MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Glaciecola sp. 4H-3-7+YE-5 plasmid pGLAAG01

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015498	CAATG	2	10	1632	1641	40 %	20 %	20 %	20 %	332308621
2	NC_015498	CGGTT	2	10	2522	2531	0 %	40 %	40 %	20 %	332308621
3	NC_015498	ACTTC	2	10	2917	2926	20 %	40 %	0 %	40 %	332308621
4	NC_015498	GTTTC	2	10	3354	3363	0 %	60 %	20 %	20 %	332308622
5	NC_015498	TAAAA	2	10	6199	6208	80 %	20 %	0 %	0 %	332308625
6	NC_015498	GATTT	2	10	6366	6375	20 %	60 %	20 %	0 %	332308625
7	NC_015498	GCTAT	2	10	8443	8452	20 %	40 %	20 %	20 %	332308627
8	NC_015498	ACCGA	2	10	10820	10829	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015498	TGGTC	2	10	13780	13789	0 %	40 %	40 %	20 %	332308638
10	NC_015498	TTCGG	2	10	14145	14154	0 %	40 %	40 %	20 %	332308639
11	NC_015498	CAATC	2	10	16614	16623	40 %	20 %	0 %	40 %	332308644
12	NC_015498	AGCAG	2	10	16762	16771	40 %	0 %	40 %	20 %	332308644
13	NC_015498	TTCAC	2	10	17317	17326	20 %	40 %	0 %	40 %	332308646
14	NC_015498	AAGAA	2	10	18437	18446	80 %	0 %	20 %	0 %	332308648
15	NC_015498	AAAGC	2	10	18528	18537	60 %	0 %	20 %	20 %	332308648
16	NC_015498	AATCG	2	10	18804	18813	40 %	20 %	20 %	20 %	332308649
17	NC_015498	TCAAT	2	10	21049	21058	40 %	40 %	0 %	20 %	332308653
18	NC_015498	ATTAA	2	10	21444	21453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015498	CAAAA	2	10	21928	21937	80 %	0 %	0 %	20 %	332308654
20	NC_015498	CACAG	2	10	26961	26970	40 %	0 %	20 %	40 %	332308661
21	NC_015498	CGATA	2	10	26981	26990	40 %	20 %	20 %	20 %	332308661
22	NC_015498	GAATT	2	10	27223	27232	40 %	40 %	20 %	0 %	332308661
23	NC_015498	CCAAA	2	10	27574	27583	60 %	0 %	0 %	40 %	332308662
24	NC_015498	GCAGC	2	10	29496	29505	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015498	ACAAG	2	10	31670	31679	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015498	GAGAT	2	10	33822	33831	40 %	20 %	40 %	0 %	332308669
27	NC_015498	ATGTT	2	10	33940	33949	20 %	60 %	20 %	0 %	332308669
28	NC_015498	AAATC	2	10	35134	35143	60 %	20 %	0 %	20 %	332308670
29	NC_015498	AGTCC	2	10	36511	36520	20 %	20 %	20 %	40 %	332308672
30	NC_015498	GATCT	2	10	36881	36890	20 %	40 %	20 %	20 %	332308672
31	NC_015498	CTCAC	2	10	37312	37321	20 %	20 %	0 %	60 %	332308672
32	NC_015498	TACAT	2	10	44628	44637	40 %	40 %	0 %	20 %	332308672
33	NC_015498	AAGGT	2	10	45035	45044	40 %	20 %	40 %	0 %	332308672
34	NC_015498	AATCT	2	10	45245	45254	40 %	40 %	0 %	20 %	332308672
35	NC_015498	AGCGT	2	10	46331	46340	20 %	20 %	40 %	20 %	332308672
36	NC_015498	TAAAA	2	10	49202	49211	80 %	20 %	0 %	0 %	332308673
37	NC_015498	CCAAC	2	10	50567	50576	40 %	0 %	0 %	60 %	332308675
38	NC_015498	AGGCA	2	10	51209	51218	40 %	0 %	40 %	20 %	332308676
39	NC_015498	TCAAC	2	10	51283	51292	40 %	20 %	0 %	40 %	332308676
40	NC_015498	GCGCG	2	10	51397	51406	0 %	0 %	60 %	40 %	332308676
41	NC_015498	AAAAT	2	10	51632	51641	80 %	20 %	0 %	0 %	332308676
42	NC_015498	CTATT	2	10	51946	51955	20 %	60 %	0 %	20 %	332308677
43	NC_015498	AAGTG	2	10	52433	52442	40 %	20 %	40 %	0 %	332308677
44	NC_015498	ATTCA	2	10	53295	53304	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015498	GCTCA	2	10	54641	54650	20 %	20 %	20 %	40 %	332308679
46	NC_015498	TTAAA	2	10	54920	54929	60 %	40 %	0 %	0 %	332308679
47	NC_015498	TACTT	2	10	56212	56221	20 %	60 %	0 %	20 %	332308681
48	NC_015498	TCCAA	2	10	57529	57538	40 %	20 %	0 %	40 %	332308683
49	NC_015498	ATAAA	2	10	60117	60126	80 %	20 %	0 %	0 %	332308685
50	NC_015498	CTGGA	2	10	61832	61841	20 %	20 %	40 %	20 %	332308687
51	NC_015498	ATCTG	2	10	65200	65209	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015498	AAGAA	2	10	66476	66485	80 %	0 %	20 %	0 %	332308690
53	NC_015498	CAATC	2	10	67329	67338	40 %	20 %	0 %	40 %	332308691
54	NC_015498	TTTAT	2	10	68399	68408	20 %	80 %	0 %	0 %	332308691
55	NC_015498	AGTTC	2	10	72442	72451	20 %	40 %	20 %	20 %	332308695
56	NC_015498	CAATT	2	10	72904	72913	40 %	40 %	0 %	20 %	332308696
57	NC_015498	TGTAG	2	10	72931	72940	20 %	40 %	40 %	0 %	332308696
58	NC_015498	TTTTC	2	10	73089	73098	0 %	80 %	0 %	20 %	332308696
59	NC_015498	GGATT	2	10	73181	73190	20 %	40 %	40 %	0 %	332308696
60	NC_015498	GCTTG	2	10	75435	75444	0 %	40 %	40 %	20 %	332308696
61	NC_015498	TAGGT	2	10	77987	77996	20 %	40 %	40 %	0 %	332308696
62	NC_015498	TAGTG	2	10	86837	86846	20 %	40 %	40 %	0 %	332308697
63	NC_015498	TGCTG	2	10	87079	87088	0 %	40 %	40 %	20 %	332308697
64	NC_015498	TGGAT	2	10	87918	87927	20 %	40 %	40 %	0 %	332308697
65	NC_015498	CAAGC	2	10	89217	89226	40 %	0 %	20 %	40 %	332308699
66	NC_015498	GAAAC	2	10	90125	90134	60 %	0 %	20 %	20 %	332308700
67	NC_015498	AATTG	2	10	90842	90851	40 %	40 %	20 %	0 %	332308701
68	NC_015498	AAGAA	2	10	91236	91245	80 %	0 %	20 %	0 %	332308702
69	NC_015498	AGTTA	2	10	91993	92002	40 %	40 %	20 %	0 %	332308702
70	NC_015498	AAAAG	2	10	96119	96128	80 %	0 %	20 %	0 %	332308703
71	NC_015498	CAAAA	2	10	97036	97045	80 %	0 %	0 %	20 %	332308704
72	NC_015498	TGAAT	2	10	100816	100825	40 %	40 %	20 %	0 %	332308708
73	NC_015498	TACCT	2	10	101191	101200	20 %	40 %	0 %	40 %	332308708
74	NC_015498	AAATG	2	10	102169	102178	60 %	20 %	20 %	0 %	332308708
75	NC_015498	AATGC	2	10	102932	102941	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_015498	AGCCG	2	10	103922	103931	20 %	0 %	40 %	40 %	332308710
77	NC_015498	TTCGC	2	10	104866	104875	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_015498	TAAGT	2	10	108403	108412	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015498	TCAAA	2	10	109097	109106	60 %	20 %	0 %	20 %	332308718
80	NC_015498	TCCTG	2	10	109871	109880	0 %	40 %	20 %	40 %	332308718
81	NC_015498	ATGGC	2	10	110792	110801	20 %	20 %	40 %	20 %	332308718
82	NC_015498	TAACA	2	10	112388	112397	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_015498	TGCAT	2	10	114004	114013	20 %	40 %	20 %	20 %	332308720
84	NC_015498	CTGAC	2	10	115017	115026	20 %	20 %	20 %	40 %	332308721
85	NC_015498	TTTTA	2	10	115192	115201	20 %	80 %	0 %	0 %	332308722
86	NC_015498	CTTTG	2	10	116393	116402	0 %	60 %	20 %	20 %	332308723
87	NC_015498	GAGTG	2	10	117811	117820	20 %	20 %	60 %	0 %	332308724
88	NC_015498	TAATA	2	10	119007	119016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015498	TTCTA	2	10	119189	119198	20 %	60 %	0 %	20 %	332308726
90	NC_015498	ACTTA	2	10	120260	120269	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015498	ACTTC	2	10	120382	120391	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_015498	TTATT	2	10	122921	122930	20 %	80 %	0 %	0 %	332308728
93	NC_015498	CTGAC	2	10	124878	124887	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_015498	GTTGT	2	10	125525	125534	0 %	60 %	40 %	0 %	332308732
95	NC_015498	AAAGG	2	10	127877	127886	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015498	ACGGT	2	10	130338	130347	20 %	20 %	40 %	20 %	332308735
97	NC_015498	CGATG	2	10	130554	130563	20 %	20 %	40 %	20 %	332308735
98	NC_015498	GTTAA	2	10	131908	131917	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015498	TTAAG	2	10	133553	133562	40 %	40 %	20 %	0 %	332308738
100	NC_015498	CAAGT	2	10	137614	137623	40 %	20 %	20 %	20 %	332308743
101	NC_015498	AACCC	2	10	139228	139237	40 %	0 %	0 %	60 %	332308744
102	NC_015498	AGACG	2	10	143211	143220	40 %	0 %	40 %	20 %	332308749
103	NC_015498	CTGAC	2	10	144173	144182	20 %	20 %	20 %	40 %	332308750
104	NC_015498	ACCCA	2	10	145283	145292	40 %	0 %	0 %	60 %	332308750
105	NC_015498	GCATC	2	10	147670	147679	20 %	20 %	20 %	40 %	332308751
106	NC_015498	GCGCG	2	10	148426	148435	0 %	0 %	60 %	40 %	332308751
107	NC_015498	CATTG	2	10	149048	149057	20 %	40 %	20 %	20 %	332308751
108	NC_015498	CAGGT	2	10	149294	149303	20 %	20 %	40 %	20 %	332308751
109	NC_015498	CATTA	2	10	152389	152398	40 %	40 %	0 %	20 %	332308755
110	NC_015498	AGATA	2	10	152732	152741	60 %	20 %	20 %	0 %	332308755
111	NC_015498	CGCAT	2	10	154632	154641	20 %	20 %	20 %	40 %	332308758
112	NC_015498	GGTTA	2	10	157340	157349	20 %	40 %	40 %	0 %	332308762
113	NC_015498	TCCAT	2	10	158515	158524	20 %	40 %	0 %	40 %	332308763
114	NC_015498	CAATT	2	10	159764	159773	40 %	40 %	0 %	20 %	332308764
115	NC_015498	ATTTT	2	10	160156	160165	20 %	80 %	0 %	0 %	332308765
116	NC_015498	GCCAG	2	10	161413	161422	20 %	0 %	40 %	40 %	332308765
117	NC_015498	AAACA	2	10	163011	163020	80 %	0 %	0 %	20 %	332308765
118	NC_015498	TGAAA	2	10	165106	165115	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015498	AAGCA	2	10	166685	166694	60 %	0 %	20 %	20 %	332308769
120	NC_015498	CATCT	2	10	167927	167936	20 %	40 %	0 %	40 %	332308769
121	NC_015498	CAATT	2	10	168106	168115	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_015498	TCTTT	2	10	168200	168209	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015498	GTTTT	2	10	169665	169674	0 %	80 %	20 %	0 %	332308770
124	NC_015498	ATTTT	2	10	169750	169759	20 %	80 %	0 %	0 %	332308770
125	NC_015498	ACATC	2	10	169789	169798	40 %	20 %	0 %	40 %	332308770
126	NC_015498	GTTTG	2	10	170472	170481	0 %	60 %	40 %	0 %	332308770
127	NC_015498	TTAAT	2	10	171301	171310	40 %	60 %	0 %	0 %	332308771
128	NC_015498	ATCAA	2	10	171620	171629	60 %	20 %	0 %	20 %	332308772
129	NC_015498	TTTTA	2	10	171689	171698	20 %	80 %	0 %	0 %	332308772
130	NC_015498	GTTAA	2	10	172517	172526	40 %	40 %	20 %	0 %	332308772
131	NC_015498	ATTTA	2	10	173211	173220	40 %	60 %	0 %	0 %	332308772
132	NC_015498	ACCAC	2	10	175262	175271	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
133	NC_015498	ACATC	2	10	176333	176342	40 %	20 %	0 %	40 %	332308774
134	NC_015498	CGCTT	2	10	176424	176433	0 %	40 %	20 %	40 %	332308774
135	NC_015498	CATGG	2	10	177950	177959	20 %	20 %	40 %	20 %	332308775
136	NC_015498	ACCAC	2	10	178415	178424	40 %	0 %	0 %	60 %	332308775
137	NC_015498	GGCAT	2	10	178441	178450	20 %	20 %	40 %	20 %	332308775
138	NC_015498	TGCTG	2	10	178755	178764	0 %	40 %	40 %	20 %	332308776
139	NC_015498	TTTTA	2	10	179904	179913	20 %	80 %	0 %	0 %	332308778
140	NC_015498	GAAAA	2	10	180843	180852	80 %	0 %	20 %	0 %	332308779
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144	NC_015498	CTGAT	2	10	183911	183920	20 %	40 %	20 %	20 %	332308783
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149	NC_015498	CATTT	2	10	186739	186748	20 %	60 %	0 %	20 %	332308784
150	NC_015498	CATCA	2	10	189430	189439	40 %	20 %	0 %	40 %	332308787
151	NC_015498	AATAT	2	10	192626	192635	60 %	40 %	0 %	0 %	332308791
152	NC_015498	CATCA	2	10	194245	194254	40 %	20 %	0 %	40 %	332308793
153	NC_015498	ATACC	2	10	194913	194922	40 %	20 %	0 %	40 %	332308793
154	NC_015498	TGAGT	2	10	199547	199556	20 %	40 %	40 %	0 %	332308797
155	NC_015498	CCGAT	2	10	203859	203868	20 %	20 %	20 %	40 %	332308801
156	NC_015498	TAAGT	2	10	205799	205808	40 %	40 %	20 %	0 %	332308802
157	NC_015498	GATTT	2	10	205869	205878	20 %	60 %	20 %	0 %	332308802
158	NC_015498	TTGGG	2	10	210477	210486	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015498	AATTC	2	10	214250	214259	40 %	40 %	0 %	20 %	332308808
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164	NC_015498	GTCTG	2	10	221643	221652	0 %	40 %	40 %	20 %	332308819
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168	NC_015498	CATCA	2	10	227390	227399	40 %	20 %	0 %	40 %	332308824
169	NC_015498	AATTC	2	10	227584	227593	40 %	40 %	0 %	20 %	332308825
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172	NC_015498	ATGCC	2	10	230028	230037	20 %	20 %	20 %	40 %	332308828
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175	NC_015498	CGTAA	2	10	231915	231924	40 %	20 %	20 %	20 %	332308831
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177	NC_015498	AATAA	2	10	233305	233314	80 %	20 %	0 %	0 %	332308832
178	NC_015498	TTGGG	2	10	233930	233939	0 %	40 %	60 %	0 %	332308833
179	NC_015498	AAAAT	2	10	235640	235649	80 %	20 %	0 %	0 %	332308835
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183	NC_015498	TGCTG	2	10	240084	240093	0 %	40 %	40 %	20 %	332308840
184	NC_015498	AATCA	2	10	241107	241116	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
185	NC_015498	TAATC	2	10	242506	242515	40 %	40 %	0 %	20 %	332308842
186	NC_015498	GGACA	2	10	243137	243146	40 %	0 %	40 %	20 %	332308842
187	NC_015498	TTTTG	2	10	243472	243481	0 %	80 %	20 %	0 %	332308843
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195	NC_015498	CTTTT	2	10	251191	251200	0 %	80 %	0 %	20 %	332308850
196	NC_015498	TCGGC	2	10	251966	251975	0 %	20 %	40 %	40 %	332308850
197	NC_015498	ACCCA	2	10	253367	253376	40 %	0 %	0 %	60 %	332308850
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211	NC_015498	CTTCT	2	10	266024	266033	0 %	60 %	0 %	40 %	332308863
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213	NC_015498	ACATC	2	10	267569	267578	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
214	NC_015498	TGTGA	2	10	267913	267922	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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223	NC_015498	ATCCG	2	10	274117	274126	20 %	20 %	20 %	40 %	332308868
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226	NC_015498	AAAAT	2	10	282278	282287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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230	NC_015498	TAGGT	2	10	284426	284435	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
231	NC_015498	TTGAA	2	10	289203	289212	40 %	40 %	20 %	0 %	332308881
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233	NC_015498	CTTCG	2	10	290018	290027	0 %	40 %	20 %	40 %	332308881
234	NC_015498	ACAAT	2	10	290110	290119	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
235	NC_015498	GTGAA	2	10	290936	290945	40 %	20 %	40 %	0 %	332308883
236	NC_015498	AAACA	2	10	291211	291220	80 %	0 %	0 %	20 %	332308883
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238	NC_015498	AACTT	2	10	292433	292442	40 %	40 %	0 %	20 %	332308884
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245	NC_015498	TCTGT	2	10	300345	300354	0 %	60 %	20 %	20 %	332308894
246	NC_015498	CCTGT	2	10	302171	302180	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
247	NC_015498	TTGAC	2	10	302884	302893	20 %	40 %	20 %	20 %	332308895
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249	NC_015498	TTGAA	2	10	303762	303771	40 %	40 %	20 %	0 %	332308895
250	NC_015498	CATTT	2	10	304328	304337	20 %	60 %	0 %	20 %	332308895
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252	NC_015498	CTGAC	2	10	307341	307350	20 %	20 %	20 %	40 %	332308898
253	NC_015498	CATGA	2	10	307608	307617	40 %	20 %	20 %	20 %	332308899
254	NC_015498	CGCTA	2	10	312476	312485	20 %	20 %	20 %	40 %	332308903
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258	NC_015498	TCTAA	2	10	324483	324492	40 %	40 %	0 %	20 %	332308915
259	NC_015498	ATTTT	2	10	325819	325828	20 %	80 %	0 %	0 %	332308917
260	NC_015498	CAATC	2	10	329814	329823	40 %	20 %	0 %	40 %	332308920
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263	NC_015498	CGTTT	2	10	332177	332186	0 %	60 %	20 %	20 %	332308923
264	NC_015498	TTGCT	2	10	333453	333462	0 %	60 %	20 %	20 %	332308924
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266	NC_015498	ACAAA	2	10	335687	335696	80 %	0 %	0 %	20 %	332308926
267	NC_015498	AATCC	2	10	336852	336861	40 %	20 %	0 %	40 %	332308928
268	NC_015498	AAGTG	2	10	337238	337247	40 %	20 %	40 %	0 %	332308929
269	NC_015498	AAAAT	2	10	338194	338203	80 %	20 %	0 %	0 %	332308929
270	NC_015498	ACCAA	2	10	338303	338312	60 %	0 %	0 %	40 %	332308929
271	NC_015498	GAGGG	3	15	339891	339905	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
272	NC_015498	CATAC	2	10	340986	340995	40 %	20 %	0 %	40 %	332308934
273	NC_015498	TCATT	2	10	341187	341196	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.