MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gallibacterium anatis UMN179 chromosome

Total Repeats: 58400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015460	AGCA	2	8	179	186	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015460	ATG	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288086
3	NC_015460	ATT	2	6	264	269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288086
4	NC_015460	CAA	2	6	274	279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288086
5	NC_015460	CAA	2	6	284	289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288086
6	NC_015460	A	6	6	288	293	100 %	0 %	0 %	0 %	332288086
7	NC_015460	TAA	2	6	294	299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288086
8	NC_015460	AAC	2	6	300	305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288086
9	NC_015460	CAA	2	6	325	330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288086
10	NC_015460	A	6	6	329	334	100 %	0 %	0 %	0 %	332288086
11	NC_015460	CAA	2	6	367	372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288086
12	NC_015460	TAAT	2	8	407	414	50 %	50 %	0 %	0 %	332288086
13	NC_015460	ACTA	2	8	460	467	50 %	25 %	0 %	25 %	332288086
14	NC_015460	CAA	2	6	526	531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288086
15	NC_015460	A	7	7	597	603	100 %	0 %	0 %	0 %	332288086
16	NC_015460	ATT	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288086
17	NC_015460	ATT	2	6	690	695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288086
18	NC_015460	TAA	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288086
19	NC_015460	ATT	3	9	779	787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288086
20	NC_015460	AG	3	6	874	879	50 %	0 %	50 %	0 %	332288086
21	NC_015460	ATA	2	6	902	907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288086
22	NC_015460	TAT	2	6	940	945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288086
23	NC_015460	TCT	2	6	988	993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288086
24	NC_015460	GGAAA	2	10	1007	1016	60 %	0 %	40 %	0 %	332288086
25	NC_015460	A	6	6	1032	1037	100 %	0 %	0 %	0 %	332288086
26	NC_015460	TATT	2	8	1057	1064	25 %	75 %	0 %	0 %	332288086
27	NC_015460	TAA	2	6	1066	1071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288086
28	NC_015460	AAT	2	6	1077	1082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015460	AAAAG	2	10	1098	1107	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015460	TTTA	2	8	1115	1122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015460	A	6	6	1131	1136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015460	CAG	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288087
33	NC_015460	T	6	6	1186	1191	0 %	100 %	0 %	0 %	332288087
34	NC_015460	GAA	2	6	1289	1294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288087
35	NC_015460	CAA	2	6	1361	1366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288087
36	NC_015460	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	332288087
37	NC_015460	ACA	2	6	1461	1466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288087
38	NC_015460	GCATG	2	10	1491	1500	20 %	20 %	40 %	20 %	332288087
39	NC_015460	CCAA	2	8	1549	1556	50 %	0 %	0 %	50 %	332288087
40	NC_015460	TCA	2	6	1578	1583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288087
41	NC_015460	AAT	2	6	1593	1598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288087
42	NC_015460	GGT	2	6	1624	1629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288087
43	NC_015460	ATT	2	6	1684	1689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288087
44	NC_015460	AAC	2	6	1691	1696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288087
45	NC_015460	TCA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288087
46	NC_015460	TCA	2	6	1859	1864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288087
47	NC_015460	AAT	2	6	1865	1870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288087
48	NC_015460	GTTC	2	8	1940	1947	0 %	50 %	25 %	25 %	332288088
49	NC_015460	GTT	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288088
50	NC_015460	ACG	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288088
51	NC_015460	TTC	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288088
52	NC_015460	ACC	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015460	ATA	2	6	2356	2361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288089
54	NC_015460	GAA	2	6	2478	2483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288089
55	NC_015460	A	6	6	2564	2569	100 %	0 %	0 %	0 %	332288089
56	NC_015460	AGC	2	6	2591	2596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288089
57	NC_015460	A	6	6	2675	2680	100 %	0 %	0 %	0 %	332288090
58	NC_015460	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288090
59	NC_015460	AAG	2	6	2763	2768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288090
60	NC_015460	A	6	6	2814	2819	100 %	0 %	0 %	0 %	332288090
61	NC_015460	CAA	2	6	2879	2884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288090
62	NC_015460	ATT	2	6	2890	2895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288090
63	NC_015460	ATT	2	6	2902	2907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288090
64	NC_015460	CAA	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288090
65	NC_015460	TAT	2	6	2969	2974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288090
66	NC_015460	ATT	2	6	3019	3024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288090
67	NC_015460	T	8	8	3072	3079	0 %	100 %	0 %	0 %	332288090
68	NC_015460	CAAGC	2	10	3098	3107	40 %	0 %	20 %	40 %	332288090
69	NC_015460	ATTG	2	8	3154	3161	25 %	50 %	25 %	0 %	332288090
70	NC_015460	AAT	2	6	3242	3247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288090
71	NC_015460	CTT	2	6	3249	3254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288090
72	NC_015460	GA	3	6	3261	3266	50 %	0 %	50 %	0 %	332288090
73	NC_015460	GAA	2	6	3299	3304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288090
74	NC_015460	A	6	6	3358	3363	100 %	0 %	0 %	0 %	332288090
75	NC_015460	TGTT	2	8	3486	3493	0 %	75 %	25 %	0 %	332288090
76	NC_015460	ATT	2	6	3500	3505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288090
77	NC_015460	TTG	2	6	3510	3515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288090
78	NC_015460	ATC	2	6	3546	3551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288090
79	NC_015460	GTT	2	6	3565	3570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288090
80	NC_015460	ATA	2	6	3708	3713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288090
81	NC_015460	TCA	2	6	3773	3778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288090
82	NC_015460	TTA	2	6	3811	3816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288090
83	NC_015460	TA	3	6	3851	3856	50 %	50 %	0 %	0 %	332288090
84	NC_015460	ATC	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288090
85	NC_015460	CTT	2	6	3961	3966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288090
86	NC_015460	A	6	6	4027	4032	100 %	0 %	0 %	0 %	332288090
87	NC_015460	T	6	6	4043	4048	0 %	100 %	0 %	0 %	332288090
88	NC_015460	TTA	2	6	4186	4191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288091
89	NC_015460	CAAT	2	8	4263	4270	50 %	25 %	0 %	25 %	332288091
90	NC_015460	TGAG	2	8	4294	4301	25 %	25 %	50 %	0 %	332288091
91	NC_015460	ACG	2	6	4315	4320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288091
92	NC_015460	ACC	2	6	4332	4337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288091
93	NC_015460	AAT	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288091
94	NC_015460	CCG	2	6	4412	4417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288091
95	NC_015460	CAT	3	9	4470	4478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288091
96	NC_015460	TTC	2	6	4546	4551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288091
97	NC_015460	AGA	2	6	4573	4578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288091
98	NC_015460	TTC	2	6	4625	4630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288091
99	NC_015460	ATC	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288091
100	NC_015460	TCT	2	6	4787	4792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288091
101	NC_015460	AGT	2	6	4867	4872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288091
102	NC_015460	TGC	2	6	5251	5256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288091
103	NC_015460	CAACC	2	10	5280	5289	40 %	0 %	0 %	60 %	332288091
104	NC_015460	CCA	2	6	5346	5351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288091
105	NC_015460	AAC	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288091
106	NC_015460	GAA	2	6	5391	5396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288091
107	NC_015460	TTGT	2	8	5418	5425	0 %	75 %	25 %	0 %	332288091
108	NC_015460	CAT	2	6	5460	5465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288091
109	NC_015460	GAAA	2	8	5476	5483	75 %	0 %	25 %	0 %	332288091
110	NC_015460	ACG	2	6	5500	5505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288091
111	NC_015460	GGTC	2	8	5633	5640	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015460	CAA	2	6	5700	5705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015460	A	6	6	5718	5723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015460	GTT	2	6	5844	5849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015460	CAC	2	6	5884	5889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288092
116	NC_015460	ACA	2	6	5897	5902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288092
117	NC_015460	ATTG	2	8	6011	6018	25 %	50 %	25 %	0 %	332288092
118	NC_015460	GAAC	2	8	6036	6043	50 %	0 %	25 %	25 %	332288092
119	NC_015460	CA	3	6	6044	6049	50 %	0 %	0 %	50 %	332288092
120	NC_015460	TGT	2	6	6119	6124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288092
121	NC_015460	TG	3	6	6154	6159	0 %	50 %	50 %	0 %	332288092
122	NC_015460	GTG	2	6	6174	6179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288092
123	NC_015460	TCAA	2	8	6205	6212	50 %	25 %	0 %	25 %	332288092
124	NC_015460	GCT	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288092
125	NC_015460	GGT	2	6	6302	6307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288092
126	NC_015460	TCG	2	6	6326	6331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288092
127	NC_015460	ATT	2	6	6414	6419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288092
128	NC_015460	CTT	2	6	6436	6441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288092
129	NC_015460	TCT	2	6	6456	6461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288092
130	NC_015460	GTG	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288092
131	NC_015460	AGT	2	6	6477	6482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288092
132	NC_015460	T	7	7	6493	6499	0 %	100 %	0 %	0 %	332288092
133	NC_015460	TGA	2	6	6506	6511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288092
134	NC_015460	ACA	2	6	6563	6568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288092
135	NC_015460	CGG	2	6	6640	6645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332288092
136	NC_015460	CAA	2	6	6654	6659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288092
137	NC_015460	ATCG	2	8	6699	6706	25 %	25 %	25 %	25 %	332288092
138	NC_015460	ATT	2	6	6795	6800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288092
139	NC_015460	TGA	2	6	6832	6837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288092
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155	NC_015460	ATAAAA	2	12	7191	7202	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_015460	TAT	2	6	12926	12931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_015460	T	7	7	12956	12962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_015460	ATT	2	6	12990	12995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_015460	ATC	2	6	13036	13041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_015460	AT	3	6	13043	13048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_015460	A	6	6	13063	13068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_015460	GTG	2	6	13096	13101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
276	NC_015460	AAT	2	6	13119	13124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_015460	TTGC	2	8	13399	13406	0 %	50 %	25 %	25 %	332288098
278	NC_015460	T	6	6	13493	13498	0 %	100 %	0 %	0 %	332288098
279	NC_015460	T	6	6	13542	13547	0 %	100 %	0 %	0 %	332288098
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282	NC_015460	ATCC	2	8	13637	13644	25 %	25 %	0 %	50 %	332288098
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366	NC_015460	TGT	2	6	17648	17653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_015460	AACC	2	8	18450	18457	50 %	0 %	0 %	50 %	332288103
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392	NC_015460	ATT	3	9	19141	19149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288103
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396	NC_015460	TGA	2	6	19244	19249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288103
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398	NC_015460	CAT	2	6	19305	19310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288103
399	NC_015460	ACC	2	6	19369	19374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288103
400	NC_015460	CTG	2	6	19405	19410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288103
401	NC_015460	TAA	2	6	19411	19416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288103
402	NC_015460	ATT	2	6	19474	19479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288103
403	NC_015460	TAA	2	6	19480	19485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288103
404	NC_015460	TGC	2	6	19531	19536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288103
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406	NC_015460	TAC	2	6	19674	19679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288103
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423	NC_015460	ATA	2	6	20192	20197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_015460	GTTA	2	8	20211	20218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_015460	A	7	7	22279	22285	100 %	0 %	0 %	0 %	332288105
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