MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gallibacterium anatis UMN179 chromosome

Total Repeats: 58400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015460	CCG	2	6	181171	181176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288249
4002	NC_015460	TGAGTT	2	12	181246	181257	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	332288249
4003	NC_015460	AAATT	2	10	181276	181285	60 %	40 %	0 %	0 %	332288249
4004	NC_015460	CG	3	6	181321	181326	0 %	0 %	50 %	50 %	332288249
4005	NC_015460	AGT	2	6	181355	181360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288249
4006	NC_015460	TCAAT	2	10	181558	181567	40 %	40 %	0 %	20 %	332288249
4007	NC_015460	CTTC	2	8	181606	181613	0 %	50 %	0 %	50 %	332288249
4008	NC_015460	AGC	2	6	181620	181625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288249
4009	NC_015460	AT	3	6	181632	181637	50 %	50 %	0 %	0 %	332288249
4010	NC_015460	CCA	2	6	181690	181695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288249
4011	NC_015460	CT	3	6	181719	181724	0 %	50 %	0 %	50 %	332288249
4012	NC_015460	TTG	2	6	181743	181748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288249
4013	NC_015460	ATCA	2	8	181862	181869	50 %	25 %	0 %	25 %	332288249
4014	NC_015460	AATC	2	8	181903	181910	50 %	25 %	0 %	25 %	332288249
4015	NC_015460	GACCT	2	10	181913	181922	20 %	20 %	20 %	40 %	332288249
4016	NC_015460	T	6	6	181963	181968	0 %	100 %	0 %	0 %	332288249
4017	NC_015460	GC	3	6	182008	182013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_015460	ATA	2	6	182058	182063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_015460	AAT	2	6	182081	182086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_015460	GGAA	2	8	182140	182147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_015460	A	8	8	182199	182206	100 %	0 %	0 %	0 %	332288250
4022	NC_015460	TGC	3	9	182215	182223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288250
4023	NC_015460	TTA	2	6	182348	182353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288250
4024	NC_015460	CAA	2	6	182354	182359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288250
4025	NC_015460	GAA	2	6	182393	182398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288250
4026	NC_015460	TTGC	2	8	182402	182409	0 %	50 %	25 %	25 %	332288250
4027	NC_015460	ATT	2	6	182431	182436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288250
4028	NC_015460	GAA	2	6	182561	182566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288250
4029	NC_015460	TCAA	2	8	182748	182755	50 %	25 %	0 %	25 %	332288250
4030	NC_015460	ATTGGC	2	12	182830	182841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332288250
4031	NC_015460	CAC	2	6	182846	182851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288250
4032	NC_015460	ATG	2	6	182876	182881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288250
4033	NC_015460	A	6	6	182896	182901	100 %	0 %	0 %	0 %	332288250
4034	NC_015460	TAG	2	6	182910	182915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288250
4035	NC_015460	A	6	6	182937	182942	100 %	0 %	0 %	0 %	332288250
4036	NC_015460	TAT	2	6	182966	182971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288250
4037	NC_015460	T	6	6	183013	183018	0 %	100 %	0 %	0 %	332288250
4038	NC_015460	A	7	7	183110	183116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_015460	AATGC	2	10	183127	183136	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4040	NC_015460	CCG	2	6	183168	183173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_015460	TCA	2	6	183351	183356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_015460	TTA	2	6	183538	183543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_015460	TAA	2	6	183551	183556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288251
4044	NC_015460	CGG	2	6	183590	183595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332288251
4045	NC_015460	TTG	2	6	183623	183628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288251
4046	NC_015460	CAT	2	6	183672	183677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288251
4047	NC_015460	AGAAAT	2	12	183706	183717	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	332288251
4048	NC_015460	GGT	2	6	183805	183810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288251
4049	NC_015460	TTTG	2	8	183974	183981	0 %	75 %	25 %	0 %	332288251
4050	NC_015460	AAC	2	6	183992	183997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288251
4051	NC_015460	TGA	2	6	184031	184036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288251
4052	NC_015460	T	6	6	184147	184152	0 %	100 %	0 %	0 %	332288251
4053	NC_015460	AAT	2	6	184192	184197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288251
4054	NC_015460	GCG	2	6	184282	184287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332288251
4055	NC_015460	AAATTT	2	12	184312	184323	50 %	50 %	0 %	0 %	332288251
4056	NC_015460	AAT	2	6	184328	184333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288251
4057	NC_015460	CCAAA	2	10	184406	184415	60 %	0 %	0 %	40 %	332288251
4058	NC_015460	A	7	7	184435	184441	100 %	0 %	0 %	0 %	332288251
4059	NC_015460	TTG	2	6	184462	184467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288251
4060	NC_015460	AAT	2	6	184493	184498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015460	ATT	2	6	184539	184544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015460	GATGT	2	10	184648	184657	20 %	40 %	40 %	0 %	332288252
4063	NC_015460	ACA	2	6	184725	184730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288252
4064	NC_015460	GGT	2	6	184747	184752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288252
4065	NC_015460	TTG	2	6	184801	184806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288252
4066	NC_015460	AGC	2	6	184827	184832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288252
4067	NC_015460	ATTG	2	8	184867	184874	25 %	50 %	25 %	0 %	332288252
4068	NC_015460	TCA	2	6	184932	184937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288252
4069	NC_015460	GCA	2	6	185007	185012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288252
4070	NC_015460	TC	3	6	185040	185045	0 %	50 %	0 %	50 %	332288252
4071	NC_015460	ACA	2	6	185076	185081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288252
4072	NC_015460	GAT	2	6	185082	185087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288252
4073	NC_015460	TTA	2	6	185167	185172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288252
4074	NC_015460	GGT	2	6	185199	185204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288252
4075	NC_015460	AAG	2	6	185357	185362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288252
4076	NC_015460	TGC	2	6	185463	185468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288252
4077	NC_015460	CGC	2	6	185536	185541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288252
4078	NC_015460	TAT	2	6	185559	185564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288252
4079	NC_015460	GC	3	6	185605	185610	0 %	0 %	50 %	50 %	332288252
4080	NC_015460	A	6	6	185615	185620	100 %	0 %	0 %	0 %	332288252
4081	NC_015460	TGA	2	6	185624	185629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288252
4082	NC_015460	GTT	2	6	185636	185641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288252
4083	NC_015460	AAC	2	6	185753	185758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288252
4084	NC_015460	TAA	2	6	185766	185771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288252
4085	NC_015460	TGGT	2	8	185818	185825	0 %	50 %	50 %	0 %	332288252
4086	NC_015460	GAA	3	9	185833	185841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288252
4087	NC_015460	TTG	2	6	185878	185883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288252
4088	NC_015460	AAG	2	6	185927	185932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288252
4089	NC_015460	CCA	2	6	185984	185989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288252
4090	NC_015460	A	7	7	186001	186007	100 %	0 %	0 %	0 %	332288252
4091	NC_015460	T	6	6	186200	186205	0 %	100 %	0 %	0 %	332288253
4092	NC_015460	A	6	6	186215	186220	100 %	0 %	0 %	0 %	332288253
4093	NC_015460	ATT	2	6	186237	186242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288253
4094	NC_015460	CAG	2	6	186250	186255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288253
4095	NC_015460	TAT	3	9	186309	186317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288253
4096	NC_015460	GCA	2	6	186463	186468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288253
4097	NC_015460	GAA	2	6	186532	186537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288253
4098	NC_015460	TTCT	2	8	186570	186577	0 %	75 %	0 %	25 %	332288253
4099	NC_015460	TGG	2	6	186623	186628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288253
4100	NC_015460	TGA	2	6	186699	186704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288253
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4103	NC_015460	GTG	2	6	187045	187050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332288254
4104	NC_015460	CCG	2	6	187064	187069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288254
4105	NC_015460	CAC	2	6	187082	187087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288254
4106	NC_015460	ATT	2	6	187150	187155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288254
4107	NC_015460	GTC	2	6	187181	187186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288254
4108	NC_015460	AATC	2	8	187222	187229	50 %	25 %	0 %	25 %	332288254
4109	NC_015460	GAA	2	6	187261	187266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288254
4110	NC_015460	ACA	2	6	187341	187346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288254
4111	NC_015460	AT	3	6	187356	187361	50 %	50 %	0 %	0 %	332288254
4112	NC_015460	GCA	2	6	187412	187417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288254
4113	NC_015460	AT	3	6	187419	187424	50 %	50 %	0 %	0 %	332288254
4114	NC_015460	TAA	2	6	187425	187430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288254
4115	NC_015460	AT	3	6	187464	187469	50 %	50 %	0 %	0 %	332288254
4116	NC_015460	CAA	2	6	187513	187518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288254
4117	NC_015460	TGTT	2	8	187519	187526	0 %	75 %	25 %	0 %	332288254
4118	NC_015460	CTG	2	6	187549	187554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288254
4119	NC_015460	CAA	2	6	187610	187615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288254
4120	NC_015460	GGC	2	6	187696	187701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332288254
4121	NC_015460	CCA	2	6	187751	187756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288254
4122	NC_015460	CAA	2	6	187759	187764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288254
4123	NC_015460	A	7	7	187796	187802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_015460	TAA	2	6	187922	187927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288255
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4230	NC_015460	TTG	2	6	193101	193106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288257
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4233	NC_015460	CAA	2	6	193232	193237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288257
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4250	NC_015460	AAT	2	6	193820	193825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288258
4251	NC_015460	CTG	2	6	193890	193895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288258
4252	NC_015460	ATC	2	6	193983	193988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288258
4253	NC_015460	TGC	2	6	194003	194008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288258
4254	NC_015460	CTG	2	6	194045	194050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288258
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4263	NC_015460	TCAA	2	8	194449	194456	50 %	25 %	0 %	25 %	332288258
4264	NC_015460	GCAG	2	8	194464	194471	25 %	0 %	50 %	25 %	332288258
4265	NC_015460	T	6	6	194475	194480	0 %	100 %	0 %	0 %	332288258
4266	NC_015460	TCC	2	6	194548	194553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332288258
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4269	NC_015460	GCA	2	6	194680	194685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288258
4270	NC_015460	TTG	2	6	194754	194759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288258
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4274	NC_015460	TCT	2	6	195047	195052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288259
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4281	NC_015460	TGT	2	6	195305	195310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288259
4282	NC_015460	TAA	2	6	195345	195350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288259
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4305	NC_015460	GCA	2	6	196423	196428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288260
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4322	NC_015460	AAT	2	6	196799	196804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288260
4323	NC_015460	AT	3	6	196816	196821	50 %	50 %	0 %	0 %	332288260
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4336	NC_015460	AT	3	6	197266	197271	50 %	50 %	0 %	0 %	332288260
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4338	NC_015460	T	6	6	197465	197470	0 %	100 %	0 %	0 %	332288260
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4341	NC_015460	ACGCA	2	10	197562	197571	40 %	0 %	20 %	40 %	332288260
4342	NC_015460	GTT	2	6	197585	197590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288260
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4349	NC_015460	ATT	2	6	197734	197739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4350	NC_015460	T	6	6	197742	197747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4353	NC_015460	GAA	2	6	197846	197851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4367	NC_015460	A	6	6	198435	198440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4368	NC_015460	GAT	2	6	198498	198503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288262
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4498	NC_015460	CAA	2	6	204276	204281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4499	NC_015460	A	6	6	204280	204285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4500	NC_015460	GCC	2	6	204326	204331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288267

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