3	6	21617	21622	0 %	0 %	50 %	50 %	347626479
42	NC_016021	AC	3	6	22014	22019	50 %	0 %	0 %	50 %	347626479
43	NC_016021	GC	3	6	22471	22476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016021	TG	3	6	22600	22605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016021	GT	3	6	22963	22968	0 %	50 %	50 %	0 %	347626480
46	NC_016021	TG	3	6	23276	23281	0 %	50 %	50 %	0 %	347626480
47	NC_016021	AT	3	6	24870	24875	50 %	50 %	0 %	0 %	347626482
48	NC_016021	GC	3	6	26668	26673	0 %	0 %	50 %	50 %	347626485
49	NC_016021	GC	3	6	26846	26851	0 %	0 %	50 %	50 %	347626485
50	NC_016021	AG	3	6	27629	27634	50 %	0 %	50 %	0 %	347626485
51	NC_016021	GC	3	6	28199	28204	0 %	0 %	50 %	50 %	347626485
52	NC_016021	TC	3	6	28345	28350	0 %	50 %	0 %	50 %	347626485
53	NC_016021	TG	3	6	28602	28607	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016021	GC	3	6	29076	29081	0 %	0 %	50 %	50 %	347626486
55	NC_016021	GC	3	6	30884	30889	0 %	0 %	50 %	50 %	347626488
56	NC_016021	CG	3	6	31814	31819	0 %	0 %	50 %	50 %	347626489
57	NC_016021	GT	3	6	32841	32846	0 %	50 %	50 %	0 %	347626490
58	NC_016021	TG	3	6	33154	33159	0 %	50 %	50 %	0 %	347626490
59	NC_016021	GT	3	6	34175	34180	0 %	50 %	50 %	0 %	347626491
60	NC_016021	CA	3	6	35968	35973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016021	TG	3	6	36721	36726	0 %	50 %	50 %	0 %	347626493
62	NC_016021	GA	3	6	37415	37420	50 %	0 %	50 %	0 %	347626493
63	NC_016021	CG	3	6	38488	38493	0 %	0 %	50 %	50 %	347626494
64	NC_016021	CG	3	6	38826	38831	0 %	0 %	50 %	50 %	347626494
65	NC_016021	CG	3	6	39569	39574	0 %	0 %	50 %	50 %	347626494
66	NC_016021	CA	3	6	42167	42172	50 %	0 %	0 %	50 %	347626496
67	NC_016021	GC	3	6	42738	42743	0 %	0 %	50 %	50 %	347626496
68	NC_016021	CT	3	6	42909	42914	0 %	50 %	0 %	50 %	347626496
69	NC_016021	TC	3	6	43201	43206	0 %	50 %	0 %	50 %	347626496
70	NC_016021	CG	3	6	43648	43653	0 %	0 %	50 %	50 %	347626497
71	NC_016021	AT	3	6	44018	44023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016021	GC	3	6	44341	44346	0 %	0 %	50 %	50 %	347626498
73	NC_016021	GC	3	6	44404	44409	0 %	0 %	50 %	50 %	347626498
74	NC_016021	CG	3	6	45203	45208	0 %	0 %	50 %	50 %	347626499
75	NC_016021	GC	3	6	45877	45882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016021	CG	4	8	46030	46037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016021	CG	3	6	47227	47232	0 %	0 %	50 %	50 %	347626500
78	NC_016021	CG	3	6	47312	47317	0 %	0 %	50 %	50 %	347626500
79	NC_016021	AC	3	6	47388	47393	50 %	0 %	0 %	50 %	347626500
80	NC_016021	TA	3	6	47915	47920	50 %	50 %	0 %	0 %	347626500
81	NC_016021	TC	4	8	48052	48059	0 %	50 %	0 %	50 %	347626500
82	NC_016021	GC	3	6	48385	48390	0 %	0 %	50 %	50 %	347626500
83	NC_016021	TC	3	6	48719	48724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016021	GC	3	6	49163	49168	0 %	0 %	50 %	50 %	347626502
85	NC_016021	GA	3	6	49218	49223	50 %	0 %	50 %	0 %	347626502
86	NC_016021	CG	3	6	50066	50071	0 %	0 %	50 %	50 %	347626502
87	NC_016021	GC	3	6	50779	50784	0 %	0 %	50 %	50 %	347626502
88	NC_016021	GC	3	6	50842	50847	0 %	0 %	50 %	50 %	347626502
89	NC_016021	CG	3	6	50869	50874	0 %	0 %	50 %	50 %	347626502
90	NC_016021	CT	3	6	50933	50938	0 %	50 %	0 %	50 %	347626502
91	NC_016021	GC	3	6	51111	51116	0 %	0 %	50 %	50 %	347626502
92	NC_016021	CG	3	6	51387	51392	0 %	0 %	50 %	50 %	347626502
93	NC_016021	AC	3	6	52015	52020	50 %	0 %	0 %	50 %	347626502
94	NC_016021	GC	3	6	53656	53661	0 %	0 %	50 %	50 %	347626504
95	NC_016021	GC	3	6	53703	53708	0 %	0 %	50 %	50 %	347626504
96	NC_016021	CG	3	6	54644	54649	0 %	0 %	50 %	50 %	347626505
97	NC_016021	CG	3	6	54691	54696	0 %	0 %	50 %	50 %	347626505
98	NC_016021	CG	4	8	54827	54834	0 %	0 %	50 %	50 %	347626505
99	NC_016021	CG	4	8	55142	55149	0 %	0 %	50 %	50 %	347626506
100	NC_016021	GC	3	6	55828	55833	0 %	0 %	50 %	50 %	347626507
101	NC_016021	CG	3	6	55838	55843	0 %	0 %	50 %	50 %	347626507
102	NC_016021	GA	3	6	56410	56415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016021	GC	3	6	56559	56564	0 %	0 %	50 %	50 %	347626509
104	NC_016021	CG	3	6	56772	56777	0 %	0 %	50 %	50 %	347626509
105	NC_016021	GA	3	6	57364	57369	50 %	0 %	50 %	0 %	347626510
106	NC_016021	GA	3	6	57388	57393	50 %	0 %	50 %	0 %	347626510
107	NC_016021	GT	3	6	57592	57597	0 %	50 %	50 %	0 %	347626511
108	NC_016021	GC	3	6	57671	57676	0 %	0 %	50 %	50 %	347626511
109	NC_016021	CG	4	8	58712	58719	0 %	0 %	50 %	50 %	347626512
110	NC_016021	GC	3	6	59472	59477	0 %	0 %	50 %	50 %	347626514
111	NC_016021	AG	3	6	59642	59647	50 %	0 %	50 %	0 %	347626514
112	NC_016021	TA	3	6	59953	59958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016021	CA	3	6	60001	60006	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016021	AT	3	6	61775	61780	50 %	50 %	0 %	0 %	347626518
115	NC_016021	GA	3	6	61794	61799	50 %	0 %	50 %	0 %	347626518
116	NC_016021	GC	3	6	61932	61937	0 %	0 %	50 %	50 %	347626519
117	NC_016021	AT	3	6	63428	63433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016021	AG	3	6	63448	63453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016021	CT	3	6	63509	63514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016021	CG	3	6	63579	63584	0 %	0 %	50 %	50 %	347626522
121	NC_016021	CA	3	6	64185	64190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016021	GC	4	8	64802	64809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016021	CG	3	6	65596	65601	0 %	0 %	50 %	50 %	347626524
124	NC_016021	CG	3	6	65883	65888	0 %	0 %	50 %	50 %	347626524
125	NC_016021	TA	3	6	66165	66170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016021	GC	3	6	66611	66616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016021	GA	3	6	66949	66954	50 %	0 %	50 %	0 %	347626525
128	NC_016021	GC	5	10	67547	67556	0 %	0 %	50 %	50 %	347626526
129	NC_016021	CG	4	8	68079	68086	0 %	0 %	50 %	50 %	347626527
130	NC_016021	GC	3	6	69539	69544	0 %	0 %	50 %	50 %	347626530
131	NC_016021	GC	4	8	69546	69553	0 %	0 %	50 %	50 %	347626530
132	NC_016021	TC	3	6	70826	70831	0 %	50 %	0 %	50 %	347626531
133	NC_016021	GA	3	6	71084	71089	50 %	0 %	50 %	0 %	347626531
134	NC_016021	TA	3	6	71697	71702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016021	CA	3	6	71745	71750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016021	GC	5	10	72643	72652	0 %	0 %	50 %	50 %	347626533
137	NC_016021	CG	3	6	72799	72804	0 %	0 %	50 %	50 %	347626533
138	NC_016021	CG	3	6	73004	73009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016021	GC	3	6	73183	73188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016021	CA	3	6	73557	73562	50 %	0 %	0 %	50 %	347626534
141	NC_016021	TC	3	6	73591	73596	0 %	50 %	0 %	50 %	347626534
142	NC_016021	AC	3	6	73626	73631	50 %	0 %	0 %	50 %	347626534
143	NC_016021	CG	3	6	75113	75118	0 %	0 %	50 %	50 %	347626536
144	NC_016021	AC	3	6	75351	75356	50 %	0 %	0 %	50 %	347626536

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.