MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY020

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016021	ATCGC	2	10	874	883	20 %	20 %	20 %	40 %	347626459
2	NC_016021	CGGTG	2	10	1055	1064	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016021	CGGCG	2	10	1568	1577	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_016021	TCGCC	2	10	2506	2515	0 %	20 %	20 %	60 %	347626460
5	NC_016021	AAACG	2	10	2855	2864	60 %	0 %	20 %	20 %	347626460
6	NC_016021	CCGAA	2	10	3540	3549	40 %	0 %	20 %	40 %	347626461
7	NC_016021	TATCC	2	10	4111	4120	20 %	40 %	0 %	40 %	347626461
8	NC_016021	ACAGC	2	10	4386	4395	40 %	0 %	20 %	40 %	347626461
9	NC_016021	GTTTT	2	10	5045	5054	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016021	GGGGC	2	10	5091	5100	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016021	AGGCG	2	10	5580	5589	20 %	0 %	60 %	20 %	347626463
12	NC_016021	TCGCT	2	10	7992	8001	0 %	40 %	20 %	40 %	347626464
13	NC_016021	TAAGT	2	10	9604	9613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016021	GCGCA	2	10	11626	11635	20 %	0 %	40 %	40 %	347626468
15	NC_016021	CGGAT	2	10	13249	13258	20 %	20 %	40 %	20 %	347626469
16	NC_016021	CAGGC	2	10	13960	13969	20 %	0 %	40 %	40 %	347626470
17	NC_016021	CGTTG	2	10	15320	15329	0 %	40 %	40 %	20 %	347626470
18	NC_016021	ACGTC	2	10	15935	15944	20 %	20 %	20 %	40 %	347626472
19	NC_016021	TCTGA	2	10	16308	16317	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016021	CGACC	2	10	18702	18711	20 %	0 %	20 %	60 %	347626476
21	NC_016021	AGGTC	2	10	18789	18798	20 %	20 %	40 %	20 %	347626476
22	NC_016021	ACGGC	2	10	18813	18822	20 %	0 %	40 %	40 %	347626476
23	NC_016021	AGCTC	2	10	22553	22562	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016021	CCAGC	2	10	24252	24261	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_016021	CAGGA	2	10	24801	24810	40 %	0 %	40 %	20 %	347626482
26	NC_016021	GTGGC	2	10	26077	26086	0 %	20 %	60 %	20 %	347626484
27	NC_016021	GAGAT	2	10	26569	26578	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016021	TTTCC	2	10	27031	27040	0 %	60 %	0 %	40 %	347626485
29	NC_016021	GCCCG	2	10	29012	29021	0 %	0 %	40 %	60 %	347626486
30	NC_016021	CCTTT	2	10	30279	30288	0 %	60 %	0 %	40 %	347626488
31	NC_016021	GGACA	2	10	31395	31404	40 %	0 %	40 %	20 %	347626489
32	NC_016021	TTTCT	2	10	32728	32737	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016021	TTATT	2	10	33998	34007	20 %	80 %	0 %	0 %	347626491
34	NC_016021	CGTTC	2	10	34545	34554	0 %	40 %	20 %	40 %	347626492
35	NC_016021	GAAGC	2	10	39435	39444	40 %	0 %	40 %	20 %	347626494
36	NC_016021	TCAAG	2	10	40473	40482	40 %	20 %	20 %	20 %	347626495
37	NC_016021	CAGGA	2	10	41593	41602	40 %	0 %	40 %	20 %	347626496
38	NC_016021	CGGAC	2	10	42447	42456	20 %	0 %	40 %	40 %	347626496
39	NC_016021	GAGCA	2	10	44583	44592	40 %	0 %	40 %	20 %	347626498
40	NC_016021	ACCTT	2	10	45719	45728	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016021	CGCGT	2	10	45753	45762	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016021	CCGGG	2	10	45929	45938	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016021	CGGGG	2	10	46098	46107	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016021	TCCGG	2	10	47139	47148	0 %	20 %	40 %	40 %	347626500
45	NC_016021	TGGGA	2	10	48582	48591	20 %	20 %	60 %	0 %	347626500
46	NC_016021	CGCGC	2	10	51290	51299	0 %	0 %	40 %	60 %	347626502
47	NC_016021	GCCCT	2	10	51365	51374	0 %	20 %	20 %	60 %	347626502
48	NC_016021	GCCGT	2	10	51742	51751	0 %	20 %	40 %	40 %	347626502
49	NC_016021	GGTCG	2	10	54578	54587	0 %	20 %	60 %	20 %	347626505
50	NC_016021	TCATG	2	10	54922	54931	20 %	40 %	20 %	20 %	347626505
51	NC_016021	GCGCC	2	10	55530	55539	0 %	0 %	40 %	60 %	347626506
52	NC_016021	TTGCC	2	10	56328	56337	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016021	CTCCC	2	10	59232	59241	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
54	NC_016021	GCAGC	2	10	60098	60107	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_016021	CGCAG	2	10	60146	60155	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016021	CGCAG	3	15	60345	60359	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_016021	GCGCA	2	10	61608	61617	20 %	0 %	40 %	40 %	347626518
58	NC_016021	GCAGC	2	10	64282	64291	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016021	CGCAG	2	10	64330	64339	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016021	CGCAG	3	15	64528	64542	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016021	CGGGT	2	10	64912	64921	0 %	20 %	60 %	20 %	347626523
62	NC_016021	CAGAC	2	10	65717	65726	40 %	0 %	20 %	40 %	347626524
63	NC_016021	GCAGC	2	10	66310	66319	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016021	CGCAG	2	10	66358	66367	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016021	CGTAG	2	10	66557	66566	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016021	ACGCG	2	10	66835	66844	20 %	0 %	40 %	40 %	347626525
67	NC_016021	GCACA	2	10	67323	67332	40 %	0 %	20 %	40 %	347626525
68	NC_016021	CTGGA	2	10	67425	67434	20 %	20 %	40 %	20 %	347626526
69	NC_016021	CATGG	2	10	67492	67501	20 %	20 %	40 %	20 %	347626526
70	NC_016021	TATTC	2	10	67903	67912	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016021	AGGGC	2	10	70031	70040	20 %	0 %	60 %	20 %	347626531
72	NC_016021	GCAGC	2	10	71842	71851	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_016021	CGCAG	2	10	71890	71899	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_016021	CGCAG	3	15	72089	72103	20 %	0 %	40 %	40 %	347626532
75	NC_016021	CGGAA	2	10	73993	74002	40 %	0 %	40 %	20 %	347626534
76	NC_016021	ACCTG	2	10	74391	74400	20 %	20 %	20 %	40 %	347626535
77	NC_016021	TCACG	2	10	75143	75152	20 %	20 %	20 %	40 %	347626536

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.