MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Geobacillus thermoglucosidasius C56-YS93 plasmid pGEOTH01

Total Repeats: 1856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015665	ATG	2	6	67136	67141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233527
1502	NC_015665	GGA	2	6	67152	67157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233527
1503	NC_015665	ATC	2	6	67192	67197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233527
1504	NC_015665	AT	3	6	67210	67215	50 %	50 %	0 %	0 %	336233527
1505	NC_015665	CAT	2	6	67371	67376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233527
1506	NC_015665	AT	3	6	67416	67421	50 %	50 %	0 %	0 %	336233527
1507	NC_015665	ACT	2	6	67434	67439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233527
1508	NC_015665	TAC	2	6	67479	67484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233527
1509	NC_015665	GCC	2	6	67491	67496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336233527
1510	NC_015665	TCC	2	6	67540	67545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336233527
1511	NC_015665	GAAA	2	8	67552	67559	75 %	0 %	25 %	0 %	336233527
1512	NC_015665	TAT	2	6	67578	67583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233527
1513	NC_015665	ACTC	2	8	67596	67603	25 %	25 %	0 %	50 %	336233527
1514	NC_015665	AC	3	6	67636	67641	50 %	0 %	0 %	50 %	336233527
1515	NC_015665	TTC	2	6	67643	67648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233527
1516	NC_015665	A	7	7	67668	67674	100 %	0 %	0 %	0 %	336233527
1517	NC_015665	GCT	3	9	67681	67689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233527
1518	NC_015665	ACT	2	6	67695	67700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233527
1519	NC_015665	ATCT	2	8	67714	67721	25 %	50 %	0 %	25 %	336233527
1520	NC_015665	GAA	2	6	67795	67800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233527
1521	NC_015665	GAAG	2	8	67827	67834	50 %	0 %	50 %	0 %	336233527
1522	NC_015665	ACT	2	6	67841	67846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233527
1523	NC_015665	GCA	2	6	67870	67875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233527
1524	NC_015665	ATAA	2	8	67937	67944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015665	ATC	2	6	67956	67961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_015665	TGTAA	2	10	67971	67980	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015665	AC	3	6	67989	67994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_015665	T	6	6	68026	68031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_015665	AT	3	6	68060	68065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015665	AAT	2	6	68097	68102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336233528
1531	NC_015665	GGGT	2	8	68185	68192	0 %	25 %	75 %	0 %	336233528
1532	NC_015665	GAA	2	6	68214	68219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233528
1533	NC_015665	ACAT	2	8	68263	68270	50 %	25 %	0 %	25 %	336233528
1534	NC_015665	A	6	6	68278	68283	100 %	0 %	0 %	0 %	336233528
1535	NC_015665	ATG	2	6	68305	68310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233528
1536	NC_015665	AT	3	6	68320	68325	50 %	50 %	0 %	0 %	336233528
1537	NC_015665	TGA	2	6	68348	68353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233528
1538	NC_015665	CG	3	6	68355	68360	0 %	0 %	50 %	50 %	336233528
1539	NC_015665	CGT	2	6	68427	68432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233528
1540	NC_015665	AT	3	6	68459	68464	50 %	50 %	0 %	0 %	336233528
1541	NC_015665	ATG	2	6	68485	68490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233528
1542	NC_015665	ACAA	2	8	68507	68514	75 %	0 %	0 %	25 %	336233528
1543	NC_015665	A	6	6	68525	68530	100 %	0 %	0 %	0 %	336233528
1544	NC_015665	TA	3	6	68533	68538	50 %	50 %	0 %	0 %	336233528
1545	NC_015665	GAA	2	6	68565	68570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233528
1546	NC_015665	AGG	2	6	68600	68605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_015665	ATAA	2	8	68675	68682	75 %	25 %	0 %	0 %	336233529
1548	NC_015665	A	6	6	68700	68705	100 %	0 %	0 %	0 %	336233529
1549	NC_015665	GAA	2	6	68759	68764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233529
1550	NC_015665	ATG	2	6	68817	68822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233529
1551	NC_015665	TTA	2	6	68838	68843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233529
1552	NC_015665	AC	3	6	68897	68902	50 %	0 %	0 %	50 %	336233529
1553	NC_015665	AT	3	6	68937	68942	50 %	50 %	0 %	0 %	336233529
1554	NC_015665	GAG	2	6	69008	69013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336233529
1555	NC_015665	CCAC	2	8	69106	69113	25 %	0 %	0 %	75 %	336233529
1556	NC_015665	GTA	2	6	69251	69256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233529
1557	NC_015665	TAG	2	6	69265	69270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233529
1558	NC_015665	AAAC	2	8	69325	69332	75 %	0 %	0 %	25 %	336233529
1559	NC_015665	ATC	2	6	69378	69383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233529
1560	NC_015665	GA	3	6	69395	69400	50 %	0 %	50 %	0 %	336233529
1561	NC_015665	TGA	2	6	69445	69450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233529
1562	NC_015665	ATG	2	6	69498	69503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233529
1563	NC_015665	ATT	2	6	69580	69585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233529
1564	NC_015665	CGA	2	6	69606	69611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233529
1565	NC_015665	TGGT	2	8	69633	69640	0 %	50 %	50 %	0 %	336233529
1566	NC_015665	CGA	2	6	69661	69666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233529
1567	NC_015665	TAA	2	6	69723	69728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_015665	GAAT	2	8	69789	69796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_015665	CGA	2	6	69841	69846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_015665	TCC	2	6	69855	69860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_015665	C	6	6	69859	69864	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1572	NC_015665	TTGA	2	8	69938	69945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015665	AGGG	2	8	69960	69967	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_015665	TCC	2	6	69984	69989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_015665	T	7	7	70000	70006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_015665	T	6	6	70025	70030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_015665	CAA	2	6	70088	70093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_015665	TAA	2	6	70193	70198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_015665	T	7	7	70222	70228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_015665	CTTG	2	8	70257	70264	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_015665	ATC	2	6	70287	70292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233530
1582	NC_015665	T	6	6	70317	70322	0 %	100 %	0 %	0 %	336233530
1583	NC_015665	CAAG	2	8	70372	70379	50 %	0 %	25 %	25 %	336233530
1584	NC_015665	CGT	2	6	70383	70388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233530
1585	NC_015665	ATT	2	6	70401	70406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336233530
1586	NC_015665	AAC	2	6	70422	70427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233530
1587	NC_015665	T	6	6	70432	70437	0 %	100 %	0 %	0 %	336233530
1588	NC_015665	CTG	2	6	70481	70486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233530
1589	NC_015665	AG	3	6	70492	70497	50 %	0 %	50 %	0 %	336233530
1590	NC_015665	TAC	2	6	70527	70532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233530
1591	NC_015665	TGGA	2	8	70536	70543	25 %	25 %	50 %	0 %	336233530
1592	NC_015665	CCTG	2	8	70546	70553	0 %	25 %	25 %	50 %	336233530
1593	NC_015665	AAC	2	6	70556	70561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233530
1594	NC_015665	TCA	2	6	70565	70570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233530
1595	NC_015665	TTC	2	6	70598	70603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233530
1596	NC_015665	AATG	2	8	70611	70618	50 %	25 %	25 %	0 %	336233530
1597	NC_015665	CAA	2	6	70634	70639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336233530
1598	NC_015665	GAT	2	6	70670	70675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233530
1599	NC_015665	T	6	6	70735	70740	0 %	100 %	0 %	0 %	336233530
1600	NC_015665	CTG	2	6	70805	70810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233530
1601	NC_015665	GAA	2	6	70877	70882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336233530
1602	NC_015665	GCT	2	6	70891	70896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233530
1603	NC_015665	TTC	2	6	70975	70980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233530
1604	NC_015665	CTT	2	6	71015	71020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233530
1605	NC_015665	CCTT	2	8	71033	71040	0 %	50 %	0 %	50 %	336233530
1606	NC_015665	TTCG	2	8	71041	71048	0 %	50 %	25 %	25 %	336233530
1607	NC_015665	TTC	2	6	71070	71075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233530
1608	NC_015665	TGG	2	6	71103	71108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336233530
1609	NC_015665	TTC	2	6	71151	71156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336233530
1610	NC_015665	TTA	2	6	71220	71225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_015665	TA	3	6	71224	71229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_015665	AT	4	8	71245	71252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_015665	TTC	2	6	71303	71308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_015665	AAT	2	6	71316	71321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_015665	GGAG	2	8	71333	71340	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_015665	TCTT	2	8	71357	71364	0 %	75 %	0 %	25 %	336233531
1617	NC_015665	TTG	2	6	71416	71421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233531
1618	NC_015665	TTG	2	6	71524	71529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233531
1619	NC_015665	TGC	2	6	71621	71626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233531
1620	NC_015665	GCT	2	6	71686	71691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336233531
1621	NC_015665	GGC	2	6	71743	71748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336233531
1622	NC_015665	CT	3	6	71819	71824	0 %	50 %	0 %	50 %	336233531
1623	NC_015665	TCA	2	6	71828	71833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336233531
1624	NC_015665	CCA	2	6	71899	71904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336233531
1625	NC_015665	ATG	2	6	71926	71931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336233531
1626	NC_015665	GCA	2	6	71947	71952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336233531
1627	NC_015665	TTG	2	6	71954	71959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336233531
1628	NC_015665	AT	3	6	72003	72008	50 %	50 %	0 %	0 %	336233531
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.