MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gallibacterium anatis UMN179 chromosome

Total Repeats: 58400

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015460	CCG	2	6	23666	23671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288107
502	NC_015460	ATC	2	6	23780	23785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288107
503	NC_015460	CTT	2	6	23816	23821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288107
504	NC_015460	A	7	7	23836	23842	100 %	0 %	0 %	0 %	332288107
505	NC_015460	TC	3	6	23844	23849	0 %	50 %	0 %	50 %	332288107
506	NC_015460	GCC	2	6	23856	23861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288107
507	NC_015460	A	7	7	23878	23884	100 %	0 %	0 %	0 %	332288107
508	NC_015460	ATT	2	6	23925	23930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288107
509	NC_015460	GAA	2	6	23932	23937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288107
510	NC_015460	TGA	2	6	23979	23984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288107
511	NC_015460	A	6	6	24000	24005	100 %	0 %	0 %	0 %	332288107
512	NC_015460	A	6	6	24049	24054	100 %	0 %	0 %	0 %	332288107
513	NC_015460	GCT	2	6	24148	24153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288107
514	NC_015460	AAC	2	6	24311	24316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288107
515	NC_015460	GCC	2	6	24331	24336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288107
516	NC_015460	AATG	2	8	24565	24572	50 %	25 %	25 %	0 %	332288107
517	NC_015460	ATT	2	6	24738	24743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288107
518	NC_015460	TGAT	2	8	24785	24792	25 %	50 %	25 %	0 %	332288107
519	NC_015460	GAA	2	6	24868	24873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288107
520	NC_015460	CAA	2	6	24991	24996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288107
521	NC_015460	ATT	2	6	25008	25013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288107
522	NC_015460	A	6	6	25040	25045	100 %	0 %	0 %	0 %	332288107
523	NC_015460	TAC	2	6	25096	25101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015460	AT	3	6	25103	25108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015460	A	6	6	25158	25163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015460	AAC	2	6	25192	25197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288108
527	NC_015460	ATC	2	6	25201	25206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288108
528	NC_015460	AAT	2	6	25230	25235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288108
529	NC_015460	GCC	2	6	25253	25258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288108
530	NC_015460	ATT	2	6	25276	25281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288108
531	NC_015460	CAAAT	2	10	25315	25324	60 %	20 %	0 %	20 %	332288108
532	NC_015460	AAAT	2	8	25334	25341	75 %	25 %	0 %	0 %	332288108
533	NC_015460	TAT	2	6	25362	25367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288108
534	NC_015460	GTT	2	6	25484	25489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288108
535	NC_015460	TCA	2	6	25498	25503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288108
536	NC_015460	TGA	2	6	25516	25521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288108
537	NC_015460	AAATA	2	10	25576	25585	80 %	20 %	0 %	0 %	332288108
538	NC_015460	TAA	2	6	25760	25765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288108
539	NC_015460	AAT	2	6	25776	25781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288108
540	NC_015460	TAA	2	6	25803	25808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015460	CTT	2	6	25832	25837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_015460	ATAGC	2	10	25839	25848	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
543	NC_015460	ATA	2	6	25861	25866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015460	AT	3	6	25868	25873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015460	TTC	2	6	25874	25879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_015460	CTA	2	6	25897	25902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015460	CAA	2	6	25940	25945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_015460	T	6	6	25953	25958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015460	A	6	6	25971	25976	100 %	0 %	0 %	0 %	332288109
550	NC_015460	CAA	2	6	26060	26065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288109
551	NC_015460	ATT	2	6	26104	26109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288109
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553	NC_015460	T	7	7	26133	26139	0 %	100 %	0 %	0 %	332288109
554	NC_015460	ACA	2	6	26218	26223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288109
555	NC_015460	ATT	3	9	26345	26353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288109
556	NC_015460	CAAAA	2	10	26382	26391	80 %	0 %	0 %	20 %	332288109
557	NC_015460	TGA	2	6	26458	26463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288109
558	NC_015460	A	6	6	26463	26468	100 %	0 %	0 %	0 %	332288109
559	NC_015460	CCA	2	6	26501	26506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332288109
560	NC_015460	CAT	2	6	26585	26590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288109
561	NC_015460	T	6	6	26594	26599	0 %	100 %	0 %	0 %	332288109
562	NC_015460	AGC	2	6	26623	26628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288109
563	NC_015460	ATGG	2	8	26662	26669	25 %	25 %	50 %	0 %	332288109
564	NC_015460	ATT	2	6	26736	26741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288109
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566	NC_015460	AG	3	6	26801	26806	50 %	0 %	50 %	0 %	332288109
567	NC_015460	ATT	2	6	26833	26838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015460	TTAA	2	8	26894	26901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015460	CAA	2	6	26938	26943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288110
570	NC_015460	CCG	2	6	26967	26972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288110
571	NC_015460	TAA	2	6	26996	27001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288110
572	NC_015460	CTA	2	6	27016	27021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288110
573	NC_015460	AAT	2	6	27224	27229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288110
574	NC_015460	GCA	2	6	27255	27260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288110
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576	NC_015460	T	6	6	27343	27348	0 %	100 %	0 %	0 %	332288110
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579	NC_015460	CAT	2	6	27512	27517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288110
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581	NC_015460	AATT	2	8	27563	27570	50 %	50 %	0 %	0 %	332288110
582	NC_015460	T	6	6	27569	27574	0 %	100 %	0 %	0 %	332288110
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593	NC_015460	AAT	2	6	27987	27992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288110
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598	NC_015460	GCA	2	6	28284	28289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332288110
599	NC_015460	T	6	6	28294	28299	0 %	100 %	0 %	0 %	332288110
600	NC_015460	ATT	2	6	28304	28309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288110
601	NC_015460	TTC	2	6	28351	28356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288110
602	NC_015460	TCT	2	6	28361	28366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288110
603	NC_015460	AAC	2	6	28390	28395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015460	A	7	7	28403	28409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015460	AATT	2	8	28417	28424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015460	TAA	2	6	28460	28465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015460	T	6	6	28489	28494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_015460	TAT	2	6	28567	28572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288111
609	NC_015460	GCT	2	6	28586	28591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288111
610	NC_015460	GCG	2	6	28598	28603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332288111
611	NC_015460	CAA	3	9	28649	28657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288111
612	NC_015460	ACA	3	9	28669	28677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288111
613	NC_015460	ATT	2	6	28824	28829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288111
614	NC_015460	A	6	6	28855	28860	100 %	0 %	0 %	0 %	332288111
615	NC_015460	AAC	2	6	28998	29003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332288111
616	NC_015460	ATG	2	6	29021	29026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015460	CAT	2	6	29038	29043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_015460	TCC	2	6	29140	29145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332288112
619	NC_015460	GCT	2	6	29192	29197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288112
620	NC_015460	TAAT	2	8	29246	29253	50 %	50 %	0 %	0 %	332288112
621	NC_015460	TCTG	2	8	29260	29267	0 %	50 %	25 %	25 %	332288112
622	NC_015460	AAG	2	6	29287	29292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332288112
623	NC_015460	TGC	2	6	29327	29332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288112
624	NC_015460	TCT	2	6	29406	29411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332288112
625	NC_015460	CGG	2	6	29477	29482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332288112
626	NC_015460	T	6	6	29512	29517	0 %	100 %	0 %	0 %	332288112
627	NC_015460	ACT	2	6	29533	29538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288112
628	NC_015460	TTA	2	6	29539	29544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288112
629	NC_015460	CAT	2	6	29735	29740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288112
630	NC_015460	TTTGA	2	10	29745	29754	20 %	60 %	20 %	0 %	332288112
631	NC_015460	CAT	2	6	29775	29780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288112
632	NC_015460	GCT	2	6	29852	29857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288112
633	NC_015460	TAA	2	6	29883	29888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288112
634	NC_015460	T	7	7	29891	29897	0 %	100 %	0 %	0 %	332288112
635	NC_015460	AAT	2	6	29957	29962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332288112
636	NC_015460	TAT	2	6	29975	29980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288112
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639	NC_015460	ACCA	2	8	30067	30074	50 %	0 %	0 %	50 %	332288112
640	NC_015460	ATG	2	6	30105	30110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332288112
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643	NC_015460	TCA	2	6	30316	30321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288112
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645	NC_015460	AATAA	2	10	30459	30468	80 %	20 %	0 %	0 %	332288112
646	NC_015460	TTG	2	6	30501	30506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288112
647	NC_015460	GAAT	2	8	30544	30551	50 %	25 %	25 %	0 %	332288112
648	NC_015460	ATC	2	6	30592	30597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288112
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654	NC_015460	ATAA	2	8	30966	30973	75 %	25 %	0 %	0 %	332288112
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657	NC_015460	CCG	2	6	31057	31062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332288112
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672	NC_015460	T	6	6	31781	31786	0 %	100 %	0 %	0 %	332288113
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746	NC_015460	AG	3	6	34711	34716	50 %	0 %	50 %	0 %	332288116
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752	NC_015460	AAT	2	6	35102	35107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
753	NC_015460	A	6	6	35108	35113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
754	NC_015460	GT	3	6	35137	35142	0 %	50 %	50 %	0 %	332288117
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758	NC_015460	A	6	6	35400	35405	100 %	0 %	0 %	0 %	332288117
759	NC_015460	AGCAC	2	10	35429	35438	40 %	0 %	20 %	40 %	332288117
760	NC_015460	ATTCC	2	10	35471	35480	20 %	40 %	0 %	40 %	332288117
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762	NC_015460	TTA	2	6	35555	35560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332288117
763	NC_015460	CGG	2	6	35567	35572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332288117
764	NC_015460	TTG	2	6	35581	35586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332288117
765	NC_015460	TGC	2	6	35648	35653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332288117
766	NC_015460	TCA	2	6	35663	35668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332288117
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781	NC_015460	TTGC	2	8	36163	36170	0 %	50 %	25 %	25 %	332288117
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852	NC_015460	ATAAAA	2	12	39428	39439	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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